MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 21924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021490	TGC	2	6	249814	249819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556316
4502	NC_021490	GACG	2	8	249822	249829	25 %	0 %	50 %	25 %	512556316
4503	NC_021490	ATT	2	6	249838	249843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556316
4504	NC_021490	GCA	2	6	249947	249952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556316
4505	NC_021490	CGGCG	2	10	250025	250034	0 %	0 %	60 %	40 %	512556316
4506	NC_021490	GAT	2	6	250068	250073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556316
4507	NC_021490	GAA	2	6	250242	250247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556316
4508	NC_021490	AATT	2	8	250388	250395	50 %	50 %	0 %	0 %	512556317
4509	NC_021490	T	6	6	250426	250431	0 %	100 %	0 %	0 %	512556317
4510	NC_021490	TAC	2	6	250448	250453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556317
4511	NC_021490	GGAATG	2	12	250457	250468	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512556317
4512	NC_021490	TAC	2	6	250605	250610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556317
4513	NC_021490	A	6	6	250721	250726	100 %	0 %	0 %	0 %	512556317
4514	NC_021490	GGC	2	6	250779	250784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556317
4515	NC_021490	CGG	2	6	250789	250794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556317
4516	NC_021490	ACCTTG	2	12	250831	250842	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556317
4517	NC_021490	TTG	2	6	250849	250854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556317
4518	NC_021490	GAT	2	6	250871	250876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556317
4519	NC_021490	TGC	2	6	250906	250911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556317
4520	NC_021490	GAT	2	6	250964	250969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556317
4521	NC_021490	ATC	2	6	251124	251129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556317
4522	NC_021490	TAT	2	6	251396	251401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556317
4523	NC_021490	GAAA	2	8	251417	251424	75 %	0 %	25 %	0 %	512556317
4524	NC_021490	TGG	2	6	251578	251583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556317
4525	NC_021490	TG	3	6	251612	251617	0 %	50 %	50 %	0 %	512556317
4526	NC_021490	GGC	2	6	251678	251683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556317
4527	NC_021490	TGT	2	6	251707	251712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556317
4528	NC_021490	TAT	2	6	251787	251792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556317
4529	NC_021490	CT	3	6	251807	251812	0 %	50 %	0 %	50 %	512556317
4530	NC_021490	GGA	2	6	251849	251854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556317
4531	NC_021490	ATG	2	6	251859	251864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556317
4532	NC_021490	TGA	2	6	252011	252016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556317
4533	NC_021490	AATT	2	8	252031	252038	50 %	50 %	0 %	0 %	512556317
4534	NC_021490	CTT	2	6	252122	252127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556317
4535	NC_021490	GAC	2	6	252147	252152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556317
4536	NC_021490	ATC	2	6	252153	252158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556317
4537	NC_021490	G	6	6	252231	252236	0 %	0 %	100 %	0 %	512556317
4538	NC_021490	CGT	2	6	252266	252271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556317
4539	NC_021490	GAG	2	6	252294	252299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556317
4540	NC_021490	ATG	2	6	252312	252317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556317
4541	NC_021490	GGAT	2	8	252338	252345	25 %	25 %	50 %	0 %	512556317
4542	NC_021490	ATG	2	6	252360	252365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556317
4543	NC_021490	GC	3	6	252378	252383	0 %	0 %	50 %	50 %	512556317
4544	NC_021490	ATC	2	6	252450	252455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556317
4545	NC_021490	T	6	6	252504	252509	0 %	100 %	0 %	0 %	512556317
4546	NC_021490	CGT	2	6	252582	252587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556317
4547	NC_021490	TGG	2	6	252610	252615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556317
4548	NC_021490	GAG	2	6	252621	252626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556317
4549	NC_021490	CG	3	6	252657	252662	0 %	0 %	50 %	50 %	512556317
4550	NC_021490	ATT	2	6	252681	252686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556317
4551	NC_021490	CTG	2	6	252756	252761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556317
4552	NC_021490	CGA	2	6	252782	252787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556317
4553	NC_021490	GAA	2	6	252807	252812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556317
4554	NC_021490	GAG	2	6	252865	252870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556317
4555	NC_021490	TG	5	10	252871	252880	0 %	50 %	50 %	0 %	512556317
