MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021490	GTAT	2	8	278194	278201	25 %	50 %	25 %	0 %	512556340
5002	NC_021490	GCG	2	6	278243	278248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556340
5003	NC_021490	GGC	2	6	278301	278306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556340
5004	NC_021490	AC	3	6	278474	278479	50 %	0 %	0 %	50 %	512556340
5005	NC_021490	AGGC	2	8	278539	278546	25 %	0 %	50 %	25 %	512556340
5006	NC_021490	TAG	2	6	278565	278570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556340
5007	NC_021490	GC	3	6	278621	278626	0 %	0 %	50 %	50 %	512556340
5008	NC_021490	GGCG	2	8	278648	278655	0 %	0 %	75 %	25 %	512556340
5009	NC_021490	A	6	6	278691	278696	100 %	0 %	0 %	0 %	512556340
5010	NC_021490	GGGA	2	8	278757	278764	25 %	0 %	75 %	0 %	512556340
5011	NC_021490	GTG	2	6	278842	278847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556340
5012	NC_021490	AGG	2	6	278936	278941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556340
5013	NC_021490	AGG	2	6	278950	278955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556340
5014	NC_021490	GT	3	6	279010	279015	0 %	50 %	50 %	0 %	512556340
5015	NC_021490	GAA	2	6	279045	279050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556340
5016	NC_021490	TGT	2	6	279054	279059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556340
5017	NC_021490	AT	3	6	279060	279065	50 %	50 %	0 %	0 %	512556340
5018	NC_021490	AGT	2	6	279076	279081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556340
5019	NC_021490	GATG	2	8	279095	279102	25 %	25 %	50 %	0 %	512556340
5020	NC_021490	G	6	6	279348	279353	0 %	0 %	100 %	0 %	512556340
5021	NC_021490	GAA	3	9	279375	279383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556340
5022	NC_021490	GTAT	2	8	279418	279425	25 %	50 %	25 %	0 %	512556340
5023	NC_021490	GAT	2	6	284749	284754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556341
5024	NC_021490	GTG	2	6	284831	284836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556341
5025	NC_021490	GAG	2	6	284878	284883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556341
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5027	NC_021490	GT	3	6	285052	285057	0 %	50 %	50 %	0 %	512556341
5028	NC_021490	CT	3	6	285103	285108	0 %	50 %	0 %	50 %	512556342
5029	NC_021490	GT	3	6	285147	285152	0 %	50 %	50 %	0 %	512556342
5030	NC_021490	GCA	2	6	285167	285172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556342
5031	NC_021490	CGGG	2	8	285192	285199	0 %	0 %	75 %	25 %	512556342
5032	NC_021490	TGC	2	6	285222	285227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556342
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5034	NC_021490	GC	3	6	285338	285343	0 %	0 %	50 %	50 %	512556342
5035	NC_021490	GCC	2	6	285348	285353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556342
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5039	NC_021490	TAT	2	6	285480	285485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556342
5040	NC_021490	CTT	2	6	285518	285523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556342
5041	NC_021490	TGG	2	6	285579	285584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556342
5042	NC_021490	GC	3	6	285608	285613	0 %	0 %	50 %	50 %	512556342
5043	NC_021490	GTAG	2	8	285721	285728	25 %	25 %	50 %	0 %	512556342
5044	NC_021490	GTC	2	6	285769	285774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556343
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5046	NC_021490	AGG	2	6	285817	285822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556343
5047	NC_021490	TG	4	8	285868	285875	0 %	50 %	50 %	0 %	512556343
5048	NC_021490	GGCGC	2	10	285914	285923	0 %	0 %	60 %	40 %	512556343
5049	NC_021490	TCGT	2	8	285925	285932	0 %	50 %	25 %	25 %	512556343
5050	NC_021490	GAT	2	6	286017	286022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556343
5051	NC_021490	GTAT	2	8	286124	286131	25 %	50 %	25 %	0 %	512556343
5052	NC_021490	TGCG	2	8	286138	286145	0 %	25 %	50 %	25 %	512556343
5053	NC_021490	CTT	2	6	286153	286158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556343
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5055	NC_021490	A	7	7	286164	286170	100 %	0 %	0 %	0 %	512556343
5056	NC_021490	CG	3	6	286264	286269	0 %	0 %	50 %	50 %	512556343
5057	NC_021490	T	6	6	286331	286336	0 %	100 %	0 %	0 %	512556343
5058	NC_021490	AC	3	6	286437	286442	50 %	0 %	0 %	50 %	512556343
5059	NC_021490	TTA	2	6	286551	286556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556343
5060	NC_021490	T	6	6	286631	286636	0 %	100 %	0 %	0 %	512556343
5061	NC_021490	CG	3	6	286654	286659	0 %	0 %	50 %	50 %	512556343
