MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM4

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017959	CG	4	8	591	598	0 %	0 %	50 %	50 %	389875180
2	NC_017959	GC	3	6	826	831	0 %	0 %	50 %	50 %	389875180
3	NC_017959	CG	4	8	1068	1075	0 %	0 %	50 %	50 %	389875180
4	NC_017959	GC	3	6	1110	1115	0 %	0 %	50 %	50 %	389875180
5	NC_017959	GC	3	6	1793	1798	0 %	0 %	50 %	50 %	389875182
6	NC_017959	GC	3	6	2862	2867	0 %	0 %	50 %	50 %	389875183
7	NC_017959	CG	3	6	3134	3139	0 %	0 %	50 %	50 %	389875183
8	NC_017959	TG	3	6	3816	3821	0 %	50 %	50 %	0 %	389875184
9	NC_017959	GC	3	6	4104	4109	0 %	0 %	50 %	50 %	389875184
10	NC_017959	CT	3	6	4229	4234	0 %	50 %	0 %	50 %	389875184
11	NC_017959	CG	3	6	4337	4342	0 %	0 %	50 %	50 %	389875184
12	NC_017959	GC	3	6	4407	4412	0 %	0 %	50 %	50 %	389875184
13	NC_017959	CG	3	6	4780	4785	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
14	NC_017959	AG	3	6	5013	5018	50 %	0 %	50 %	0 %	389875185
15	NC_017959	CG	4	8	6099	6106	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
16	NC_017959	CG	3	6	6852	6857	0 %	0 %	50 %	50 %	389875186
17	NC_017959	GC	3	6	6891	6896	0 %	0 %	50 %	50 %	389875186
18	NC_017959	GC	3	6	7174	7179	0 %	0 %	50 %	50 %	389875186
19	NC_017959	CG	3	6	8010	8015	0 %	0 %	50 %	50 %	389875188
20	NC_017959	CG	3	6	9368	9373	0 %	0 %	50 %	50 %	389875188
21	NC_017959	GC	3	6	10323	10328	0 %	0 %	50 %	50 %	389875189
22	NC_017959	GC	3	6	10505	10510	0 %	0 %	50 %	50 %	389875189
23	NC_017959	AG	3	6	10536	10541	50 %	0 %	50 %	0 %	389875189
24	NC_017959	GA	3	6	12647	12652	50 %	0 %	50 %	0 %	389875193
25	NC_017959	CG	3	6	14039	14044	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
26	NC_017959	CG	3	6	14486	14491	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
27	NC_017959	GC	3	6	14983	14988	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
28	NC_017959	CG	3	6	15134	15139	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
29	NC_017959	GC	3	6	15317	15322	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
30	NC_017959	CG	3	6	15462	15467	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
31	NC_017959	CG	3	6	15974	15979	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
32	NC_017959	CG	3	6	16231	16236	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
33	NC_017959	GC	3	6	16284	16289	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
34	NC_017959	CG	3	6	16524	16529	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
35	NC_017959	GC	3	6	16706	16711	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
36	NC_017959	GC	3	6	19086	19091	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
37	NC_017959	GA	3	6	20068	20073	50 %	0 %	50 %	0 %	389875195
38	NC_017959	AC	3	6	20440	20445	50 %	0 %	0 %	50 %	389875195
39	NC_017959	CG	3	6	21452	21457	0 %	0 %	50 %	50 %	389875196
40	NC_017959	GC	3	6	22557	22562	0 %	0 %	50 %	50 %	389875197
41	NC_017959	GC	3	6	22860	22865	0 %	0 %	50 %	50 %	389875198
