MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021490	CGTC	2	8	166867	166874	0 %	25 %	25 %	50 %	512556227
3002	NC_021490	CAG	3	9	166887	166895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556227
3003	NC_021490	GCAGC	2	10	166908	166917	20 %	0 %	40 %	40 %	512556227
3004	NC_021490	AGA	2	6	166918	166923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556227
3005	NC_021490	GT	4	8	167059	167066	0 %	50 %	50 %	0 %	512556228
3006	NC_021490	TCC	2	6	167073	167078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556228
3007	NC_021490	CTGC	2	8	167148	167155	0 %	25 %	25 %	50 %	512556228
3008	NC_021490	CTT	2	6	167194	167199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556228
3009	NC_021490	GTG	2	6	167263	167268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556228
3010	NC_021490	GCA	2	6	167340	167345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556228
3011	NC_021490	GCAC	2	8	167409	167416	25 %	0 %	25 %	50 %	512556228
3012	NC_021490	A	6	6	167445	167450	100 %	0 %	0 %	0 %	512556228
3013	NC_021490	CG	3	6	167453	167458	0 %	0 %	50 %	50 %	512556228
3014	NC_021490	GTT	2	6	167495	167500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556228
3015	NC_021490	GCGG	2	8	167505	167512	0 %	0 %	75 %	25 %	512556228
3016	NC_021490	T	6	6	167576	167581	0 %	100 %	0 %	0 %	512556228
3017	NC_021490	CAGG	2	8	167632	167639	25 %	0 %	50 %	25 %	512556228
3018	NC_021490	CG	4	8	167665	167672	0 %	0 %	50 %	50 %	512556228
3019	NC_021490	CTA	2	6	167680	167685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556228
3020	NC_021490	GTG	2	6	167724	167729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556228
3021	NC_021490	GT	3	6	167784	167789	0 %	50 %	50 %	0 %	512556228
3022	NC_021490	TG	3	6	167819	167824	0 %	50 %	50 %	0 %	512556228
3023	NC_021490	TGC	2	6	168017	168022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556228
3024	NC_021490	GCA	2	6	168045	168050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556228
3025	NC_021490	CGT	2	6	168108	168113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556228
3026	NC_021490	CGC	2	6	168127	168132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556228
3027	NC_021490	TG	3	6	168141	168146	0 %	50 %	50 %	0 %	512556228
3028	NC_021490	GAA	2	6	168209	168214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556228
3029	NC_021490	CCT	2	6	168223	168228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556228
3030	NC_021490	G	8	8	168246	168253	0 %	0 %	100 %	0 %	512556228
3031	NC_021490	TCC	2	6	168260	168265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556228
3032	NC_021490	TGAAG	2	10	168404	168413	40 %	20 %	40 %	0 %	512556228
3033	NC_021490	GGTT	2	8	168540	168547	0 %	50 %	50 %	0 %	512556228
3034	NC_021490	GTGG	2	8	168576	168583	0 %	25 %	75 %	0 %	512556228
3035	NC_021490	AAG	2	6	168606	168611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556228
3036	NC_021490	TGC	2	6	168622	168627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556228
3037	NC_021490	GTG	2	6	168628	168633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556228
3038	NC_021490	GA	3	6	168634	168639	50 %	0 %	50 %	0 %	512556228
3039	NC_021490	GGC	2	6	168728	168733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556228
3040	NC_021490	GAA	2	6	168804	168809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556228
3041	NC_021490	GTG	2	6	168828	168833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556228
3042	NC_021490	AGG	2	6	168961	168966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556228
3043	NC_021490	TGC	2	6	170679	170684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556229
3044	NC_021490	A	6	6	170705	170710	100 %	0 %	0 %	0 %	512556229
3045	NC_021490	TCA	2	6	170731	170736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556229
3046	NC_021490	A	6	6	170769	170774	100 %	0 %	0 %	0 %	512556229
3047	NC_021490	T	6	6	170800	170805	0 %	100 %	0 %	0 %	512556229
3048	NC_021490	A	6	6	170838	170843	100 %	0 %	0 %	0 %	512556229
3049	NC_021490	T	7	7	170850	170856	0 %	100 %	0 %	0 %	512556229
3050	NC_021490	TTC	2	6	170877	170882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556229
3051	NC_021490	AG	3	6	171015	171020	50 %	0 %	50 %	0 %	512556229
3052	NC_021490	CTG	2	6	171059	171064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556229
3053	NC_021490	A	6	6	171083	171088	100 %	0 %	0 %	0 %	512556229
3054	NC_021490	TCA	2	6	171134	171139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556229
3055	NC_021490	GA	4	8	171149	171156	50 %	0 %	50 %	0 %	512556229
