MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 78359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_019902	CGG	2	6	87525	87530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759439
1503	NC_019902	GCAG	2	8	87548	87555	25 %	0 %	50 %	25 %	430759439
1504	NC_019902	CGC	2	6	87564	87569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759439
1505	NC_019902	CGG	2	6	87572	87577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759439
1506	NC_019902	GCC	2	6	88120	88125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759441
1507	NC_019902	GC	3	6	88128	88133	0 %	0 %	50 %	50 %	430759441
1508	NC_019902	GAT	2	6	88143	88148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759441
1509	NC_019902	GAG	2	6	88380	88385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759441
1510	NC_019902	AGC	2	6	88471	88476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759441
1511	NC_019902	TGG	2	6	88511	88516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759441
1512	NC_019902	CGG	2	6	88530	88535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759441
1513	NC_019902	GTG	2	6	88575	88580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759441
1514	NC_019902	GGT	2	6	88649	88654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759441
1515	NC_019902	GACC	2	8	88691	88698	25 %	0 %	25 %	50 %	430759441
1516	NC_019902	TGGC	2	8	88713	88720	0 %	25 %	50 %	25 %	430759441
1517	NC_019902	CTG	2	6	88740	88745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759441
1518	NC_019902	TCC	2	6	88760	88765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759441
1519	NC_019902	GAA	2	6	88835	88840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759441
1520	NC_019902	GCCG	2	8	88975	88982	0 %	0 %	50 %	50 %	430759441
1521	NC_019902	GAA	2	6	88999	89004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759441
1522	NC_019902	GGA	2	6	89025	89030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759441
1523	NC_019902	CTG	2	6	89158	89163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759441
1524	NC_019902	GCC	2	6	89194	89199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759441
1525	NC_019902	TGC	2	6	89201	89206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759441
1526	NC_019902	TCG	2	6	89207	89212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759441
1527	NC_019902	GACG	2	8	89310	89317	25 %	0 %	50 %	25 %	430759441
1528	NC_019902	CTG	2	6	89349	89354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759441
1529	NC_019902	GCC	2	6	89370	89375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759441
1530	NC_019902	TCG	2	6	89539	89544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759440
1531	NC_019902	CGCGC	2	10	89555	89564	0 %	0 %	40 %	60 %	430759440
1532	NC_019902	CCTT	2	8	89995	90002	0 %	50 %	0 %	50 %	430759442
1533	NC_019902	GAC	2	6	90021	90026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759442
1534	NC_019902	CTT	2	6	90036	90041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759442
1535	NC_019902	GTG	2	6	90082	90087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759442
1536	NC_019902	CTC	2	6	90159	90164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759443
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1538	NC_019902	TGC	2	6	90240	90245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759443
1539	NC_019902	CAGGCG	2	12	90247	90258	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430759443
1540	NC_019902	GGTG	2	8	90291	90298	0 %	25 %	75 %	0 %	430759443
1541	NC_019902	CGG	2	6	90320	90325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759443
1542	NC_019902	TTG	2	6	90329	90334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759443
1543	NC_019902	AGC	2	6	90660	90665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759444
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1545	NC_019902	TCGA	2	8	90762	90769	25 %	25 %	25 %	25 %	430759444
1546	NC_019902	TCG	2	6	90825	90830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759444
1547	NC_019902	GC	3	6	90850	90855	0 %	0 %	50 %	50 %	430759444
1548	NC_019902	TCG	2	6	90951	90956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759444
1549	NC_019902	CGG	2	6	90957	90962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759444
1550	NC_019902	AAT	2	6	91030	91035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430759444
1551	NC_019902	GCA	2	6	91060	91065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759444
1552	NC_019902	GGT	2	6	91115	91120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759444
1553	NC_019902	TCG	2	6	91132	91137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759444
1554	NC_019902	GCA	2	6	91174	91179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759444
1555	NC_019902	GTG	2	6	91191	91196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759444
1556	NC_019902	GCC	2	6	91201	91206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759444
1557	NC_019902	CGG	2	6	91237	91242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759444
1558	NC_019902	TCC	2	6	91245	91250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759444
1559	NC_019902	TCGA	2	8	91260	91267	25 %	25 %	25 %	25 %	430759444
1560	NC_019902	CGGC	3	12	91312	91323	0 %	0 %	50 %	50 %	430759444
1561	NC_019902	CGC	2	6	91345	91350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759444
1562	NC_019902	CCA	2	6	91394	91399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759444
1563	NC_019902	TCG	2	6	91453	91458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759444
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1565	NC_019902	CG	3	6	91529	91534	0 %	0 %	50 %	50 %	430759444
1566	NC_019902	CCGT	2	8	91538	91545	0 %	25 %	25 %	50 %	430759444
1567	NC_019902	TCG	2	6	91572	91577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759444
1568	NC_019902	GTG	2	6	91584	91589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759444
1569	NC_019902	CGT	2	6	91600	91605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759444
