MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021490	CGC	2	6	57317	57322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556131
1002	NC_021490	CG	4	8	57328	57335	0 %	0 %	50 %	50 %	512556131
1003	NC_021490	ACA	2	6	57409	57414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556131
1004	NC_021490	CTG	2	6	58247	58252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556132
1005	NC_021490	CTT	2	6	58253	58258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556132
1006	NC_021490	CCG	2	6	58307	58312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556132
1007	NC_021490	A	8	8	58352	58359	100 %	0 %	0 %	0 %	512556132
1008	NC_021490	AGA	2	6	58384	58389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556132
1009	NC_021490	GTA	2	6	58411	58416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556132
1010	NC_021490	GCG	2	6	58480	58485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556132
1011	NC_021490	GC	3	6	58491	58496	0 %	0 %	50 %	50 %	512556132
1012	NC_021490	TGC	2	6	58821	58826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556133
1013	NC_021490	TTG	2	6	58836	58841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556133
1014	NC_021490	GCAGG	2	10	58861	58870	20 %	0 %	60 %	20 %	512556133
1015	NC_021490	GTA	3	9	58880	58888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556133
1016	NC_021490	AG	3	6	58916	58921	50 %	0 %	50 %	0 %	512556133
1017	NC_021490	AGT	2	6	58987	58992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556133
1018	NC_021490	ATC	2	6	59129	59134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556133
1019	NC_021490	AGG	2	6	59171	59176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556133
1020	NC_021490	TGA	2	6	59197	59202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556133
1021	NC_021490	CGC	2	6	59205	59210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556133
1022	NC_021490	AGG	2	6	59258	59263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556133
1023	NC_021490	TCA	2	6	59394	59399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556133
1024	NC_021490	GAA	2	6	59600	59605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556134
1025	NC_021490	GC	3	6	59608	59613	0 %	0 %	50 %	50 %	512556134
1026	NC_021490	CAG	2	6	59630	59635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556134
1027	NC_021490	CTGCA	2	10	59841	59850	20 %	20 %	20 %	40 %	512556134
1028	NC_021490	GCT	2	6	59875	59880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556134
1029	NC_021490	C	6	6	59885	59890	0 %	0 %	0 %	100 %	512556134
1030	NC_021490	AGA	2	6	59904	59909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556134
1031	NC_021490	CGG	2	6	59929	59934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556134
1032	NC_021490	CGG	2	6	59938	59943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556134
1033	NC_021490	TGA	2	6	59944	59949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556134
1034	NC_021490	AGC	2	6	59950	59955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556134
1035	NC_021490	TGC	2	6	59962	59967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556134
1036	NC_021490	GGA	2	6	60050	60055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556134
1037	NC_021490	TGC	2	6	60195	60200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556134
1038	NC_021490	CGTG	2	8	60241	60248	0 %	25 %	50 %	25 %	512556134
1039	NC_021490	TGG	2	6	60274	60279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556134
1040	NC_021490	GT	3	6	60283	60288	0 %	50 %	50 %	0 %	512556134
1041	NC_021490	CTAC	2	8	60323	60330	25 %	25 %	0 %	50 %	512556134
1042	NC_021490	TGTC	2	8	60343	60350	0 %	50 %	25 %	25 %	512556134
1043	NC_021490	TCAAA	2	10	60364	60373	60 %	20 %	0 %	20 %	512556134
1044	NC_021490	GCA	2	6	60402	60407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556134
1045	NC_021490	ATC	2	6	60534	60539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556134
1046	NC_021490	GCGT	2	8	60540	60547	0 %	25 %	50 %	25 %	512556134
1047	NC_021490	GA	3	6	60624	60629	50 %	0 %	50 %	0 %	512556134
1048	NC_021490	CG	3	6	60678	60683	0 %	0 %	50 %	50 %	512556135
1049	NC_021490	GTT	2	6	60687	60692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556135
