MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 78359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019902	CTG	2	6	165252	165257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3002	NC_019902	CGA	2	6	165284	165289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3003	NC_019902	GTG	2	6	165300	165305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759505
3004	NC_019902	ACC	2	6	165312	165317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759505
3005	NC_019902	CGAGCG	2	12	165389	165400	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430759505
3006	NC_019902	CTG	2	6	165402	165407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3007	NC_019902	GTC	2	6	165465	165470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3008	NC_019902	CG	3	6	165474	165479	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3009	NC_019902	G	6	6	165481	165486	0 %	0 %	100 %	0 %	430759505
3010	NC_019902	CTG	3	9	165501	165509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3011	NC_019902	GA	3	6	165706	165711	50 %	0 %	50 %	0 %	430759505
3012	NC_019902	CGT	2	6	165734	165739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3013	NC_019902	TGC	2	6	165745	165750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3014	NC_019902	GTG	2	6	165771	165776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759505
3015	NC_019902	TCA	2	6	165785	165790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759505
3016	NC_019902	CTG	2	6	165803	165808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3017	NC_019902	TCA	2	6	165853	165858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759505
3018	NC_019902	GCG	2	6	165878	165883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759505
3019	NC_019902	CG	3	6	165894	165899	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3020	NC_019902	CCGG	2	8	165962	165969	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3021	NC_019902	CCCGCA	2	12	166040	166051	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	430759505
3022	NC_019902	CTC	2	6	166062	166067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759505
3023	NC_019902	GGA	2	6	166127	166132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759505
3024	NC_019902	TCCAG	2	10	166294	166303	20 %	20 %	20 %	40 %	430759505
3025	NC_019902	CTG	2	6	166305	166310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3026	NC_019902	CG	3	6	166344	166349	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3027	NC_019902	CG	3	6	166402	166407	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3028	NC_019902	CGC	2	6	166420	166425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759505
3029	NC_019902	AGG	2	6	166426	166431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759505
3030	NC_019902	CGC	2	6	166472	166477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759505
3031	NC_019902	CG	3	6	166559	166564	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3032	NC_019902	GCCG	2	8	166613	166620	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3033	NC_019902	CTG	2	6	166626	166631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3034	NC_019902	TCG	2	6	166648	166653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3035	NC_019902	GGT	2	6	166679	166684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759505
3036	NC_019902	ACG	2	6	166693	166698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759505
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3038	NC_019902	CAC	2	6	166731	166736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759505
3039	NC_019902	ACC	2	6	166794	166799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759505
3040	NC_019902	CCG	2	6	166894	166899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759505
3041	NC_019902	GCT	2	6	166913	166918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3042	NC_019902	ACG	2	6	166960	166965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3043	NC_019902	TCGC	2	8	166974	166981	0 %	25 %	25 %	50 %	430759505
3044	NC_019902	CG	3	6	167042	167047	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3045	NC_019902	TCGA	2	8	167049	167056	25 %	25 %	25 %	25 %	430759505
3046	NC_019902	GC	3	6	167061	167066	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3047	NC_019902	CGG	2	6	167116	167121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759505
3048	NC_019902	CGA	2	6	167153	167158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759505
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3050	NC_019902	TGC	2	6	167194	167199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3051	NC_019902	GCT	2	6	167296	167301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3052	NC_019902	GCCG	2	8	167308	167315	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3053	NC_019902	GGGC	2	8	167377	167384	0 %	0 %	75 %	25 %	430759505
3054	NC_019902	GCG	2	6	167390	167395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759505
3055	NC_019902	CGC	2	6	167443	167448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759506
3056	NC_019902	CTT	2	6	167530	167535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759506
3057	NC_019902	TGGC	2	8	167593	167600	0 %	25 %	50 %	25 %	430759506
3058	NC_019902	GCG	2	6	167659	167664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759506
3059	NC_019902	TGA	2	6	167685	167690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759506
3060	NC_019902	GGGCG	2	10	167713	167722	0 %	0 %	80 %	20 %	430759506
3061	NC_019902	TGG	3	9	167757	167765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759506
3062	NC_019902	GCCT	2	8	167800	167807	0 %	25 %	25 %	50 %	430759506
3063	NC_019902	ATC	2	6	167852	167857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759506
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3069	NC_019902	CGG	2	6	168329	168334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759507