4556	NC_021490	CAA	2	6	252905	252910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556317
4557	NC_021490	TAC	2	6	253019	253024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556317
4558	NC_021490	GGA	2	6	253094	253099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556317
4559	NC_021490	T	6	6	253134	253139	0 %	100 %	0 %	0 %	512556317
4560	NC_021490	CG	4	8	253197	253204	0 %	0 %	50 %	50 %	512556317
4561	NC_021490	ACCAC	2	10	253228	253237	40 %	0 %	0 %	60 %	512556317
4562	NC_021490	ATCG	2	8	253284	253291	25 %	25 %	25 %	25 %	512556317
4563	NC_021490	GTA	2	6	253347	253352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556317
4564	NC_021490	GCC	2	6	253373	253378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556317
4565	NC_021490	ATT	2	6	253458	253463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556317
4566	NC_021490	TGG	2	6	253507	253512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556317
4567	NC_021490	ACG	2	6	253524	253529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556317
4568	NC_021490	TGA	2	6	253571	253576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556317
4569	NC_021490	TAC	2	6	253599	253604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556317
4570	NC_021490	GC	3	6	253617	253622	0 %	0 %	50 %	50 %	512556317
4571	NC_021490	GAA	2	6	253632	253637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556317
4572	NC_021490	GC	3	6	253639	253644	0 %	0 %	50 %	50 %	512556317
4573	NC_021490	G	7	7	253709	253715	0 %	0 %	100 %	0 %	512556317
4574	NC_021490	ATT	2	6	253733	253738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556317
4575	NC_021490	GCG	2	6	253745	253750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556317
4576	NC_021490	GTG	2	6	253830	253835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556317
4577	NC_021490	GGAA	2	8	253849	253856	50 %	0 %	50 %	0 %	512556317
4578	NC_021490	AGGC	2	8	253915	253922	25 %	0 %	50 %	25 %	512556317
4579	NC_021490	TG	3	6	253930	253935	0 %	50 %	50 %	0 %	512556317
4580	NC_021490	TGA	2	6	253999	254004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556317
4581	NC_021490	TCAA	2	8	254040	254047	50 %	25 %	0 %	25 %	512556317
4582	NC_021490	GTG	2	6	254067	254072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556317
4583	NC_021490	G	6	6	254187	254192	0 %	0 %	100 %	0 %	512556317
4584	NC_021490	GC	3	6	254205	254210	0 %	0 %	50 %	50 %	512556317
4585	NC_021490	GGC	2	6	254234	254239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556317
4586	NC_021490	GCG	2	6	254304	254309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556317
4587	NC_021490	TGA	2	6	254324	254329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556317
4588	NC_021490	TG	3	6	254332	254337	0 %	50 %	50 %	0 %	512556317
4589	NC_021490	GCG	2	6	254390	254395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556317
4590	NC_021490	GGA	2	6	254450	254455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556317
4591	NC_021490	AGG	2	6	254482	254487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556317
4592	NC_021490	T	6	6	254686	254691	0 %	100 %	0 %	0 %	512556318
4593	NC_021490	GT	3	6	254739	254744	0 %	50 %	50 %	0 %	512556318
4594	NC_021490	TGA	2	6	254752	254757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556318
4595	NC_021490	A	6	6	254768	254773	100 %	0 %	0 %	0 %	512556318
4596	NC_021490	TCTGC	2	10	254781	254790	0 %	40 %	20 %	40 %	512556318
4597	NC_021490	G	6	6	254938	254943	0 %	0 %	100 %	0 %	512556318
4598	NC_021490	GTG	2	6	254961	254966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556318
4599	NC_021490	CG	3	6	255009	255014	0 %	0 %	50 %	50 %	512556318
4600	NC_021490	CCG	2	6	255072	255077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556319
4601	NC_021490	CG	3	6	255083	255088	0 %	0 %	50 %	50 %	512556319
4602	NC_021490	GTG	2	6	255099	255104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556319
4603	NC_021490	ATG	2	6	255126	255131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556319
4604	NC_021490	AAG	2	6	255141	255146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556319
4605	NC_021490	TAT	2	6	255161	255166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556319
4606	NC_021490	GAG	2	6	255204	255209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556319
4607	NC_021490	CGG	2	6	255270	255275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556319
4608	NC_021490	TGG	2	6	255278	255283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556319
4609	NC_021490	GCA	2	6	255357	255362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556319
4610	NC_021490	GCA	2	6	255399	255404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556319
4611	NC_021490	TTG	2	6	255533	255538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556320
4612	NC_021490	G	7	7	255667	255673	0 %	0 %	100 %	0 %	512556320
4613	NC_021490	GC	4	8	255698	255705	0 %	0 %	50 %	50 %	512556320
4614	NC_021490	GGT	2	6	255751	255756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556320
4615	NC_021490	TGCG	2	8	255801	255808	0 %	25 %	50 %	25 %	512556320