5062	NC_021490	TCATTT	2	12	286667	286678	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	512556343
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5064	NC_021490	AC	3	6	286729	286734	50 %	0 %	0 %	50 %	512556343
5065	NC_021490	GAA	2	6	286779	286784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556343
5066	NC_021490	TCG	2	6	286807	286812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556343
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5069	NC_021490	GGGA	2	8	287031	287038	25 %	0 %	75 %	0 %	512556343
5070	NC_021490	GGT	2	6	287048	287053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556343
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5074	NC_021490	GCT	2	6	287283	287288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556344
5075	NC_021490	AGTG	2	8	287295	287302	25 %	25 %	50 %	0 %	512556344
5076	NC_021490	TGT	2	6	287334	287339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556344
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5079	NC_021490	CG	3	6	287568	287573	0 %	0 %	50 %	50 %	512556344
5080	NC_021490	ATC	2	6	287644	287649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556344
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5091	NC_021490	TGC	2	6	288060	288065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556344
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5097	NC_021490	CG	3	6	288267	288272	0 %	0 %	50 %	50 %	512556344
5098	NC_021490	CGT	2	6	288310	288315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556344
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5100	NC_021490	TG	3	6	288353	288358	0 %	50 %	50 %	0 %	512556344
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5108	NC_021490	GC	3	6	288852	288857	0 %	0 %	50 %	50 %	512556345
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5122	NC_021490	T	7	7	289327	289333	0 %	100 %	0 %	0 %	512556345
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5124	NC_021490	CTGG	2	8	289454	289461	0 %	25 %	50 %	25 %	512556345
5125	NC_021490	CTC	2	6	289494	289499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556345
5126	NC_021490	GA	3	6	289500	289505	50 %	0 %	50 %	0 %	512556345
5127	NC_021490	GCA	2	6	289547	289552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556345
5128	NC_021490	GCA	2	6	289625	289630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556345
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5132	NC_021490	CTA	2	6	290127	290132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556346
5133	NC_021490	GCA	2	6	290202	290207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556346
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5138	NC_021490	A	7	7	290583	290589	100 %	0 %	0 %	0 %	512556347
5139	NC_021490	CATTG	2	10	290590	290599	20 %	40 %	20 %	20 %	512556347
5140	NC_021490	GGGTA	2	10	290654	290663	20 %	20 %	60 %	0 %	512556347
5141	NC_021490	GTT	2	6	290700	290705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556347
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5143	NC_021490	GT	4	8	290862	290869	0 %	50 %	50 %	0 %	512556347
5144	NC_021490	GT	3	6	290890	290895	0 %	50 %	50 %	0 %	512556347
5145	NC_021490	GCAC	2	8	290908	290915	25 %	0 %	25 %	50 %	512556347
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5149	NC_021490	CCTT	2	8	291077	291084	0 %	50 %	0 %	50 %	512556347
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5157	NC_021490	TC	3	6	291320	291325	0 %	50 %	0 %	50 %	512556347
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5222	NC_021490	AG	5	10	295416	295425	50 %	0 %	50 %	0 %	512556352
5223	NC_021490	CGTTG	2	10	295448	295457	0 %	40 %	40 %	20 %	512556352
5224	NC_021490	GTGC	2	8	295460	295467	0 %	25 %	50 %	25 %	512556352
5225	NC_021490	GCCG	2	8	295485	295492	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
5226	NC_021490	ATC	2	6	295505	295510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556352
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5229	NC_021490	GC	3	6	295575	295580	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
5230	NC_021490	TTCT	2	8	295597	295604	0 %	75 %	0 %	25 %	512556352
5231	NC_021490	CGC	2	6	295621	295626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556352
5232	NC_021490	GCG	2	6	295685	295690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556352
5233	NC_021490	CAA	2	6	295716	295721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556352
5234	NC_021490	CAT	2	6	295731	295736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556352
5235	NC_021490	CTC	2	6	295740	295745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556352
5236	NC_021490	AGA	2	6	295755	295760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556352