3070	NC_019902	TGC	2	6	168384	168389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759508
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3072	NC_019902	GC	4	8	168445	168452	0 %	0 %	50 %	50 %	430759508
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3075	NC_019902	TCG	2	6	168543	168548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759508
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3082	NC_019902	GAC	2	6	168893	168898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759508
3083	NC_019902	GC	5	10	168922	168931	0 %	0 %	50 %	50 %	430759508
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3087	NC_019902	CAGC	2	8	169133	169140	25 %	0 %	25 %	50 %	430759508
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3089	NC_019902	GC	3	6	169225	169230	0 %	0 %	50 %	50 %	430759508
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3101	NC_019902	ACGG	2	8	169952	169959	25 %	0 %	50 %	25 %	430759510
3102	NC_019902	CAG	2	6	170010	170015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759510
3103	NC_019902	CGC	2	6	170024	170029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759510
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3105	NC_019902	TGA	2	6	170150	170155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759510
3106	NC_019902	GGC	2	6	170177	170182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759510
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3108	NC_019902	GCT	2	6	170318	170323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759510
3109	NC_019902	CGG	2	6	170330	170335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759510
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3111	NC_019902	TTG	2	6	170415	170420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759510
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3117	NC_019902	GGCC	2	8	170600	170607	0 %	0 %	50 %	50 %	430759510
3118	NC_019902	CCG	3	9	170630	170638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759510
3119	NC_019902	GCC	2	6	170660	170665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759510
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3121	NC_019902	CGC	2	6	170699	170704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759510
3122	NC_019902	ACCT	2	8	170739	170746	25 %	25 %	0 %	50 %	430759510
3123	NC_019902	CGG	2	6	170921	170926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759510
3124	NC_019902	TCC	2	6	170944	170949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759510
3125	NC_019902	GC	3	6	170960	170965	0 %	0 %	50 %	50 %	430759510
3126	NC_019902	CAG	2	6	171057	171062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759510
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3129	NC_019902	TGC	2	6	171142	171147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759510
3130	NC_019902	GTC	2	6	171183	171188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759510
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3132	NC_019902	GTC	2	6	171281	171286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759511
3133	NC_019902	TGC	2	6	171302	171307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759511
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3137	NC_019902	TGA	2	6	171568	171573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759511
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3141	NC_019902	CCT	2	6	171766	171771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759511
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3145	NC_019902	CGT	2	6	171916	171921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759511
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3149	NC_019902	C	6	6	172083	172088	0 %	0 %	0 %	100 %	430759511
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3153	NC_019902	CGT	2	6	172375	172380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759511
3154	NC_019902	CGT	2	6	172456	172461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759511
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3159	NC_019902	CTG	2	6	172646	172651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759511
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3223	NC_019902	GATG	2	8	177804	177811	25 %	25 %	50 %	0 %	430759517
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3226	NC_019902	CCGGCG	2	12	177925	177936	0 %	0 %	50 %	50 %	430759517
3227	NC_019902	CGA	2	6	177951	177956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759517
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3230	NC_019902	CGA	2	6	177996	178001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759517
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3233	NC_019902	GACC	2	8	178098	178105	25 %	0 %	25 %	50 %	430759517
3234	NC_019902	CGA	2	6	178107	178112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759517
3235	NC_019902	CGA	2	6	178215	178220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759517
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3237	NC_019902	CGG	2	6	178298	178303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759517
3238	NC_019902	CGA	2	6	178305	178310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759517
3239	NC_019902	CTCC	2	8	178334	178341	0 %	25 %	0 %	75 %	430759517
3240	NC_019902	GCG	2	6	178358	178363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759517
3241	NC_019902	CGAGGG	2	12	178401	178412	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	430759517
3242	NC_019902	CGA	2	6	178542	178547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759517
3243	NC_019902	TCGCT	2	10	178574	178583	0 %	40 %	20 %	40 %	430759517
3244	NC_019902	TCC	2	6	178615	178620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759518
3245	NC_019902	GC	3	6	178630	178635	0 %	0 %	50 %	50 %	430759518
3246	NC_019902	GGT	2	6	178657	178662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759518
