MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1801

Total Repeats: 6043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017588	CCT	2	6	184874	184879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361620
4002	NC_017588	GCC	2	6	184920	184925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361620
4003	NC_017588	GCC	2	6	184938	184943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361620
4004	NC_017588	GGA	2	6	184967	184972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361620
4005	NC_017588	GCC	2	6	184977	184982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361620
4006	NC_017588	TTC	2	6	185076	185081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361620
4007	NC_017588	CCG	2	6	185083	185088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361620
4008	NC_017588	GGGTCC	2	12	185101	185112	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386361620
4009	NC_017588	AG	3	6	185251	185256	50 %	0 %	50 %	0 %	386361621
4010	NC_017588	GAG	2	6	185261	185266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361621
4011	NC_017588	GGT	2	6	185338	185343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361621
4012	NC_017588	CCCG	2	8	185434	185441	0 %	0 %	25 %	75 %	386361621
4013	NC_017588	CAG	2	6	185522	185527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361621
4014	NC_017588	TCC	2	6	185619	185624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361621
4015	NC_017588	TCA	2	6	185625	185630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361621
4016	NC_017588	GGT	2	6	185638	185643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361621
4017	NC_017588	GAG	2	6	185696	185701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361621
4018	NC_017588	TGCG	2	8	185702	185709	0 %	25 %	50 %	25 %	386361621
4019	NC_017588	CGGG	2	8	185713	185720	0 %	0 %	75 %	25 %	386361621
4020	NC_017588	CAG	2	6	185738	185743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361621
4021	NC_017588	GAG	2	6	185744	185749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361621
4022	NC_017588	AGC	2	6	185760	185765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361621
4023	NC_017588	CAG	2	6	185771	185776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361621
4024	NC_017588	CGC	2	6	185809	185814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361621
4025	NC_017588	GGC	2	6	185824	185829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361621
4026	NC_017588	TTC	2	6	185960	185965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361622
4027	NC_017588	G	7	7	186028	186034	0 %	0 %	100 %	0 %	386361622
4028	NC_017588	CACCTT	2	12	186081	186092	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386361622
4029	NC_017588	CCT	2	6	186159	186164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361622
4030	NC_017588	CCT	2	6	186168	186173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361622
4031	NC_017588	TCG	2	6	186218	186223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361622
4032	NC_017588	CTC	2	6	186238	186243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361622
4033	NC_017588	GGC	2	6	186261	186266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361622
4034	NC_017588	GAGCGC	2	12	186330	186341	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386361622
4035	NC_017588	CCT	2	6	186348	186353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361622
4036	NC_017588	CTC	2	6	186358	186363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361622
4037	NC_017588	AGC	2	6	186398	186403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361622
4038	NC_017588	TGC	2	6	186406	186411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361622
4039	NC_017588	CTC	2	6	186432	186437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361623
4040	NC_017588	CTT	2	6	186438	186443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361623
4041	NC_017588	GTG	2	6	186456	186461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361623
4042	NC_017588	ATCGGG	2	12	186468	186479	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386361623
4043	NC_017588	G	6	6	186477	186482	0 %	0 %	100 %	0 %	386361623
4044	NC_017588	TCT	2	6	186487	186492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361623
4045	NC_017588	CCT	2	6	186563	186568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361623
4046	NC_017588	TGA	2	6	186601	186606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361623
4047	NC_017588	CTC	2	6	186630	186635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361623
4048	NC_017588	GCGGG	2	10	186665	186674	0 %	0 %	80 %	20 %	386361623
4049	NC_017588	G	8	8	186710	186717	0 %	0 %	100 %	0 %	386361623
4050	NC_017588	CCA	2	6	186742	186747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361623
4051	NC_017588	CGC	2	6	186806	186811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361623
4052	NC_017588	CCT	2	6	186830	186835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361623
4053	NC_017588	C	6	6	186848	186853	0 %	0 %	0 %	100 %	386361623
4054	NC_017588	G	7	7	186914	186920	0 %	0 %	100 %	0 %	386361623
4055	NC_017588	GGC	2	6	186941	186946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361623
4056	NC_017588	CCT	2	6	186968	186973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361623
4057	NC_017588	CCGCC	2	10	187003	187012	0 %	0 %	20 %	80 %	386361623
4058	NC_017588	AGG	2	6	187021	187026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361623
4059	NC_017588	GGC	2	6	187031	187036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361623
4060	NC_017588	CTT	2	6	187049	187054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361623
4061	NC_017588	GCC	2	6	187083	187088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361623
4062	NC_017588	GCG	3	9	187125	187133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361623
4063	NC_017588	TGG	2	6	187150	187155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361623
4064	NC_017588	TGG	2	6	187228	187233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361623
4065	NC_017588	CTC	2	6	187236	187241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361623
4066	NC_017588	GGC	2	6	187250	187255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361623
4067	NC_017588	CTC	3	9	187344	187352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361623
4068	NC_017588	CTC	2	6	187365	187370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361623
