MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 22549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021179	AGCG	2	8	27254	27261	25 %	0 %	50 %	25 %	488657434
502	NC_021179	T	6	6	27269	27274	0 %	100 %	0 %	0 %	488657434
503	NC_021179	TTGAGA	2	12	27322	27333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657434
504	NC_021179	CAGT	2	8	27345	27352	25 %	25 %	25 %	25 %	488657434
505	NC_021179	GT	4	8	27414	27421	0 %	50 %	50 %	0 %	488657434
506	NC_021179	GC	4	8	27456	27463	0 %	0 %	50 %	50 %	488657434
507	NC_021179	T	6	6	27493	27498	0 %	100 %	0 %	0 %	488657434
508	NC_021179	GTG	2	6	27612	27617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657435
509	NC_021179	GTT	2	6	27659	27664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657435
510	NC_021179	TGG	2	6	27676	27681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657435
511	NC_021179	TGG	2	6	27686	27691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657435
512	NC_021179	TATTT	2	10	27711	27720	20 %	80 %	0 %	0 %	488657435
513	NC_021179	CTGCG	2	10	27777	27786	0 %	20 %	40 %	40 %	488657435
514	NC_021179	TGCG	2	8	27793	27800	0 %	25 %	50 %	25 %	488657435
515	NC_021179	GT	4	8	27808	27815	0 %	50 %	50 %	0 %	488657435
516	NC_021179	CATC	2	8	27822	27829	25 %	25 %	0 %	50 %	488657435
517	NC_021179	T	6	6	27833	27838	0 %	100 %	0 %	0 %	488657435
518	NC_021179	GGT	2	6	27859	27864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657435
519	NC_021179	GTA	2	6	27933	27938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657435
520	NC_021179	GT	3	6	28049	28054	0 %	50 %	50 %	0 %	488657435
521	NC_021179	AGTG	2	8	28055	28062	25 %	25 %	50 %	0 %	488657435
522	NC_021179	ATG	2	6	28101	28106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657435
523	NC_021179	T	6	6	28111	28116	0 %	100 %	0 %	0 %	488657435
524	NC_021179	TTA	2	6	28132	28137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657435
525	NC_021179	AT	4	8	28142	28149	50 %	50 %	0 %	0 %	488657435
526	NC_021179	TCA	2	6	28203	28208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657435
527	NC_021179	T	6	6	28251	28256	0 %	100 %	0 %	0 %	488657435
528	NC_021179	G	6	6	28268	28273	0 %	0 %	100 %	0 %	488657435
529	NC_021179	T	6	6	28355	28360	0 %	100 %	0 %	0 %	488657435
530	NC_021179	CAG	2	6	28421	28426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657435
531	NC_021179	TTTG	2	8	28439	28446	0 %	75 %	25 %	0 %	488657435
532	NC_021179	TGA	2	6	28486	28491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657435
533	NC_021179	GT	3	6	28495	28500	0 %	50 %	50 %	0 %	488657435
534	NC_021179	TG	3	6	28510	28515	0 %	50 %	50 %	0 %	488657435
535	NC_021179	GTG	2	6	28692	28697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657435
536	NC_021179	TGA	2	6	28735	28740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657435
537	NC_021179	GGT	2	6	28884	28889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657435
538	NC_021179	GCT	2	6	29131	29136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657436
539	NC_021179	TCC	2	6	29157	29162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657436
540	NC_021179	GC	3	6	29215	29220	0 %	0 %	50 %	50 %	488657436
541	NC_021179	GAT	2	6	29254	29259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657436
542	NC_021179	ATC	2	6	29308	29313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657436
543	NC_021179	AAC	2	6	29323	29328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657436
544	NC_021179	A	7	7	29335	29341	100 %	0 %	0 %	0 %	488657436
545	NC_021179	A	6	6	29447	29452	100 %	0 %	0 %	0 %	488657436
546	NC_021179	TCT	2	6	29476	29481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657436
547	NC_021179	GAA	2	6	29550	29555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657436
548	NC_021179	TC	3	6	29586	29591	0 %	50 %	0 %	50 %	488657436
549	NC_021179	AG	3	6	29866	29871	50 %	0 %	50 %	0 %	488657437
550	NC_021179	ACC	2	6	29943	29948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657437
551	NC_021179	TGCGC	2	10	29965	29974	0 %	20 %	40 %	40 %	488657437
552	NC_021179	AGT	2	6	29979	29984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657437
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555	NC_021179	CAC	2	6	30319	30324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657437
556	NC_021179	T	6	6	30337	30342	0 %	100 %	0 %	0 %	488657437
557	NC_021179	TC	3	6	30395	30400	0 %	50 %	0 %	50 %	488657437
