MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1802

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017590	GC	3	6	4585	4590	0 %	0 %	50 %	50 %	386361718
2	NC_017590	CT	3	6	6196	6201	0 %	50 %	0 %	50 %	386361721
3	NC_017590	TC	3	6	6400	6405	0 %	50 %	0 %	50 %	386361721
4	NC_017590	CT	3	6	10346	10351	0 %	50 %	0 %	50 %	386361725
5	NC_017590	CG	3	6	12038	12043	0 %	0 %	50 %	50 %	386361730
6	NC_017590	GC	3	6	12190	12195	0 %	0 %	50 %	50 %	386361730
7	NC_017590	CG	3	6	12324	12329	0 %	0 %	50 %	50 %	386361730
8	NC_017590	AG	3	6	12911	12916	50 %	0 %	50 %	0 %	386361732
9	NC_017590	GA	3	6	13789	13794	50 %	0 %	50 %	0 %	386361734
10	NC_017590	AG	3	6	17255	17260	50 %	0 %	50 %	0 %	386361745
11	NC_017590	AG	3	6	24734	24739	50 %	0 %	50 %	0 %	386361750
12	NC_017590	GC	3	6	25431	25436	0 %	0 %	50 %	50 %	386361751
13	NC_017590	GA	3	6	27444	27449	50 %	0 %	50 %	0 %	386361753
14	NC_017590	AT	3	6	29464	29469	50 %	50 %	0 %	0 %	386361754
15	NC_017590	CT	3	6	29877	29882	0 %	50 %	0 %	50 %	386361754
16	NC_017590	TC	3	6	30614	30619	0 %	50 %	0 %	50 %	386361755
17	NC_017590	CT	3	6	33260	33265	0 %	50 %	0 %	50 %	386361757
18	NC_017590	GA	3	6	34810	34815	50 %	0 %	50 %	0 %	386361759
19	NC_017590	AG	3	6	36407	36412	50 %	0 %	50 %	0 %	386361762
20	NC_017590	AG	3	6	37611	37616	50 %	0 %	50 %	0 %	386361765
21	NC_017590	CT	3	6	39575	39580	0 %	50 %	0 %	50 %	386361767
22	NC_017590	GC	3	6	43092	43097	0 %	0 %	50 %	50 %	386361770
23	NC_017590	GC	3	6	43741	43746	0 %	0 %	50 %	50 %	386361773
24	NC_017590	CG	3	6	45563	45568	0 %	0 %	50 %	50 %	386361775
25	NC_017590	CT	4	8	46923	46930	0 %	50 %	0 %	50 %	386361777
26	NC_017590	TC	3	6	47162	47167	0 %	50 %	0 %	50 %	386361777
27	NC_017590	GA	3	6	53697	53702	50 %	0 %	50 %	0 %	386361785
28	NC_017590	GC	3	6	53767	53772	0 %	0 %	50 %	50 %	386361785
29	NC_017590	CG	3	6	58319	58324	0 %	0 %	50 %	50 %	386361791
30	NC_017590	CG	3	6	58924	58929	0 %	0 %	50 %	50 %	386361791
31	NC_017590	CT	3	6	61733	61738	0 %	50 %	0 %	50 %	386361796
32	NC_017590	GA	3	6	62929	62934	50 %	0 %	50 %	0 %	386361797
33	NC_017590	GT	3	6	66197	66202	0 %	50 %	50 %	0 %	386361801
34	NC_017590	GT	3	6	66251	66256	0 %	50 %	50 %	0 %	386361801
35	NC_017590	AC	3	6	67398	67403	50 %	0 %	0 %	50 %	386361802
36	NC_017590	GC	3	6	68477	68482	0 %	0 %	50 %	50 %	386361803
37	NC_017590	GA	3	6	69565	69570	50 %	0 %	50 %	0 %	386361805
38	NC_017590	GT	3	6	69632	69637	0 %	50 %	50 %	0 %	386361805