5237	NC_021490	TGA	2	6	295774	295779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556352
5238	NC_021490	GC	3	6	295799	295804	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
5239	NC_021490	CTG	2	6	295865	295870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556352
5240	NC_021490	ACG	2	6	295997	296002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556352
5241	NC_021490	CGT	2	6	296066	296071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556352
5242	NC_021490	AGC	2	6	296112	296117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556352
5243	NC_021490	GC	4	8	296122	296129	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
5244	NC_021490	GC	3	6	296147	296152	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
5245	NC_021490	G	7	7	296158	296164	0 %	0 %	100 %	0 %	512556352
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5247	NC_021490	GAG	2	6	296216	296221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556352
5248	NC_021490	CG	4	8	296236	296243	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
5249	NC_021490	GAG	2	6	296268	296273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556352
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5370	NC_021490	ATG	2	6	302969	302974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556357
5371	NC_021490	CT	3	6	303008	303013	0 %	50 %	0 %	50 %	512556357
5372	NC_021490	ATGCGT	2	12	303030	303041	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512556357
5373	NC_021490	CG	3	6	303043	303048	0 %	0 %	50 %	50 %	512556357
5374	NC_021490	GGT	3	9	303052	303060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556357
5375	NC_021490	GCG	2	6	303110	303115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556357
5376	NC_021490	TGCT	2	8	303312	303319	0 %	50 %	25 %	25 %	512556357
5377	NC_021490	G	6	6	303328	303333	0 %	0 %	100 %	0 %	512556357
5378	NC_021490	T	6	6	303494	303499	0 %	100 %	0 %	0 %	512556357
5379	NC_021490	CAC	2	6	303514	303519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556357
5380	NC_021490	TGG	2	6	303525	303530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556357
5381	NC_021490	AGA	2	6	303541	303546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556357
5382	NC_021490	AC	3	6	303548	303553	50 %	0 %	0 %	50 %	512556357
5383	NC_021490	CG	4	8	303557	303564	0 %	0 %	50 %	50 %	512556357
5384	NC_021490	ACGG	3	12	303634	303645	25 %	0 %	50 %	25 %	512556357
5385	NC_021490	CTT	2	6	303663	303668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556357
5386	NC_021490	GCTGCA	2	12	303740	303751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512556357
5387	NC_021490	GCG	2	6	303755	303760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556357
5388	NC_021490	T	6	6	303790	303795	0 %	100 %	0 %	0 %	512556357
5389	NC_021490	CTG	2	6	303831	303836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556357
5390	NC_021490	CTG	2	6	303840	303845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556357
5391	NC_021490	GCA	2	6	303868	303873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556357
5392	NC_021490	ATT	2	6	303878	303883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556357
5393	NC_021490	TGT	2	6	303892	303897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556357
5394	NC_021490	A	6	6	303956	303961	100 %	0 %	0 %	0 %	512556357
5395	NC_021490	CTG	2	6	303964	303969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556357
5396	NC_021490	TGT	2	6	304000	304005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556357
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5398	NC_021490	TC	3	6	304060	304065	0 %	50 %	0 %	50 %	512556357
5399	NC_021490	T	7	7	304105	304111	0 %	100 %	0 %	0 %	512556357
5400	NC_021490	GAA	2	6	304112	304117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556357
5401	NC_021490	GC	3	6	304178	304183	0 %	0 %	50 %	50 %	512556357
5402	NC_021490	GGA	2	6	304189	304194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556357
5403	NC_021490	T	6	6	304218	304223	0 %	100 %	0 %	0 %	512556357
5404	NC_021490	AC	3	6	304371	304376	50 %	0 %	0 %	50 %	512556357
5405	NC_021490	CAA	2	6	304466	304471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556357
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5408	NC_021490	GC	3	6	304694	304699	0 %	0 %	50 %	50 %	512556357
5409	NC_021490	A	6	6	304705	304710	100 %	0 %	0 %	0 %	512556357
5410	NC_021490	GTG	2	6	304748	304753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556357
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5412	NC_021490	TGG	2	6	304801	304806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556357
