MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1802

Total Repeats: 2367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017590	CAC	2	6	177	182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361712
2	NC_017590	GCC	2	6	202	207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361712
3	NC_017590	TCC	2	6	286	291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361712
4	NC_017590	CTC	3	9	312	320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361712
5	NC_017590	GGA	2	6	341	346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361712
6	NC_017590	AGG	2	6	516	521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361713
7	NC_017590	AGG	2	6	531	536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361713
8	NC_017590	GGT	2	6	682	687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361713
9	NC_017590	CAG	2	6	797	802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361714
10	NC_017590	GCC	2	6	825	830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361714
11	NC_017590	TCT	2	6	831	836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361714
12	NC_017590	TGG	2	6	843	848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361714
13	NC_017590	GAG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361714
14	NC_017590	CCT	2	6	940	945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361714
15	NC_017590	CTT	2	6	961	966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361714
16	NC_017590	GAG	2	6	1016	1021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361714
17	NC_017590	GCC	2	6	1026	1031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361714
18	NC_017590	CAG	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361715
19	NC_017590	CGG	2	6	1308	1313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361715
20	NC_017590	ACT	2	6	1338	1343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361715
21	NC_017590	AGG	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
22	NC_017590	CCT	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361715
23	NC_017590	AGG	2	6	1413	1418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
24	NC_017590	TGG	2	6	1509	1514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361715
25	NC_017590	GGA	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
26	NC_017590	GGT	2	6	1681	1686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361715
27	NC_017590	GGA	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
28	NC_017590	GAC	2	6	1733	1738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361715
29	NC_017590	ACC	2	6	1739	1744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361715
30	NC_017590	GGA	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
31	NC_017590	GAG	3	9	1796	1804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
32	NC_017590	GGA	2	6	1828	1833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
33	NC_017590	CGG	2	6	1856	1861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361715
34	NC_017590	AGG	2	6	1875	1880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
35	NC_017590	GGA	2	6	1915	1920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
36	NC_017590	GAG	2	6	1931	1936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
37	NC_017590	AGG	2	6	1953	1958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361715
38	NC_017590	GGC	2	6	1984	1989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361715
39	NC_017590	GGC	2	6	2141	2146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361716
40	NC_017590	GGA	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
41	NC_017590	CGG	2	6	2175	2180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361716
42	NC_017590	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
43	NC_017590	TGA	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361716
44	NC_017590	GGC	2	6	2222	2227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361716
45	NC_017590	AGG	2	6	2230	2235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
46	NC_017590	AGG	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
47	NC_017590	AGG	2	6	2374	2379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
48	NC_017590	GGA	2	6	2489	2494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
49	NC_017590	CGC	2	6	2495	2500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361716
50	NC_017590	GAG	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
51	NC_017590	GAG	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
52	NC_017590	GAG	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
53	NC_017590	TGG	2	6	2680	2685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361716
54	NC_017590	TGG	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361716
55	NC_017590	GGT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361716
56	NC_017590	CCT	2	6	2849	2854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361716
57	NC_017590	CCT	2	6	2875	2880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361716
58	NC_017590	GCC	2	6	2899	2904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361716
59	NC_017590	CCT	2	6	2993	2998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361716
60	NC_017590	AGG	2	6	3018	3023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361716
61	NC_017590	CCG	2	6	3469	3474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361717
62	NC_017590	GGA	2	6	3609	3614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361717
63	NC_017590	GCC	3	9	3919	3927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361717
64	NC_017590	CCG	2	6	4050	4055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361717
65	NC_017590	TGG	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361718
66	NC_017590	TGG	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361718
67	NC_017590	AGG	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361718
68	NC_017590	GGA	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361718
69	NC_017590	GGT	2	6	4554	4559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361718
70	NC_017590	GGT	2	6	4596	4601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361718
71	NC_017590	TGG	2	6	4654	4659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361719
72	NC_017590	CTC	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361719
73	NC_017590	CCT	2	6	4700	4705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361719
74	NC_017590	ACT	2	6	4717	4722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361719
75	NC_017590	AGG	2	6	4780	4785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361719
76	NC_017590	AGG	2	6	4798	4803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361719
77	NC_017590	AGG	2	6	4807	4812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361719
78	NC_017590	GCT	2	6	4815	4820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361719
79	NC_017590	AGG	2	6	4822	4827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361719
80	NC_017590	CTT	2	6	4904	4909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361720
81	NC_017590	CCT	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361720
82	NC_017590	GCC	2	6	5001	5006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361720
83	NC_017590	GGC	2	6	5081	5086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361720
84	NC_017590	GGC	2	6	5105	5110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361720
85	NC_017590	GGC	2	6	5123	5128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361720
86	NC_017590	GAT	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361720
87	NC_017590	CCG	2	6	5326	5331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
88	NC_017590	CGG	2	6	5351	5356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361721
89	NC_017590	GGC	2	6	5593	5598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361721
90	NC_017590	GCC	2	6	5616	5621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
91	NC_017590	GCC	2	6	5658	5663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
92	NC_017590	TCC	2	6	5702	5707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361721
93	NC_017590	TGG	2	6	5713	5718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361721
94	NC_017590	CCG	2	6	5866	5871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
95	NC_017590	GAG	2	6	5898	5903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361721
96	NC_017590	AGG	2	6	5907	5912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361721
97	NC_017590	CAC	2	6	5981	5986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361721
98	NC_017590	GCC	2	6	6023	6028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
99	NC_017590	CCG	2	6	6029	6034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
100	NC_017590	CCT	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361721
101	NC_017590	TTC	2	6	6078	6083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361721
102	NC_017590	CCG	2	6	6145	6150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
103	NC_017590	CCT	2	6	6214	6219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361721
104	NC_017590	ACC	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361721
105	NC_017590	GAG	2	6	6261	6266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361721
106	NC_017590	GCC	2	6	6279	6284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
107	NC_017590	CTA	2	6	6347	6352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361721
108	NC_017590	CGC	2	6	6357	6362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
109	NC_017590	CTC	3	9	6408	6416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361721
110	NC_017590	TGG	2	6	6424	6429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361721
111	NC_017590	GAG	2	6	6486	6491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361721
112	NC_017590	TCC	2	6	6496	6501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361721
113	NC_017590	GCG	2	6	6587	6592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361721
114	NC_017590	ACC	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361721
115	NC_017590	AGG	3	9	6646	6654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361721
116	NC_017590	TCA	2	6	6739	6744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361721
117	NC_017590	GCG	2	6	6806	6811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361721
118	NC_017590	GAG	2	6	6894	6899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361721
119	NC_017590	TCC	2	6	6943	6948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361721
120	NC_017590	GTG	2	6	6963	6968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361721
121	NC_017590	CCA	2	6	6997	7002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361721
122	NC_017590	TCT	2	6	7006	7011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361721
123	NC_017590	GGT	2	6	7091	7096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361721
124	NC_017590	AGG	2	6	7123	7128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361721
125	NC_017590	TGG	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361721
126	NC_017590	GGC	2	6	7194	7199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361721
127	NC_017590	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
128	NC_017590	GAG	2	6	7215	7220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361721
129	NC_017590	CCG	2	6	7321	7326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361721
130	NC_017590	TCC	2	6	7354	7359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361721
131	NC_017590	AGG	2	6	7383	7388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361721
132	NC_017590	TCC	2	6	7399	7404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361721
133	NC_017590	TGG	3	9	7556	7564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361722
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