1570	NC_019902	CGG	2	6	91619	91624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759444
1571	NC_019902	GGC	3	9	91667	91675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759444
1572	NC_019902	GCCA	2	8	91731	91738	25 %	0 %	25 %	50 %	430759444
1573	NC_019902	GCC	2	6	91805	91810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759444
1574	NC_019902	TGC	2	6	91834	91839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759444
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1577	NC_019902	ATG	2	6	91995	92000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759444
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1579	NC_019902	CG	3	6	92152	92157	0 %	0 %	50 %	50 %	430759444
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1581	NC_019902	CTT	2	6	92189	92194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759444
1582	NC_019902	TGC	2	6	92200	92205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759444
1583	NC_019902	GC	3	6	92252	92257	0 %	0 %	50 %	50 %	430759444
1584	NC_019902	AGC	2	6	92263	92268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759444
1585	NC_019902	CTC	2	6	92339	92344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759444
1586	NC_019902	TCG	2	6	92397	92402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759444
1587	NC_019902	TTC	2	6	92424	92429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759444
1588	NC_019902	AAGCGC	2	12	92909	92920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759445
1589	NC_019902	CCG	2	6	92926	92931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759445
1590	NC_019902	GGCC	2	8	92956	92963	0 %	0 %	50 %	50 %	430759445
1591	NC_019902	TGC	2	6	92998	93003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759445
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1593	NC_019902	GAT	2	6	93068	93073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759445
1594	NC_019902	GAC	2	6	93107	93112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759445
1595	NC_019902	CGC	2	6	93185	93190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759445
1596	NC_019902	AGC	2	6	93631	93636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759446
1597	NC_019902	GCC	2	6	93664	93669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759446
1598	NC_019902	CGG	2	6	93674	93679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759446
1599	NC_019902	GGCG	2	8	93687	93694	0 %	0 %	75 %	25 %	430759446
1600	NC_019902	CGCTG	2	10	93714	93723	0 %	20 %	40 %	40 %	430759446
1601	NC_019902	TGTTCA	2	12	93743	93754	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	430759446
1602	NC_019902	CGA	2	6	93825	93830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759446
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1605	NC_019902	AC	3	6	94516	94521	50 %	0 %	0 %	50 %	430759447
1606	NC_019902	CG	3	6	94535	94540	0 %	0 %	50 %	50 %	430759447
1607	NC_019902	CAG	2	6	94623	94628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759447
1608	NC_019902	CTC	2	6	94669	94674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759447
1609	NC_019902	ACG	2	6	94727	94732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759447
1610	NC_019902	CGT	2	6	94749	94754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759447
1611	NC_019902	GGC	2	6	94806	94811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759447
1612	NC_019902	CG	3	6	94833	94838	0 %	0 %	50 %	50 %	430759447
1613	NC_019902	GC	3	6	94858	94863	0 %	0 %	50 %	50 %	430759447
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1619	NC_019902	GGC	2	6	95127	95132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759447
1620	NC_019902	GAT	2	6	95160	95165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759447
1621	NC_019902	TCATC	2	10	95261	95270	20 %	40 %	0 %	40 %	430759447
1622	NC_019902	GGT	2	6	95358	95363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759447
1623	NC_019902	CG	3	6	95440	95445	0 %	0 %	50 %	50 %	430759447
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1743	NC_019902	ACCGAT	2	12	102018	102029	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759452
1744	NC_019902	ACCGAT	4	24	102036	102059	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759452
1745	NC_019902	ACCGAT	7	42	102084	102125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759452
1746	NC_019902	GACACG	15	90	102131	102220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759452
1747	NC_019902	ACACGG	7	42	102223	102264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759452
1748	NC_019902	CAG	2	6	102341	102346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759452
1749	NC_019902	CGA	3	9	102362	102370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759452
1750	NC_019902	CGG	2	6	102404	102409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759452
1751	NC_019902	GAC	2	6	102411	102416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759452
1752	NC_019902	GAA	2	6	102435	102440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759452
1753	NC_019902	TTC	2	6	102444	102449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759452
1754	NC_019902	GAC	2	6	102450	102455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759452
1755	NC_019902	AGC	2	6	102493	102498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759452
1756	NC_019902	ACG	2	6	102973	102978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759453
1757	NC_019902	TGC	2	6	103063	103068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759453
1758	NC_019902	GCC	2	6	103202	103207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759453
1759	NC_019902	GTT	2	6	103216	103221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759453
1760	NC_019902	CGA	2	6	103267	103272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759453
1761	NC_019902	ATC	2	6	103283	103288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759453
1762	NC_019902	GC	3	6	103811	103816	0 %	0 %	50 %	50 %	430759454
