MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018722	CGG	2	6	308711	308716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502181
5502	NC_018722	GTA	2	6	308896	308901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502181
5503	NC_018722	TTC	2	6	308943	308948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502181
5504	NC_018722	A	6	6	308955	308960	100 %	0 %	0 %	0 %	408502181
5505	NC_018722	GAT	2	6	308970	308975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502181
5506	NC_018722	ATT	2	6	308990	308995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502181
5507	NC_018722	GGT	2	6	308997	309002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502181
5508	NC_018722	CTTT	2	8	309176	309183	0 %	75 %	0 %	25 %	408502181
5509	NC_018722	TGA	2	6	309207	309212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502181
5510	NC_018722	TC	3	6	309233	309238	0 %	50 %	0 %	50 %	408502181
5511	NC_018722	ATT	2	6	309241	309246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502181
5512	NC_018722	CA	4	8	309265	309272	50 %	0 %	0 %	50 %	408502181
5513	NC_018722	GTT	2	6	309315	309320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502181
5514	NC_018722	CG	4	8	309321	309328	0 %	0 %	50 %	50 %	408502181
5515	NC_018722	CG	3	6	309333	309338	0 %	0 %	50 %	50 %	408502181
5516	NC_018722	TCA	2	6	309342	309347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502181
5517	NC_018722	AATC	2	8	309349	309356	50 %	25 %	0 %	25 %	408502181
5518	NC_018722	GAT	2	6	309373	309378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502181
5519	NC_018722	ATC	2	6	309385	309390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502181
5520	NC_018722	CGCT	2	8	309405	309412	0 %	25 %	25 %	50 %	408502181
5521	NC_018722	CG	3	6	309431	309436	0 %	0 %	50 %	50 %	408502181
5522	NC_018722	GCG	2	6	309508	309513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502182
5523	NC_018722	ATT	2	6	309514	309519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502182
5524	NC_018722	T	6	6	309598	309603	0 %	100 %	0 %	0 %	408502182
5525	NC_018722	CGTGC	2	10	309622	309631	0 %	20 %	40 %	40 %	408502182
5526	NC_018722	CGT	2	6	309672	309677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502182
5527	NC_018722	AAG	2	6	309688	309693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502182
5528	NC_018722	CGGTG	2	10	309748	309757	0 %	20 %	60 %	20 %	408502182
5529	NC_018722	T	7	7	309764	309770	0 %	100 %	0 %	0 %	408502182
5530	NC_018722	T	6	6	309826	309831	0 %	100 %	0 %	0 %	408502182
5531	NC_018722	TCT	2	6	309835	309840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502182
5532	NC_018722	AT	3	6	309853	309858	50 %	50 %	0 %	0 %	408502182
5533	NC_018722	CG	3	6	309934	309939	0 %	0 %	50 %	50 %	408502182
5534	NC_018722	TTG	2	6	309989	309994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502182
5535	NC_018722	CCT	2	6	309995	310000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502182
5536	NC_018722	GCG	2	6	310022	310027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502182
5537	NC_018722	GCA	2	6	310042	310047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502182
5538	NC_018722	ATGT	2	8	310115	310122	25 %	50 %	25 %	0 %	408502182
5539	NC_018722	CCT	2	6	310132	310137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502182
5540	NC_018722	GCG	2	6	310248	310253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502182
5541	NC_018722	ATG	2	6	310316	310321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502182
5542	NC_018722	C	6	6	310327	310332	0 %	0 %	0 %	100 %	408502182
5543	NC_018722	GTG	2	6	310336	310341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502182
5544	NC_018722	GT	3	6	310381	310386	0 %	50 %	50 %	0 %	408502182
5545	NC_018722	GTTG	2	8	310466	310473	0 %	50 %	50 %	0 %	408502182
5546	NC_018722	GTT	2	6	310499	310504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502182
5547	NC_018722	GT	3	6	310557	310562	0 %	50 %	50 %	0 %	408502182
5548	NC_018722	CAG	2	6	310592	310597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502182