3056	NC_021490	GA	3	6	171195	171200	50 %	0 %	50 %	0 %	512556229
3057	NC_021490	ATT	2	6	171201	171206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556229
3058	NC_021490	AC	3	6	171209	171214	50 %	0 %	0 %	50 %	512556229
3059	NC_021490	GTGC	2	8	171220	171227	0 %	25 %	50 %	25 %	512556229
3060	NC_021490	AGG	2	6	171244	171249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556229
3061	NC_021490	GC	3	6	171269	171274	0 %	0 %	50 %	50 %	512556229
3062	NC_021490	AGA	2	6	171300	171305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556229
3063	NC_021490	A	8	8	171309	171316	100 %	0 %	0 %	0 %	512556229
3064	NC_021490	ATG	2	6	171351	171356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556229
3065	NC_021490	GTT	2	6	171362	171367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556229
3066	NC_021490	GTAC	2	8	171398	171405	25 %	25 %	25 %	25 %	512556229
3067	NC_021490	ATC	2	6	171406	171411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556229
3068	NC_021490	ACA	2	6	171419	171424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556229
3069	NC_021490	CG	3	6	171427	171432	0 %	0 %	50 %	50 %	512556229
3070	NC_021490	TG	3	6	171433	171438	0 %	50 %	50 %	0 %	512556229
3071	NC_021490	ATT	2	6	171445	171450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556229
3072	NC_021490	AAAC	2	8	171514	171521	75 %	0 %	0 %	25 %	512556229
3073	NC_021490	AGG	2	6	171522	171527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556229
3074	NC_021490	GT	3	6	171624	171629	0 %	50 %	50 %	0 %	512556229
3075	NC_021490	A	6	6	171630	171635	100 %	0 %	0 %	0 %	512556229
3076	NC_021490	CGGTA	2	10	171754	171763	20 %	20 %	40 %	20 %	512556229
3077	NC_021490	CAA	2	6	171767	171772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556229
3078	NC_021490	TGC	2	6	171779	171784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556229
3079	NC_021490	TAG	2	6	171806	171811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556229
3080	NC_021490	ATTCC	2	10	171857	171866	20 %	40 %	0 %	40 %	512556229
3081	NC_021490	GCG	2	6	171892	171897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556229
3082	NC_021490	AGC	2	6	171920	171925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556229
3083	NC_021490	GAGG	2	8	171998	172005	25 %	0 %	75 %	0 %	512556229
3084	NC_021490	CCG	2	6	172030	172035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556229
3085	NC_021490	TTG	2	6	172069	172074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556229
3086	NC_021490	ATAAG	2	10	172075	172084	60 %	20 %	20 %	0 %	512556229
3087	NC_021490	T	7	7	172099	172105	0 %	100 %	0 %	0 %	512556229
3088	NC_021490	A	7	7	172116	172122	100 %	0 %	0 %	0 %	512556229
3089	NC_021490	GTT	2	6	172151	172156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556229
3090	NC_021490	A	7	7	172175	172181	100 %	0 %	0 %	0 %	512556229
3091	NC_021490	GCA	2	6	172246	172251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556229
3092	NC_021490	T	6	6	172281	172286	0 %	100 %	0 %	0 %	512556229
3093	NC_021490	CGC	2	6	172307	172312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556230
3094	NC_021490	CG	3	6	172442	172447	0 %	0 %	50 %	50 %	512556230
3095	NC_021490	TGG	2	6	172453	172458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556230
3096	NC_021490	ACGCA	2	10	172664	172673	40 %	0 %	20 %	40 %	512556230
3097	NC_021490	GA	3	6	172771	172776	50 %	0 %	50 %	0 %	512556230
3098	NC_021490	GAT	2	6	172990	172995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556231
3099	NC_021490	ATG	2	6	173075	173080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556231
3100	NC_021490	CAT	2	6	173185	173190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556231
3101	NC_021490	CATA	2	8	173226	173233	50 %	25 %	0 %	25 %	512556231
3102	NC_021490	TGG	2	6	173235	173240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556231
3103	NC_021490	AGAC	2	8	173252	173259	50 %	0 %	25 %	25 %	512556231
3104	NC_021490	A	6	6	173290	173295	100 %	0 %	0 %	0 %	512556231
3105	NC_021490	GA	3	6	173300	173305	50 %	0 %	50 %	0 %	512556231
3106	NC_021490	CAG	2	6	173314	173319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556231
3107	NC_021490	A	7	7	173325	173331	100 %	0 %	0 %	0 %	512556231
3108	NC_021490	AGT	2	6	173354	173359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556231
3109	NC_021490	CG	3	6	173425	173430	0 %	0 %	50 %	50 %	512556231
3110	NC_021490	TACT	2	8	173441	173448	25 %	50 %	0 %	25 %	512556231
3111	NC_021490	GC	3	6	173501	173506	0 %	0 %	50 %	50 %	512556232
