MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacterium phage THSA-485A

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018264	TA	3	6	164	169	50 %	50 %	0 %	0 %	397912606
2	NC_018264	TC	3	6	502	507	0 %	50 %	0 %	50 %	397912607
3	NC_018264	TA	4	8	631	638	50 %	50 %	0 %	0 %	397912607
4	NC_018264	TC	3	6	725	730	0 %	50 %	0 %	50 %	397912607
5	NC_018264	AG	3	6	1003	1008	50 %	0 %	50 %	0 %	397912608
6	NC_018264	AT	3	6	1465	1470	50 %	50 %	0 %	0 %	397912609
7	NC_018264	TA	3	6	1592	1597	50 %	50 %	0 %	0 %	397912609
8	NC_018264	TA	3	6	1629	1634	50 %	50 %	0 %	0 %	397912609
9	NC_018264	AT	3	6	1704	1709	50 %	50 %	0 %	0 %	397912609
10	NC_018264	GA	3	6	2176	2181	50 %	0 %	50 %	0 %	397912610
11	NC_018264	TA	3	6	2554	2559	50 %	50 %	0 %	0 %	397912611
12	NC_018264	AT	3	6	2749	2754	50 %	50 %	0 %	0 %	397912611
13	NC_018264	CT	3	6	2765	2770	0 %	50 %	0 %	50 %	397912611
14	NC_018264	AT	4	8	3805	3812	50 %	50 %	0 %	0 %	397912613
15	NC_018264	AT	3	6	4978	4983	50 %	50 %	0 %	0 %	397912615
16	NC_018264	TC	3	6	5459	5464	0 %	50 %	0 %	50 %	397912615
17	NC_018264	TA	3	6	5510	5515	50 %	50 %	0 %	0 %	397912615
18	NC_018264	GT	3	6	6616	6621	0 %	50 %	50 %	0 %	397912616
19	NC_018264	AT	3	6	7131	7136	50 %	50 %	0 %	0 %	397912617
20	NC_018264	AT	4	8	7598	7605	50 %	50 %	0 %	0 %	397912619
21	NC_018264	AT	3	6	8285	8290	50 %	50 %	0 %	0 %	397912621
22	NC_018264	TA	3	6	8498	8503	50 %	50 %	0 %	0 %	397912622
23	NC_018264	AT	3	6	9359	9364	50 %	50 %	0 %	0 %	397912622
24	NC_018264	TA	3	6	10062	10067	50 %	50 %	0 %	0 %	397912623
25	NC_018264	TA	3	6	10397	10402	50 %	50 %	0 %	0 %	397912624
26	NC_018264	TG	3	6	10416	10421	0 %	50 %	50 %	0 %	397912624
27	NC_018264	AT	3	6	10543	10548	50 %	50 %	0 %	0 %	397912624
28	NC_018264	AT	3	6	10860	10865	50 %	50 %	0 %	0 %	397912624
29	NC_018264	AC	3	6	11002	11007	50 %	0 %	0 %	50 %	397912624
30	NC_018264	CA	3	6	11385	11390	50 %	0 %	0 %	50 %	397912624
31	NC_018264	TA	3	6	11793	11798	50 %	50 %	0 %	0 %	397912625
32	NC_018264	AT	3	6	13978	13983	50 %	50 %	0 %	0 %	397912626
33	NC_018264	TC	3	6	14330	14335	0 %	50 %	0 %	50 %	397912626
34	NC_018264	TC	3	6	14850	14855	0 %	50 %	0 %	50 %	397912626
35	NC_018264	TA	3	6	16352	16357	50 %	50 %	0 %	0 %	397912628
36	NC_018264	AT	3	6	16605	16610	50 %	50 %	0 %	0 %	397912628
37	NC_018264	TA	3	6	17100	17105	50 %	50 %	0 %	0 %	397912629
38	NC_018264	AT	3	6	17226	17231	50 %	50 %	0 %	0 %	397912629
39	NC_018264	CT	3	6	17379	17384	0 %	50 %	0 %	50 %	397912629
40	NC_018264	AT	3	6	17882	17887	50 %	50 %	0 %	0 %	397912629
41	NC_018264	GA	3	6	17951	17956	50 %	0 %	50 %	0 %	397912629
42	NC_018264	AT	3	6	18505	18510	50 %	50 %	0 %	0 %	397912631
43	NC_018264	CT	3	6	18601	18606	0 %	50 %	0 %	50 %	397912632
44	NC_018264	CT	3	6	19035	19040	0 %	50 %	0 %	50 %	397912633
45	NC_018264	TC	3	6	19156	19161	0 %	50 %	0 %	50 %	397912633
46	NC_018264	AT	3	6	19324	19329	50 %	50 %	0 %	0 %	397912633
