MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018722	GCC	2	6	86750	86755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408501981
1502	NC_018722	T	7	7	86786	86792	0 %	100 %	0 %	0 %	408501981
1503	NC_018722	ATTTGT	2	12	86826	86837	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408501981
1504	NC_018722	ATT	2	6	86887	86892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408501981
1505	NC_018722	T	6	6	86948	86953	0 %	100 %	0 %	0 %	408501981
1506	NC_018722	TG	3	6	86964	86969	0 %	50 %	50 %	0 %	408501981
1507	NC_018722	ACGCTT	2	12	87014	87025	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408501981
1508	NC_018722	GTG	2	6	87077	87082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408501981
1509	NC_018722	CGCAC	2	10	87083	87092	20 %	0 %	20 %	60 %	408501981
1510	NC_018722	AT	4	8	87115	87122	50 %	50 %	0 %	0 %	408501981
1511	NC_018722	GC	3	6	87145	87150	0 %	0 %	50 %	50 %	408501982
1512	NC_018722	CG	3	6	87185	87190	0 %	0 %	50 %	50 %	408501982
1513	NC_018722	TGC	2	6	87200	87205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501982
1514	NC_018722	CT	3	6	87222	87227	0 %	50 %	0 %	50 %	408501982
1515	NC_018722	GCA	2	6	87253	87258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408501982
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1517	NC_018722	TGA	2	6	87366	87371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408501982
1518	NC_018722	TGG	2	6	87401	87406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408501982
1519	NC_018722	CA	3	6	87527	87532	50 %	0 %	0 %	50 %	408501982
1520	NC_018722	CTC	2	6	87540	87545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408501982
1521	NC_018722	ACT	2	6	87569	87574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408501982
1522	NC_018722	GCT	2	6	87631	87636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501982
1523	NC_018722	GCA	2	6	87714	87719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408501982
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1527	NC_018722	GATC	2	8	87960	87967	25 %	25 %	25 %	25 %	408501982
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1529	NC_018722	AT	3	6	88145	88150	50 %	50 %	0 %	0 %	408501982
1530	NC_018722	TG	3	6	88226	88231	0 %	50 %	50 %	0 %	408501982
1531	NC_018722	AGGA	2	8	88232	88239	50 %	0 %	50 %	0 %	408501982
1532	NC_018722	TCG	2	6	88245	88250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501982
1533	NC_018722	GC	3	6	88411	88416	0 %	0 %	50 %	50 %	408501982
1534	NC_018722	TCA	2	6	88475	88480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408501982
1535	NC_018722	GGA	2	6	88497	88502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408501982
1536	NC_018722	T	6	6	88510	88515	0 %	100 %	0 %	0 %	408501982
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1539	NC_018722	AAG	2	6	88681	88686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408501982
1540	NC_018722	GTG	2	6	88702	88707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408501982
1541	NC_018722	CTG	2	6	88778	88783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501982
1542	NC_018722	GCAC	2	8	88838	88845	25 %	0 %	25 %	50 %	408501982
1543	NC_018722	TAT	2	6	88860	88865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408501982
1544	NC_018722	GTTT	2	8	88917	88924	0 %	75 %	25 %	0 %	408501982
1545	NC_018722	GTACC	2	10	88959	88968	20 %	20 %	20 %	40 %	408501982
1546	NC_018722	GC	3	6	89029	89034	0 %	0 %	50 %	50 %	408501982
1547	NC_018722	ATC	2	6	89050	89055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408501982
1548	NC_018722	ATCC	2	8	89057	89064	25 %	25 %	0 %	50 %	408501982
1549	NC_018722	CTC	2	6	89069	89074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408501982
1550	NC_018722	TGC	3	9	89103	89111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501982
1551	NC_018722	CTG	2	6	89147	89152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501982
1552	NC_018722	TAC	2	6	89155	89160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408501982
1553	NC_018722	GCA	2	6	89161	89166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408501982
1554	NC_018722	TTG	2	6	89216	89221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408501982
1555	NC_018722	T	6	6	89231	89236	0 %	100 %	0 %	0 %	408501982
1556	NC_018722	CTTC	2	8	89364	89371	0 %	50 %	0 %	50 %	408501983