39	NC_017590	CG	3	6	70045	70050	0 %	0 %	50 %	50 %	386361805
40	NC_017590	CG	3	6	72328	72333	0 %	0 %	50 %	50 %	386361807
41	NC_017590	TC	3	6	74645	74650	0 %	50 %	0 %	50 %	386361810
42	NC_017590	CT	3	6	75856	75861	0 %	50 %	0 %	50 %	386361810
43	NC_017590	CA	3	6	80784	80789	50 %	0 %	0 %	50 %	386361814
44	NC_017590	CG	3	6	81230	81235	0 %	0 %	50 %	50 %	386361815
45	NC_017590	GA	3	6	83794	83799	50 %	0 %	50 %	0 %	386361818
46	NC_017590	GA	3	6	83806	83811	50 %	0 %	50 %	0 %	386361818
47	NC_017590	CG	3	6	84993	84998	0 %	0 %	50 %	50 %	386361818
48	NC_017590	AG	3	6	86195	86200	50 %	0 %	50 %	0 %	386361819
49	NC_017590	CT	3	6	86229	86234	0 %	50 %	0 %	50 %	386361819
50	NC_017590	GC	3	6	88645	88650	0 %	0 %	50 %	50 %	386361819
51	NC_017590	CG	3	6	90946	90951	0 %	0 %	50 %	50 %	386361821
52	NC_017590	GA	3	6	96912	96917	50 %	0 %	50 %	0 %	386361824
53	NC_017590	AC	3	6	102278	102283	50 %	0 %	0 %	50 %	386361829
54	NC_017590	TC	3	6	103455	103460	0 %	50 %	0 %	50 %	386361829
55	NC_017590	CG	3	6	105114	105119	0 %	0 %	50 %	50 %	386361830
56	NC_017590	TC	3	6	105543	105548	0 %	50 %	0 %	50 %	386361830
57	NC_017590	GA	3	6	107902	107907	50 %	0 %	50 %	0 %	386361831
58	NC_017590	GC	3	6	108209	108214	0 %	0 %	50 %	50 %	386361831
59	NC_017590	CT	3	6	109776	109781	0 %	50 %	0 %	50 %	386361832
60	NC_017590	AG	3	6	110545	110550	50 %	0 %	50 %	0 %	386361833
61	NC_017590	AG	3	6	110680	110685	50 %	0 %	50 %	0 %	386361833
62	NC_017590	CG	3	6	111112	111117	0 %	0 %	50 %	50 %	386361833
63	NC_017590	GC	3	6	111848	111853	0 %	0 %	50 %	50 %	386361835
64	NC_017590	GA	3	6	112898	112903	50 %	0 %	50 %	0 %	386361836
65	NC_017590	GA	3	6	113043	113048	50 %	0 %	50 %	0 %	386361836
66	NC_017590	GC	3	6	115401	115406	0 %	0 %	50 %	50 %	386361839
67	NC_017590	CG	3	6	116557	116562	0 %	0 %	50 %	50 %	386361841
68	NC_017590	CG	3	6	116662	116667	0 %	0 %	50 %	50 %	386361841
69	NC_017590	GT	3	6	119335	119340	0 %	50 %	50 %	0 %	386361845
70	NC_017590	GC	3	6	119647	119652	0 %	0 %	50 %	50 %	386361846
71	NC_017590	CT	3	6	120773	120778	0 %	50 %	0 %	50 %	386361847
72	NC_017590	CG	3	6	126337	126342	0 %	0 %	50 %	50 %	386361857
73	NC_017590	TC	3	6	126499	126504	0 %	50 %	0 %	50 %	386361857
74	NC_017590	CG	3	6	129863	129868	0 %	0 %	50 %	50 %	386361858
75	NC_017590	GC	3	6	137735	137740	0 %	0 %	50 %	50 %	386361867
76	NC_017590	CT	4	8	141463	141470	0 %	50 %	0 %	50 %	386361872

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.