MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 12405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021179	GAA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657417
2	NC_021179	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657417
3	NC_021179	ACA	2	6	538	543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657417
4	NC_021179	CTT	2	6	658	663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657417
5	NC_021179	AAG	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657417
6	NC_021179	TGT	2	6	945	950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657417
7	NC_021179	TTC	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657417
8	NC_021179	TTC	2	6	1078	1083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657417
9	NC_021179	TTC	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657417
10	NC_021179	GTT	2	6	1192	1197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657417
11	NC_021179	ACT	2	6	1249	1254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657417
12	NC_021179	TGG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657417
13	NC_021179	TTC	2	6	1506	1511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657418
14	NC_021179	TAT	2	6	1582	1587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657418
15	NC_021179	TAA	2	6	1621	1626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657418
16	NC_021179	GGA	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657418
17	NC_021179	AAG	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657418
18	NC_021179	GCT	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657419
19	NC_021179	TGT	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657419
20	NC_021179	CAA	2	6	1885	1890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657419
21	NC_021179	GAA	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657419
22	NC_021179	AGG	2	6	2009	2014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657419
23	NC_021179	AGA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657419
24	NC_021179	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657419
25	NC_021179	GCA	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657419
26	NC_021179	TCT	2	6	2337	2342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657419
27	NC_021179	ATC	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657419
28	NC_021179	GTT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657419
29	NC_021179	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657419
30	NC_021179	CAG	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657419
31	NC_021179	TTG	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657419
32	NC_021179	GAA	2	6	2562	2567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657419
33	NC_021179	GAA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657419
34	NC_021179	AGG	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657419
35	NC_021179	CAT	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657419
36	NC_021179	TGC	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657420
37	NC_021179	CAG	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657420
38	NC_021179	CTT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657420
39	NC_021179	TAT	2	6	3373	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657420
40	NC_021179	CTC	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657420
41	NC_021179	GAG	2	6	3445	3450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657420
42	NC_021179	GAT	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657420
43	NC_021179	ATG	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657420
44	NC_021179	AAT	2	6	3830	3835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657420
45	NC_021179	CGT	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657421
46	NC_021179	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657421
47	NC_021179	GAA	2	6	4247	4252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657421
48	NC_021179	GAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657422
49	NC_021179	GGA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657422
50	NC_021179	TTC	2	6	4875	4880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657422
51	NC_021179	TCT	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657422
52	NC_021179	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657422
53	NC_021179	ATT	2	6	5174	5179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657422
54	NC_021179	TAC	2	6	5206	5211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657422
55	NC_021179	ACG	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657422
56	NC_021179	GTA	2	6	5345	5350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657422
57	NC_021179	ATC	2	6	5579	5584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657422
58	NC_021179	TCT	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657422
59	NC_021179	GGA	2	6	5764	5769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657422
60	NC_021179	GTT	2	6	5801	5806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657422
61	NC_021179	GAT	2	6	5843	5848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657422
62	NC_021179	AGA	2	6	5893	5898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657422
63	NC_021179	GGA	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657422
64	NC_021179	GGC	2	6	6019	6024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657422
65	NC_021179	TTA	2	6	6033	6038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657422
66	NC_021179	TAA	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657422
67	NC_021179	ACT	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657422
68	NC_021179	TAT	2	6	6313	6318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657422
69	NC_021179	TTA	2	6	6390	6395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657422
70	NC_021179	AAC	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657422
71	NC_021179	AGA	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657422
72	NC_021179	GTG	2	6	6753	6758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657422
73	NC_021179	TAG	3	9	6798	6806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657422
74	NC_021179	TGT	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657423
75	NC_021179	GAG	2	6	6936	6941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657423
76	NC_021179	GGA	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657423
77	NC_021179	GGA	2	6	7135	7140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657424
78	NC_021179	CTT	2	6	7141	7146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657424
79	NC_021179	GAT	2	6	7188	7193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657424
80	NC_021179	TGC	2	6	7462	7467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657424
81	NC_021179	ACT	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657424
82	NC_021179	TGA	2	6	7618	7623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657424
83	NC_021179	GCA	2	6	7626	7631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657424
84	NC_021179	TCA	2	6	7801	7806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657424
85	NC_021179	TTG	2	6	7812	7817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657424
86	NC_021179	GAT	2	6	8049	8054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657424
87	NC_021179	TCA	2	6	8341	8346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657425
88	NC_021179	TCT	2	6	8402	8407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657425
89	NC_021179	AAG	2	6	8746	8751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657425
90	NC_021179	GCA	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657425
91	NC_021179	CTG	2	6	8785	8790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657425
92	NC_021179	ACG	2	6	8810	8815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657425
93	NC_021179	ATC	2	6	8917	8922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657425
94	NC_021179	GCA	2	6	8951	8956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657425
95	NC_021179	CGC	2	6	9010	9015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657425
96	NC_021179	CCT	2	6	9035	9040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657425
97	NC_021179	ACG	2	6	9118	9123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657425
98	NC_021179	TCT	2	6	9147	9152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657425
99	NC_021179	CGA	2	6	9174	9179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657425
100	NC_021179	TGT	2	6	9312	9317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657425
101	NC_021179	CCT	2	6	9357	9362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657425
102	NC_021179	CTT	2	6	9403	9408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657425
103	NC_021179	TCT	2	6	9542	9547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657425
104	NC_021179	GTG	2	6	9620	9625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657425
105	NC_021179	GCT	2	6	9832	9837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657425
106	NC_021179	GAT	2	6	9933	9938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657425
107	NC_021179	AGT	2	6	10144	10149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657425
108	NC_021179	CAC	2	6	10162	10167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657425
109	NC_021179	TCC	2	6	10498	10503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657426
110	NC_021179	CTG	2	6	10520	10525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657426
111	NC_021179	GTC	2	6	10540	10545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657426
112	NC_021179	AGC	2	6	10612	10617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657426
113	NC_021179	TTG	2	6	10636	10641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657426
114	NC_021179	GAC	2	6	10767	10772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657426
115	NC_021179	GAA	2	6	10796	10801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657426
116	NC_021179	TAC	2	6	10908	10913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657426
117	NC_021179	TGG	2	6	10953	10958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657426
118	NC_021179	TCG	2	6	11035	11040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657426
119	NC_021179	GCA	2	6	11200	11205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657426
120	NC_021179	CAT	2	6	11254	11259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657426
121	NC_021179	AAG	2	6	11362	11367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657426
122	NC_021179	TTG	2	6	11459	11464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657426
123	NC_021179	CTG	2	6	11465	11470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657426
124	NC_021179	CGC	2	6	11490	11495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657426
125	NC_021179	CAC	2	6	11513	11518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657426
126	NC_021179	CCT	2	6	11560	11565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657426
127	NC_021179	CGT	2	6	11586	11591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657426
128	NC_021179	GGT	2	6	11680	11685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657426
129	NC_021179	AGT	2	6	11803	11808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657426
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253	NC_021179	GTT	2	6	22836	22841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657432
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500	NC_021179	GTT	2	6	48320	48325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657452

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