MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021490	TTC	2	6	308898	308903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556362
5502	NC_021490	A	6	6	308910	308915	100 %	0 %	0 %	0 %	512556362
5503	NC_021490	GAT	2	6	308925	308930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556362
5504	NC_021490	ATT	2	6	308945	308950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556362
5505	NC_021490	GGT	2	6	308952	308957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556362
5506	NC_021490	CTTT	2	8	309131	309138	0 %	75 %	0 %	25 %	512556362
5507	NC_021490	TGA	2	6	309162	309167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556362
5508	NC_021490	TC	3	6	309188	309193	0 %	50 %	0 %	50 %	512556362
5509	NC_021490	ATT	2	6	309196	309201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556362
5510	NC_021490	CA	4	8	309220	309227	50 %	0 %	0 %	50 %	512556362
5511	NC_021490	GTT	2	6	309270	309275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556362
5512	NC_021490	CG	4	8	309276	309283	0 %	0 %	50 %	50 %	512556362
5513	NC_021490	CG	3	6	309288	309293	0 %	0 %	50 %	50 %	512556362
5514	NC_021490	TCA	2	6	309297	309302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556362
5515	NC_021490	AATC	2	8	309304	309311	50 %	25 %	0 %	25 %	512556362
5516	NC_021490	GAT	2	6	309328	309333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556362
5517	NC_021490	ATC	2	6	309340	309345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556362
5518	NC_021490	CGCT	2	8	309360	309367	0 %	25 %	25 %	50 %	512556362
5519	NC_021490	CG	3	6	309386	309391	0 %	0 %	50 %	50 %	512556362
5520	NC_021490	GCG	2	6	309463	309468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556363
5521	NC_021490	ATT	2	6	309469	309474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556363
5522	NC_021490	T	6	6	309553	309558	0 %	100 %	0 %	0 %	512556363
5523	NC_021490	CGTGC	2	10	309577	309586	0 %	20 %	40 %	40 %	512556363
5524	NC_021490	CGT	2	6	309627	309632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556363
5525	NC_021490	AAG	2	6	309643	309648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556363
5526	NC_021490	CGGTG	2	10	309703	309712	0 %	20 %	60 %	20 %	512556363
5527	NC_021490	T	7	7	309719	309725	0 %	100 %	0 %	0 %	512556363
5528	NC_021490	T	6	6	309781	309786	0 %	100 %	0 %	0 %	512556363
5529	NC_021490	TCT	2	6	309790	309795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556363
5530	NC_021490	AT	3	6	309808	309813	50 %	50 %	0 %	0 %	512556363
5531	NC_021490	CG	3	6	309889	309894	0 %	0 %	50 %	50 %	512556363
5532	NC_021490	TTG	2	6	309944	309949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556363
5533	NC_021490	CCT	2	6	309950	309955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556363
5534	NC_021490	GCG	2	6	309977	309982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556363
5535	NC_021490	GCA	2	6	309997	310002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556363
5536	NC_021490	ATGT	2	8	310070	310077	25 %	50 %	25 %	0 %	512556363
5537	NC_021490	CCT	2	6	310087	310092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556363
5538	NC_021490	GCG	2	6	310203	310208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556363
5539	NC_021490	ATG	2	6	310271	310276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556363
5540	NC_021490	C	6	6	310282	310287	0 %	0 %	0 %	100 %	512556363
5541	NC_021490	GTG	2	6	310291	310296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556363
5542	NC_021490	GT	3	6	310336	310341	0 %	50 %	50 %	0 %	512556363
5543	NC_021490	GTTG	2	8	310421	310428	0 %	50 %	50 %	0 %	512556363
5544	NC_021490	GTT	2	6	310454	310459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556363
5545	NC_021490	GT	3	6	310512	310517	0 %	50 %	50 %	0 %	512556363
5546	NC_021490	CAG	2	6	310547	310552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556363
5547	NC_021490	GTC	2	6	310565	310570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556363
5548	NC_021490	TGC	2	6	310635	310640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556363
5549	NC_021490	GTG	2	6	310785	310790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556364
5550	NC_021490	GAA	2	6	310795	310800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556364
5551	NC_021490	GC	3	6	310853	310858	0 %	0 %	50 %	50 %	512556364
5552	NC_021490	TAG	2	6	310893	310898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556364
5553	NC_021490	GGCTGC	2	12	310912	310923	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512556364
5554	NC_021490	GC	3	6	310922	310927	0 %	0 %	50 %	50 %	512556364
5555	NC_021490	GGC	2	6	310952	310957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556364
5556	NC_021490	GT	3	6	310977	310982	0 %	50 %	50 %	0 %	512556364
5557	NC_021490	ACT	2	6	311002	311007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556364
5558	NC_021490	GCA	3	9	311008	311016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556364
5559	NC_021490	TG	3	6	311052	311057	0 %	50 %	50 %	0 %	512556364
5560	NC_021490	GC	5	10	311066	311075	0 %	0 %	50 %	50 %	512556364
5561	NC_021490	GTTTT	2	10	311148	311157	0 %	80 %	20 %	0 %	512556364
5562	NC_021490	AGA	2	6	311390	311395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556365
5563	NC_021490	GT	3	6	311423	311428	0 %	50 %	50 %	0 %	512556365
5564	NC_021490	ATT	2	6	311437	311442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556365
5565	NC_021490	TGT	2	6	311459	311464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556365
5566	NC_021490	CCTA	2	8	311470	311477	25 %	25 %	0 %	50 %	512556365
5567	NC_021490	TTC	2	6	311478	311483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556365
5568	NC_021490	GTG	2	6	311525	311530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556365
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5570	NC_021490	A	6	6	311582	311587	100 %	0 %	0 %	0 %	512556365
5571	NC_021490	GGT	2	6	311643	311648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556365
5572	NC_021490	TCC	2	6	311691	311696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556365
5573	NC_021490	CAGGA	2	10	311725	311734	40 %	0 %	40 %	20 %	512556365
5574	NC_021490	TTG	2	6	311852	311857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556365
