MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018722	TGG	2	6	192336	192341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502071
3502	NC_018722	GGT	2	6	192354	192359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502071
3503	NC_018722	AAG	2	6	192377	192382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502071
3504	NC_018722	AG	3	6	192460	192465	50 %	0 %	50 %	0 %	408502071
3505	NC_018722	TGCTT	2	10	192474	192483	0 %	60 %	20 %	20 %	408502071
3506	NC_018722	TGG	2	6	192503	192508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502071
3507	NC_018722	TTC	2	6	192531	192536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502071
3508	NC_018722	AGG	2	6	192547	192552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502071
3509	NC_018722	TGC	2	6	192558	192563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502071
3510	NC_018722	GCGCG	2	10	192577	192586	0 %	0 %	60 %	40 %	408502071
3511	NC_018722	GAAG	2	8	192591	192598	50 %	0 %	50 %	0 %	408502071
3512	NC_018722	ATT	2	6	192601	192606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502071
3513	NC_018722	TGG	2	6	192666	192671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502072
3514	NC_018722	G	6	6	192670	192675	0 %	0 %	100 %	0 %	408502072
3515	NC_018722	GAT	2	6	192686	192691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502072
3516	NC_018722	TCT	2	6	192705	192710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502072
3517	NC_018722	CCT	2	6	192736	192741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502072
3518	NC_018722	TAGT	2	8	192760	192767	25 %	50 %	25 %	0 %	408502072
3519	NC_018722	AGC	2	6	192895	192900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502072
3520	NC_018722	GAA	2	6	192938	192943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502072
3521	NC_018722	TCC	2	6	193068	193073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502072
3522	NC_018722	T	7	7	193128	193134	0 %	100 %	0 %	0 %	408502072
3523	NC_018722	AGC	2	6	193146	193151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502072
3524	NC_018722	GGAAGA	2	12	193175	193186	50 %	0 %	50 %	0 %	408502072
3525	NC_018722	C	7	7	193198	193204	0 %	0 %	0 %	100 %	408502072
3526	NC_018722	A	6	6	193237	193242	100 %	0 %	0 %	0 %	408502072
3527	NC_018722	CTC	2	6	193244	193249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502072
3528	NC_018722	GACACT	2	12	193336	193347	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502072
3529	NC_018722	GC	3	6	193391	193396	0 %	0 %	50 %	50 %	408502072
3530	NC_018722	CAG	2	6	193411	193416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502072
3531	NC_018722	GC	3	6	193424	193429	0 %	0 %	50 %	50 %	408502072
3532	NC_018722	GGTGAG	2	12	193499	193510	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	408502072
3533	NC_018722	A	6	6	193538	193543	100 %	0 %	0 %	0 %	408502072
3534	NC_018722	GAGT	2	8	193555	193562	25 %	25 %	50 %	0 %	408502072
3535	NC_018722	ACA	2	6	193582	193587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502072
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3537	NC_018722	CCA	2	6	193674	193679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502072
3538	NC_018722	GTC	2	6	193694	193699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502072
3539	NC_018722	AAC	2	6	193713	193718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502072
3540	NC_018722	A	6	6	193732	193737	100 %	0 %	0 %	0 %	408502072
3541	NC_018722	TCA	2	6	193758	193763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502072
3542	NC_018722	CG	3	6	193825	193830	0 %	0 %	50 %	50 %	408502072
3543	NC_018722	GCT	2	6	193861	193866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502072
3544	NC_018722	GC	3	6	193962	193967	0 %	0 %	50 %	50 %	408502072
3545	NC_018722	TCC	2	6	194008	194013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502072
3546	NC_018722	TTTGT	2	10	194059	194068	0 %	80 %	20 %	0 %	408502073
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3549	NC_018722	TAA	2	6	194141	194146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502073
3550	NC_018722	TTGT	2	8	194148	194155	0 %	75 %	25 %	0 %	408502073
3551	NC_018722	CTG	2	6	194174	194179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502073
3552	NC_018722	TCC	2	6	194259	194264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502073
3553	NC_018722	TG	3	6	194266	194271	0 %	50 %	50 %	0 %	408502073
3554	NC_018722	GCG	2	6	194324	194329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502073
3555	NC_018722	GGC	2	6	194463	194468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502073
3556	NC_018722	GCCA	2	8	194469	194476	25 %	0 %	25 %	50 %	408502073
3557	NC_018722	A	6	6	194497	194502	100 %	0 %	0 %	0 %	408502073
3558	NC_018722	GAA	2	6	194509	194514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502073
