MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_018722	GCG	2	6	166352	166357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502047
3003	NC_018722	CG	3	6	166387	166392	0 %	0 %	50 %	50 %	408502047
3004	NC_018722	TG	3	6	166435	166440	0 %	50 %	50 %	0 %	408502047
3005	NC_018722	TG	3	6	166611	166616	0 %	50 %	50 %	0 %	408502047
3006	NC_018722	GAT	2	6	166714	166719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502047
3007	NC_018722	GC	3	6	166775	166780	0 %	0 %	50 %	50 %	408502047
3008	NC_018722	CGTC	2	8	166908	166915	0 %	25 %	25 %	50 %	408502047
3009	NC_018722	CAG	3	9	166928	166936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502047
3010	NC_018722	GCAGC	2	10	166949	166958	20 %	0 %	40 %	40 %	408502047
3011	NC_018722	AGA	2	6	166959	166964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502047
3012	NC_018722	GT	4	8	167100	167107	0 %	50 %	50 %	0 %	408502048
3013	NC_018722	TCC	2	6	167114	167119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502048
3014	NC_018722	CTGC	2	8	167189	167196	0 %	25 %	25 %	50 %	408502048
3015	NC_018722	CTT	2	6	167235	167240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502048
3016	NC_018722	GTG	2	6	167304	167309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502048
3017	NC_018722	GCA	2	6	167381	167386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502048
3018	NC_018722	GCAC	2	8	167450	167457	25 %	0 %	25 %	50 %	408502048
3019	NC_018722	A	6	6	167486	167491	100 %	0 %	0 %	0 %	408502048
3020	NC_018722	CG	3	6	167494	167499	0 %	0 %	50 %	50 %	408502048
3021	NC_018722	GTT	2	6	167536	167541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502048
3022	NC_018722	GCGG	2	8	167546	167553	0 %	0 %	75 %	25 %	408502048
3023	NC_018722	T	6	6	167617	167622	0 %	100 %	0 %	0 %	408502048
3024	NC_018722	CAGG	2	8	167673	167680	25 %	0 %	50 %	25 %	408502048
3025	NC_018722	CG	4	8	167706	167713	0 %	0 %	50 %	50 %	408502048
3026	NC_018722	CTA	2	6	167721	167726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502048
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3028	NC_018722	GT	3	6	167825	167830	0 %	50 %	50 %	0 %	408502048
3029	NC_018722	TG	3	6	167860	167865	0 %	50 %	50 %	0 %	408502048
3030	NC_018722	TGC	2	6	168058	168063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502048
3031	NC_018722	GCA	2	6	168086	168091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502048
3032	NC_018722	CGT	2	6	168149	168154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502048
3033	NC_018722	CGC	2	6	168168	168173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502048
3034	NC_018722	TG	3	6	168182	168187	0 %	50 %	50 %	0 %	408502048
3035	NC_018722	GAA	2	6	168250	168255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502048
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3037	NC_018722	G	8	8	168287	168294	0 %	0 %	100 %	0 %	408502048
3038	NC_018722	TCC	2	6	168301	168306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502048
3039	NC_018722	TGAAG	2	10	168445	168454	40 %	20 %	40 %	0 %	408502048
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3041	NC_018722	GTGG	2	8	168617	168624	0 %	25 %	75 %	0 %	408502048
3042	NC_018722	AAG	2	6	168647	168652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502048
3043	NC_018722	TGC	2	6	168663	168668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502048
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3045	NC_018722	GA	3	6	168675	168680	50 %	0 %	50 %	0 %	408502048
3046	NC_018722	GGC	2	6	168769	168774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502048
3047	NC_018722	GAA	2	6	168845	168850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502048
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3053	NC_018722	A	6	6	170810	170815	100 %	0 %	0 %	0 %	408502049
3054	NC_018722	T	6	6	170841	170846	0 %	100 %	0 %	0 %	408502049
3055	NC_018722	A	6	6	170879	170884	100 %	0 %	0 %	0 %	408502049
3056	NC_018722	T	7	7	170891	170897	0 %	100 %	0 %	0 %	408502049
3057	NC_018722	TTC	2	6	170918	170923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502049
3058	NC_018722	AG	3	6	171056	171061	50 %	0 %	50 %	0 %	408502049
3059	NC_018722	CTG	2	6	171100	171105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502049
3060	NC_018722	A	6	6	171124	171129	100 %	0 %	0 %	0 %	408502049
3061	NC_018722	TCA	2	6	171175	171180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502049
3062	NC_018722	GA	4	8	171190	171197	50 %	0 %	50 %	0 %	408502049
3063	NC_018722	GA	3	6	171236	171241	50 %	0 %	50 %	0 %	408502049
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3067	NC_018722	AGG	2	6	171285	171290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502049
