MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 78359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019902	GGCG	2	8	211753	211760	0 %	0 %	75 %	25 %	430759554
4002	NC_019902	TCG	2	6	211785	211790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759554
4003	NC_019902	GCG	2	6	211831	211836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759554
4004	NC_019902	TGC	2	6	211837	211842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759554
4005	NC_019902	GCG	2	6	211896	211901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759554
4006	NC_019902	GGGCC	2	10	211927	211936	0 %	0 %	60 %	40 %	430759554
4007	NC_019902	CGA	2	6	211984	211989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759554
4008	NC_019902	CGG	2	6	212044	212049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759554
4009	NC_019902	TCGG	2	8	212065	212072	0 %	25 %	50 %	25 %	430759554
4010	NC_019902	GAA	2	6	212096	212101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759554
4011	NC_019902	CCGT	2	8	212105	212112	0 %	25 %	25 %	50 %	430759554
4012	NC_019902	TCGC	2	8	212196	212203	0 %	25 %	25 %	50 %	430759554
4013	NC_019902	GGC	2	6	212408	212413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759555
4014	NC_019902	CGCCAG	2	12	212459	212470	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	430759555
4015	NC_019902	GAGG	2	8	212511	212518	25 %	0 %	75 %	0 %	430759555
4016	NC_019902	GAT	2	6	212543	212548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759555
4017	NC_019902	GGC	2	6	212678	212683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759555
4018	NC_019902	CAG	2	6	212690	212695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759555
4019	NC_019902	CCG	2	6	212703	212708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759555
4020	NC_019902	GTA	2	6	212732	212737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759555
4021	NC_019902	ATG	2	6	212844	212849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759555
4022	NC_019902	CGT	2	6	212875	212880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759555
4023	NC_019902	CG	4	8	212941	212948	0 %	0 %	50 %	50 %	430759555
4024	NC_019902	TGCG	2	8	213007	213014	0 %	25 %	50 %	25 %	430759555
4025	NC_019902	GCG	2	6	213018	213023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759555
4026	NC_019902	GC	3	6	213065	213070	0 %	0 %	50 %	50 %	430759555
4027	NC_019902	GGC	2	6	213071	213076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759555
4028	NC_019902	CAG	2	6	213146	213151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759555
4029	NC_019902	CGG	2	6	213202	213207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759555
4030	NC_019902	CCG	2	6	213217	213222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759555
4031	NC_019902	CGG	2	6	213262	213267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759555
4032	NC_019902	TCG	2	6	213324	213329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759555
4033	NC_019902	GC	7	14	213349	213362	0 %	0 %	50 %	50 %	430759555
4034	NC_019902	GTC	2	6	213479	213484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759555
4035	NC_019902	GGCC	2	8	213502	213509	0 %	0 %	50 %	50 %	430759555
4036	NC_019902	GGC	2	6	213529	213534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759555
4037	NC_019902	CAGCGC	2	12	213551	213562	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	430759555
4038	NC_019902	GAA	2	6	213565	213570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759555
4039	NC_019902	AGCG	2	8	213626	213633	25 %	0 %	50 %	25 %	430759555
4040	NC_019902	AGG	2	6	213663	213668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759555
4041	NC_019902	GGT	2	6	213697	213702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759555
4042	NC_019902	CG	3	6	213719	213724	0 %	0 %	50 %	50 %	430759555
4043	NC_019902	CCAG	2	8	213754	213761	25 %	0 %	25 %	50 %	430759555
4044	NC_019902	GCG	2	6	213797	213802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759555
4045	NC_019902	GTC	2	6	213877	213882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759555
4046	NC_019902	CCA	2	6	213961	213966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759555
4047	NC_019902	CCT	2	6	213970	213975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759555
4048	NC_019902	CCGT	2	8	214035	214042	0 %	25 %	25 %	50 %	430759555
4049	NC_019902	CCT	2	6	214078	214083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759555
4050	NC_019902	GCA	2	6	214111	214116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759555
4051	NC_019902	GC	3	6	214190	214195	0 %	0 %	50 %	50 %	430759555
4052	NC_019902	GCA	2	6	214219	214224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759555
4053	NC_019902	TCG	2	6	214269	214274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759555
4054	NC_019902	GC	3	6	214285	214290	0 %	0 %	50 %	50 %	430759555
4055	NC_019902	GCA	2	6	214383	214388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759555