3112	NC_021490	T	6	6	173582	173587	0 %	100 %	0 %	0 %	512556232
3113	NC_021490	A	7	7	173595	173601	100 %	0 %	0 %	0 %	512556232
3114	NC_021490	T	6	6	173670	173675	0 %	100 %	0 %	0 %	512556232
3115	NC_021490	CGTGA	2	10	173730	173739	20 %	20 %	40 %	20 %	512556232
3116	NC_021490	CTTGC	2	10	173755	173764	0 %	40 %	20 %	40 %	512556232
3117	NC_021490	GCG	2	6	173775	173780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556232
3118	NC_021490	TGA	2	6	173785	173790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556232
3119	NC_021490	CTTTT	2	10	173795	173804	0 %	80 %	0 %	20 %	512556232
3120	NC_021490	A	6	6	173805	173810	100 %	0 %	0 %	0 %	512556232
3121	NC_021490	GC	3	6	173819	173824	0 %	0 %	50 %	50 %	512556232
3122	NC_021490	TAG	2	6	173929	173934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556233
3123	NC_021490	AGT	2	6	173980	173985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556233
3124	NC_021490	T	6	6	174043	174048	0 %	100 %	0 %	0 %	512556233
3125	NC_021490	A	6	6	174054	174059	100 %	0 %	0 %	0 %	512556233
3126	NC_021490	GC	3	6	174155	174160	0 %	0 %	50 %	50 %	512556233
3127	NC_021490	GTGTGC	2	12	174192	174203	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556233
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3129	NC_021490	AC	3	6	174280	174285	50 %	0 %	0 %	50 %	512556233
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3131	NC_021490	AC	3	6	174344	174349	50 %	0 %	0 %	50 %	512556233
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3232	NC_021490	A	6	6	178696	178701	100 %	0 %	0 %	0 %	512556237
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3238	NC_021490	CGT	2	6	178896	178901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556237
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3240	NC_021490	CTC	2	6	179004	179009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556237
3241	NC_021490	TTC	2	6	179029	179034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556237
3242	NC_021490	ATGG	2	8	179040	179047	25 %	25 %	50 %	0 %	512556237
3243	NC_021490	CGG	2	6	179105	179110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556237
3244	NC_021490	CAGTG	2	10	179161	179170	20 %	20 %	40 %	20 %	512556237
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3246	NC_021490	CAG	2	6	179247	179252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556237
3247	NC_021490	CG	3	6	179256	179261	0 %	0 %	50 %	50 %	512556237
3248	NC_021490	ATT	2	6	179284	179289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556237
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3250	NC_021490	TGCGTA	2	12	179373	179384	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556237
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3374	NC_021490	TCT	2	6	185214	185219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556243
3375	NC_021490	GAA	2	6	185252	185257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556243
3376	NC_021490	CTCA	2	8	185267	185274	25 %	25 %	0 %	50 %	512556243
3377	NC_021490	CGT	2	6	185375	185380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556243
3378	NC_021490	G	6	6	185394	185399	0 %	0 %	100 %	0 %	512556243
3379	NC_021490	CG	3	6	185437	185442	0 %	0 %	50 %	50 %	512556243
3380	NC_021490	TGAA	2	8	185448	185455	50 %	25 %	25 %	0 %	512556243
3381	NC_021490	GTTTT	2	10	185470	185479	0 %	80 %	20 %	0 %	512556243
3382	NC_021490	AGG	2	6	185502	185507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556243
3383	NC_021490	ACGC	2	8	185820	185827	25 %	0 %	25 %	50 %	512556244
3384	NC_021490	CAC	2	6	185873	185878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556244
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3386	NC_021490	CAG	3	9	186273	186281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556244
3387	NC_021490	CTGC	2	8	186324	186331	0 %	25 %	25 %	50 %	512556244
3388	NC_021490	GT	3	6	186340	186345	0 %	50 %	50 %	0 %	512556244
3389	NC_021490	ATG	2	6	186358	186363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556244
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3391	NC_021490	CGAG	2	8	186619	186626	25 %	0 %	50 %	25 %	512556244
3392	NC_021490	AC	3	6	186648	186653	50 %	0 %	0 %	50 %	512556244
3393	NC_021490	TGC	2	6	186671	186676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556244
3394	NC_021490	GAC	2	6	186876	186881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556245
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3396	NC_021490	TCT	2	6	187010	187015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556245
