MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_018722	GTAT	2	8	278247	278254	25 %	50 %	25 %	0 %	408502159
5003	NC_018722	GCG	2	6	278296	278301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502159
5004	NC_018722	GGC	2	6	278354	278359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502159
5005	NC_018722	AC	3	6	278527	278532	50 %	0 %	0 %	50 %	408502159
5006	NC_018722	AGGC	2	8	278592	278599	25 %	0 %	50 %	25 %	408502159
5007	NC_018722	TAG	2	6	278618	278623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502159
5008	NC_018722	GC	3	6	278674	278679	0 %	0 %	50 %	50 %	408502159
5009	NC_018722	GGCG	2	8	278701	278708	0 %	0 %	75 %	25 %	408502159
5010	NC_018722	A	6	6	278744	278749	100 %	0 %	0 %	0 %	408502159
5011	NC_018722	GGGA	2	8	278810	278817	25 %	0 %	75 %	0 %	408502159
5012	NC_018722	GTG	2	6	278895	278900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502159
5013	NC_018722	AGG	2	6	278989	278994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502159
5014	NC_018722	AGG	2	6	279003	279008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502159
5015	NC_018722	GT	3	6	279063	279068	0 %	50 %	50 %	0 %	408502159
5016	NC_018722	GAA	2	6	279098	279103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502159
5017	NC_018722	TGT	2	6	279107	279112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502159
5018	NC_018722	AT	3	6	279113	279118	50 %	50 %	0 %	0 %	408502159
5019	NC_018722	AGT	2	6	279129	279134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502159
5020	NC_018722	GATG	2	8	279148	279155	25 %	25 %	50 %	0 %	408502159
5021	NC_018722	G	6	6	279401	279406	0 %	0 %	100 %	0 %	408502159
5022	NC_018722	GAA	3	9	279428	279436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502159
5023	NC_018722	GTAT	2	8	279471	279478	25 %	50 %	25 %	0 %	408502159
5024	NC_018722	GAT	2	6	284792	284797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502160
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5030	NC_018722	GT	3	6	285190	285195	0 %	50 %	50 %	0 %	408502161
5031	NC_018722	GCA	2	6	285210	285215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502161
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5033	NC_018722	TGC	2	6	285265	285270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502161
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5039	NC_018722	CCG	2	6	285515	285520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502161
5040	NC_018722	TAT	2	6	285523	285528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502161
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5042	NC_018722	TGG	2	6	285622	285627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502161
5043	NC_018722	GC	3	6	285651	285656	0 %	0 %	50 %	50 %	408502161
5044	NC_018722	GTAG	2	8	285764	285771	25 %	25 %	50 %	0 %	408502161
5045	NC_018722	GTC	2	6	285812	285817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502162
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5047	NC_018722	AGG	2	6	285860	285865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502162
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5049	NC_018722	GGCGC	2	10	285957	285966	0 %	0 %	60 %	40 %	408502162
5050	NC_018722	TCGT	2	8	285968	285975	0 %	50 %	25 %	25 %	408502162
5051	NC_018722	GAT	2	6	286060	286065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502162
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5053	NC_018722	TGCG	2	8	286181	286188	0 %	25 %	50 %	25 %	408502162
5054	NC_018722	CTT	2	6	286196	286201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502162
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5056	NC_018722	A	7	7	286207	286213	100 %	0 %	0 %	0 %	408502162
5057	NC_018722	CG	3	6	286307	286312	0 %	0 %	50 %	50 %	408502162
5058	NC_018722	T	6	6	286374	286379	0 %	100 %	0 %	0 %	408502162
5059	NC_018722	AC	3	6	286480	286485	50 %	0 %	0 %	50 %	408502162
5060	NC_018722	TTA	2	6	286594	286599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502162
5061	NC_018722	T	6	6	286674	286679	0 %	100 %	0 %	0 %	408502162
5062	NC_018722	CG	3	6	286697	286702	0 %	0 %	50 %	50 %	408502162
5063	NC_018722	TCATTT	2	12	286710	286721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408502162
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5066	NC_018722	GAA	2	6	286822	286827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502162
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5071	NC_018722	GGT	2	6	287091	287096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502162
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5075	NC_018722	GCT	2	6	287326	287331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502163
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5124	NC_018722	T	7	7	289481	289487	0 %	100 %	0 %	0 %	408502164
5125	NC_018722	CTGG	2	8	289497	289504	0 %	25 %	50 %	25 %	408502164
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5133	NC_018722	CTA	2	6	290170	290175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502165
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5145	NC_018722	GT	3	6	290933	290938	0 %	50 %	50 %	0 %	408502166
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5232	NC_018722	TTCT	2	8	295642	295649	0 %	75 %	0 %	25 %	408502171
5233	NC_018722	CGC	2	6	295666	295671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502171
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5240	NC_018722	GC	3	6	295844	295849	0 %	0 %	50 %	50 %	408502171
5241	NC_018722	CTG	2	6	295910	295915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502171
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5243	NC_018722	CGT	2	6	296111	296116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502171
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5245	NC_018722	GC	4	8	296167	296174	0 %	0 %	50 %	50 %	408502171
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5247	NC_018722	G	7	7	296203	296209	0 %	0 %	100 %	0 %	408502171
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5372	NC_018722	ATG	2	6	303014	303019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502176
5373	NC_018722	CT	3	6	303053	303058	0 %	50 %	0 %	50 %	408502176
5374	NC_018722	ATGCGT	2	12	303075	303086	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502176
5375	NC_018722	CG	3	6	303088	303093	0 %	0 %	50 %	50 %	408502176
5376	NC_018722	GGT	3	9	303097	303105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502176
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5379	NC_018722	G	6	6	303373	303378	0 %	0 %	100 %	0 %	408502176
5380	NC_018722	T	6	6	303539	303544	0 %	100 %	0 %	0 %	408502176
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5384	NC_018722	AC	3	6	303593	303598	50 %	0 %	0 %	50 %	408502176
5385	NC_018722	CG	4	8	303602	303609	0 %	0 %	50 %	50 %	408502176
5386	NC_018722	ACGG	3	12	303679	303690	25 %	0 %	50 %	25 %	408502176
5387	NC_018722	CTT	2	6	303708	303713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502176
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5495	NC_018722	TG	3	6	308381	308386	0 %	50 %	50 %	0 %	408502181
5496	NC_018722	ACGT	2	8	308396	308403	25 %	25 %	25 %	25 %	408502181
5497	NC_018722	AATG	2	8	308479	308486	50 %	25 %	25 %	0 %	408502181
5498	NC_018722	ATC	2	6	308528	308533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502181
5499	NC_018722	A	7	7	308563	308569	100 %	0 %	0 %	0 %	408502181
5500	NC_018722	TGA	2	6	308591	308596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502181

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