4056	NC_019902	GC	3	6	214396	214401	0 %	0 %	50 %	50 %	430759555
4057	NC_019902	GACC	2	8	214609	214616	25 %	0 %	25 %	50 %	430759556
4058	NC_019902	CCG	2	6	214688	214693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759556
4059	NC_019902	CGG	2	6	214706	214711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759556
4060	NC_019902	CGG	2	6	214718	214723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759556
4061	NC_019902	GGT	2	6	214728	214733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759556
4062	NC_019902	GCCG	2	8	214755	214762	0 %	0 %	50 %	50 %	430759556
4063	NC_019902	TGG	2	6	214852	214857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759556
4064	NC_019902	CGT	2	6	214897	214902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759556
4065	NC_019902	ACC	2	6	214911	214916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759556
4066	NC_019902	GCCG	2	8	214939	214946	0 %	0 %	50 %	50 %	430759556
4067	NC_019902	CGGT	2	8	215001	215008	0 %	25 %	50 %	25 %	430759556
4068	NC_019902	CAG	2	6	215042	215047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759556
4069	NC_019902	GGC	2	6	215101	215106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759557
4070	NC_019902	CCAGCG	2	12	215137	215148	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	430759557
4071	NC_019902	ACC	3	9	215157	215165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759557
4072	NC_019902	GTGTCG	2	12	215232	215243	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	430759557
4073	NC_019902	GGTCG	2	10	215264	215273	0 %	20 %	60 %	20 %	430759557
4074	NC_019902	CCGT	2	8	215348	215355	0 %	25 %	25 %	50 %	430759557
4075	NC_019902	GC	4	8	215387	215394	0 %	0 %	50 %	50 %	430759557
4076	NC_019902	GGT	2	6	215401	215406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759557
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4078	NC_019902	GCA	2	6	215653	215658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759557
4079	NC_019902	CAG	3	9	215681	215689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759557
4080	NC_019902	GC	4	8	215699	215706	0 %	0 %	50 %	50 %	430759557
4081	NC_019902	GCCGC	2	10	215714	215723	0 %	0 %	40 %	60 %	430759557
4082	NC_019902	TGG	2	6	215737	215742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759557
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4084	NC_019902	G	8	8	215827	215834	0 %	0 %	100 %	0 %	430759558
4085	NC_019902	GCC	2	6	215940	215945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759558
4086	NC_019902	TGCC	2	8	215947	215954	0 %	25 %	25 %	50 %	430759558
4087	NC_019902	TCGG	2	8	215968	215975	0 %	25 %	50 %	25 %	430759558
4088	NC_019902	CGG	2	6	215994	215999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759558
4089	NC_019902	CCT	2	6	216024	216029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759558
4090	NC_019902	GCG	2	6	216030	216035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759558
4091	NC_019902	GCCAGC	2	12	216137	216148	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	430759558
4092	NC_019902	CCGG	2	8	216165	216172	0 %	0 %	50 %	50 %	430759558
4093	NC_019902	CGGT	2	8	216236	216243	0 %	25 %	50 %	25 %	430759558
4094	NC_019902	GC	3	6	216306	216311	0 %	0 %	50 %	50 %	430759558
4095	NC_019902	CGGT	2	8	216442	216449	0 %	25 %	50 %	25 %	430759558
4096	NC_019902	CGATG	2	10	216468	216477	20 %	20 %	40 %	20 %	430759558
4097	NC_019902	CGAACG	2	12	216504	216515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759558
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4100	NC_019902	CGAT	2	8	216718	216725	25 %	25 %	25 %	25 %	430759559
4101	NC_019902	CGAG	2	8	216743	216750	25 %	0 %	50 %	25 %	430759559
4102	NC_019902	CGA	2	6	216791	216796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759559
4103	NC_019902	GCC	2	6	216807	216812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759559
4104	NC_019902	CAG	2	6	216870	216875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759559
4105	NC_019902	GCA	2	6	216887	216892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759559
4106	NC_019902	CGG	2	6	216898	216903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759559
4107	NC_019902	CGC	2	6	216936	216941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759559
4108	NC_019902	CGT	2	6	216950	216955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759559
4109	NC_019902	CGA	2	6	217013	217018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759559
4110	NC_019902	GCA	2	6	217082	217087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759559
4111	NC_019902	CCG	2	6	217111	217116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759559
4112	NC_019902	CGA	2	6	217163	217168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759559
4113	NC_019902	CGCC	2	8	217196	217203	0 %	0 %	25 %	75 %	430759559
4114	NC_019902	CG	3	6	217307	217312	0 %	0 %	50 %	50 %	430759559
