MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 22549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_021179	TGCAC	2	10	1136933	1136942	20 %	20 %	20 %	40 %	488658474
22502	NC_021179	CAC	2	6	1136944	1136949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658474
22503	NC_021179	ATCCG	2	10	1137088	1137097	20 %	20 %	20 %	40 %	488658474
22504	NC_021179	T	6	6	1137111	1137116	0 %	100 %	0 %	0 %	488658474
22505	NC_021179	GTCA	2	8	1137351	1137358	25 %	25 %	25 %	25 %	488658475
22506	NC_021179	CG	3	6	1137434	1137439	0 %	0 %	50 %	50 %	488658475
22507	NC_021179	TCT	2	6	1137475	1137480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658475
22508	NC_021179	GC	3	6	1137527	1137532	0 %	0 %	50 %	50 %	488658475
22509	NC_021179	AAC	2	6	1137541	1137546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488658475
22510	NC_021179	ATA	2	6	1137585	1137590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488658475
22511	NC_021179	AGC	2	6	1137711	1137716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658475
22512	NC_021179	T	7	7	1137786	1137792	0 %	100 %	0 %	0 %	488658475
22513	NC_021179	CGTG	2	8	1138038	1138045	0 %	25 %	50 %	25 %	488658476
22514	NC_021179	GGAC	2	8	1138071	1138078	25 %	0 %	50 %	25 %	488658476
22515	NC_021179	GATT	2	8	1138110	1138117	25 %	50 %	25 %	0 %	488658476
22516	NC_021179	A	6	6	1138123	1138128	100 %	0 %	0 %	0 %	488658476
22517	NC_021179	CTA	2	6	1138137	1138142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658476
22518	NC_021179	TGA	2	6	1138160	1138165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658476
22519	NC_021179	TGG	2	6	1138199	1138204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488658476
22520	NC_021179	GCA	2	6	1138237	1138242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658476
22521	NC_021179	GAC	2	6	1138432	1138437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658476
22522	NC_021179	GC	3	6	1138468	1138473	0 %	0 %	50 %	50 %	488658476
22523	NC_021179	GTG	2	6	1138501	1138506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488658476
22524	NC_021179	CTT	2	6	1138509	1138514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658476
22525	NC_021179	AGC	2	6	1138677	1138682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658477
22526	NC_021179	TGC	2	6	1138706	1138711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658477
22527	NC_021179	TGCG	2	8	1138729	1138736	0 %	25 %	50 %	25 %	488658477
22528	NC_021179	TTC	2	6	1138802	1138807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658477
22529	NC_021179	GCT	2	6	1138840	1138845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658477
22530	NC_021179	ACC	2	6	1138902	1138907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658477
22531	NC_021179	GT	3	6	1138962	1138967	0 %	50 %	50 %	0 %	488658477
22532	NC_021179	CAGG	2	8	1138976	1138983	25 %	0 %	50 %	25 %	488658477
22533	NC_021179	ACG	2	6	1139010	1139015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658477
22534	NC_021179	CAA	2	6	1139047	1139052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488658477
22535	NC_021179	ACT	2	6	1139168	1139173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658477
22536	NC_021179	TGC	2	6	1139317	1139322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658477
22537	NC_021179	GTA	2	6	1139360	1139365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658477
22538	NC_021179	GTG	2	6	1139618	1139623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488658477
22539	NC_021179	A	6	6	1139631	1139636	100 %	0 %	0 %	0 %	488658477
22540	NC_021179	GC	3	6	1139659	1139664	0 %	0 %	50 %	50 %	488658477
22541	NC_021179	ATT	2	6	1139688	1139693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488658477
22542	NC_021179	T	6	6	1139712	1139717	0 %	100 %	0 %	0 %	488658478
22543	NC_021179	AGT	2	6	1139769	1139774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658478
22544	NC_021179	CGTG	2	8	1139867	1139874	0 %	25 %	50 %	25 %	488658478
22545	NC_021179	TGTC	2	8	1139883	1139890	0 %	50 %	25 %	25 %	488658478
22546	NC_021179	T	6	6	1139963	1139968	0 %	100 %	0 %	0 %	488658478
22547	NC_021179	CAAC	2	8	1140000	1140007	50 %	0 %	0 %	50 %	488658478
22548	NC_021179	C	7	7	1140081	1140087	0 %	0 %	0 %	100 %	488658478
22549	NC_021179	A	7	7	1140227	1140233	100 %	0 %	0 %	0 %	488658478

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.