MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 78359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019902	CTG	2	6	280237	280242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759614
5502	NC_019902	CAT	2	6	280516	280521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759615
5503	NC_019902	GAA	2	6	280534	280539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759615
5504	NC_019902	GCG	2	6	280595	280600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759615
5505	NC_019902	GC	4	8	280616	280623	0 %	0 %	50 %	50 %	430759615
5506	NC_019902	AAG	2	6	280628	280633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759615
5507	NC_019902	GAA	2	6	280648	280653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759615
5508	NC_019902	CGC	2	6	280657	280662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759615
5509	NC_019902	GC	3	6	280661	280666	0 %	0 %	50 %	50 %	430759615
5510	NC_019902	GCA	2	6	280670	280675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759615
5511	NC_019902	AACG	2	8	280687	280694	50 %	0 %	25 %	25 %	430759615
5512	NC_019902	AGC	2	6	280752	280757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759615
5513	NC_019902	CAT	2	6	280820	280825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759615
5514	NC_019902	CTGG	2	8	280831	280838	0 %	25 %	50 %	25 %	430759615
5515	NC_019902	CGG	2	6	280867	280872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759615
5516	NC_019902	GGA	2	6	280930	280935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759616
5517	NC_019902	CCGG	2	8	281032	281039	0 %	0 %	50 %	50 %	430759616
5518	NC_019902	GCT	3	9	281095	281103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759616
5519	NC_019902	CGC	2	6	281253	281258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759616
5520	NC_019902	CG	3	6	281301	281306	0 %	0 %	50 %	50 %	430759616
5521	NC_019902	CCA	2	6	281310	281315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759616
5522	NC_019902	GCCGCG	2	12	281381	281392	0 %	0 %	50 %	50 %	430759616
5523	NC_019902	GCC	2	6	281523	281528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759617
5524	NC_019902	CAC	2	6	281595	281600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759617
5525	NC_019902	CTT	2	6	281722	281727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759618
5526	NC_019902	GAT	2	6	281773	281778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759618
5527	NC_019902	CTT	2	6	281909	281914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759619
5528	NC_019902	CGT	2	6	281915	281920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759619
5529	NC_019902	GCT	2	6	281943	281948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759619
5530	NC_019902	TTC	2	6	281965	281970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759619
5531	NC_019902	GTG	2	6	282323	282328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759620
5532	NC_019902	CGC	2	6	282374	282379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759620
5533	NC_019902	CTG	2	6	282387	282392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759620
5534	NC_019902	GCCG	2	8	282406	282413	0 %	0 %	50 %	50 %	430759620
5535	NC_019902	T	6	6	282420	282425	0 %	100 %	0 %	0 %	430759620
5536	NC_019902	GGC	3	9	282434	282442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759620
5537	NC_019902	CTG	2	6	282498	282503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759620
5538	NC_019902	GCA	2	6	282519	282524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759620
5539	NC_019902	CGC	2	6	282530	282535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759620
5540	NC_019902	GTC	2	6	282570	282575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759620
5541	NC_019902	TGC	2	6	282694	282699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759620
5542	NC_019902	ATTC	2	8	282763	282770	25 %	50 %	0 %	25 %	430759620
5543	NC_019902	CGA	2	6	282890	282895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759620
5544	NC_019902	CGA	2	6	282911	282916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759620
5545	NC_019902	CGA	2	6	282932	282937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759620
5546	NC_019902	CGA	2	6	282953	282958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759620
5547	NC_019902	CGA	2	6	282974	282979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759620
5548	NC_019902	CGC	2	6	283338	283343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759621
5549	NC_019902	CGGT	2	8	283476	283483	0 %	25 %	50 %	25 %	430759621
5550	NC_019902	CAG	2	6	283631	283636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759621
5551	NC_019902	GAA	2	6	283691	283696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759621
5552	NC_019902	GAG	2	6	283715	283720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759621
5553	NC_019902	GTG	2	6	283727	283732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759621
5554	NC_019902	GACC	2	8	283753	283760	25 %	0 %	25 %	50 %	430759621
5555	NC_019902	TGGA	2	8	283824	283831	25 %	25 %	50 %	0 %	430759621
5556	NC_019902	TCA	2	6	283843	283848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759621
5557	NC_019902	TGA	2	6	283866	283871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759621
5558	NC_019902	CAG	2	6	283892	283897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759621
5559	NC_019902	CGG	2	6	283927	283932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759621
5560	NC_019902	CAC	2	6	283933	283938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759621
5561	NC_019902	AACC	2	8	283951	283958	50 %	0 %	0 %	50 %	430759621