4616	NC_021490	GC	3	6	255871	255876	0 %	0 %	50 %	50 %	512556320
4617	NC_021490	TGCAG	2	10	255884	255893	20 %	20 %	40 %	20 %	512556320
4618	NC_021490	TGT	2	6	255900	255905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556320
4619	NC_021490	ATA	2	6	255927	255932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556320
4620	NC_021490	CG	3	6	255973	255978	0 %	0 %	50 %	50 %	512556320
4621	NC_021490	GGA	2	6	256096	256101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556320
4622	NC_021490	AGC	2	6	256108	256113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556320
4623	NC_021490	TGC	2	6	256153	256158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556320
4624	NC_021490	TGC	2	6	256222	256227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556320
4625	NC_021490	CGC	2	6	256318	256323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556320
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4652	NC_021490	GCA	2	6	257729	257734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556320
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4654	NC_021490	CG	3	6	257827	257832	0 %	0 %	50 %	50 %	512556320
4655	NC_021490	GAGG	2	8	257843	257850	25 %	0 %	75 %	0 %	512556320
4656	NC_021490	CG	3	6	257856	257861	0 %	0 %	50 %	50 %	512556320
4657	NC_021490	GAT	2	6	257870	257875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556320
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4675	NC_021490	CT	3	6	258704	258709	0 %	50 %	0 %	50 %	512556320
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4684	NC_021490	TATG	2	8	259304	259311	25 %	50 %	25 %	0 %	512556321
4685	NC_021490	T	6	6	259318	259323	0 %	100 %	0 %	0 %	512556321
4686	NC_021490	GA	3	6	259334	259339	50 %	0 %	50 %	0 %	512556321
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4688	NC_021490	TAC	2	6	259452	259457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556321
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4690	NC_021490	GCT	2	6	259478	259483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556321
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4692	NC_021490	GCAT	2	8	259611	259618	25 %	25 %	25 %	25 %	512556321
4693	NC_021490	GTA	2	6	259632	259637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556321
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4701	NC_021490	GTGC	2	8	260232	260239	0 %	25 %	50 %	25 %	512556321
4702	NC_021490	GTT	2	6	260277	260282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556321
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4728	NC_021490	GGTGC	2	10	261353	261362	0 %	20 %	60 %	20 %	512556322
4729	NC_021490	GGA	2	6	261380	261385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556322
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4731	NC_021490	GAAA	2	8	261439	261446	75 %	0 %	25 %	0 %	512556322
4732	NC_021490	TTGCG	2	10	261453	261462	0 %	40 %	40 %	20 %	512556322
4733	NC_021490	ACTT	2	8	261483	261490	25 %	50 %	0 %	25 %	512556322
4734	NC_021490	GC	3	6	261494	261499	0 %	0 %	50 %	50 %	512556322
4735	NC_021490	GAG	2	6	261554	261559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556322
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4747	NC_021490	TGAA	2	8	262597	262604	50 %	25 %	25 %	0 %	512556323
4748	NC_021490	GCT	2	6	262632	262637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556323
4749	NC_021490	TGA	2	6	262659	262664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556323
4750	NC_021490	TGA	2	6	262802	262807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556323
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4754	NC_021490	TGC	2	6	262875	262880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556323
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4860	NC_021490	GTT	2	6	268679	268684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556331
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4864	NC_021490	TTTTC	2	10	268741	268750	0 %	80 %	0 %	20 %	512556331
4865	NC_021490	TTA	2	6	268777	268782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556331
4866	NC_021490	CG	3	6	268783	268788	0 %	0 %	50 %	50 %	512556331
4867	NC_021490	TTTTTC	2	12	268896	268907	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	512556331
4868	NC_021490	ATG	2	6	268934	268939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556331
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4870	NC_021490	CTT	2	6	269039	269044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556331
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4996	NC_021490	GGC	2	6	277525	277530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556339
4997	NC_021490	CG	4	8	277538	277545	0 %	0 %	50 %	50 %	512556339
4998	NC_021490	CCT	2	6	277622	277627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556339
4999	NC_021490	T	6	6	278102	278107	0 %	100 %	0 %	0 %	512556340
5000	NC_021490	CAG	2	6	278164	278169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556340

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