47	NC_018264	TA	3	6	19602	19607	50 %	50 %	0 %	0 %	397912633
48	NC_018264	CT	3	6	19707	19712	0 %	50 %	0 %	50 %	397912633
49	NC_018264	TG	3	6	20535	20540	0 %	50 %	50 %	0 %	397912636
50	NC_018264	AT	3	6	20567	20572	50 %	50 %	0 %	0 %	397912636
51	NC_018264	GT	3	6	21094	21099	0 %	50 %	50 %	0 %	397912636
52	NC_018264	TC	3	6	21350	21355	0 %	50 %	0 %	50 %	397912636
53	NC_018264	GA	3	6	21413	21418	50 %	0 %	50 %	0 %	397912636
54	NC_018264	TA	3	6	22953	22958	50 %	50 %	0 %	0 %	397912637
55	NC_018264	AT	3	6	24348	24353	50 %	50 %	0 %	0 %	397912638
56	NC_018264	TA	3	6	25207	25212	50 %	50 %	0 %	0 %	397912638
57	NC_018264	AT	3	6	25690	25695	50 %	50 %	0 %	0 %	397912638
58	NC_018264	TG	3	6	25753	25758	0 %	50 %	50 %	0 %	397912638
59	NC_018264	CT	3	6	26436	26441	0 %	50 %	0 %	50 %	397912639
60	NC_018264	AT	3	6	26626	26631	50 %	50 %	0 %	0 %	397912639
61	NC_018264	TC	3	6	26685	26690	0 %	50 %	0 %	50 %	397912639
62	NC_018264	AT	3	6	26709	26714	50 %	50 %	0 %	0 %	397912639
63	NC_018264	TA	3	6	27475	27480	50 %	50 %	0 %	0 %	397912639
64	NC_018264	TC	3	6	27689	27694	0 %	50 %	0 %	50 %	397912640
65	NC_018264	TA	3	6	28001	28006	50 %	50 %	0 %	0 %	397912641
66	NC_018264	TA	3	6	28097	28102	50 %	50 %	0 %	0 %	397912641
67	NC_018264	AT	6	12	28197	28208	50 %	50 %	0 %	0 %	397912641
68	NC_018264	AT	3	6	30092	30097	50 %	50 %	0 %	0 %	397912646
69	NC_018264	AT	3	6	31378	31383	50 %	50 %	0 %	0 %	397912648
70	NC_018264	CT	3	6	31418	31423	0 %	50 %	0 %	50 %	397912648
71	NC_018264	AT	3	6	31528	31533	50 %	50 %	0 %	0 %	397912648
72	NC_018264	AT	3	6	31965	31970	50 %	50 %	0 %	0 %	397912648
73	NC_018264	TC	3	6	32057	32062	0 %	50 %	0 %	50 %	397912648
74	NC_018264	AT	5	10	33000	33009	50 %	50 %	0 %	0 %	397912648
75	NC_018264	AT	3	6	33318	33323	50 %	50 %	0 %	0 %	397912648
76	NC_018264	AT	3	6	33802	33807	50 %	50 %	0 %	0 %	397912649
77	NC_018264	TC	3	6	33892	33897	0 %	50 %	0 %	50 %	397912649
78	NC_018264	TA	3	6	34163	34168	50 %	50 %	0 %	0 %	397912650
79	NC_018264	AT	3	6	34333	34338	50 %	50 %	0 %	0 %	397912650
80	NC_018264	AT	3	6	34840	34845	50 %	50 %	0 %	0 %	397912651
81	NC_018264	TA	3	6	35391	35396	50 %	50 %	0 %	0 %	397912651
82	NC_018264	TA	3	6	35472	35477	50 %	50 %	0 %	0 %	397912651
83	NC_018264	CT	3	6	35698	35703	0 %	50 %	0 %	50 %	397912652
84	NC_018264	CT	3	6	36305	36310	0 %	50 %	0 %	50 %	397912654
85	NC_018264	TA	3	6	36566	36571	50 %	50 %	0 %	0 %	397912655
86	NC_018264	AT	3	6	37076	37081	50 %	50 %	0 %	0 %	397912655
87	NC_018264	TA	3	6	37907	37912	50 %	50 %	0 %	0 %	397912655
88	NC_018264	TC	4	8	38652	38659	0 %	50 %	0 %	50 %	397912657
89	NC_018264	TG	3	6	39993	39998	0 %	50 %	50 %	0 %	397912661
90	NC_018264	AT	4	8	40123	40130	50 %	50 %	0 %	0 %	397912661
91	NC_018264	AG	3	6	40516	40521	50 %	0 %	50 %	0 %	397912662
92	NC_018264	AG	3	6	41846	41851	50 %	0 %	50 %	0 %	397912662

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.