MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Turneriella parva DSM 21527 chromosome

Total Repeats: 80623

< Previous12...150151152153154155156157158159160161162Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
80501	NC_018020	TCG	2	6	4376365	4376370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405687
80502	NC_018020	CGG	2	6	4376438	4376443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405687
80503	NC_018020	TCG	2	6	4376487	4376492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405687
80504	NC_018020	GAT	2	6	4376636	4376641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405687
80505	NC_018020	CAT	2	6	4376669	4376674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405687
80506	NC_018020	CGG	2	6	4376732	4376737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405687
80507	NC_018020	AC	3	6	4376761	4376766	50 %	0 %	0 %	50 %	392405687
80508	NC_018020	CTG	2	6	4376794	4376799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405687
80509	NC_018020	AGA	2	6	4376918	4376923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405687
80510	NC_018020	AAG	2	6	4376959	4376964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405687
80511	NC_018020	CGG	2	6	4377227	4377232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405688
80512	NC_018020	GC	4	8	4377281	4377288	0 %	0 %	50 %	50 %	392405688
80513	NC_018020	C	7	7	4377317	4377323	0 %	0 %	0 %	100 %	392405688
80514	NC_018020	CAA	2	6	4377338	4377343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405688
80515	NC_018020	GAA	4	12	4377509	4377520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405688
80516	NC_018020	TC	3	6	4377552	4377557	0 %	50 %	0 %	50 %	392405688
80517	NC_018020	CAGT	2	8	4377622	4377629	25 %	25 %	25 %	25 %	392405688
80518	NC_018020	TCA	2	6	4377631	4377636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405688
80519	NC_018020	GC	4	8	4377648	4377655	0 %	0 %	50 %	50 %	392405688
80520	NC_018020	CGC	2	6	4377700	4377705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405688
80521	NC_018020	CATGTG	2	12	4377708	4377719	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392405688
80522	NC_018020	GCCA	2	8	4377796	4377803	25 %	0 %	25 %	50 %	392405689
80523	NC_018020	GCA	2	6	4378016	4378021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405689
80524	NC_018020	CGCTG	2	10	4378029	4378038	0 %	20 %	40 %	40 %	392405689
80525	NC_018020	CCG	2	6	4378086	4378091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405689
80526	NC_018020	T	6	6	4378147	4378152	0 %	100 %	0 %	0 %	392405689
80527	NC_018020	ATTCT	2	10	4378240	4378249	20 %	60 %	0 %	20 %	392405689
80528	NC_018020	TGC	2	6	4378252	4378257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405689
80529	NC_018020	CGA	2	6	4378266	4378271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405689
80530	NC_018020	GCGG	2	8	4378307	4378314	0 %	0 %	75 %	25 %	392405689
80531	NC_018020	GCACT	2	10	4378341	4378350	20 %	20 %	20 %	40 %	392405689
80532	NC_018020	GC	4	8	4378359	4378366	0 %	0 %	50 %	50 %	392405689
80533	NC_018020	ACG	2	6	4378398	4378403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405689
80534	NC_018020	CA	3	6	4378414	4378419	50 %	0 %	0 %	50 %	392405689
80535	NC_018020	CGA	2	6	4378441	4378446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405689
80536	NC_018020	AGC	2	6	4378521	4378526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405689
80537	NC_018020	T	6	6	4378565	4378570	0 %	100 %	0 %	0 %	392405689
80538	NC_018020	CGA	2	6	4378614	4378619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405690
80539	NC_018020	CGC	2	6	4378638	4378643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405690
80540	NC_018020	TGC	2	6	4378918	4378923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405691
80541	NC_018020	C	7	7	4379007	4379013	0 %	0 %	0 %	100 %	392405691
80542	NC_018020	TGG	2	6	4379068	4379073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405691
80543	NC_018020	TTG	2	6	4379157	4379162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392405691
80544	NC_018020	AAGA	2	8	4379169	4379176	75 %	0 %	25 %	0 %	392405691
80545	NC_018020	CAT	2	6	4379210	4379215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405691
80546	NC_018020	GAA	2	6	4379276	4379281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405691
80547	NC_018020	A	6	6	4379401	4379406	100 %	0 %	0 %	0 %	392405691
80548	NC_018020	TGA	2	6	4379443	4379448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405691
80549	NC_018020	GCG	2	6	4379538	4379543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405691
80550	NC_018020	GTCGAT	2	12	4379579	4379590	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392405691
80551	NC_018020	ACC	2	6	4379823	4379828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405692
80552	NC_018020	ACG	3	9	4379888	4379896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405692
80553	NC_018020	TGT	2	6	4379909	4379914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392405692
80554	NC_018020	ATG	2	6	4379929	4379934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405692
80555	NC_018020	T	6	6	4380068	4380073	0 %	100 %	0 %	0 %	392405693
80556	NC_018020	GCC	2	6	4380132	4380137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405693
80557	NC_018020	GGCAT	2	10	4380190	4380199	20 %	20 %	40 %	20 %	392405693
80558	NC_018020	GAA	2	6	4380207	4380212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405693
80559	NC_018020	TTA	2	6	4380280	4380285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392405693
80560	NC_018020	ACG	2	6	4380303	4380308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405693
80561	NC_018020	GCA	2	6	4380320	4380325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405693
80562	NC_018020	CGA	2	6	4380368	4380373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405693