5562	NC_019902	CGG	2	6	283962	283967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759621
5563	NC_019902	TCA	2	6	284052	284057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759621
5564	NC_019902	TCG	2	6	284108	284113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759621
5565	NC_019902	GAA	2	6	284291	284296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759621
5566	NC_019902	CGC	2	6	284652	284657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759622
5567	NC_019902	TCG	2	6	284666	284671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759622
5568	NC_019902	ACCC	2	8	284708	284715	25 %	0 %	0 %	75 %	430759622
5569	NC_019902	TGCG	2	8	284726	284733	0 %	25 %	50 %	25 %	430759622
5570	NC_019902	TGC	2	6	284840	284845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759622
5571	NC_019902	ACG	2	6	284879	284884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759622
5572	NC_019902	GCA	2	6	284886	284891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759622
5573	NC_019902	TCT	3	9	284900	284908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759622
5574	NC_019902	CGA	2	6	284909	284914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759622
5575	NC_019902	CGC	2	6	284939	284944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759622
5576	NC_019902	GTG	2	6	284950	284955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759622
5577	NC_019902	GCT	2	6	284958	284963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759622
5578	NC_019902	ATC	2	6	285061	285066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759622
5579	NC_019902	CCAGGC	2	12	285220	285231	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	430759623
5580	NC_019902	AGC	2	6	285282	285287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759623
5581	NC_019902	ACG	2	6	285330	285335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759623
5582	NC_019902	CGG	2	6	285370	285375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759623
5583	NC_019902	TGG	2	6	285388	285393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759623
5584	NC_019902	CGG	2	6	285415	285420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759623
5585	NC_019902	GCGCG	2	10	285493	285502	0 %	0 %	60 %	40 %	430759623
5586	NC_019902	CG	3	6	285538	285543	0 %	0 %	50 %	50 %	430759623
5587	NC_019902	GGC	2	6	285561	285566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759623
5588	NC_019902	CGC	2	6	285590	285595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759623
5589	NC_019902	GAC	2	6	285662	285667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759623
5590	NC_019902	AGC	2	6	285672	285677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759623
5591	NC_019902	CG	3	6	285739	285744	0 %	0 %	50 %	50 %	430759623
5592	NC_019902	GATC	2	8	285757	285764	25 %	25 %	25 %	25 %	430759623
5593	NC_019902	ACGTC	2	10	285804	285813	20 %	20 %	20 %	40 %	430759623
5594	NC_019902	CAG	2	6	285824	285829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759623
5595	NC_019902	CG	3	6	285858	285863	0 %	0 %	50 %	50 %	430759623
5596	NC_019902	TGA	2	6	285865	285870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759623
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5598	NC_019902	GTC	2	6	285911	285916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759623
5599	NC_019902	TCG	2	6	285925	285930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759623
5600	NC_019902	CAG	2	6	285998	286003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759623
5601	NC_019902	CAG	2	6	286045	286050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759624
5602	NC_019902	GCG	2	6	286073	286078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759624
5603	NC_019902	CAG	2	6	286111	286116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759624
5604	NC_019902	GCC	2	6	286134	286139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759624
5605	NC_019902	TCG	2	6	286166	286171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759624
5606	NC_019902	GAGC	2	8	286239	286246	25 %	0 %	50 %	25 %	430759624
5607	NC_019902	TCC	2	6	286292	286297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759624
5608	NC_019902	GGTG	2	8	286374	286381	0 %	25 %	75 %	0 %	430759624
5609	NC_019902	CGC	2	6	286384	286389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759624
5610	NC_019902	CAG	2	6	286402	286407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759624
5611	NC_019902	CAC	2	6	286438	286443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759624
5612	NC_019902	CGC	2	6	286446	286451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759624
5613	NC_019902	GCT	2	6	286456	286461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759624
5614	NC_019902	AGC	2	6	286463	286468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759624
5615	NC_019902	CCTCGA	2	12	286515	286526	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	430759624
5616	NC_019902	GCG	2	6	286549	286554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759624
5617	NC_019902	ATG	2	6	286555	286560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759624
5618	NC_019902	CGG	2	6	286563	286568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759624
5619	NC_019902	GTCG	2	8	286593	286600	0 %	25 %	50 %	25 %	430759625
5620	NC_019902	GCA	2	6	286631	286636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759625
5621	NC_019902	GAT	2	6	286668	286673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759625
5622	NC_019902	GTG	2	6	286723	286728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759625
5623	NC_019902	ATA	2	6	286785	286790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430759625
