MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1802

Total Repeats: 3325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017590	TGG	2	6	68211	68216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361803
1502	NC_017590	GTA	2	6	68240	68245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361803
1503	NC_017590	AGG	2	6	68302	68307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361803
1504	NC_017590	CAAA	2	8	68323	68330	75 %	0 %	0 %	25 %	386361803
1505	NC_017590	GCA	2	6	68372	68377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361803
1506	NC_017590	AGG	2	6	68401	68406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361803
1507	NC_017590	ACC	2	6	68424	68429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361803
1508	NC_017590	AGG	2	6	68437	68442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361803
1509	NC_017590	GC	3	6	68477	68482	0 %	0 %	50 %	50 %	386361803
1510	NC_017590	TCGC	2	8	68487	68494	0 %	25 %	25 %	50 %	386361803
1511	NC_017590	TTC	2	6	68541	68546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361803
1512	NC_017590	CAG	2	6	68572	68577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361803
1513	NC_017590	AGA	2	6	68653	68658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361803
1514	NC_017590	GGC	2	6	68689	68694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361803
1515	NC_017590	GAC	2	6	68735	68740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361803
1516	NC_017590	CGC	2	6	68773	68778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361803
1517	NC_017590	TCT	2	6	68856	68861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361803
1518	NC_017590	CACC	2	8	68898	68905	25 %	0 %	0 %	75 %	386361803
1519	NC_017590	GCG	2	6	68924	68929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361803
1520	NC_017590	AGA	2	6	68962	68967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361804
1521	NC_017590	TGGC	2	8	69017	69024	0 %	25 %	50 %	25 %	386361804
1522	NC_017590	CAC	2	6	69058	69063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361804
1523	NC_017590	ATCC	2	8	69081	69088	25 %	25 %	0 %	50 %	386361804
1524	NC_017590	GAT	2	6	69107	69112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361804
1525	NC_017590	TCG	2	6	69117	69122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361804
1526	NC_017590	TCA	2	6	69198	69203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361804
1527	NC_017590	AGG	3	9	69219	69227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361804
1528	NC_017590	GCGG	2	8	69282	69289	0 %	0 %	75 %	25 %	386361804
1529	NC_017590	GTG	2	6	69422	69427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361804
1530	NC_017590	GAG	2	6	69429	69434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361804
1531	NC_017590	AAG	2	6	69534	69539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361805
1532	NC_017590	AGC	2	6	69550	69555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361805
1533	NC_017590	GA	3	6	69565	69570	50 %	0 %	50 %	0 %	386361805
1534	NC_017590	CTAC	2	8	69591	69598	25 %	25 %	0 %	50 %	386361805
1535	NC_017590	GT	3	6	69632	69637	0 %	50 %	50 %	0 %	386361805
1536	NC_017590	GGA	2	6	69649	69654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361805
1537	NC_017590	AGC	2	6	69721	69726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361805
1538	NC_017590	A	6	6	69738	69743	100 %	0 %	0 %	0 %	386361805
1539	NC_017590	AGC	2	6	69777	69782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361805
1540	NC_017590	ACA	2	6	69906	69911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361805
1541	NC_017590	CTC	2	6	69938	69943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361805
1542	NC_017590	GCC	2	6	69959	69964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361805
1543	NC_017590	CG	3	6	70045	70050	0 %	0 %	50 %	50 %	386361805
1544	NC_017590	G	6	6	70053	70058	0 %	0 %	100 %	0 %	386361805
1545	NC_017590	GCAAAG	2	12	70115	70126	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386361805
1546	NC_017590	TGA	2	6	70192	70197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361805
1547	NC_017590	ACT	2	6	70280	70285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361805
1548	NC_017590	CGT	2	6	70317	70322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361806
1549	NC_017590	CCT	2	6	70356	70361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361806
1550	NC_017590	GGGGGT	2	12	70371	70382	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	386361806
1551	NC_017590	GGT	3	9	70380	70388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361806
1552	NC_017590	CCGGG	2	10	70437	70446	0 %	0 %	60 %	40 %	386361806
1553	NC_017590	A	6	6	70506	70511	100 %	0 %	0 %	0 %	386361806
1554	NC_017590	G	7	7	70546	70552	0 %	0 %	100 %	0 %	386361806
1555	NC_017590	CAG	2	6	70612	70617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361806
1556	NC_017590	GGA	2	6	70650	70655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361806
1557	NC_017590	GGT	2	6	70683	70688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361806
1558	NC_017590	GGA	2	6	70743	70748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361806
1559	NC_017590	GTG	2	6	70771	70776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361806
1560	NC_017590	CTGG	2	8	70854	70861	0 %	25 %	50 %	25 %	386361806
1561	NC_017590	GCCA	2	8	70906	70913	25 %	0 %	25 %	50 %	386361806
