MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_018722	TAC	2	6	604921	604926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502425
11502	NC_018722	CA	5	10	604948	604957	50 %	0 %	0 %	50 %	408502425
11503	NC_018722	ACAA	2	8	605009	605016	75 %	0 %	0 %	25 %	408502425
11504	NC_018722	CACC	2	8	605166	605173	25 %	0 %	0 %	75 %	408502425
11505	NC_018722	AGA	2	6	605180	605185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502425
11506	NC_018722	TG	3	6	605236	605241	0 %	50 %	50 %	0 %	408502425
11507	NC_018722	CTG	2	6	605260	605265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502425
11508	NC_018722	AAAT	2	8	605271	605278	75 %	25 %	0 %	0 %	408502425
11509	NC_018722	A	6	6	605397	605402	100 %	0 %	0 %	0 %	408502426
11510	NC_018722	GC	3	6	605411	605416	0 %	0 %	50 %	50 %	408502426
11511	NC_018722	ATC	2	6	605433	605438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502426
11512	NC_018722	G	6	6	605444	605449	0 %	0 %	100 %	0 %	408502426
11513	NC_018722	CG	3	6	605529	605534	0 %	0 %	50 %	50 %	408502426
11514	NC_018722	GATAC	2	10	605584	605593	40 %	20 %	20 %	20 %	408502426
11515	NC_018722	A	6	6	605616	605621	100 %	0 %	0 %	0 %	408502426
11516	NC_018722	CAG	2	6	605628	605633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502426
11517	NC_018722	TTCT	2	8	605669	605676	0 %	75 %	0 %	25 %	408502426
11518	NC_018722	GCTC	2	8	605715	605722	0 %	25 %	25 %	50 %	408502426
11519	NC_018722	AGC	2	6	605726	605731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502426
11520	NC_018722	CAGT	2	8	605745	605752	25 %	25 %	25 %	25 %	408502426
11521	NC_018722	GCA	2	6	605753	605758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502426
11522	NC_018722	GTCA	2	8	605766	605773	25 %	25 %	25 %	25 %	408502426
11523	NC_018722	TG	3	6	605933	605938	0 %	50 %	50 %	0 %	408502426
11524	NC_018722	GC	3	6	605946	605951	0 %	0 %	50 %	50 %	408502426
11525	NC_018722	TTG	2	6	605971	605976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502426
11526	NC_018722	AACCG	2	10	605979	605988	40 %	0 %	20 %	40 %	408502426
11527	NC_018722	TAC	2	6	605997	606002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502426
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11529	NC_018722	GAA	2	6	606139	606144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502427
11530	NC_018722	CG	3	6	606161	606166	0 %	0 %	50 %	50 %	408502427
11531	NC_018722	GC	3	6	606177	606182	0 %	0 %	50 %	50 %	408502427
11532	NC_018722	T	7	7	606217	606223	0 %	100 %	0 %	0 %	408502427
11533	NC_018722	GGC	2	6	606224	606229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502427
11534	NC_018722	CG	3	6	606235	606240	0 %	0 %	50 %	50 %	408502427
11535	NC_018722	TGC	2	6	606270	606275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502427
11536	NC_018722	GCC	2	6	606308	606313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502427
11537	NC_018722	CG	3	6	606344	606349	0 %	0 %	50 %	50 %	408502427
11538	NC_018722	TGG	2	6	606350	606355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502427
11539	NC_018722	T	6	6	606426	606431	0 %	100 %	0 %	0 %	408502427
11540	NC_018722	GGA	2	6	606444	606449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502427
11541	NC_018722	TG	3	6	606457	606462	0 %	50 %	50 %	0 %	408502427
11542	NC_018722	GCG	2	6	606491	606496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502427
11543	NC_018722	GT	3	6	606540	606545	0 %	50 %	50 %	0 %	408502427
11544	NC_018722	CA	3	6	606561	606566	50 %	0 %	0 %	50 %	408502427
11545	NC_018722	GCAC	2	8	606569	606576	25 %	0 %	25 %	50 %	408502427
11546	NC_018722	CTT	2	6	606616	606621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502427
11547	NC_018722	TC	4	8	606630	606637	0 %	50 %	0 %	50 %	408502427
11548	NC_018722	CGGG	2	8	606666	606673	0 %	0 %	75 %	25 %	408502427
11549	NC_018722	GC	3	6	606696	606701	0 %	0 %	50 %	50 %	408502427
11550	NC_018722	GT	3	6	606710	606715	0 %	50 %	50 %	0 %	408502427
11551	NC_018722	TTTA	2	8	606769	606776	25 %	75 %	0 %	0 %	408502427
11552	NC_018722	CTG	2	6	606783	606788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502427
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11554	NC_018722	TGA	2	6	606798	606803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502427
11555	NC_018722	T	6	6	606924	606929	0 %	100 %	0 %	0 %	408502427
11556	NC_018722	AGA	2	6	606939	606944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502427
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11558	NC_018722	AAG	2	6	607158	607163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502428
