MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM4

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017959	ACCGGC	2	12	811	822	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389875180
2	NC_017959	GCACCG	2	12	1658	1669	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389875181
3	NC_017959	CCGTGA	2	12	4966	4977	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389875185
4	NC_017959	GCGGGC	2	12	5153	5164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875185
5	NC_017959	GCCGGG	2	12	6344	6355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875185
6	NC_017959	CGTCCT	2	12	6837	6848	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	389875186
7	NC_017959	CGGCCG	2	12	8427	8438	0 %	0 %	50 %	50 %	389875188
8	NC_017959	CGGATC	2	12	10271	10282	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389875189
9	NC_017959	ATGCGC	2	12	11772	11783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389875191
10	NC_017959	GGCGCC	2	12	15645	15656	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
11	NC_017959	CAGCGA	2	12	17099	17110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875195
12	NC_017959	TTCGAC	2	12	18552	18563	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	389875195
13	NC_017959	GCTTCC	2	12	19824	19835	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	389875195
14	NC_017959	CGAGGC	2	12	21530	21541	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389875197
15	NC_017959	CGACGG	2	12	23078	23089	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389875198
16	NC_017959	GGAGAT	2	12	24691	24702	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	389875201
17	NC_017959	CCTCGG	2	12	24849	24860	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	389875201
18	NC_017959	CGCCGT	2	12	26586	26597	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	389875202
19	NC_017959	GGCTTC	2	12	30920	30931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875207
20	NC_017959	TCGGGC	2	12	31497	31508	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	389875208
21	NC_017959	ACCGTC	2	12	32417	32428	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	389875208
22	NC_017959	AGCACC	2	12	36626	36637	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	389875212
23	NC_017959	GTGCTG	2	12	40172	40183	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	389875216
24	NC_017959	CGAGGC	2	12	40189	40200	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389875216
25	NC_017959	GCTGGA	2	12	40986	40997	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389875216
26	NC_017959	GGGGCT	2	12	42237	42248	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	389875217
27	NC_017959	CGAGCC	2	12	43511	43522	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389875218
28	NC_017959	CGGCCT	2	12	44151	44162	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	389875220
29	NC_017959	TCGCCC	2	12	44980	44991	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	389875221
30	NC_017959	CGAGGC	2	12	45422	45433	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389875221
31	NC_017959	CCGCTG	2	12	49545	49556	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	389875225
32	NC_017959	GATCGC	2	12	51787	51798	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389875228
33	NC_017959	CAGCAC	2	12	54800	54811	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	389875230
34	NC_017959	CGCCAG	2	12	54983	54994	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389875230
35	NC_017959	GGGGCG	2	12	55071	55082	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	389875230
36	NC_017959	CCCCGG	2	12	56010	56021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875231
37	NC_017959	GGGTGC	2	12	56450	56461	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	389875232
38	NC_017959	TTCAAG	2	12	56568	56579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	389875232
39	NC_017959	CGCCGG	2	12	58517	58528	0 %	0 %	50 %	50 %	389875232
40	NC_017959	ACGGTG	2	12	59155	59166	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389875233
41	NC_017959	AGGGCG	2	12	59398	59409	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	389875233
42	NC_017959	GGTGCT	2	12	62409	62420	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	389875236
43	NC_017959	AGCGCC	2	12	63356	63367	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389875237
44	NC_017959	TGACCG	2	12	63536	63547	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389875237
45	NC_017959	CGAGGC	2	12	64964	64975	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389875238
46	NC_017959	CCCGCG	2	12	64996	65007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875238
47	NC_017959	CGCGAG	2	12	65946	65957	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389875239
48	NC_017959	GGGCGA	2	12	67006	67017	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	389875241
49	NC_017959	GATCCC	2	12	68458	68469	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	389875243
50	NC_017959	CCGAGA	2	12	69285	69296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875243
51	NC_017959	GCGGCC	2	12	69910	69921	0 %	0 %	50 %	50 %	389875244
52	NC_017959	ACCTGA	2	12	74619	74630	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	389875248
53	NC_017959	CAAGAC	2	12	74632	74643	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	389875248
54	NC_017959	CCATGC	2	12	74674	74685	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	389875248
55	NC_017959	CTGGAT	2	12	76610	76621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	389875249
56	NC_017959	GCATCG	2	12	76923	76934	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389875250
57	NC_017959	CGGTGA	2	12	77020	77031	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389875250
58	NC_017959	GGGCCA	2	12	77065	77076	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389875250
59	NC_017959	GGGAAG	2	12	77549	77560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389875251

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.