42	NC_017959	GC	3	6	23157	23162	0 %	0 %	50 %	50 %	389875198
43	NC_017959	GC	3	6	23951	23956	0 %	0 %	50 %	50 %	389875200
44	NC_017959	CG	3	6	24542	24547	0 %	0 %	50 %	50 %	389875200
45	NC_017959	GC	3	6	24600	24605	0 %	0 %	50 %	50 %	389875200
46	NC_017959	GC	3	6	24616	24621	0 %	0 %	50 %	50 %	389875200
47	NC_017959	GC	3	6	24918	24923	0 %	0 %	50 %	50 %	389875201
48	NC_017959	CG	3	6	25033	25038	0 %	0 %	50 %	50 %	389875201
49	NC_017959	GC	3	6	25101	25106	0 %	0 %	50 %	50 %	389875201
50	NC_017959	GA	3	6	26180	26185	50 %	0 %	50 %	0 %	389875202
51	NC_017959	GC	3	6	26750	26755	0 %	0 %	50 %	50 %	389875202
52	NC_017959	TG	3	6	27067	27072	0 %	50 %	50 %	0 %	389875203
53	NC_017959	GC	3	6	27101	27106	0 %	0 %	50 %	50 %	389875203
54	NC_017959	AT	3	6	27283	27288	50 %	50 %	0 %	0 %	389875203
55	NC_017959	GC	3	6	27425	27430	0 %	0 %	50 %	50 %	389875203
56	NC_017959	GC	3	6	28124	28129	0 %	0 %	50 %	50 %	389875204
57	NC_017959	CG	3	6	28672	28677	0 %	0 %	50 %	50 %	389875204
58	NC_017959	GC	3	6	29127	29132	0 %	0 %	50 %	50 %	389875205
59	NC_017959	GC	3	6	29289	29294	0 %	0 %	50 %	50 %	389875205
60	NC_017959	GC	5	10	29300	29309	0 %	0 %	50 %	50 %	389875205
61	NC_017959	CG	3	6	29373	29378	0 %	0 %	50 %	50 %	389875205
62	NC_017959	TC	3	6	29648	29653	0 %	50 %	0 %	50 %	389875205
63	NC_017959	CG	3	6	29986	29991	0 %	0 %	50 %	50 %	389875206
64	NC_017959	CG	4	8	30227	30234	0 %	0 %	50 %	50 %	389875206
65	NC_017959	GC	3	6	30872	30877	0 %	0 %	50 %	50 %	389875207
66	NC_017959	GC	3	6	31360	31365	0 %	0 %	50 %	50 %	389875207
67	NC_017959	GC	3	6	31925	31930	0 %	0 %	50 %	50 %	389875208
68	NC_017959	CG	4	8	32635	32642	0 %	0 %	50 %	50 %	389875209
69	NC_017959	CG	3	6	34050	34055	0 %	0 %	50 %	50 %	389875210
70	NC_017959	CG	3	6	34165	34170	0 %	0 %	50 %	50 %	389875210
71	NC_017959	GC	3	6	34696	34701	0 %	0 %	50 %	50 %	389875211
72	NC_017959	CG	3	6	34766	34771	0 %	0 %	50 %	50 %	389875211
73	NC_017959	GC	3	6	35414	35419	0 %	0 %	50 %	50 %	389875211
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75	NC_017959	CG	3	6	37355	37360	0 %	0 %	50 %	50 %	389875213
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77	NC_017959	GC	3	6	37843	37848	0 %	0 %	50 %	50 %	389875214
78	NC_017959	GC	4	8	37862	37869	0 %	0 %	50 %	50 %	389875214
79	NC_017959	GC	3	6	38719	38724	0 %	0 %	50 %	50 %	389875215
80	NC_017959	CG	4	8	38901	38908	0 %	0 %	50 %	50 %	389875215
81	NC_017959	GC	3	6	39080	39085	0 %	0 %	50 %	50 %	389875215
82	NC_017959	GC	3	6	39503	39508	0 %	0 %	50 %	50 %	389875215
83	NC_017959	GC	3	6	40518	40523	0 %	0 %	50 %	50 %	389875216
84	NC_017959	GC	3	6	41085	41090	0 %	0 %	50 %	50 %	389875216
85	NC_017959	CG	3	6	41320	41325	0 %	0 %	50 %	50 %	389875216
86	NC_017959	GC	3	6	41519	41524	0 %	0 %	50 %	50 %	389875217
87	NC_017959	TC	3	6	41594	41599	0 %	50 %	0 %	50 %	389875217
88	NC_017959	GC	3	6	41649	41654	0 %	0 %	50 %	50 %	389875217
89	NC_017959	GC	3	6	42361	42366	0 %	0 %	50 %	50 %	389875217
