MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 22549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_021179	TGT	2	6	131320	131325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657531
2503	NC_021179	GGC	2	6	131473	131478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657531
2504	NC_021179	TTGTCG	2	12	131505	131516	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	488657531
2505	NC_021179	AAG	2	6	131630	131635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657531
2506	NC_021179	GAG	2	6	131693	131698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657531
2507	NC_021179	CGC	2	6	131731	131736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657531
2508	NC_021179	CGT	2	6	132016	132021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657532
2509	NC_021179	TCCA	2	8	132088	132095	25 %	25 %	0 %	50 %	488657532
2510	NC_021179	CGT	2	6	132136	132141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657532
2511	NC_021179	CCG	2	6	132180	132185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657532
2512	NC_021179	CGCGC	2	10	132206	132215	0 %	0 %	40 %	60 %	488657532
2513	NC_021179	CCT	2	6	132235	132240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657532
2514	NC_021179	AAC	2	6	132308	132313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657532
2515	NC_021179	CG	3	6	132317	132322	0 %	0 %	50 %	50 %	488657532
2516	NC_021179	ATC	2	6	132339	132344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657532
2517	NC_021179	GCA	2	6	132414	132419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657532
2518	NC_021179	CA	3	6	132536	132541	50 %	0 %	0 %	50 %	488657532
2519	NC_021179	CAC	2	6	132670	132675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657532
2520	NC_021179	CCA	2	6	132690	132695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657532
2521	NC_021179	CTT	2	6	132888	132893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657533
2522	NC_021179	CGTG	2	8	132934	132941	0 %	25 %	50 %	25 %	488657533
2523	NC_021179	TCA	2	6	133047	133052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657533
2524	NC_021179	ATA	2	6	133056	133061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657533
2525	NC_021179	CT	3	6	133067	133072	0 %	50 %	0 %	50 %	488657533
2526	NC_021179	T	6	6	133099	133104	0 %	100 %	0 %	0 %	488657533
2527	NC_021179	TAC	2	6	133136	133141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657533
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2529	NC_021179	CGT	2	6	133259	133264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657533
2530	NC_021179	TCTTGA	2	12	133360	133371	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488657533
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2533	NC_021179	GTT	2	6	133520	133525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657533
2534	NC_021179	GCG	2	6	133551	133556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657533
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2536	NC_021179	GA	3	6	133752	133757	50 %	0 %	50 %	0 %	488657533
2537	NC_021179	ATT	2	6	133782	133787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657533
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2539	NC_021179	CTT	2	6	133832	133837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657533
2540	NC_021179	ATT	2	6	133839	133844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657533
2541	NC_021179	TGA	2	6	133870	133875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657533
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2543	NC_021179	AAC	2	6	134085	134090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657533
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2545	NC_021179	GAAC	2	8	134191	134198	50 %	0 %	25 %	25 %	488657533
2546	NC_021179	A	8	8	134221	134228	100 %	0 %	0 %	0 %	488657533
2547	NC_021179	ATT	2	6	134247	134252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657533
2548	NC_021179	TGCG	2	8	134331	134338	0 %	25 %	50 %	25 %	488657533
2549	NC_021179	TTA	2	6	134369	134374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657533
2550	NC_021179	CATT	2	8	134403	134410	25 %	50 %	0 %	25 %	488657533
2551	NC_021179	T	6	6	134437	134442	0 %	100 %	0 %	0 %	488657533
2552	NC_021179	CGA	3	9	134448	134456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657533
2553	NC_021179	ATT	2	6	134468	134473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657533
2554	NC_021179	AGC	2	6	134479	134484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657533
2555	NC_021179	GCGAT	2	10	134529	134538	20 %	20 %	40 %	20 %	488657533
2556	NC_021179	A	7	7	134665	134671	100 %	0 %	0 %	0 %	488657533
2557	NC_021179	GC	3	6	134704	134709	0 %	0 %	50 %	50 %	488657533
2558	NC_021179	GCAGAC	2	12	134711	134722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657533
2559	NC_021179	CA	3	6	134728	134733	50 %	0 %	0 %	50 %	488657533
2560	NC_021179	TGC	2	6	134734	134739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657533
2561	NC_021179	A	7	7	134744	134750	100 %	0 %	0 %	0 %	488657533
2562	NC_021179	TTCA	2	8	135078	135085	25 %	50 %	0 %	25 %	488657534
2563	NC_021179	TAA	2	6	135104	135109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657534
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2565	NC_021179	CAC	2	6	135190	135195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657534
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2567	NC_021179	GGTG	2	8	135335	135342	0 %	25 %	75 %	0 %	488657534
2568	NC_021179	AGT	2	6	135392	135397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657534
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2570	NC_021179	GC	3	6	135526	135531	0 %	0 %	50 %	50 %	488657534
2571	NC_021179	AGC	2	6	135699	135704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657534
2572	NC_021179	CAT	2	6	135753	135758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657534