11559	NC_018722	GCAG	2	8	607248	607255	25 %	0 %	50 %	25 %	408502428
11560	NC_018722	CCT	2	6	607276	607281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502428
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11562	NC_018722	CTG	2	6	607320	607325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502428
11563	NC_018722	GCT	3	9	607341	607349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502428
11564	NC_018722	CGCT	2	8	607405	607412	0 %	25 %	25 %	50 %	408502428
11565	NC_018722	GC	3	6	607413	607418	0 %	0 %	50 %	50 %	408502428
11566	NC_018722	GGCGC	2	10	607445	607454	0 %	0 %	60 %	40 %	408502428
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11571	NC_018722	CCT	2	6	607761	607766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502428
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11573	NC_018722	GACA	2	8	607847	607854	50 %	0 %	25 %	25 %	408502428
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11575	NC_018722	GCCCCT	2	12	607878	607889	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	408502428
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11578	NC_018722	CCGC	2	8	608054	608061	0 %	0 %	25 %	75 %	408502428
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11599	NC_018722	AGCG	2	8	608908	608915	25 %	0 %	50 %	25 %	408502429
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11604	NC_018722	CCG	2	6	609071	609076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502429
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11606	NC_018722	CAGAG	2	10	609240	609249	40 %	0 %	40 %	20 %	408502429
11607	NC_018722	GACA	2	8	609312	609319	50 %	0 %	25 %	25 %	408502429
11608	NC_018722	AGCT	2	8	609325	609332	25 %	25 %	25 %	25 %	408502429
11609	NC_018722	AGC	2	6	609361	609366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502429
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11611	NC_018722	T	6	6	609527	609532	0 %	100 %	0 %	0 %	408502429
11612	NC_018722	CT	3	6	609535	609540	0 %	50 %	0 %	50 %	408502429
11613	NC_018722	CG	3	6	609575	609580	0 %	0 %	50 %	50 %	408502429
11614	NC_018722	AAT	2	6	609610	609615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502429
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11623	NC_018722	GTT	2	6	610007	610012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502429
11624	NC_018722	CGT	2	6	610101	610106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502429
11625	NC_018722	GCA	2	6	610124	610129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502429
11626	NC_018722	GCA	2	6	610232	610237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502429
11627	NC_018722	CTG	2	6	610242	610247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502429
11628	NC_018722	CG	3	6	610327	610332	0 %	0 %	50 %	50 %	408502429
11629	NC_018722	CTT	2	6	610338	610343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502429
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11639	NC_018722	CTG	2	6	610743	610748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502430
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11655	NC_018722	GCA	3	9	611606	611614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502431
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11742	NC_018722	CA	3	6	615654	615659	50 %	0 %	0 %	50 %	408502434
11743	NC_018722	GTT	2	6	615704	615709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502434
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11990	NC_018722	GC	3	6	627849	627854	0 %	0 %	50 %	50 %	408502444
11991	NC_018722	GCT	2	6	627870	627875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502444
11992	NC_018722	GCA	2	6	627876	627881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502444
11993	NC_018722	CG	4	8	627903	627910	0 %	0 %	50 %	50 %	408502444
11994	NC_018722	TGCGC	2	10	627968	627977	0 %	20 %	40 %	40 %	408502444
11995	NC_018722	GC	3	6	627995	628000	0 %	0 %	50 %	50 %	408502444
11996	NC_018722	TCC	2	6	628053	628058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502444
11997	NC_018722	T	6	6	628060	628065	0 %	100 %	0 %	0 %	408502444
11998	NC_018722	AGG	2	6	628163	628168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502444
11999	NC_018722	GCG	2	6	628226	628231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502444
12000	NC_018722	ACTT	2	8	628255	628262	25 %	50 %	0 %	25 %	408502444

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