1562	NC_017590	GGA	2	6	70983	70988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361806
1563	NC_017590	A	6	6	71081	71086	100 %	0 %	0 %	0 %	386361806
1564	NC_017590	C	6	6	71093	71098	0 %	0 %	0 %	100 %	386361806
1565	NC_017590	GCA	2	6	71124	71129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361806
1566	NC_017590	GCC	2	6	71132	71137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361806
1567	NC_017590	TGG	2	6	71144	71149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361806
1568	NC_017590	CGC	2	6	71154	71159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361806
1569	NC_017590	C	6	6	71169	71174	0 %	0 %	0 %	100 %	386361806
1570	NC_017590	AGGAG	2	10	71253	71262	40 %	0 %	60 %	0 %	386361806
1571	NC_017590	TTC	2	6	71317	71322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361806
1572	NC_017590	CAC	2	6	71457	71462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361806
1573	NC_017590	GGTG	2	8	71468	71475	0 %	25 %	75 %	0 %	386361806
1574	NC_017590	CTT	2	6	71947	71952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361807
1575	NC_017590	CTA	2	6	71980	71985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361807
1576	NC_017590	ACC	2	6	72002	72007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361807
1577	NC_017590	CGCC	2	8	72079	72086	0 %	0 %	25 %	75 %	386361807
1578	NC_017590	TGG	2	6	72090	72095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361807
1579	NC_017590	CGC	2	6	72124	72129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361807
1580	NC_017590	GTCA	2	8	72134	72141	25 %	25 %	25 %	25 %	386361807
1581	NC_017590	GGC	2	6	72148	72153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361807
1582	NC_017590	GACC	2	8	72211	72218	25 %	0 %	25 %	50 %	386361807
1583	NC_017590	GGC	2	6	72229	72234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361807
1584	NC_017590	GAG	2	6	72263	72268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361807
1585	NC_017590	CG	3	6	72328	72333	0 %	0 %	50 %	50 %	386361807
1586	NC_017590	TGGGA	2	10	72420	72429	20 %	20 %	60 %	0 %	386361807
1587	NC_017590	GCG	2	6	72463	72468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361807
1588	NC_017590	GGTGC	2	10	72469	72478	0 %	20 %	60 %	20 %	386361807
1589	NC_017590	GTG	2	6	72479	72484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361807
1590	NC_017590	CTG	2	6	72533	72538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361807
1591	NC_017590	GGA	2	6	72541	72546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361807
1592	NC_017590	GAA	2	6	72578	72583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361807
1593	NC_017590	GGA	2	6	72598	72603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361807
1594	NC_017590	GCC	2	6	72611	72616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361807
1595	NC_017590	GTG	2	6	72638	72643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361807
1596	NC_017590	GCG	2	6	72754	72759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361807
1597	NC_017590	CTT	2	6	72812	72817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361807
1598	NC_017590	AGG	2	6	72885	72890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361807
1599	NC_017590	C	6	6	72921	72926	0 %	0 %	0 %	100 %	386361807
1600	NC_017590	TCA	2	6	73118	73123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361808
1601	NC_017590	CGG	2	6	73139	73144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361808
1602	NC_017590	TGG	2	6	73151	73156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361808
1603	NC_017590	G	6	6	73158	73163	0 %	0 %	100 %	0 %	386361808
1604	NC_017590	G	6	6	73222	73227	0 %	0 %	100 %	0 %	386361808
1605	NC_017590	GGT	2	6	73293	73298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361808
1606	NC_017590	CGGGGG	2	12	73308	73319	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	386361808
1607	NC_017590	G	7	7	73315	73321	0 %	0 %	100 %	0 %	386361808
1608	NC_017590	CCCGA	2	10	73349	73358	20 %	0 %	20 %	60 %	386361808
1609	NC_017590	GGT	2	6	73389	73394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361808
1610	NC_017590	C	6	6	73399	73404	0 %	0 %	0 %	100 %	386361808
1611	NC_017590	CCT	2	6	73452	73457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361808
1612	NC_017590	GTA	2	6	73477	73482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361808
1613	NC_017590	ACCC	2	8	73650	73657	25 %	0 %	0 %	75 %	386361808
1614	NC_017590	GCC	4	12	73663	73674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361808
1615	NC_017590	CGG	2	6	73692	73697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361808
1616	NC_017590	GGC	2	6	73728	73733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361808
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1619	NC_017590	CCT	2	6	73847	73852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361808
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1621	NC_017590	CCTGG	2	10	74121	74130	0 %	20 %	40 %	40 %	386361809
1622	NC_017590	G	7	7	74211	74217	0 %	0 %	100 %	0 %	386361809
1623	NC_017590	CCTGG	2	10	74223	74232	0 %	20 %	40 %	40 %	386361809
1624	NC_017590	GAG	2	6	74268	74273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361809
1625	NC_017590	CTTCTC	2	12	74293	74304	0 %	50 %	0 %	50 %	386361809
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1627	NC_017590	CCT	2	6	74325	74330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361809
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