558	NC_021179	AGC	2	6	30462	30467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657437
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560	NC_021179	TGT	2	6	30537	30542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657437
561	NC_021179	GTG	2	6	30566	30571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657437
562	NC_021179	TG	3	6	30635	30640	0 %	50 %	50 %	0 %	488657437
563	NC_021179	TCCAG	2	10	30791	30800	20 %	20 %	20 %	40 %	488657437
564	NC_021179	TTC	2	6	30803	30808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657437
565	NC_021179	TGC	2	6	30818	30823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657437
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567	NC_021179	AAAG	2	8	30939	30946	75 %	0 %	25 %	0 %	488657437
568	NC_021179	CA	3	6	30961	30966	50 %	0 %	0 %	50 %	488657437
569	NC_021179	GT	3	6	31054	31059	0 %	50 %	50 %	0 %	488657437
570	NC_021179	CTA	2	6	31105	31110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657437
571	NC_021179	GCGG	2	8	31115	31122	0 %	0 %	75 %	25 %	488657437
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574	NC_021179	CTG	2	6	31249	31254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657437
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578	NC_021179	TGGGG	2	10	31349	31358	0 %	20 %	80 %	0 %	488657437
579	NC_021179	GTT	2	6	31366	31371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657437
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581	NC_021179	TGTC	2	8	31421	31428	0 %	50 %	25 %	25 %	488657437
582	NC_021179	GC	3	6	31460	31465	0 %	0 %	50 %	50 %	488657437
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586	NC_021179	GTCTGG	2	12	31541	31552	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	488657437
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589	NC_021179	GA	3	6	31733	31738	50 %	0 %	50 %	0 %	488657437
590	NC_021179	GCG	2	6	31754	31759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657437
591	NC_021179	CAA	2	6	31828	31833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657437
592	NC_021179	TGC	2	6	31884	31889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657437
593	NC_021179	A	8	8	31907	31914	100 %	0 %	0 %	0 %	488657437
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597	NC_021179	GTAC	2	8	32144	32151	25 %	25 %	25 %	25 %	488657437
598	NC_021179	G	6	6	32175	32180	0 %	0 %	100 %	0 %	488657437
599	NC_021179	G	6	6	32183	32188	0 %	0 %	100 %	0 %	488657437
600	NC_021179	T	6	6	32303	32308	0 %	100 %	0 %	0 %	488657437
601	NC_021179	CCT	2	6	32361	32366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657437
602	NC_021179	GT	3	6	32402	32407	0 %	50 %	50 %	0 %	488657437
603	NC_021179	AC	3	6	32443	32448	50 %	0 %	0 %	50 %	488657437
604	NC_021179	TTCA	2	8	32456	32463	25 %	50 %	0 %	25 %	488657437
605	NC_021179	GTTG	2	8	32485	32492	0 %	50 %	50 %	0 %	488657437
606	NC_021179	CTT	2	6	32518	32523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657437
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609	NC_021179	CTT	2	6	32767	32772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657437
610	NC_021179	CAAA	2	8	32794	32801	75 %	0 %	0 %	25 %	488657437
611	NC_021179	T	7	7	32845	32851	0 %	100 %	0 %	0 %	488657437
612	NC_021179	GAA	2	6	32920	32925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657437
613	NC_021179	GC	3	6	32987	32992	0 %	0 %	50 %	50 %	488657438
614	NC_021179	AG	3	6	33099	33104	50 %	0 %	50 %	0 %	488657438
615	NC_021179	AG	3	6	33108	33113	50 %	0 %	50 %	0 %	488657438
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618	NC_021179	GCA	2	6	33154	33159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657438
619	NC_021179	T	6	6	33164	33169	0 %	100 %	0 %	0 %	488657438
620	NC_021179	ATC	2	6	33222	33227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657438
621	NC_021179	TGCG	2	8	33241	33248	0 %	25 %	50 %	25 %	488657438
622	NC_021179	T	7	7	33271	33277	0 %	100 %	0 %	0 %	488657438
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624	NC_021179	CG	3	6	33309	33314	0 %	0 %	50 %	50 %	488657438
625	NC_021179	GCA	2	6	33422	33427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657438
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629	NC_021179	AGG	2	6	33574	33579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657438
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