4069	NC_017588	TGA	2	6	187399	187404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361623
4070	NC_017588	TCC	2	6	187408	187413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361623
4071	NC_017588	CTC	2	6	187503	187508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361623
4072	NC_017588	C	6	6	187512	187517	0 %	0 %	0 %	100 %	386361623
4073	NC_017588	GTG	2	6	187644	187649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361623
4074	NC_017588	GAA	2	6	187699	187704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361624
4075	NC_017588	CGG	2	6	187719	187724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361624
4076	NC_017588	GTG	2	6	187817	187822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361624
4077	NC_017588	GTG	2	6	187916	187921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361624
4078	NC_017588	GAG	2	6	187961	187966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361624
4079	NC_017588	TCC	2	6	187971	187976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361624
4080	NC_017588	GCC	2	6	188009	188014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361624
4081	NC_017588	GCC	2	6	188027	188032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361624
4082	NC_017588	TCA	2	6	188049	188054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361624
4083	NC_017588	GGC	2	6	188068	188073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361624
4084	NC_017588	CCA	2	6	188109	188114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361624
4085	NC_017588	GCC	2	6	188117	188122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361624
4086	NC_017588	TGG	2	6	188124	188129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361624
4087	NC_017588	CCCT	2	8	188210	188217	0 %	25 %	0 %	75 %	386361624
4088	NC_017588	GGAGG	2	10	188231	188240	20 %	0 %	80 %	0 %	386361624
4089	NC_017588	CTC	2	6	188270	188275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361624
4090	NC_017588	GAG	2	6	188294	188299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361624
4091	NC_017588	CGC	2	6	188302	188307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361624
4092	NC_017588	GTG	2	6	188363	188368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361624
4093	NC_017588	G	6	6	188372	188377	0 %	0 %	100 %	0 %	386361624
4094	NC_017588	GGCG	2	8	188393	188400	0 %	0 %	75 %	25 %	386361625
4095	NC_017588	TGG	2	6	188483	188488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361625
4096	NC_017588	G	6	6	188501	188506	0 %	0 %	100 %	0 %	386361625
4097	NC_017588	GCC	2	6	188546	188551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361625
4098	NC_017588	GGA	2	6	188592	188597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361625
4099	NC_017588	CCT	2	6	188613	188618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361625
4100	NC_017588	GGC	2	6	188667	188672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361625
4101	NC_017588	AGG	2	6	188686	188691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361625
4102	NC_017588	AGG	2	6	188768	188773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361625
4103	NC_017588	CAC	2	6	188790	188795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361625
4104	NC_017588	GTG	2	6	188812	188817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361625
4105	NC_017588	GGC	2	6	188824	188829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361625
4106	NC_017588	CGC	2	6	188865	188870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361625
4107	NC_017588	C	6	6	188964	188969	0 %	0 %	0 %	100 %	386361625
4108	NC_017588	G	6	6	188975	188980	0 %	0 %	100 %	0 %	386361625
4109	NC_017588	G	6	6	189040	189045	0 %	0 %	100 %	0 %	386361625
4110	NC_017588	CGCCCT	2	12	189057	189068	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386361625
4111	NC_017588	TGG	2	6	189071	189076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361625
4112	NC_017588	ACG	2	6	189134	189139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361625
4113	NC_017588	CTT	2	6	189168	189173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361625
4114	NC_017588	GAG	2	6	189277	189282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361625
4115	NC_017588	AGG	2	6	189310	189315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361625
4116	NC_017588	GTG	2	6	189358	189363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361625
4117	NC_017588	GGT	2	6	189421	189426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361626
4118	NC_017588	CGG	2	6	189429	189434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361626
4119	NC_017588	TGG	2	6	189444	189449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361626
4120	NC_017588	CGTGGC	2	12	189526	189537	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386361626
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4122	NC_017588	TCT	2	6	189714	189719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361626
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4244	NC_017588	CCT	2	6	194568	194573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361630
4245	NC_017588	GCG	3	9	194626	194634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361630
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4248	NC_017588	GC	3	6	194703	194708	0 %	0 %	50 %	50 %	386361630
4249	NC_017588	TCCTCG	2	12	194759	194770	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386361631
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4274	NC_017588	CGCC	2	8	195705	195712	0 %	0 %	25 %	75 %	386361632
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4491	NC_017588	C	7	7	203957	203963	0 %	0 %	0 %	100 %	386361641
4492	NC_017588	CGG	2	6	203979	203984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361641
4493	NC_017588	CAC	2	6	204029	204034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361641
4494	NC_017588	CTC	2	6	204189	204194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361641
4495	NC_017588	CTT	2	6	204218	204223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361641
4496	NC_017588	CCG	2	6	204224	204229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361641
4497	NC_017588	CCCCT	2	10	204243	204252	0 %	20 %	0 %	80 %	386361641
4498	NC_017588	G	6	6	204291	204296	0 %	0 %	100 %	0 %	386361641
4499	NC_017588	CG	3	6	204302	204307	0 %	0 %	50 %	50 %	386361641
4500	NC_017588	AGGG	2	8	204312	204319	25 %	0 %	75 %	0 %	386361641

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