1763	NC_019902	GAA	2	6	103875	103880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759454
1764	NC_019902	CTT	2	6	103916	103921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759454
1765	NC_019902	GC	3	6	103943	103948	0 %	0 %	50 %	50 %	430759454
1766	NC_019902	CGT	2	6	103952	103957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759454
1767	NC_019902	CTGG	2	8	104090	104097	0 %	25 %	50 %	25 %	430759454
1768	NC_019902	CCAAGA	2	12	104116	104127	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	430759454
1769	NC_019902	ATT	2	6	104131	104136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430759454
1770	NC_019902	G	6	6	104143	104148	0 %	0 %	100 %	0 %	430759454
1771	NC_019902	TC	3	6	104208	104213	0 %	50 %	0 %	50 %	430759454
1772	NC_019902	TGGC	2	8	104294	104301	0 %	25 %	50 %	25 %	430759454
1773	NC_019902	CTA	2	6	104921	104926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759454
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1775	NC_019902	TGGCT	2	10	105054	105063	0 %	40 %	40 %	20 %	430759454
1776	NC_019902	GCA	2	6	105083	105088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759454
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1778	NC_019902	ACC	2	6	105165	105170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759454
1779	NC_019902	GCT	2	6	105179	105184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759454
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1783	NC_019902	CG	3	6	105215	105220	0 %	0 %	50 %	50 %	430759454
1784	NC_019902	GAC	2	6	105231	105236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759454
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1846	NC_019902	CGT	2	6	108575	108580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759455
1847	NC_019902	TACC	2	8	108598	108605	25 %	25 %	0 %	50 %	430759455
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1852	NC_019902	GCA	2	6	108869	108874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759455
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1857	NC_019902	ACC	2	6	109085	109090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759455
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1859	NC_019902	AGG	2	6	109209	109214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759455
1860	NC_019902	CG	4	8	109222	109229	0 %	0 %	50 %	50 %	430759455
1861	NC_019902	GA	3	6	109243	109248	50 %	0 %	50 %	0 %	430759455
1862	NC_019902	GCT	2	6	109291	109296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759455
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1864	NC_019902	CTC	2	6	109413	109418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759455
1865	NC_019902	CGG	2	6	109435	109440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759455
1866	NC_019902	CTG	2	6	109482	109487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759455
1867	NC_019902	CCGA	2	8	109533	109540	25 %	0 %	25 %	50 %	430759455
1868	NC_019902	GAAG	2	8	109633	109640	50 %	0 %	50 %	0 %	430759455
1869	NC_019902	GAT	2	6	109738	109743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759455
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1882	NC_019902	CCGG	2	8	110610	110617	0 %	0 %	50 %	50 %	430759456
1883	NC_019902	GCTGCA	2	12	110658	110669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430759456
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1887	NC_019902	AGC	2	6	110717	110722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759456
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1894	NC_019902	GCCG	2	8	111476	111483	0 %	0 %	50 %	50 %	430759457
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1975	NC_019902	TGC	2	6	114855	114860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759462
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1978	NC_019902	CGA	3	9	115050	115058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759463
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1980	NC_019902	CAA	2	6	115110	115115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430759463
1981	NC_019902	TCA	2	6	115118	115123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759463
1982	NC_019902	TGG	2	6	115153	115158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759463
1983	NC_019902	GTG	2	6	115159	115164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759463
1984	NC_019902	ACGGCA	2	12	115169	115180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759463
1985	NC_019902	TGC	2	6	115181	115186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759463
1986	NC_019902	CTGCG	2	10	115189	115198	0 %	20 %	40 %	40 %	430759463
1987	NC_019902	AGA	2	6	115247	115252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759463
1988	NC_019902	GAC	2	6	116044	116049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759464
1989	NC_019902	GGC	2	6	116088	116093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759464
1990	NC_019902	ATC	2	6	116155	116160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759464
1991	NC_019902	GGC	2	6	116211	116216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759464
1992	NC_019902	AGC	2	6	116299	116304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759464
1993	NC_019902	CTT	2	6	116373	116378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759464
1994	NC_019902	GC	3	6	116395	116400	0 %	0 %	50 %	50 %	430759464
1995	NC_019902	TTA	2	6	116424	116429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430759464
1996	NC_019902	GCT	2	6	116433	116438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759464
1997	NC_019902	GGC	2	6	116442	116447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759464
1998	NC_019902	GCG	2	6	116455	116460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759464
1999	NC_019902	TCTGGC	2	12	116622	116633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759464
2000	NC_019902	ACG	2	6	116669	116674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759464

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