MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_021490	CAC	2	6	333867	333872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556381
6003	NC_021490	C	6	6	333918	333923	0 %	0 %	0 %	100 %	512556381
6004	NC_021490	GGTG	2	8	333998	334005	0 %	25 %	75 %	0 %	512556381
6005	NC_021490	AGA	2	6	334128	334133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556381
6006	NC_021490	AC	3	6	334197	334202	50 %	0 %	0 %	50 %	512556381
6007	NC_021490	ACGC	2	8	334238	334245	25 %	0 %	25 %	50 %	512556381
6008	NC_021490	CTG	2	6	334269	334274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556381
6009	NC_021490	TCT	3	9	334295	334303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556381
6010	NC_021490	CTT	2	6	334307	334312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556381
6011	NC_021490	TTG	2	6	334404	334409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556381
6012	NC_021490	GCAA	2	8	334453	334460	50 %	0 %	25 %	25 %	512556381
6013	NC_021490	TCT	2	6	334474	334479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556381
6014	NC_021490	TGA	2	6	334499	334504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556381
6015	NC_021490	TGC	2	6	334512	334517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556381
6016	NC_021490	CAC	2	6	334599	334604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556381
6017	NC_021490	GCA	2	6	334622	334627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556381
6018	NC_021490	AGG	2	6	334680	334685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556381
6019	NC_021490	CTT	2	6	334827	334832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556381
6020	NC_021490	CCAG	2	8	334844	334851	25 %	0 %	25 %	50 %	512556381
6021	NC_021490	TG	3	6	334921	334926	0 %	50 %	50 %	0 %	512556381
6022	NC_021490	CAG	2	6	335034	335039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556381
6023	NC_021490	TCT	2	6	335092	335097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556381
6024	NC_021490	TACT	2	8	335182	335189	25 %	50 %	0 %	25 %	512556381
6025	NC_021490	GA	3	6	335233	335238	50 %	0 %	50 %	0 %	512556381
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6029	NC_021490	AGTGT	2	10	335435	335444	20 %	40 %	40 %	0 %	512556381
6030	NC_021490	TGC	2	6	335545	335550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556381
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6032	NC_021490	GTA	2	6	335608	335613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556381
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6034	NC_021490	CAC	3	9	335781	335789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556381
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6036	NC_021490	GA	4	8	335983	335990	50 %	0 %	50 %	0 %	512556382
6037	NC_021490	CG	3	6	335999	336004	0 %	0 %	50 %	50 %	512556382
6038	NC_021490	T	6	6	336015	336020	0 %	100 %	0 %	0 %	512556382
6039	NC_021490	TGC	2	6	336027	336032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556382
6040	NC_021490	GCT	2	6	336039	336044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556382
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6042	NC_021490	TCG	2	6	336099	336104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556382
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6049	NC_021490	G	6	6	336673	336678	0 %	0 %	100 %	0 %	512556382
6050	NC_021490	GC	3	6	336704	336709	0 %	0 %	50 %	50 %	512556382
6051	NC_021490	TCG	2	6	336712	336717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556382
6052	NC_021490	ATGG	2	8	336767	336774	25 %	25 %	50 %	0 %	512556382
6053	NC_021490	GCGGA	2	10	336836	336845	20 %	0 %	60 %	20 %	512556382
6054	NC_021490	G	6	6	336878	336883	0 %	0 %	100 %	0 %	512556382
6055	NC_021490	GAG	2	6	336980	336985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556382
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6060	NC_021490	CGT	2	6	337117	337122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556383
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6062	NC_021490	GTT	2	6	337163	337168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556383
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6065	NC_021490	TTTC	2	8	337350	337357	0 %	75 %	0 %	25 %	512556384
6066	NC_021490	GA	3	6	337392	337397	50 %	0 %	50 %	0 %	512556384
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6091	NC_021490	CG	3	6	338420	338425	0 %	0 %	50 %	50 %	512556384
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6097	NC_021490	CG	3	6	338625	338630	0 %	0 %	50 %	50 %	512556384
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6102	NC_021490	A	7	7	338861	338867	100 %	0 %	0 %	0 %	512556384
6103	NC_021490	GCT	2	6	338928	338933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556385
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6106	NC_021490	GT	4	8	339223	339230	0 %	50 %	50 %	0 %	512556385
6107	NC_021490	CTTT	3	12	339253	339264	0 %	75 %	0 %	25 %	512556385
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6109	NC_021490	GGA	2	6	339301	339306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556385
6110	NC_021490	GC	3	6	339333	339338	0 %	0 %	50 %	50 %	512556385
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6495	NC_021490	TG	3	6	359516	359521	0 %	50 %	50 %	0 %	512556397
6496	NC_021490	CCTC	2	8	359540	359547	0 %	25 %	0 %	75 %	512556397
6497	NC_021490	ACA	2	6	359553	359558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556397
6498	NC_021490	GC	3	6	359659	359664	0 %	0 %	50 %	50 %	512556397
6499	NC_021490	TAT	2	6	359723	359728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556397
6500	NC_021490	GCA	2	6	359748	359753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556397

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