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3560	NC_018722	GT	3	6	194656	194661	0 %	50 %	50 %	0 %	408502073
3561	NC_018722	A	7	7	194694	194700	100 %	0 %	0 %	0 %	408502073
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3563	NC_018722	T	6	6	194783	194788	0 %	100 %	0 %	0 %	408502073
3564	NC_018722	A	6	6	195006	195011	100 %	0 %	0 %	0 %	408502073
3565	NC_018722	A	7	7	195039	195045	100 %	0 %	0 %	0 %	408502073
3566	NC_018722	GAT	2	6	195054	195059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502073
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3568	NC_018722	ATA	2	6	195139	195144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502073
3569	NC_018722	GCA	2	6	195207	195212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502073
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3571	NC_018722	GCAG	2	8	195292	195299	25 %	0 %	50 %	25 %	408502073
3572	NC_018722	TTCT	2	8	195302	195309	0 %	75 %	0 %	25 %	408502073
3573	NC_018722	GAGTG	2	10	195334	195343	20 %	20 %	60 %	0 %	408502073
3574	NC_018722	AAG	2	6	195358	195363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502073
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3576	NC_018722	T	8	8	195475	195482	0 %	100 %	0 %	0 %	408502073
3577	NC_018722	ATTA	2	8	196649	196656	50 %	50 %	0 %	0 %	408502074
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3581	NC_018722	GC	3	6	196950	196955	0 %	0 %	50 %	50 %	408502075
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3585	NC_018722	CAG	2	6	197159	197164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502075
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3588	NC_018722	G	6	6	197200	197205	0 %	0 %	100 %	0 %	408502075
3589	NC_018722	AGC	2	6	197280	197285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502075
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3591	NC_018722	ACGC	2	8	197371	197378	25 %	0 %	25 %	50 %	408502075
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3593	NC_018722	CCTG	2	8	197559	197566	0 %	25 %	25 %	50 %	408502075
3594	NC_018722	GTC	2	6	197573	197578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502075
3595	NC_018722	GCAG	2	8	197588	197595	25 %	0 %	50 %	25 %	408502075
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3597	NC_018722	GTG	3	9	197639	197647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502075
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3599	NC_018722	CG	3	6	197707	197712	0 %	0 %	50 %	50 %	408502075
3600	NC_018722	GA	3	6	197722	197727	50 %	0 %	50 %	0 %	408502075
3601	NC_018722	GTA	2	6	197761	197766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502075
3602	NC_018722	GC	4	8	197804	197811	0 %	0 %	50 %	50 %	408502075
3603	NC_018722	CTC	2	6	197886	197891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502076
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3605	NC_018722	AGC	2	6	197917	197922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502076
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3607	NC_018722	GTC	4	12	198183	198194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502076
3608	NC_018722	GCT	2	6	198218	198223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502076
3609	NC_018722	GGA	2	6	198249	198254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502076
3610	NC_018722	CG	3	6	198413	198418	0 %	0 %	50 %	50 %	408502076
3611	NC_018722	GTC	2	6	198429	198434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502076
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3613	NC_018722	TGA	2	6	198557	198562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502076
3614	NC_018722	TCGTC	2	10	198596	198605	0 %	40 %	20 %	40 %	408502076
3615	NC_018722	ATC	2	6	198609	198614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502076
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3624	NC_018722	GGC	2	6	199048	199053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502076
3625	NC_018722	GTC	2	6	199098	199103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502076
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3754	NC_018722	TCG	2	6	205311	205316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502083
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3761	NC_018722	TTTTA	2	10	205568	205577	20 %	80 %	0 %	0 %	408502083
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3872	NC_018722	TTA	2	6	211853	211858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502097
3873	NC_018722	GC	3	6	211885	211890	0 %	0 %	50 %	50 %	408502097
3874	NC_018722	GTA	2	6	211955	211960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502097
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3992	NC_018722	CG	4	8	218620	218627	0 %	0 %	50 %	50 %	408502109
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3999	NC_018722	AAG	2	6	218877	218882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502110
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