4115	NC_019902	TGA	2	6	217322	217327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759559
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4117	NC_019902	TGA	2	6	217403	217408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759559
4118	NC_019902	G	6	6	217478	217483	0 %	0 %	100 %	0 %	430759559
4119	NC_019902	GCG	2	6	217504	217509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759559
4120	NC_019902	GCA	2	6	217516	217521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759559
4121	NC_019902	AGC	2	6	217537	217542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759559
4122	NC_019902	CGGC	2	8	217600	217607	0 %	0 %	50 %	50 %	430759559
4123	NC_019902	GAT	2	6	217611	217616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759559
4124	NC_019902	CCG	2	6	217884	217889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759560
4125	NC_019902	TGC	2	6	217958	217963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759560
4126	NC_019902	CG	3	6	218001	218006	0 %	0 %	50 %	50 %	430759560
4127	NC_019902	TCG	2	6	218045	218050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759560
4128	NC_019902	GC	3	6	218076	218081	0 %	0 %	50 %	50 %	430759560
4129	NC_019902	GTT	2	6	218110	218115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759560
4130	NC_019902	GCT	2	6	218352	218357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759560
4131	NC_019902	AGC	2	6	218444	218449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759560
4132	NC_019902	TGCG	2	8	218496	218503	0 %	25 %	50 %	25 %	430759560
4133	NC_019902	TCC	2	6	218504	218509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759560
4134	NC_019902	CGC	2	6	218548	218553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759560
4135	NC_019902	TGA	2	6	218556	218561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759560
4136	NC_019902	GTC	2	6	218578	218583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759560
4137	NC_019902	GTGCG	2	10	218638	218647	0 %	20 %	60 %	20 %	430759560
4138	NC_019902	TCC	2	6	218654	218659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759560
4139	NC_019902	GCC	2	6	218668	218673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759560
4140	NC_019902	TGA	2	6	218703	218708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759560
4141	NC_019902	TTC	2	6	218710	218715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759560
4142	NC_019902	GCCTT	2	10	218780	218789	0 %	40 %	20 %	40 %	430759560
4143	NC_019902	TCC	2	6	218906	218911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759560
4144	NC_019902	CG	3	6	218917	218922	0 %	0 %	50 %	50 %	430759560
4145	NC_019902	GC	3	6	219017	219022	0 %	0 %	50 %	50 %	430759560
4146	NC_019902	GC	3	6	219038	219043	0 %	0 %	50 %	50 %	430759560
4147	NC_019902	CTG	2	6	219568	219573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759561
4148	NC_019902	CTGG	2	8	219589	219596	0 %	25 %	50 %	25 %	430759561
4149	NC_019902	GCG	2	6	219602	219607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759561
4150	NC_019902	GCG	2	6	219627	219632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759561
4151	NC_019902	CGG	2	6	219702	219707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759561
4152	NC_019902	CGC	2	6	219730	219735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759561
4153	NC_019902	GGC	2	6	219774	219779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759561
4154	NC_019902	GCGCC	2	10	219813	219822	0 %	0 %	40 %	60 %	430759561
4155	NC_019902	TCT	2	6	219900	219905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759561
4156	NC_019902	GAT	2	6	219946	219951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759561
4157	NC_019902	GAT	2	6	219988	219993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759561
4158	NC_019902	C	6	6	220016	220021	0 %	0 %	0 %	100 %	430759561
4159	NC_019902	CCAGTC	2	12	220072	220083	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	430759561
4160	NC_019902	CGC	2	6	220145	220150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759561
4161	NC_019902	CAG	2	6	220300	220305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759561
4162	NC_019902	AGG	2	6	220349	220354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759561
4163	NC_019902	GCG	3	9	220677	220685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759562
4164	NC_019902	TCT	2	6	220718	220723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759562
4165	NC_019902	GATG	2	8	220850	220857	25 %	25 %	50 %	0 %	430759562
4166	NC_019902	C	6	6	221268	221273	0 %	0 %	0 %	100 %	430759563
4167	NC_019902	TGG	2	6	221316	221321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759563
4168	NC_019902	TGCG	2	8	221346	221353	0 %	25 %	50 %	25 %	430759563
4169	NC_019902	ACG	2	6	221379	221384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759563
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4179	NC_019902	CTG	2	6	221816	221821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759563