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3069	NC_018722	AGA	2	6	171341	171346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502049
3070	NC_018722	A	8	8	171350	171357	100 %	0 %	0 %	0 %	408502049
3071	NC_018722	ATG	2	6	171392	171397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502049
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3073	NC_018722	GTAC	2	8	171439	171446	25 %	25 %	25 %	25 %	408502049
3074	NC_018722	ATC	2	6	171447	171452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502049
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3078	NC_018722	ATT	2	6	171486	171491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502049
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3081	NC_018722	A	6	6	171671	171676	100 %	0 %	0 %	0 %	408502049
3082	NC_018722	CGGTA	2	10	171795	171804	20 %	20 %	40 %	20 %	408502049
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3089	NC_018722	GAGG	2	8	172039	172046	25 %	0 %	75 %	0 %	408502049
3090	NC_018722	CCG	2	6	172071	172076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502049
3091	NC_018722	TTG	2	6	172110	172115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502049
3092	NC_018722	ATAAG	2	10	172116	172125	60 %	20 %	20 %	0 %	408502049
3093	NC_018722	T	7	7	172140	172146	0 %	100 %	0 %	0 %	408502049
3094	NC_018722	A	7	7	172157	172163	100 %	0 %	0 %	0 %	408502049
3095	NC_018722	GTT	2	6	172192	172197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502049
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3097	NC_018722	GCA	2	6	172287	172292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502049
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3103	NC_018722	GA	3	6	172812	172817	50 %	0 %	50 %	0 %	408502050
3104	NC_018722	GAT	2	6	173031	173036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502051
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3106	NC_018722	CAT	2	6	173226	173231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502051
3107	NC_018722	CATA	2	8	173267	173274	50 %	25 %	0 %	25 %	408502051
3108	NC_018722	TGG	2	6	173276	173281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502051
3109	NC_018722	AGAC	2	8	173293	173300	50 %	0 %	25 %	25 %	408502051
3110	NC_018722	A	6	6	173331	173336	100 %	0 %	0 %	0 %	408502051
3111	NC_018722	GA	3	6	173341	173346	50 %	0 %	50 %	0 %	408502051
3112	NC_018722	CAG	2	6	173355	173360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502051
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3115	NC_018722	CG	3	6	173466	173471	0 %	0 %	50 %	50 %	408502051
3116	NC_018722	TACT	2	8	173482	173489	25 %	50 %	0 %	25 %	408502051
3117	NC_018722	GC	3	6	173542	173547	0 %	0 %	50 %	50 %	408502052
3118	NC_018722	T	6	6	173623	173628	0 %	100 %	0 %	0 %	408502052
3119	NC_018722	A	7	7	173636	173642	100 %	0 %	0 %	0 %	408502052
3120	NC_018722	T	6	6	173711	173716	0 %	100 %	0 %	0 %	408502052
3121	NC_018722	CGTGA	2	10	173771	173780	20 %	20 %	40 %	20 %	408502052
3122	NC_018722	CTTGC	2	10	173796	173805	0 %	40 %	20 %	40 %	408502052
3123	NC_018722	GCG	2	6	173816	173821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502052
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3126	NC_018722	A	6	6	173846	173851	100 %	0 %	0 %	0 %	408502052
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3376	NC_018722	CG	3	6	185134	185139	0 %	0 %	50 %	50 %	408502063
3377	NC_018722	G	6	6	185165	185170	0 %	0 %	100 %	0 %	408502063
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3383	NC_018722	CGT	2	6	185416	185421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502063
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3385	NC_018722	CG	3	6	185478	185483	0 %	0 %	50 %	50 %	408502063
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3424	NC_018722	TCA	2	6	188086	188091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502066
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3443	NC_018722	TG	3	6	188992	188997	0 %	50 %	50 %	0 %	408502067
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3483	NC_018722	TAAC	2	8	190953	190960	50 %	25 %	0 %	25 %	408502069
3484	NC_018722	TGC	2	6	191295	191300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502070
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3494	NC_018722	TGCAG	2	10	191556	191565	20 %	20 %	40 %	20 %	408502070
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3499	NC_018722	GTG	2	6	192079	192084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502070
3500	NC_018722	TGA	2	6	192294	192299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502071

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