5624	NC_019902	CGC	2	6	286804	286809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759625
5625	NC_019902	CGT	2	6	286841	286846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759625
5626	NC_019902	GC	3	6	286869	286874	0 %	0 %	50 %	50 %	430759625
5627	NC_019902	ACGC	2	8	286875	286882	25 %	0 %	25 %	50 %	430759625
5628	NC_019902	CAT	2	6	286988	286993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759625
5629	NC_019902	GCT	2	6	287070	287075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759625
5630	NC_019902	CAGC	2	8	287078	287085	25 %	0 %	25 %	50 %	430759625
5631	NC_019902	GTG	3	9	287100	287108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759625
5632	NC_019902	GCT	2	6	287114	287119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759625
5633	NC_019902	GTC	3	9	287187	287195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759625
5634	NC_019902	CGG	2	6	287213	287218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759625
5635	NC_019902	GCG	2	6	287248	287253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759625
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5637	NC_019902	ATG	2	6	287299	287304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759625
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5639	NC_019902	A	6	6	287357	287362	100 %	0 %	0 %	0 %	430759626
5640	NC_019902	TCC	2	6	287363	287368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759626
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5642	NC_019902	ATGG	2	8	287430	287437	25 %	25 %	50 %	0 %	430759626
5643	NC_019902	CGA	2	6	287489	287494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759626
5644	NC_019902	GC	3	6	287529	287534	0 %	0 %	50 %	50 %	430759626
5645	NC_019902	CTG	2	6	287541	287546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759626
5646	NC_019902	CTG	3	9	287715	287723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759626
5647	NC_019902	ATC	2	6	287782	287787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759626
5648	NC_019902	CGT	2	6	287795	287800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759626
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5650	NC_019902	GCT	2	6	287836	287841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759626
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5652	NC_019902	GCA	2	6	287942	287947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759626
5653	NC_019902	GCG	2	6	287953	287958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759626
5654	NC_019902	CG	3	6	287974	287979	0 %	0 %	50 %	50 %	430759626
5655	NC_019902	CGG	2	6	287995	288000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759626
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5657	NC_019902	ATC	2	6	288225	288230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759627
5658	NC_019902	GTCGAC	2	12	288264	288275	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430759627
5659	NC_019902	GC	3	6	288314	288319	0 %	0 %	50 %	50 %	430759627
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5665	NC_019902	GCT	2	6	288832	288837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759628
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5673	NC_019902	CGG	2	6	289110	289115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759628
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5685	NC_019902	GGATAC	2	12	289513	289524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	430759629
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5722	NC_019902	TGCC	2	8	291642	291649	0 %	25 %	25 %	50 %	430759632
5723	NC_019902	CG	3	6	291676	291681	0 %	0 %	50 %	50 %	430759632
5724	NC_019902	AGCC	2	8	291704	291711	25 %	0 %	25 %	50 %	430759632
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5731	NC_019902	CGC	2	6	292113	292118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759633
5732	NC_019902	GTCGA	2	10	292152	292161	20 %	20 %	40 %	20 %	430759633
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5737	NC_019902	G	6	6	292239	292244	0 %	0 %	100 %	0 %	430759633
5738	NC_019902	GCC	3	9	292294	292302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759633
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5984	NC_019902	GC	3	6	304259	304264	0 %	0 %	50 %	50 %	430759648
5985	NC_019902	C	6	6	304287	304292	0 %	0 %	0 %	100 %	430759648
5986	NC_019902	GGC	2	6	304306	304311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759648
5987	NC_019902	GCCG	2	8	304346	304353	0 %	0 %	50 %	50 %	430759648
5988	NC_019902	TTC	2	6	304426	304431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759647
5989	NC_019902	CGC	2	6	304467	304472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759647
5990	NC_019902	CG	4	8	304494	304501	0 %	0 %	50 %	50 %	430759647
5991	NC_019902	TGC	2	6	304640	304645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759647
5992	NC_019902	GC	3	6	304644	304649	0 %	0 %	50 %	50 %	430759647
5993	NC_019902	GC	4	8	304705	304712	0 %	0 %	50 %	50 %	430759647
5994	NC_019902	CGC	2	6	304718	304723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759647
5995	NC_019902	TGCG	2	8	304736	304743	0 %	25 %	50 %	25 %	430759647
5996	NC_019902	GCGCG	2	10	304746	304755	0 %	0 %	60 %	40 %	430759647
5997	NC_019902	CGC	2	6	304767	304772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759647
5998	NC_019902	C	6	6	304787	304792	0 %	0 %	0 %	100 %	430759647
5999	NC_019902	TGG	2	6	304796	304801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759647
6000	NC_019902	CCG	2	6	304813	304818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759647

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