3247	NC_019902	CG	3	6	178664	178669	0 %	0 %	50 %	50 %	430759518
3248	NC_019902	TGC	2	6	178699	178704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759518
3249	NC_019902	GC	3	6	178703	178708	0 %	0 %	50 %	50 %	430759518
3250	NC_019902	GGA	2	6	178714	178719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759518
3251	NC_019902	GCGG	2	8	178733	178740	0 %	0 %	75 %	25 %	430759518
3252	NC_019902	CCGC	2	8	178759	178766	0 %	0 %	25 %	75 %	430759518
3253	NC_019902	AGC	2	6	178770	178775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759518
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3255	NC_019902	GC	3	6	179019	179024	0 %	0 %	50 %	50 %	430759518
3256	NC_019902	CCGGG	2	10	179108	179117	0 %	0 %	60 %	40 %	430759518
3257	NC_019902	GCA	2	6	179176	179181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759518
3258	NC_019902	TG	3	6	179236	179241	0 %	50 %	50 %	0 %	430759518
3259	NC_019902	GCC	3	9	179273	179281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759518
3260	NC_019902	GGTGT	2	10	179303	179312	0 %	40 %	60 %	0 %	430759518
3261	NC_019902	GCGA	2	8	179314	179321	25 %	0 %	50 %	25 %	430759518
3262	NC_019902	ACGG	2	8	179323	179330	25 %	0 %	50 %	25 %	430759518
3263	NC_019902	CGG	2	6	179380	179385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759518
3264	NC_019902	GCG	2	6	179410	179415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759518
3265	NC_019902	GCGAG	2	10	179434	179443	20 %	0 %	60 %	20 %	430759518
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3271	NC_019902	GCG	2	6	179589	179594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759518
3272	NC_019902	GCG	2	6	179619	179624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759518
3273	NC_019902	CGG	2	6	179644	179649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759518
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3276	NC_019902	TCG	2	6	179691	179696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759518
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3284	NC_019902	GGGCT	2	10	180275	180284	0 %	20 %	60 %	20 %	430759519
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3328	NC_019902	GCCG	2	8	181865	181872	0 %	0 %	50 %	50 %	430759521
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3331	NC_019902	GTG	2	6	181968	181973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759521
3332	NC_019902	GCC	2	6	182018	182023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759521
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3335	NC_019902	CCGCG	2	10	182178	182187	0 %	0 %	40 %	60 %	430759521
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3346	NC_019902	GCTG	2	8	182941	182948	0 %	25 %	50 %	25 %	430759522
3347	NC_019902	CCT	2	6	183129	183134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759523
3348	NC_019902	TCG	2	6	183156	183161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759523
3349	NC_019902	CTG	2	6	183176	183181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759523
3350	NC_019902	GGT	2	6	183229	183234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759523
3351	NC_019902	CG	3	6	183249	183254	0 %	0 %	50 %	50 %	430759523
3352	NC_019902	GCT	2	6	183277	183282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759523
3353	NC_019902	AGGC	2	8	183300	183307	25 %	0 %	50 %	25 %	430759523
3354	NC_019902	CGGGCC	2	12	183345	183356	0 %	0 %	50 %	50 %	430759523
3355	NC_019902	GAC	2	6	183470	183475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759523
3356	NC_019902	CGTTCC	2	12	183486	183497	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	430759523
3357	NC_019902	TGC	2	6	183501	183506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759523
3358	NC_019902	CGG	2	6	183514	183519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759523
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3360	NC_019902	CGG	2	6	183588	183593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759523
3361	NC_019902	GCT	2	6	183619	183624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759523
3362	NC_019902	CGG	2	6	183640	183645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759523
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3364	NC_019902	CGG	2	6	183753	183758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759523
3365	NC_019902	CGG	2	6	183792	183797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759523
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3473	NC_019902	GAT	2	6	187995	188000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759528
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3486	NC_019902	GCT	2	6	188575	188580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759529
3487	NC_019902	CGA	2	6	188615	188620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759529
3488	NC_019902	GGC	2	6	188648	188653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759529
3489	NC_019902	ACC	2	6	188668	188673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759529
3490	NC_019902	CGG	2	6	188720	188725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759529
3491	NC_019902	GCA	2	6	188750	188755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759529
3492	NC_019902	CGC	2	6	188821	188826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759529
3493	NC_019902	ACT	2	6	188830	188835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759529
3494	NC_019902	GAT	2	6	188852	188857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759529
3495	NC_019902	ACG	2	6	189004	189009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759529
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3497	NC_019902	TCG	2	6	189043	189048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759529
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3499	NC_019902	TCG	2	6	189198	189203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759530
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