MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021490	TTC	2	6	192490	192495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556251
3502	NC_021490	AGG	2	6	192506	192511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556251
3503	NC_021490	TGC	2	6	192517	192522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556251
3504	NC_021490	GCGCG	2	10	192536	192545	0 %	0 %	60 %	40 %	512556251
3505	NC_021490	GAAG	2	8	192550	192557	50 %	0 %	50 %	0 %	512556251
3506	NC_021490	ATT	2	6	192560	192565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556251
3507	NC_021490	TGG	2	6	192625	192630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556252
3508	NC_021490	G	6	6	192629	192634	0 %	0 %	100 %	0 %	512556252
3509	NC_021490	GAT	2	6	192645	192650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556252
3510	NC_021490	TCT	2	6	192664	192669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556252
3511	NC_021490	CCT	2	6	192695	192700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556252
3512	NC_021490	TAGT	2	8	192719	192726	25 %	50 %	25 %	0 %	512556252
3513	NC_021490	AGC	2	6	192854	192859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556252
3514	NC_021490	GAA	2	6	192897	192902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556252
3515	NC_021490	TCC	2	6	193027	193032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556252
3516	NC_021490	T	7	7	193087	193093	0 %	100 %	0 %	0 %	512556252
3517	NC_021490	AGC	2	6	193105	193110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556252
3518	NC_021490	GGAAGA	2	12	193134	193145	50 %	0 %	50 %	0 %	512556252
3519	NC_021490	C	7	7	193157	193163	0 %	0 %	0 %	100 %	512556252
3520	NC_021490	A	6	6	193196	193201	100 %	0 %	0 %	0 %	512556252
3521	NC_021490	CTC	2	6	193203	193208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556252
3522	NC_021490	GACACT	2	12	193295	193306	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556252
3523	NC_021490	GC	3	6	193350	193355	0 %	0 %	50 %	50 %	512556252
3524	NC_021490	CAG	2	6	193370	193375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556252
3525	NC_021490	GC	3	6	193383	193388	0 %	0 %	50 %	50 %	512556252
3526	NC_021490	GGTGAG	2	12	193458	193469	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	512556252
3527	NC_021490	A	6	6	193497	193502	100 %	0 %	0 %	0 %	512556252
3528	NC_021490	GAGT	2	8	193514	193521	25 %	25 %	50 %	0 %	512556252
3529	NC_021490	ACA	2	6	193541	193546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556252
3530	NC_021490	AG	3	6	193600	193605	50 %	0 %	50 %	0 %	512556252
3531	NC_021490	CCA	2	6	193633	193638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556252
3532	NC_021490	GTC	2	6	193653	193658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556252
3533	NC_021490	AAC	2	6	193672	193677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556252
3534	NC_021490	A	6	6	193691	193696	100 %	0 %	0 %	0 %	512556252
3535	NC_021490	TCA	2	6	193717	193722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556252
3536	NC_021490	CG	3	6	193784	193789	0 %	0 %	50 %	50 %	512556252
3537	NC_021490	GCT	2	6	193820	193825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556252
3538	NC_021490	GC	3	6	193921	193926	0 %	0 %	50 %	50 %	512556252
3539	NC_021490	TCC	2	6	193967	193972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556252
3540	NC_021490	TTTGT	2	10	194018	194027	0 %	80 %	20 %	0 %	512556253
3541	NC_021490	GAG	2	6	194053	194058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556253
3542	NC_021490	A	6	6	194093	194098	100 %	0 %	0 %	0 %	512556253
3543	NC_021490	TAA	2	6	194100	194105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556253
3544	NC_021490	TTGT	2	8	194107	194114	0 %	75 %	25 %	0 %	512556253
3545	NC_021490	CTG	2	6	194133	194138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556253
3546	NC_021490	TCC	2	6	194218	194223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556253
3547	NC_021490	TG	3	6	194225	194230	0 %	50 %	50 %	0 %	512556253
3548	NC_021490	GCG	2	6	194283	194288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556253
3549	NC_021490	GGC	2	6	194422	194427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556253
3550	NC_021490	GCCA	2	8	194428	194435	25 %	0 %	25 %	50 %	512556253
3551	NC_021490	A	6	6	194456	194461	100 %	0 %	0 %	0 %	512556253
3552	NC_021490	GAA	2	6	194468	194473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556253
3553	NC_021490	CCT	2	6	194504	194509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556253
3554	NC_021490	GT	3	6	194615	194620	0 %	50 %	50 %	0 %	512556253
3555	NC_021490	A	7	7	194653	194659	100 %	0 %	0 %	0 %	512556253
3556	NC_021490	AC	3	6	194683	194688	50 %	0 %	0 %	50 %	512556253
3557	NC_021490	T	6	6	194742	194747	0 %	100 %	0 %	0 %	512556253
3558	NC_021490	A	6	6	194965	194970	100 %	0 %	0 %	0 %	512556253
3559	NC_021490	A	7	7	194998	195004	100 %	0 %	0 %	0 %	512556253
3560	NC_021490	GAT	2	6	195013	195018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556253
3561	NC_021490	GAA	2	6	195072	195077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556253
3562	NC_021490	ATA	2	6	195098	195103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556253
3563	NC_021490	GCA	2	6	195166	195171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556253
3564	NC_021490	A	6	6	195228	195233	100 %	0 %	0 %	0 %	512556253
3565	NC_021490	GCAG	2	8	195251	195258	25 %	0 %	50 %	25 %	512556253
3566	NC_021490	TTCT	2	8	195261	195268	0 %	75 %	0 %	25 %	512556253
3567	NC_021490	GAGTG	2	10	195293	195302	20 %	20 %	60 %	0 %	512556253
3568	NC_021490	AAG	2	6	195317	195322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556253
3569	NC_021490	TG	4	8	195337	195344	0 %	50 %	50 %	0 %	512556253
3570	NC_021490	T	8	8	195434	195441	0 %	100 %	0 %	0 %	512556253
3571	NC_021490	ATTA	2	8	196608	196615	50 %	50 %	0 %	0 %	512556254
3572	NC_021490	AGAA	2	8	196616	196623	75 %	0 %	25 %	0 %	512556254
3573	NC_021490	GGA	2	6	196894	196899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556255
3574	NC_021490	CGTC	2	8	196900	196907	0 %	25 %	25 %	50 %	512556255
