MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM4

Total Repeats: 1893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017959	GAG	2	6	61258	61263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389875236
1502	NC_017959	GGC	2	6	61303	61308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875236
1503	NC_017959	GTG	2	6	61315	61320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389875236
1504	NC_017959	GGC	2	6	61323	61328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875236
1505	NC_017959	TGC	2	6	61356	61361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875236
1506	NC_017959	GTG	3	9	61390	61398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389875236
1507	NC_017959	CGG	3	9	61406	61414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875236
1508	NC_017959	GCC	2	6	61421	61426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875236
1509	NC_017959	TCG	2	6	61607	61612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875236
1510	NC_017959	GGT	2	6	61614	61619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389875236
1511	NC_017959	GCG	2	6	61634	61639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875236
1512	NC_017959	GCC	2	6	61645	61650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875236
1513	NC_017959	CGA	2	6	61656	61661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875236
1514	NC_017959	GGC	2	6	61683	61688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875236
1515	NC_017959	CCGGC	2	10	61700	61709	0 %	0 %	40 %	60 %	389875236
1516	NC_017959	GCCG	2	8	61719	61726	0 %	0 %	50 %	50 %	389875236
1517	NC_017959	CAT	2	6	61758	61763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389875236
1518	NC_017959	GCC	2	6	61792	61797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875236
1519	NC_017959	GCT	2	6	61815	61820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875236
1520	NC_017959	GTG	2	6	61849	61854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389875236
1521	NC_017959	TGG	2	6	61937	61942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389875236
1522	NC_017959	CGA	2	6	62061	62066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875236
1523	NC_017959	CGA	2	6	62069	62074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875236
1524	NC_017959	GGC	2	6	62110	62115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875236
1525	NC_017959	CGA	2	6	62196	62201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875236
1526	NC_017959	TGG	2	6	62210	62215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389875236
1527	NC_017959	CGGC	2	8	62249	62256	0 %	0 %	50 %	50 %	389875236
1528	NC_017959	GCT	2	6	62259	62264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875236
1529	NC_017959	GCG	2	6	62282	62287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875236
1530	NC_017959	CCG	2	6	62295	62300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875236
1531	NC_017959	CGG	3	9	62315	62323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875236
1532	NC_017959	GCCCG	2	10	62348	62357	0 %	0 %	40 %	60 %	389875236
1533	NC_017959	GGTGCT	2	12	62409	62420	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	389875236
1534	NC_017959	GCC	2	6	62435	62440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875236
1535	NC_017959	GCT	2	6	62460	62465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875236
1536	NC_017959	GCC	2	6	62504	62509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875236
1537	NC_017959	CGA	2	6	62526	62531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875236
1538	NC_017959	GGC	2	6	62535	62540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875236
1539	NC_017959	GC	3	6	62545	62550	0 %	0 %	50 %	50 %	389875236
1540	NC_017959	CTG	2	6	62554	62559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875236
1541	NC_017959	CGC	2	6	62571	62576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875236
1542	NC_017959	GAT	3	9	62659	62667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389875237
1543	NC_017959	CGG	2	6	62671	62676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875237
1544	NC_017959	CGC	2	6	62681	62686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875237
1545	NC_017959	CGG	2	6	62712	62717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875237
1546	NC_017959	GCG	2	6	62735	62740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875237
1547	NC_017959	ACC	2	6	62765	62770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389875237
1548	NC_017959	GGCC	2	8	62771	62778	0 %	0 %	50 %	50 %	389875237
1549	NC_017959	TCG	2	6	62780	62785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875237
1550	NC_017959	AGGC	2	8	62830	62837	25 %	0 %	50 %	25 %	389875237
1551	NC_017959	TCG	2	6	62852	62857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875237
1552	NC_017959	CG	4	8	62856	62863	0 %	0 %	50 %	50 %	389875237
1553	NC_017959	CCG	2	6	62891	62896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875237
1554	NC_017959	CAG	2	6	62989	62994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875237
1555	NC_017959	GGC	2	6	63080	63085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875237
1556	NC_017959	GCG	2	6	63108	63113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875237
1557	NC_017959	GTCT	2	8	63118	63125	0 %	50 %	25 %	25 %	389875237
1558	NC_017959	GCG	2	6	63177	63182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875237
1559	NC_017959	GCC	2	6	63270	63275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875237
1560	NC_017959	AGCGCC	2	12	63356	63367	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389875237