1050	NC_021490	AC	3	6	60722	60727	50 %	0 %	0 %	50 %	512556135
1051	NC_021490	TTGC	2	8	60760	60767	0 %	50 %	25 %	25 %	512556135
1052	NC_021490	CGTG	2	8	60775	60782	0 %	25 %	50 %	25 %	512556135
1053	NC_021490	CAG	2	6	60796	60801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556135
1054	NC_021490	T	6	6	60895	60900	0 %	100 %	0 %	0 %	512556135
1055	NC_021490	ATG	2	6	60994	60999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556135
1056	NC_021490	TGCG	2	8	61109	61116	0 %	25 %	50 %	25 %	512556135
1057	NC_021490	CT	3	6	61130	61135	0 %	50 %	0 %	50 %	512556135
1058	NC_021490	CG	3	6	61188	61193	0 %	0 %	50 %	50 %	512556135
1059	NC_021490	CG	3	6	61220	61225	0 %	0 %	50 %	50 %	512556135
1060	NC_021490	ATG	2	6	61322	61327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556135
1061	NC_021490	GC	5	10	61366	61375	0 %	0 %	50 %	50 %	512556135
1062	NC_021490	CAC	2	6	61456	61461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556135
1063	NC_021490	AAGG	2	8	61477	61484	50 %	0 %	50 %	0 %	512556135
1064	NC_021490	GC	3	6	61531	61536	0 %	0 %	50 %	50 %	512556135
1065	NC_021490	GCA	2	6	61546	61551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556135
1066	NC_021490	TC	3	6	61581	61586	0 %	50 %	0 %	50 %	512556135
1067	NC_021490	ATC	2	6	61751	61756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556136
1068	NC_021490	A	7	7	61799	61805	100 %	0 %	0 %	0 %	512556136
1069	NC_021490	CCA	2	6	61942	61947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556136
1070	NC_021490	C	6	6	61990	61995	0 %	0 %	0 %	100 %	512556136
1071	NC_021490	AAT	2	6	62093	62098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556136
1072	NC_021490	GT	4	8	62117	62124	0 %	50 %	50 %	0 %	512556136
1073	NC_021490	TTA	2	6	62175	62180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556136
1074	NC_021490	AGA	2	6	62194	62199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556136
1075	NC_021490	AAAT	2	8	62217	62224	75 %	25 %	0 %	0 %	512556136
1076	NC_021490	CAG	2	6	62258	62263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556136
1077	NC_021490	GC	3	6	62321	62326	0 %	0 %	50 %	50 %	512556136
1078	NC_021490	TCG	2	6	62337	62342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556136
1079	NC_021490	TTC	2	6	62372	62377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556136
1080	NC_021490	TGTAAC	2	12	62401	62412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556136
1081	NC_021490	AAGG	2	8	62531	62538	50 %	0 %	50 %	0 %	512556136
1082	NC_021490	TTC	2	6	62615	62620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556136
1083	NC_021490	GTT	2	6	62633	62638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556136
1084	NC_021490	TGCC	2	8	62642	62649	0 %	25 %	25 %	50 %	512556136
1085	NC_021490	C	6	6	62711	62716	0 %	0 %	0 %	100 %	512556136
1086	NC_021490	GC	3	6	62764	62769	0 %	0 %	50 %	50 %	512556136
1087	NC_021490	CAT	2	6	62795	62800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556136
1088	NC_021490	CCT	2	6	63022	63027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556137
1089	NC_021490	GCG	2	6	63030	63035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556137
1090	NC_021490	CT	3	6	63042	63047	0 %	50 %	0 %	50 %	512556137
1091	NC_021490	GCA	2	6	63083	63088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556137
1092	NC_021490	T	6	6	63115	63120	0 %	100 %	0 %	0 %	512556137
1093	NC_021490	TGCG	2	8	63128	63135	0 %	25 %	50 %	25 %	512556137
1094	NC_021490	TG	3	6	63152	63157	0 %	50 %	50 %	0 %	512556137
1095	NC_021490	TGC	2	6	63165	63170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556137
1096	NC_021490	TGC	2	6	63246	63251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556137
1097	NC_021490	TGT	2	6	63324	63329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556137
1098	NC_021490	TGC	2	6	63381	63386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556137
1099	NC_021490	T	7	7	63387	63393	0 %	100 %	0 %	0 %	512556137
1100	NC_021490	CACT	2	8	63400	63407	25 %	25 %	0 %	50 %	512556137
1101	NC_021490	GGT	2	6	63408	63413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556137