1557	NC_018722	GA	3	6	89395	89400	50 %	0 %	50 %	0 %	408501983
1558	NC_018722	T	6	6	89457	89462	0 %	100 %	0 %	0 %	408501983
1559	NC_018722	T	7	7	89495	89501	0 %	100 %	0 %	0 %	408501983
1560	NC_018722	TTG	2	6	89527	89532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408501983
1561	NC_018722	GCA	2	6	89543	89548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408501983
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1563	NC_018722	TTA	2	6	89604	89609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408501983
1564	NC_018722	GAA	2	6	89631	89636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408501983
1565	NC_018722	TTAT	2	8	89776	89783	25 %	75 %	0 %	0 %	408501984
1566	NC_018722	TG	3	6	89806	89811	0 %	50 %	50 %	0 %	408501984
1567	NC_018722	TAC	2	6	89815	89820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408501984
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1569	NC_018722	TGG	2	6	89972	89977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408501984
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1573	NC_018722	CGCA	2	8	90049	90056	25 %	0 %	25 %	50 %	408501984
1574	NC_018722	G	6	6	90090	90095	0 %	0 %	100 %	0 %	408501984
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1582	NC_018722	CTG	2	6	90561	90566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501984
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1588	NC_018722	GGTAT	2	10	92301	92310	20 %	40 %	40 %	0 %	408501985
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1598	NC_018722	GGAT	2	8	93902	93909	25 %	25 %	50 %	0 %	408501986
1599	NC_018722	CG	4	8	93942	93949	0 %	0 %	50 %	50 %	408501986
1600	NC_018722	GGT	2	6	93995	94000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408501986
1601	NC_018722	GC	4	8	94010	94017	0 %	0 %	50 %	50 %	408501986
1602	NC_018722	CTA	3	9	94140	94148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408501986
1603	NC_018722	GGT	2	6	94185	94190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408501986
1604	NC_018722	CTAC	2	8	94215	94222	25 %	25 %	0 %	50 %	408501986
1605	NC_018722	TAC	2	6	94243	94248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408501986
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1608	NC_018722	AAC	2	6	94318	94323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408501986
1609	NC_018722	GC	4	8	94355	94362	0 %	0 %	50 %	50 %	408501986
1610	NC_018722	GCC	2	6	94371	94376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408501986
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1612	NC_018722	GCT	2	6	94502	94507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501987
1613	NC_018722	AAC	2	6	94523	94528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408501987
1614	NC_018722	T	7	7	94599	94605	0 %	100 %	0 %	0 %	408501987
1615	NC_018722	GC	4	8	94640	94647	0 %	0 %	50 %	50 %	408501987
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1619	NC_018722	TCGA	2	8	95092	95099	25 %	25 %	25 %	25 %	408501988
1620	NC_018722	CA	3	6	95101	95106	50 %	0 %	0 %	50 %	408501988
1621	NC_018722	GCA	2	6	95114	95119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408501988
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1623	NC_018722	TCC	2	6	95177	95182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408501988
1624	NC_018722	ATTC	2	8	95239	95246	25 %	50 %	0 %	25 %	408501988
1625	NC_018722	GC	3	6	95355	95360	0 %	0 %	50 %	50 %	408501989
1626	NC_018722	CCA	2	6	95371	95376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408501989
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1755	NC_018722	GTG	2	6	101795	101800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408501995
1756	NC_018722	CGT	2	6	101828	101833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501995
1757	NC_018722	CG	3	6	101865	101870	0 %	0 %	50 %	50 %	408501995
1758	NC_018722	TG	3	6	101875	101880	0 %	50 %	50 %	0 %	408501995
1759	NC_018722	GC	3	6	101935	101940	0 %	0 %	50 %	50 %	408501995
1760	NC_018722	GC	3	6	102071	102076	0 %	0 %	50 %	50 %	408501995
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1762	NC_018722	TGC	2	6	102128	102133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501996
1763	NC_018722	GC	3	6	102187	102192	0 %	0 %	50 %	50 %	408501996
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