1561	NC_017959	CGC	2	6	63396	63401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875237
1562	NC_017959	GAT	2	6	63421	63426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389875237
1563	NC_017959	CAC	2	6	63442	63447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389875237
1564	NC_017959	CGG	3	9	63468	63476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875237
1565	NC_017959	CGG	4	12	63492	63503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875237
1566	NC_017959	CGG	2	6	63507	63512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875237
1567	NC_017959	TGACCG	2	12	63536	63547	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389875237
1568	NC_017959	GCC	2	6	63550	63555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875237
1569	NC_017959	GCG	2	6	63558	63563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875237
1570	NC_017959	GCGT	2	8	63585	63592	0 %	25 %	50 %	25 %	389875237
1571	NC_017959	CGG	2	6	63594	63599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875237
1572	NC_017959	CGG	2	6	63609	63614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875237
1573	NC_017959	CGG	2	6	63659	63664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875237
1574	NC_017959	GGC	3	9	63676	63684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875237
1575	NC_017959	ATG	2	6	63707	63712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389875237
1576	NC_017959	TCG	2	6	63728	63733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875237
1577	NC_017959	TGC	2	6	64306	64311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875238
1578	NC_017959	CGG	2	6	64313	64318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875238
1579	NC_017959	TGG	2	6	64319	64324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389875238
1580	NC_017959	GCG	3	9	64330	64338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875238
1581	NC_017959	GGTG	2	8	64444	64451	0 %	25 %	75 %	0 %	389875238
1582	NC_017959	ACC	2	6	64455	64460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389875238
1583	NC_017959	GCCGC	2	10	64570	64579	0 %	0 %	40 %	60 %	389875238
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1585	NC_017959	CAT	2	6	64631	64636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389875238
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1587	NC_017959	CGC	2	6	64762	64767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875238
1588	NC_017959	AGC	2	6	64804	64809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389875238
1589	NC_017959	CGC	2	6	64894	64899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875238
1590	NC_017959	GGC	2	6	64931	64936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875238
1591	NC_017959	CGAGGC	2	12	64964	64975	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389875238
1592	NC_017959	CCCGCG	2	12	64996	65007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875238
1593	NC_017959	G	6	6	65211	65216	0 %	0 %	100 %	0 %	389875238
1594	NC_017959	GCG	2	6	65221	65226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875238
1595	NC_017959	GTCG	2	8	65231	65238	0 %	25 %	50 %	25 %	389875238
1596	NC_017959	GCCC	2	8	65273	65280	0 %	0 %	25 %	75 %	389875238
1597	NC_017959	GTC	4	12	65306	65317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875238
1598	NC_017959	GCC	2	6	65322	65327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875238
1599	NC_017959	CGG	2	6	65329	65334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389875238
1600	NC_017959	CCA	3	9	65347	65355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389875238
1601	NC_017959	CGC	2	6	65356	65361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875238
1602	NC_017959	TCT	2	6	65396	65401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389875239
1603	NC_017959	TCG	3	9	65416	65424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875239
1604	NC_017959	CCG	4	12	65425	65436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875239
1605	NC_017959	TCG	2	6	65437	65442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875239
1606	NC_017959	TCG	2	6	65448	65453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875239
1607	NC_017959	GTC	2	6	65460	65465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875239
1608	NC_017959	TGC	2	6	65488	65493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875239
1609	NC_017959	GGT	2	6	65513	65518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389875239
1610	NC_017959	AGG	2	6	65608	65613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389875239
1611	NC_017959	TGG	3	9	65638	65646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389875239
1612	NC_017959	TCGGA	2	10	65698	65707	20 %	20 %	40 %	20 %	389875239
1613	NC_017959	CCAG	2	8	65794	65801	25 %	0 %	25 %	50 %	389875239
1614	NC_017959	TGA	2	6	65812	65817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389875239
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1616	NC_017959	CGGA	2	8	65937	65944	25 %	0 %	50 %	25 %	389875239
1617	NC_017959	CGCGAG	2	12	65946	65957	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389875239
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1619	NC_017959	TGC	2	6	66031	66036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389875239
1620	NC_017959	CGC	2	6	66048	66053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389875239
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1622	NC_017959	ACC	2	6	66189	66194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389875239
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.