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91	NC_017959	CG	4	8	42719	42726	0 %	0 %	50 %	50 %	389875217
92	NC_017959	GC	4	8	43251	43258	0 %	0 %	50 %	50 %	389875218
93	NC_017959	CG	3	6	44625	44630	0 %	0 %	50 %	50 %	389875220
94	NC_017959	GC	3	6	45299	45304	0 %	0 %	50 %	50 %	389875221
95	NC_017959	GC	3	6	47735	47740	0 %	0 %	50 %	50 %	389875224
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100	NC_017959	CG	3	6	51285	51290	0 %	0 %	50 %	50 %	389875228
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102	NC_017959	GC	3	6	52223	52228	0 %	0 %	50 %	50 %	389875228
103	NC_017959	CG	3	6	52608	52613	0 %	0 %	50 %	50 %	389875229
104	NC_017959	GC	3	6	54256	54261	0 %	0 %	50 %	50 %	389875230
105	NC_017959	CG	4	8	54535	54542	0 %	0 %	50 %	50 %	389875230
106	NC_017959	CG	3	6	55372	55377	0 %	0 %	50 %	50 %	389875231
107	NC_017959	CG	3	6	55832	55837	0 %	0 %	50 %	50 %	389875231
108	NC_017959	GT	3	6	56288	56293	0 %	50 %	50 %	0 %	389875232
109	NC_017959	GT	3	6	58121	58126	0 %	50 %	50 %	0 %	389875232
110	NC_017959	GC	3	6	58768	58773	0 %	0 %	50 %	50 %	389875233
111	NC_017959	GA	3	6	58777	58782	50 %	0 %	50 %	0 %	389875233
112	NC_017959	CG	3	6	58863	58868	0 %	0 %	50 %	50 %	389875233
113	NC_017959	CG	3	6	59831	59836	0 %	0 %	50 %	50 %	389875234
114	NC_017959	TG	3	6	59963	59968	0 %	50 %	50 %	0 %	389875234
115	NC_017959	GC	3	6	62545	62550	0 %	0 %	50 %	50 %	389875236
116	NC_017959	CG	4	8	62856	62863	0 %	0 %	50 %	50 %	389875237
117	NC_017959	CG	3	6	66007	66012	0 %	0 %	50 %	50 %	389875239
118	NC_017959	CG	3	6	66695	66700	0 %	0 %	50 %	50 %	389875240
119	NC_017959	CG	3	6	67469	67474	0 %	0 %	50 %	50 %	389875241
120	NC_017959	CG	3	6	67585	67590	0 %	0 %	50 %	50 %	389875241
121	NC_017959	CG	3	6	68057	68062	0 %	0 %	50 %	50 %	389875242
122	NC_017959	GC	3	6	68357	68362	0 %	0 %	50 %	50 %	389875243
123	NC_017959	GC	3	6	69159	69164	0 %	0 %	50 %	50 %	389875243
124	NC_017959	GC	3	6	70004	70009	0 %	0 %	50 %	50 %	389875244
125	NC_017959	CG	3	6	70206	70211	0 %	0 %	50 %	50 %	389875244
126	NC_017959	GC	4	8	70282	70289	0 %	0 %	50 %	50 %	389875244
127	NC_017959	CG	3	6	70656	70661	0 %	0 %	50 %	50 %	389875244
128	NC_017959	CG	3	6	70981	70986	0 %	0 %	50 %	50 %	389875245
129	NC_017959	CG	3	6	71080	71085	0 %	0 %	50 %	50 %	389875245
130	NC_017959	CG	3	6	71219	71224	0 %	0 %	50 %	50 %	389875245
131	NC_017959	GC	3	6	71371	71376	0 %	0 %	50 %	50 %	389875245
132	NC_017959	GC	3	6	71519	71524	0 %	0 %	50 %	50 %	389875245
133	NC_017959	GC	3	6	71700	71705	0 %	0 %	50 %	50 %	389875245
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140	NC_017959	GC	3	6	74350	74355	0 %	0 %	50 %	50 %	389875247
141	NC_017959	CG	3	6	74375	74380	0 %	0 %	50 %	50 %	389875247
142	NC_017959	CG	3	6	74943	74948	0 %	0 %	50 %	50 %	389875248
143	NC_017959	GC	3	6	75550	75555	0 %	0 %	50 %	50 %	389875248
144	NC_017959	GC	3	6	77355	77360	0 %	0 %	50 %	50 %	389875250
145	NC_017959	GA	3	6	77858	77863	50 %	0 %	50 %	0 %	389875251

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.