5549	NC_018722	GTC	2	6	310610	310615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502182
5550	NC_018722	TGC	2	6	310680	310685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502182
5551	NC_018722	GTG	2	6	310830	310835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502183
5552	NC_018722	GAA	2	6	310840	310845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502183
5553	NC_018722	GC	3	6	310898	310903	0 %	0 %	50 %	50 %	408502183
5554	NC_018722	TAG	2	6	310938	310943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502183
5555	NC_018722	GGCTGC	2	12	310957	310968	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	408502183
5556	NC_018722	GC	3	6	310967	310972	0 %	0 %	50 %	50 %	408502183
5557	NC_018722	GGC	2	6	310997	311002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502183
5558	NC_018722	GT	3	6	311022	311027	0 %	50 %	50 %	0 %	408502183
5559	NC_018722	ACT	2	6	311047	311052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502183
5560	NC_018722	GCA	3	9	311053	311061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502183
5561	NC_018722	TG	3	6	311097	311102	0 %	50 %	50 %	0 %	408502183
5562	NC_018722	GC	5	10	311111	311120	0 %	0 %	50 %	50 %	408502183
5563	NC_018722	GTTTT	2	10	311193	311202	0 %	80 %	20 %	0 %	408502183
5564	NC_018722	AGA	2	6	311435	311440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502184
5565	NC_018722	GT	3	6	311468	311473	0 %	50 %	50 %	0 %	408502184
5566	NC_018722	ATT	2	6	311482	311487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502184
5567	NC_018722	TGT	2	6	311504	311509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502184
5568	NC_018722	CCTA	2	8	311515	311522	25 %	25 %	0 %	50 %	408502184
5569	NC_018722	TTC	2	6	311523	311528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502184
5570	NC_018722	GTG	2	6	311570	311575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502184
5571	NC_018722	A	6	6	311616	311621	100 %	0 %	0 %	0 %	408502184
5572	NC_018722	A	6	6	311627	311632	100 %	0 %	0 %	0 %	408502184
5573	NC_018722	GGT	2	6	311688	311693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502184
5574	NC_018722	TCC	2	6	311736	311741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502184
5575	NC_018722	CAGGA	2	10	311770	311779	40 %	0 %	40 %	20 %	408502184
5576	NC_018722	TTG	2	6	311897	311902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502184
5577	NC_018722	GC	3	6	311914	311919	0 %	0 %	50 %	50 %	408502184
5578	NC_018722	CTG	2	6	311942	311947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502184
5579	NC_018722	TA	3	6	312125	312130	50 %	50 %	0 %	0 %	408502184
5580	NC_018722	CGGTG	2	10	312339	312348	0 %	20 %	60 %	20 %	408502185
5581	NC_018722	TG	3	6	312347	312352	0 %	50 %	50 %	0 %	408502185
5582	NC_018722	GC	3	6	312414	312419	0 %	0 %	50 %	50 %	408502185
5583	NC_018722	TGT	2	6	312476	312481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502185
5584	NC_018722	CG	3	6	312514	312519	0 %	0 %	50 %	50 %	408502185
5585	NC_018722	GCA	2	6	312527	312532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502185
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5587	NC_018722	TGC	2	6	312597	312602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502185
5588	NC_018722	CGC	2	6	312713	312718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502185
5589	NC_018722	AGTG	2	8	312792	312799	25 %	25 %	50 %	0 %	408502185
5590	NC_018722	A	7	7	312829	312835	100 %	0 %	0 %	0 %	408502185
5591	NC_018722	TGA	2	6	312866	312871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502185
5592	NC_018722	TAT	2	6	312879	312884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502185
5593	NC_018722	GTG	2	6	312943	312948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502185
5594	NC_018722	ATG	2	6	313018	313023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502185
5595	NC_018722	GCG	2	6	313031	313036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502185
5596	NC_018722	CG	3	6	313062	313067	0 %	0 %	50 %	50 %	408502185