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2575	NC_021179	CCT	2	6	135928	135933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657534
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2577	NC_021179	TCGT	2	8	135961	135968	0 %	50 %	25 %	25 %	488657534
2578	NC_021179	TGC	2	6	135994	135999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657534
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2581	NC_021179	CCGGAG	2	12	136207	136218	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	488657534
2582	NC_021179	CA	3	6	136296	136301	50 %	0 %	0 %	50 %	488657534
2583	NC_021179	GGAA	2	8	136355	136362	50 %	0 %	50 %	0 %	488657534
2584	NC_021179	AGA	2	6	136401	136406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657534
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2589	NC_021179	GAGT	2	8	136622	136629	25 %	25 %	50 %	0 %	488657534
2590	NC_021179	AGC	2	6	136647	136652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657534
2591	NC_021179	CACT	2	8	136698	136705	25 %	25 %	0 %	50 %	488657534
2592	NC_021179	AC	3	6	136782	136787	50 %	0 %	0 %	50 %	488657535
2593	NC_021179	GACA	2	8	136804	136811	50 %	0 %	25 %	25 %	488657535
2594	NC_021179	AG	3	6	136822	136827	50 %	0 %	50 %	0 %	488657535
2595	NC_021179	CCT	2	6	136875	136880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657535
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2598	NC_021179	CA	3	6	137009	137014	50 %	0 %	0 %	50 %	488657535
2599	NC_021179	GCT	2	6	137016	137021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657535
2600	NC_021179	CTGA	2	8	137022	137029	25 %	25 %	25 %	25 %	488657535
2601	NC_021179	GTCTT	2	10	137139	137148	0 %	60 %	20 %	20 %	488657535
2602	NC_021179	AGG	2	6	137158	137163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657535
2603	NC_021179	TCCT	2	8	137173	137180	0 %	50 %	0 %	50 %	488657535
2604	NC_021179	AAC	2	6	137190	137195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657535
2605	NC_021179	GCA	2	6	137204	137209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657535
2606	NC_021179	GC	4	8	137215	137222	0 %	0 %	50 %	50 %	488657535
2607	NC_021179	CGC	2	6	137269	137274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657535
2608	NC_021179	CAC	2	6	137295	137300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657535
2609	NC_021179	GC	3	6	137309	137314	0 %	0 %	50 %	50 %	488657535
2610	NC_021179	GC	3	6	137317	137322	0 %	0 %	50 %	50 %	488657535
2611	NC_021179	CTT	2	6	137331	137336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657535
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2618	NC_021179	GCA	2	6	137933	137938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657535
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2623	NC_021179	GC	3	6	138149	138154	0 %	0 %	50 %	50 %	488657537
2624	NC_021179	TCA	2	6	138232	138237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657537
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2747	NC_021179	TC	3	6	145124	145129	0 %	50 %	0 %	50 %	488657541
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2861	NC_021179	CCG	2	6	150910	150915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657550
2862	NC_021179	CTG	2	6	150935	150940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657550
2863	NC_021179	GTTTG	2	10	150951	150960	0 %	60 %	40 %	0 %	488657550
2864	NC_021179	G	6	6	150979	150984	0 %	0 %	100 %	0 %	488657550
2865	NC_021179	TCC	2	6	151009	151014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657550
2866	NC_021179	CCA	2	6	151034	151039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657550
2867	NC_021179	T	7	7	151040	151046	0 %	100 %	0 %	0 %	488657550
2868	NC_021179	GCGG	2	8	151143	151150	0 %	0 %	75 %	25 %	488657551
2869	NC_021179	GTC	2	6	151247	151252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657551
2870	NC_021179	CGGCTC	2	12	151270	151281	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	488657551
2871	NC_021179	T	6	6	151303	151308	0 %	100 %	0 %	0 %	488657551
2872	NC_021179	GC	3	6	151324	151329	0 %	0 %	50 %	50 %	488657551
2873	NC_021179	GCA	3	9	151373	151381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657551
2874	NC_021179	T	6	6	151384	151389	0 %	100 %	0 %	0 %	488657551
2875	NC_021179	CCG	2	6	151397	151402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657551
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2883	NC_021179	CTG	2	6	151970	151975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657554
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2885	NC_021179	CCT	2	6	152046	152051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657554
2886	NC_021179	CCA	2	6	152070	152075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657554
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2984	NC_021179	A	6	6	156887	156892	100 %	0 %	0 %	0 %	488657558
2985	NC_021179	GGGT	2	8	156957	156964	0 %	25 %	75 %	0 %	488657558
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2989	NC_021179	CG	4	8	157042	157049	0 %	0 %	50 %	50 %	488657558
2990	NC_021179	CCGC	2	8	157098	157105	0 %	0 %	25 %	75 %	488657558
2991	NC_021179	GC	3	6	157220	157225	0 %	0 %	50 %	50 %	488657558
2992	NC_021179	ACT	2	6	157373	157378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657559
2993	NC_021179	TAC	2	6	157390	157395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657559
2994	NC_021179	TGC	2	6	157464	157469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657559
2995	NC_021179	GCG	2	6	157475	157480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657559
2996	NC_021179	GAA	2	6	157507	157512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657559
2997	NC_021179	GA	4	8	157513	157520	50 %	0 %	50 %	0 %	488657559
2998	NC_021179	CCG	2	6	157553	157558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657559
2999	NC_021179	TG	4	8	157928	157935	0 %	50 %	50 %	0 %	488657560
3000	NC_021179	GAG	2	6	157938	157943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657560

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