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4183	NC_019902	TTG	2	6	222017	222022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759563
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4193	NC_019902	GCCG	2	8	222451	222458	0 %	0 %	50 %	50 %	430759563
4194	NC_019902	GTC	2	6	222479	222484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759563
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4200	NC_019902	CGC	2	6	222807	222812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759564
4201	NC_019902	GTC	2	6	222822	222827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759564
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4224	NC_019902	GAAGAT	2	12	223604	223615	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	430759566
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4228	NC_019902	GAT	2	6	223877	223882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759566
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4230	NC_019902	CAC	2	6	223928	223933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759566
4231	NC_019902	GCA	2	6	223987	223992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759566
4232	NC_019902	CAG	2	6	223997	224002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759566
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4234	NC_019902	CG	3	6	224123	224128	0 %	0 %	50 %	50 %	430759566
4235	NC_019902	GTCG	2	8	224179	224186	0 %	25 %	50 %	25 %	430759566
4236	NC_019902	GCT	2	6	224204	224209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759566
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4244	NC_019902	GAT	2	6	224522	224527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759566
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4365	NC_019902	ACA	2	6	230226	230231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430759570
4366	NC_019902	GT	3	6	230259	230264	0 %	50 %	50 %	0 %	430759570
4367	NC_019902	GCG	2	6	230268	230273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759570
4368	NC_019902	CAT	2	6	230314	230319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759570
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4370	NC_019902	CTG	2	6	230357	230362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759570
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4373	NC_019902	CG	3	6	230419	230424	0 %	0 %	50 %	50 %	430759570
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4375	NC_019902	CG	3	6	230495	230500	0 %	0 %	50 %	50 %	430759570
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4383	NC_019902	GCA	2	6	230698	230703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759570
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4385	NC_019902	ACT	2	6	230853	230858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759570
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4392	NC_019902	CCTGGT	2	12	231347	231358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759571
4393	NC_019902	CGG	2	6	231359	231364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759571
4394	NC_019902	GGT	2	6	231413	231418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759571
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4397	NC_019902	GGT	2	6	231749	231754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759571
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4432	NC_019902	ATCCTG	2	12	233409	233420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	430759573
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4484	NC_019902	CGT	2	6	235661	235666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759573
4485	NC_019902	CAA	2	6	235676	235681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430759573
4486	NC_019902	CG	4	8	235736	235743	0 %	0 %	50 %	50 %	430759573
4487	NC_019902	AAC	2	6	235746	235751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430759573
4488	NC_019902	GAA	2	6	235794	235799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759573
4489	NC_019902	CGC	2	6	235811	235816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759573
4490	NC_019902	GCT	2	6	235847	235852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759573
4491	NC_019902	CGG	2	6	235856	235861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759573
4492	NC_019902	ACC	2	6	235866	235871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759573
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4494	NC_019902	GGT	2	6	235922	235927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759573
4495	NC_019902	CG	3	6	235947	235952	0 %	0 %	50 %	50 %	430759573
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4498	NC_019902	TGC	2	6	236215	236220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759573
4499	NC_019902	CGA	2	6	236225	236230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759573
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