5597	NC_018722	CGCTG	2	10	313178	313187	0 %	20 %	40 %	40 %	408502185
5598	NC_018722	GTAC	2	8	313242	313249	25 %	25 %	25 %	25 %	408502185
5599	NC_018722	TGA	2	6	313363	313368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502185
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5601	NC_018722	GC	3	6	313395	313400	0 %	0 %	50 %	50 %	408502186
5602	NC_018722	CG	3	6	313438	313443	0 %	0 %	50 %	50 %	408502186
5603	NC_018722	GC	3	6	313496	313501	0 %	0 %	50 %	50 %	408502186
5604	NC_018722	CGA	2	6	313505	313510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502186
5605	NC_018722	CA	3	6	313515	313520	50 %	0 %	0 %	50 %	408502186
5606	NC_018722	GC	3	6	313540	313545	0 %	0 %	50 %	50 %	408502186
5607	NC_018722	GACG	2	8	313550	313557	25 %	0 %	50 %	25 %	408502186
5608	NC_018722	T	6	6	313596	313601	0 %	100 %	0 %	0 %	408502186
5609	NC_018722	GTT	2	6	313619	313624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502186
5610	NC_018722	A	6	6	313628	313633	100 %	0 %	0 %	0 %	408502186
5611	NC_018722	TGGA	2	8	313705	313712	25 %	25 %	50 %	0 %	408502186
5612	NC_018722	AGC	2	6	313717	313722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502186
5613	NC_018722	TGC	2	6	313829	313834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502186
5614	NC_018722	GGTG	2	8	313849	313856	0 %	25 %	75 %	0 %	408502186
5615	NC_018722	GA	3	6	313871	313876	50 %	0 %	50 %	0 %	408502186
5616	NC_018722	GAA	2	6	313916	313921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502186
5617	NC_018722	GAA	2	6	313923	313928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502186
5618	NC_018722	T	6	6	313959	313964	0 %	100 %	0 %	0 %	408502186
5619	NC_018722	TCA	2	6	314002	314007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502186
5620	NC_018722	TTTTC	2	10	314050	314059	0 %	80 %	0 %	20 %	408502186
5621	NC_018722	T	6	6	314073	314078	0 %	100 %	0 %	0 %	408502186
5622	NC_018722	TTC	2	6	314084	314089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502186
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5749	NC_018722	GCA	2	6	319868	319873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502190
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5752	NC_018722	A	6	6	319940	319945	100 %	0 %	0 %	0 %	408502190
5753	NC_018722	CCG	2	6	319995	320000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502190
5754	NC_018722	A	6	6	320102	320107	100 %	0 %	0 %	0 %	408502190
5755	NC_018722	GT	3	6	320190	320195	0 %	50 %	50 %	0 %	408502190
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5763	NC_018722	CGT	2	6	320611	320616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502190
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5769	NC_018722	ACA	2	6	320875	320880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502190
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5863	NC_018722	CG	3	6	325467	325472	0 %	0 %	50 %	50 %	408502193
5864	NC_018722	CG	3	6	325502	325507	0 %	0 %	50 %	50 %	408502193
5865	NC_018722	TGCAGG	2	12	325526	325537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408502193
5866	NC_018722	TG	3	6	325621	325626	0 %	50 %	50 %	0 %	408502193
5867	NC_018722	G	7	7	325645	325651	0 %	0 %	100 %	0 %	408502193
5868	NC_018722	G	6	6	325683	325688	0 %	0 %	100 %	0 %	408502193
5869	NC_018722	G	7	7	325743	325749	0 %	0 %	100 %	0 %	408502193
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5994	NC_018722	TAC	2	6	331905	331910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502199
5995	NC_018722	CCA	2	6	332034	332039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502199
5996	NC_018722	CCG	2	6	332129	332134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502199
5997	NC_018722	GA	4	8	332165	332172	50 %	0 %	50 %	0 %	408502199
5998	NC_018722	CGC	2	6	332179	332184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502199
5999	NC_018722	GC	3	6	332271	332276	0 %	0 %	50 %	50 %	408502199
6000	NC_018722	CGC	2	6	333610	333615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502200

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