3575	NC_021490	GC	3	6	196909	196914	0 %	0 %	50 %	50 %	512556255
3576	NC_021490	AGT	2	6	196916	196921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556255
3577	NC_021490	TGA	2	6	196933	196938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556255
3578	NC_021490	GAA	2	6	197025	197030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556255
3579	NC_021490	CAG	2	6	197118	197123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556255
3580	NC_021490	GAA	2	6	197149	197154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556255
3581	NC_021490	CGG	2	6	197155	197160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556255
3582	NC_021490	G	6	6	197159	197164	0 %	0 %	100 %	0 %	512556255
3583	NC_021490	AGC	2	6	197239	197244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556255
3584	NC_021490	GC	3	6	197303	197308	0 %	0 %	50 %	50 %	512556255
3585	NC_021490	ACGC	2	8	197330	197337	25 %	0 %	25 %	50 %	512556255
3586	NC_021490	CTC	2	6	197339	197344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556255
3587	NC_021490	CCTG	2	8	197518	197525	0 %	25 %	25 %	50 %	512556255
3588	NC_021490	GTC	2	6	197532	197537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556255
3589	NC_021490	GCAG	2	8	197547	197554	25 %	0 %	50 %	25 %	512556255
3590	NC_021490	AGG	2	6	197565	197570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556255
3591	NC_021490	GTG	3	9	197598	197606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556255
3592	NC_021490	GAGAAA	2	12	197651	197662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556255
3593	NC_021490	CG	3	6	197666	197671	0 %	0 %	50 %	50 %	512556255
3594	NC_021490	GA	3	6	197681	197686	50 %	0 %	50 %	0 %	512556255
3595	NC_021490	GTA	2	6	197720	197725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556255
3596	NC_021490	GC	4	8	197763	197770	0 %	0 %	50 %	50 %	512556255
3597	NC_021490	CTC	2	6	197845	197850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556256
3598	NC_021490	TCT	2	6	197853	197858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556256
3599	NC_021490	AGC	2	6	197876	197881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556256
3600	NC_021490	TCG	2	6	197912	197917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
3601	NC_021490	GGC	2	6	198037	198042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556256
3602	NC_021490	TCG	3	9	198146	198154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
3603	NC_021490	GCT	2	6	198177	198182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
3604	NC_021490	GGA	2	6	198208	198213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556256
3605	NC_021490	TGT	2	6	198347	198352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556256
3606	NC_021490	CG	3	6	198372	198377	0 %	0 %	50 %	50 %	512556256
3607	NC_021490	GTC	2	6	198388	198393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
3608	NC_021490	CTC	2	6	198394	198399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556256
3609	NC_021490	CAC	2	6	198459	198464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556256
3610	NC_021490	TGA	2	6	198516	198521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556256
3611	NC_021490	TCGTC	2	10	198555	198564	0 %	40 %	20 %	40 %	512556256
3612	NC_021490	ATC	2	6	198568	198573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556256
3613	NC_021490	TTCC	2	8	198606	198613	0 %	50 %	0 %	50 %	512556256
3614	NC_021490	CTG	2	6	198704	198709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
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3617	NC_021490	GTC	2	6	198943	198948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
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3619	NC_021490	TGC	2	6	198987	198992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
3620	NC_021490	CG	3	6	198996	199001	0 %	0 %	50 %	50 %	512556256
3621	NC_021490	GGC	2	6	199007	199012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556256
3622	NC_021490	GTC	2	6	199057	199062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
3623	NC_021490	TCG	2	6	199091	199096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
3624	NC_021490	ACG	2	6	199098	199103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556256
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3626	NC_021490	GGA	3	9	199153	199161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556256
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3746	NC_021490	TGA	2	6	204954	204959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556264
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3749	NC_021490	GGA	2	6	205083	205088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556264
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3752	NC_021490	TGAA	2	8	205250	205257	50 %	25 %	25 %	0 %	512556264
3753	NC_021490	TCG	2	6	205268	205273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556264
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3761	NC_021490	ACT	2	6	205537	205542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556264
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3871	NC_021490	TTA	2	6	211810	211815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556278
3872	NC_021490	GC	3	6	211842	211847	0 %	0 %	50 %	50 %	512556278
3873	NC_021490	GTA	2	6	211912	211917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556278
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3875	NC_021490	ATT	2	6	212040	212045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556278
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3880	NC_021490	TACGC	2	10	212231	212240	20 %	20 %	20 %	40 %	512556279
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3991	NC_021490	CG	4	8	218577	218584	0 %	0 %	50 %	50 %	512556290
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3996	NC_021490	GGTC	2	8	218755	218762	0 %	25 %	50 %	25 %	512556291
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3998	NC_021490	AAG	2	6	218834	218839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556291
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