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5579	NC_021490	GC	3	6	312369	312374	0 %	0 %	50 %	50 %	512556366
5580	NC_021490	TGT	2	6	312431	312436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556366
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5582	NC_021490	GCA	2	6	312482	312487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556366
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5585	NC_021490	CGC	2	6	312668	312673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556366
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5588	NC_021490	TGA	2	6	312821	312826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556366
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5591	NC_021490	ATG	2	6	312973	312978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556366
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5593	NC_021490	CG	3	6	313017	313022	0 %	0 %	50 %	50 %	512556366
5594	NC_021490	CGCTG	2	10	313133	313142	0 %	20 %	40 %	40 %	512556366
5595	NC_021490	GTAC	2	8	313197	313204	25 %	25 %	25 %	25 %	512556366
5596	NC_021490	TGA	2	6	313318	313323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556366
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5598	NC_021490	GC	3	6	313350	313355	0 %	0 %	50 %	50 %	512556367
5599	NC_021490	CG	3	6	313393	313398	0 %	0 %	50 %	50 %	512556367
5600	NC_021490	GC	3	6	313451	313456	0 %	0 %	50 %	50 %	512556367
5601	NC_021490	CGA	2	6	313460	313465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556367
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5603	NC_021490	GC	3	6	313495	313500	0 %	0 %	50 %	50 %	512556367
5604	NC_021490	GACG	2	8	313505	313512	25 %	0 %	50 %	25 %	512556367
5605	NC_021490	T	6	6	313551	313556	0 %	100 %	0 %	0 %	512556367
5606	NC_021490	GTT	2	6	313574	313579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556367
5607	NC_021490	A	6	6	313583	313588	100 %	0 %	0 %	0 %	512556367
5608	NC_021490	TGGA	2	8	313660	313667	25 %	25 %	50 %	0 %	512556367
5609	NC_021490	AGC	2	6	313672	313677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556367
5610	NC_021490	TGC	2	6	313784	313789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556367
5611	NC_021490	GGTG	2	8	313804	313811	0 %	25 %	75 %	0 %	512556367
5612	NC_021490	GA	3	6	313826	313831	50 %	0 %	50 %	0 %	512556367
5613	NC_021490	GAA	2	6	313871	313876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556367
5614	NC_021490	GAA	2	6	313878	313883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556367
5615	NC_021490	T	6	6	313914	313919	0 %	100 %	0 %	0 %	512556367
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5617	NC_021490	TTTTC	2	10	314005	314014	0 %	80 %	0 %	20 %	512556367
5618	NC_021490	T	6	6	314028	314033	0 %	100 %	0 %	0 %	512556367
5619	NC_021490	TTC	2	6	314039	314044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556367
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5622	NC_021490	TGAA	2	8	314200	314207	50 %	25 %	25 %	0 %	512556367
5623	NC_021490	CTT	2	6	314254	314259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556367
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5625	NC_021490	TCT	2	6	314322	314327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556367
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5751	NC_021490	A	6	6	320057	320062	100 %	0 %	0 %	0 %	512556371
5752	NC_021490	GT	3	6	320145	320150	0 %	50 %	50 %	0 %	512556371
5753	NC_021490	GCT	2	6	320165	320170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556371
5754	NC_021490	GGC	2	6	320181	320186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556371
5755	NC_021490	CTC	2	6	320312	320317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556371
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5757	NC_021490	CTG	2	6	320461	320466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556371
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5763	NC_021490	CG	3	6	320683	320688	0 %	0 %	50 %	50 %	512556371
5764	NC_021490	CAT	2	6	320696	320701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556371
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5770	NC_021490	GCTC	2	8	321016	321023	0 %	25 %	25 %	50 %	512556371
5771	NC_021490	CGTC	2	8	321057	321064	0 %	25 %	25 %	50 %	512556371
5772	NC_021490	GAT	2	6	321079	321084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556371
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5775	NC_021490	ATA	2	6	321164	321169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556371
5776	NC_021490	CCTC	2	8	321469	321476	0 %	25 %	0 %	75 %	512556371
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5782	NC_021490	A	6	6	321655	321660	100 %	0 %	0 %	0 %	512556371
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5824	NC_021490	GC	3	6	323430	323435	0 %	0 %	50 %	50 %	512556372
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5859	NC_021490	GAA	2	6	325397	325402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556374
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5861	NC_021490	CG	3	6	325460	325465	0 %	0 %	50 %	50 %	512556374
5862	NC_021490	TGCAGG	2	12	325484	325495	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512556374
5863	NC_021490	TG	3	6	325579	325584	0 %	50 %	50 %	0 %	512556374
5864	NC_021490	G	7	7	325603	325609	0 %	0 %	100 %	0 %	512556374
5865	NC_021490	G	6	6	325641	325646	0 %	0 %	100 %	0 %	512556374
5866	NC_021490	G	7	7	325701	325707	0 %	0 %	100 %	0 %	512556374
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5869	NC_021490	CTG	2	6	325829	325834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556375
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5871	NC_021490	CGC	2	6	325953	325958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556375
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5873	NC_021490	GC	4	8	326012	326019	0 %	0 %	50 %	50 %	512556375
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5997	NC_021490	CGC	2	6	333569	333574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556381
5998	NC_021490	CAG	2	6	333615	333620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556381
5999	NC_021490	AG	3	6	333633	333638	50 %	0 %	50 %	0 %	512556381
6000	NC_021490	TCT	2	6	333671	333676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556381

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