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5415	NC_021490	GGT	2	6	304993	304998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556358
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5421	NC_021490	TGC	2	6	305233	305238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556358
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5424	NC_021490	GC	3	6	305385	305390	0 %	0 %	50 %	50 %	512556358
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5427	NC_021490	AT	3	6	305592	305597	50 %	50 %	0 %	0 %	512556358
5428	NC_021490	TAC	2	6	305606	305611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556358
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5431	NC_021490	ATG	3	9	305751	305759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556358
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5433	NC_021490	TG	3	6	305877	305882	0 %	50 %	50 %	0 %	512556359
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5435	NC_021490	A	6	6	305975	305980	100 %	0 %	0 %	0 %	512556359
5436	NC_021490	TAT	2	6	306074	306079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556359
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5440	NC_021490	GA	3	6	306307	306312	50 %	0 %	50 %	0 %	512556359
5441	NC_021490	GTG	2	6	306383	306388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556359
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5443	NC_021490	AG	3	6	306425	306430	50 %	0 %	50 %	0 %	512556359
5444	NC_021490	GC	3	6	306482	306487	0 %	0 %	50 %	50 %	512556359
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5449	NC_021490	GCA	2	6	306610	306615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556359
5450	NC_021490	AGG	2	6	306655	306660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556359
5451	NC_021490	GGGTG	2	10	306664	306673	0 %	20 %	80 %	0 %	512556359
5452	NC_021490	GT	3	6	306712	306717	0 %	50 %	50 %	0 %	512556359
5453	NC_021490	ATG	2	6	306718	306723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556359
5454	NC_021490	GT	3	6	306728	306733	0 %	50 %	50 %	0 %	512556360
5455	NC_021490	TG	3	6	306752	306757	0 %	50 %	50 %	0 %	512556360
5456	NC_021490	GCG	2	6	306784	306789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556360
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5465	NC_021490	GTA	2	6	307099	307104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556360
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5467	NC_021490	TACC	2	8	307239	307246	25 %	25 %	0 %	50 %	512556360
5468	NC_021490	GTG	2	6	307247	307252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556360
5469	NC_021490	ATC	2	6	307277	307282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556360
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5475	NC_021490	GCAC	2	8	307540	307547	25 %	0 %	25 %	50 %	512556360
5476	NC_021490	GGT	2	6	307548	307553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556360
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5479	NC_021490	GTT	2	6	307737	307742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556360
5480	NC_021490	ACG	2	6	307761	307766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556360
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5482	NC_021490	CG	3	6	307868	307873	0 %	0 %	50 %	50 %	512556360
5483	NC_021490	GCA	2	6	307884	307889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556360
5484	NC_021490	A	6	6	307926	307931	100 %	0 %	0 %	0 %	512556360
5485	NC_021490	TAAG	2	8	307955	307962	50 %	25 %	25 %	0 %	512556360
5486	NC_021490	GT	3	6	308021	308026	0 %	50 %	50 %	0 %	512556361
5487	NC_021490	GT	3	6	308035	308040	0 %	50 %	50 %	0 %	512556361
5488	NC_021490	GA	3	6	308121	308126	50 %	0 %	50 %	0 %	512556361
5489	NC_021490	TCG	2	6	308162	308167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556362
5490	NC_021490	TGG	2	6	308175	308180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556362
5491	NC_021490	GT	4	8	308219	308226	0 %	50 %	50 %	0 %	512556362
5492	NC_021490	T	6	6	308321	308326	0 %	100 %	0 %	0 %	512556362
5493	NC_021490	TG	3	6	308336	308341	0 %	50 %	50 %	0 %	512556362
5494	NC_021490	ACGT	2	8	308351	308358	25 %	25 %	25 %	25 %	512556362
5495	NC_021490	AATG	2	8	308434	308441	50 %	25 %	25 %	0 %	512556362
5496	NC_021490	ATC	2	6	308483	308488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556362
5497	NC_021490	A	7	7	308518	308524	100 %	0 %	0 %	0 %	512556362
5498	NC_021490	TGA	2	6	308546	308551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556362
5499	NC_021490	CGG	2	6	308666	308671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556362
5500	NC_021490	GTA	2	6	308851	308856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556362

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