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3399	NC_021490	CTA	2	6	187120	187125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556245
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3402	NC_021490	CG	3	6	187298	187303	0 %	0 %	50 %	50 %	512556245
3403	NC_021490	TTG	2	6	187426	187431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556245
3404	NC_021490	CAT	2	6	187434	187439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556245
3405	NC_021490	TGC	2	6	187474	187479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556245
3406	NC_021490	CGT	2	6	187511	187516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556245
3407	NC_021490	GAA	2	6	187530	187535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556245
3408	NC_021490	CGGA	2	8	187556	187563	25 %	0 %	50 %	25 %	512556245
3409	NC_021490	AGG	2	6	187594	187599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556245
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3412	NC_021490	TGC	2	6	187824	187829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556246
3413	NC_021490	TAG	2	6	187841	187846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556246
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3415	NC_021490	TTGGGT	2	12	187928	187939	0 %	50 %	50 %	0 %	512556246
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3417	NC_021490	ATTC	2	8	187998	188005	25 %	50 %	0 %	25 %	512556246
3418	NC_021490	TCA	2	6	188045	188050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556246
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3430	NC_021490	TG	3	6	188561	188566	0 %	50 %	50 %	0 %	512556247
3431	NC_021490	TGA	2	6	188597	188602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556247
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3437	NC_021490	TG	3	6	188951	188956	0 %	50 %	50 %	0 %	512556247
3438	NC_021490	CTG	2	6	188962	188967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556247
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3442	NC_021490	GGTG	2	8	189108	189115	0 %	25 %	75 %	0 %	512556247
3443	NC_021490	CATTG	2	10	189126	189135	20 %	40 %	20 %	20 %	512556247
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3447	NC_021490	GCA	2	6	189260	189265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556247
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3449	NC_021490	TC	3	6	189320	189325	0 %	50 %	0 %	50 %	512556247
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3452	NC_021490	GGC	2	6	189492	189497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556247
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3454	NC_021490	TGC	2	6	189551	189556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556247
3455	NC_021490	GT	3	6	189572	189577	0 %	50 %	50 %	0 %	512556247
3456	NC_021490	GCA	2	6	189643	189648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556248
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3477	NC_021490	TAAC	2	8	190912	190919	50 %	25 %	0 %	25 %	512556249
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3483	NC_021490	GGT	2	6	191359	191364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556250
3484	NC_021490	TG	3	6	191368	191373	0 %	50 %	50 %	0 %	512556250
3485	NC_021490	CGG	2	6	191374	191379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556250
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3488	NC_021490	TGCAG	2	10	191515	191524	20 %	20 %	40 %	20 %	512556250
3489	NC_021490	ATG	2	6	191526	191531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556250
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3491	NC_021490	TTA	2	6	191868	191873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556250
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3493	NC_021490	GTG	2	6	192038	192043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556250
3494	NC_021490	TGA	2	6	192253	192258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556251
3495	NC_021490	TGG	2	6	192295	192300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556251
3496	NC_021490	GGT	2	6	192313	192318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556251
3497	NC_021490	AAG	2	6	192336	192341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556251
3498	NC_021490	AG	3	6	192419	192424	50 %	0 %	50 %	0 %	512556251
3499	NC_021490	TGCTT	2	10	192433	192442	0 %	60 %	20 %	20 %	512556251
3500	NC_021490	TGG	2	6	192462	192467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556251

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