1102	NC_021490	CAG	2	6	63427	63432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556137
1103	NC_021490	GGA	2	6	63469	63474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556137
1104	NC_021490	TTG	2	6	63490	63495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556137
1105	NC_021490	TG	3	6	63527	63532	0 %	50 %	50 %	0 %	512556137
1106	NC_021490	GAA	2	6	63610	63615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556137
1107	NC_021490	GAG	2	6	63640	63645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556137
1108	NC_021490	ATC	2	6	63680	63685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556137
1109	NC_021490	GCAG	2	8	63697	63704	25 %	0 %	50 %	25 %	512556137
1110	NC_021490	T	7	7	63746	63752	0 %	100 %	0 %	0 %	512556137
1111	NC_021490	GCCAC	2	10	63808	63817	20 %	0 %	20 %	60 %	512556137
1112	NC_021490	TCC	2	6	64207	64212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556138
1113	NC_021490	TG	3	6	64236	64241	0 %	50 %	50 %	0 %	512556138
1114	NC_021490	GC	3	6	64243	64248	0 %	0 %	50 %	50 %	512556138
1115	NC_021490	TCT	2	6	64254	64259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556138
1116	NC_021490	AGG	2	6	64310	64315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556138
1117	NC_021490	CGC	2	6	64322	64327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556138
1118	NC_021490	ACG	2	6	64524	64529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556139
1119	NC_021490	TAT	2	6	64603	64608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556139
1120	NC_021490	TCAG	2	8	64746	64753	25 %	25 %	25 %	25 %	512556139
1121	NC_021490	TGC	2	6	64762	64767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556139
1122	NC_021490	GC	3	6	64862	64867	0 %	0 %	50 %	50 %	512556139
1123	NC_021490	ACT	2	6	64991	64996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556139
1124	NC_021490	GGC	2	6	65023	65028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556139
1125	NC_021490	AGC	2	6	65170	65175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556139
1126	NC_021490	CAGT	2	8	65411	65418	25 %	25 %	25 %	25 %	512556139
1127	NC_021490	ACC	2	6	65442	65447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556139
1128	NC_021490	CTG	2	6	65454	65459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556139
1129	NC_021490	CCT	2	6	65502	65507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556139
1130	NC_021490	TGG	2	6	65520	65525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556139
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1132	NC_021490	GCC	2	6	65568	65573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556139
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1139	NC_021490	TAC	2	6	65944	65949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556139
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1234	NC_021490	TG	3	6	71257	71262	0 %	50 %	50 %	0 %	512556147
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1237	NC_021490	ATCG	2	8	71437	71444	25 %	25 %	25 %	25 %	512556147
1238	NC_021490	TTAC	2	8	71463	71470	25 %	50 %	0 %	25 %	512556147
1239	NC_021490	TTC	2	6	71474	71479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556147
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1245	NC_021490	A	6	6	72206	72211	100 %	0 %	0 %	0 %	512556148
1246	NC_021490	GT	3	6	72252	72257	0 %	50 %	50 %	0 %	512556148
1247	NC_021490	CT	3	6	72419	72424	0 %	50 %	0 %	50 %	512556149
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1250	NC_021490	TA	3	6	72663	72668	50 %	50 %	0 %	0 %	512556149
1251	NC_021490	GTG	2	6	74024	74029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556150
1252	NC_021490	AGA	2	6	74054	74059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556150
1253	NC_021490	GT	3	6	74070	74075	0 %	50 %	50 %	0 %	512556150
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1255	NC_021490	GCGT	2	8	74190	74197	0 %	25 %	50 %	25 %	512556150
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1497	NC_021490	AGC	2	6	86684	86689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556160
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1499	NC_021490	CG	4	8	86736	86743	0 %	0 %	50 %	50 %	512556160
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