80563	NC_018020	AAC	2	6	4380387	4380392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405693
80564	NC_018020	T	6	6	4380401	4380406	0 %	100 %	0 %	0 %	392405693
80565	NC_018020	GCT	2	6	4380458	4380463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405693
80566	NC_018020	CGC	2	6	4380482	4380487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405693
80567	NC_018020	ACC	2	6	4380493	4380498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405693
80568	NC_018020	GGC	2	6	4380521	4380526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405693
80569	NC_018020	TGA	2	6	4380613	4380618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405693
80570	NC_018020	CAT	2	6	4380629	4380634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405693
80571	NC_018020	CGC	2	6	4380719	4380724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405693
80572	NC_018020	TGCCC	2	10	4380726	4380735	0 %	20 %	20 %	60 %	392405693
80573	NC_018020	TCA	2	6	4380737	4380742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405693
80574	NC_018020	CCG	2	6	4380803	4380808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405694
80575	NC_018020	T	7	7	4380812	4380818	0 %	100 %	0 %	0 %	392405694
80576	NC_018020	TAT	2	6	4380853	4380858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392405694
80577	NC_018020	GC	3	6	4381037	4381042	0 %	0 %	50 %	50 %	392405694
80578	NC_018020	GAA	2	6	4381051	4381056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405694
80579	NC_018020	AAT	2	6	4381065	4381070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392405694
80580	NC_018020	GCC	2	6	4381109	4381114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405694
80581	NC_018020	ATCT	2	8	4381149	4381156	25 %	50 %	0 %	25 %	392405694
80582	NC_018020	GAA	2	6	4381273	4381278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405694
80583	NC_018020	CAA	3	9	4381287	4381295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405694
80584	NC_018020	AGA	2	6	4381311	4381316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405694
80585	NC_018020	GGC	2	6	4381371	4381376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405694
80586	NC_018020	CGG	2	6	4381380	4381385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405694
80587	NC_018020	ACCGA	2	10	4381409	4381418	40 %	0 %	20 %	40 %	392405694
80588	NC_018020	CGC	2	6	4381448	4381453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405694
80589	NC_018020	ATC	2	6	4381474	4381479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405694
80590	NC_018020	ATC	2	6	4381558	4381563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405694
80591	NC_018020	GCG	2	6	4381564	4381569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405694
80592	NC_018020	CGA	2	6	4381698	4381703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405694
80593	NC_018020	GCG	2	6	4381783	4381788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405694
80594	NC_018020	CGC	2	6	4381899	4381904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405694
80595	NC_018020	GAC	2	6	4381906	4381911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405694
80596	NC_018020	TTG	2	6	4381976	4381981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392405694
80597	NC_018020	CTT	2	6	4381986	4381991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405694
80598	NC_018020	TGC	2	6	4382061	4382066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405694
80599	NC_018020	TCG	2	6	4382150	4382155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405694
80600	NC_018020	GCA	2	6	4382205	4382210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405694
80601	NC_018020	AGC	3	9	4382279	4382287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405694
80602	NC_018020	GCA	2	6	4382470	4382475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405694
80603	NC_018020	GCT	2	6	4382511	4382516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405694
80604	NC_018020	CT	3	6	4382552	4382557	0 %	50 %	0 %	50 %	392405694
80605	NC_018020	TTTC	2	8	4382693	4382700	0 %	75 %	0 %	25 %	392405694
80606	NC_018020	ATT	2	6	4382839	4382844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392405694
80607	NC_018020	CTA	2	6	4382874	4382879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405694
80608	NC_018020	GCA	2	6	4382915	4382920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405694
80609	NC_018020	GCT	2	6	4382937	4382942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405694
80610	NC_018020	GCG	2	6	4383038	4383043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405694
80611	NC_018020	AAC	2	6	4383064	4383069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405694
80612	NC_018020	ATT	2	6	4383076	4383081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392405694
80613	NC_018020	TGA	2	6	4383122	4383127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405695
80614	NC_018020	GCG	2	6	4383210	4383215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405695
80615	NC_018020	CAA	2	6	4383332	4383337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405695
80616	NC_018020	A	6	6	4383376	4383381	100 %	0 %	0 %	0 %	392405695
80617	NC_018020	GCAG	2	8	4383386	4383393	25 %	0 %	50 %	25 %	392405695
80618	NC_018020	CGG	2	6	4383397	4383402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405695
80619	NC_018020	GAA	2	6	4383538	4383543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405696
80620	NC_018020	ATG	3	9	4383709	4383717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405696
80621	NC_018020	TCG	2	6	4383746	4383751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405696
80622	NC_018020	GCGCA	2	10	4383757	4383766	20 %	0 %	40 %	40 %	392405696
80623	NC_018020	GCTG	2	8	4383849	4383856	0 %	25 %	50 %	25 %	392405696

< Previous12...150151152153154155156157158159160161162Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.