MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1801

Total Repeats: 6043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017588	ACCT	2	8	147178	147185	25 %	25 %	0 %	50 %	386361582
3002	NC_017588	CTT	2	6	147189	147194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361582
3003	NC_017588	CCG	2	6	147218	147223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361582
3004	NC_017588	GGC	2	6	147326	147331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361582
3005	NC_017588	CTC	3	9	147337	147345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361582
3006	NC_017588	TCC	2	6	147359	147364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361582
3007	NC_017588	CCT	2	6	147372	147377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361582
3008	NC_017588	TCT	2	6	147380	147385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361582
3009	NC_017588	TCC	2	6	147416	147421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361582
3010	NC_017588	CTA	2	6	147423	147428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361582
3011	NC_017588	TCC	2	6	147443	147448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361582
3012	NC_017588	ACCA	2	8	147478	147485	50 %	0 %	0 %	50 %	386361582
3013	NC_017588	GCC	3	9	147535	147543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361582
3014	NC_017588	G	6	6	147551	147556	0 %	0 %	100 %	0 %	386361582
3015	NC_017588	TCGCCC	2	12	147584	147595	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386361582
3016	NC_017588	CTC	2	6	147634	147639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361582
3017	NC_017588	CTT	2	6	147672	147677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361582
3018	NC_017588	GGA	2	6	147690	147695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361582
3019	NC_017588	CGGG	2	8	147700	147707	0 %	0 %	75 %	25 %	386361582
3020	NC_017588	CCT	2	6	147728	147733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361582
3021	NC_017588	GTG	2	6	147766	147771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361582
3022	NC_017588	CCT	2	6	147783	147788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361582
3023	NC_017588	GGA	2	6	147855	147860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361582
3024	NC_017588	CCA	2	6	147866	147871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361582
3025	NC_017588	CGC	2	6	147882	147887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361582
3026	NC_017588	GGC	2	6	147897	147902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361582
3027	NC_017588	CCTCC	2	10	147903	147912	0 %	20 %	0 %	80 %	386361582
3028	NC_017588	CTC	2	6	147916	147921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361582
3029	NC_017588	G	7	7	147944	147950	0 %	0 %	100 %	0 %	386361582
3030	NC_017588	GGC	2	6	147962	147967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361582
3031	NC_017588	CCT	2	6	147975	147980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361582
3032	NC_017588	CTC	3	9	147997	148005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361582
3033	NC_017588	CTC	2	6	148033	148038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361582
3034	NC_017588	TGG	2	6	148049	148054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361582
3035	NC_017588	GGT	2	6	148089	148094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361582
3036	NC_017588	CTA	2	6	148152	148157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361582
3037	NC_017588	TGG	2	6	148163	148168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361582
3038	NC_017588	GGGCC	2	10	148176	148185	0 %	0 %	60 %	40 %	386361582
3039	NC_017588	TGG	2	6	148196	148201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361582
3040	NC_017588	CTC	2	6	148216	148221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361582
3041	NC_017588	GGC	2	6	148272	148277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361582
3042	NC_017588	C	6	6	148300	148305	0 %	0 %	0 %	100 %	386361582
3043	NC_017588	CCT	2	6	148317	148322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361582
3044	NC_017588	GGCCCT	2	12	148323	148334	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386361582
3045	NC_017588	CG	3	6	148338	148343	0 %	0 %	50 %	50 %	386361582
3046	NC_017588	GGA	2	6	148732	148737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3047	NC_017588	CTC	2	6	148772	148777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3048	NC_017588	CCG	2	6	148787	148792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361583
3049	NC_017588	GGGCCC	2	12	148813	148824	0 %	0 %	50 %	50 %	386361583
3050	NC_017588	CCA	2	6	148849	148854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361583
3051	NC_017588	GAG	2	6	148859	148864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3052	NC_017588	CCT	2	6	148867	148872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3053	NC_017588	AGG	2	6	148893	148898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3054	NC_017588	CTT	2	6	148922	148927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361583
3055	NC_017588	CCT	2	6	148957	148962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3056	NC_017588	AGG	2	6	148977	148982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3057	NC_017588	GGT	2	6	148984	148989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361583
3058	NC_017588	GGC	2	6	149027	149032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361583
3059	NC_017588	TCC	2	6	149040	149045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3060	NC_017588	CCT	2	6	149056	149061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3061	NC_017588	CTC	2	6	149099	149104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3062	NC_017588	AGGT	2	8	149109	149116	25 %	25 %	50 %	0 %	386361583
3063	NC_017588	GTT	2	6	149171	149176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361583
3064	NC_017588	GGC	2	6	149180	149185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361583
3065	NC_017588	CTC	2	6	149186	149191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3066	NC_017588	CCT	2	6	149221	149226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3067	NC_017588	AGG	4	12	149241	149252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3068	NC_017588	GGA	2	6	149340	149345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3069	NC_017588	CCT	2	6	149371	149376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3070	NC_017588	CCT	2	6	149395	149400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3071	NC_017588	GAG	2	6	149441	149446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3072	NC_017588	GGA	2	6	149467	149472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3073	NC_017588	GAG	2	6	149498	149503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3074	NC_017588	TCC	2	6	149514	149519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3075	NC_017588	GCA	2	6	149527	149532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361583
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3077	NC_017588	GCGG	2	8	149540	149547	0 %	0 %	75 %	25 %	386361583
3078	NC_017588	CTC	2	6	149564	149569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
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3080	NC_017588	G	6	6	149586	149591	0 %	0 %	100 %	0 %	386361583
3081	NC_017588	AGG	2	6	149592	149597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3082	NC_017588	GGA	2	6	149611	149616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
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3087	NC_017588	TCC	3	9	149769	149777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3088	NC_017588	GAG	2	6	149786	149791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3089	NC_017588	GGC	2	6	149807	149812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361583
3090	NC_017588	CCT	2	6	149830	149835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3091	NC_017588	AGG	3	9	149877	149885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3092	NC_017588	GCC	2	6	149890	149895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361583
3093	NC_017588	CCT	2	6	149956	149961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3094	NC_017588	GGC	2	6	149966	149971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361583
3095	NC_017588	GAG	2	6	149981	149986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3096	NC_017588	CTTC	2	8	149988	149995	0 %	50 %	0 %	50 %	386361583
3097	NC_017588	G	6	6	150028	150033	0 %	0 %	100 %	0 %	386361583
3098	NC_017588	GCC	2	6	150061	150066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361583
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3101	NC_017588	CCT	2	6	150094	150099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3102	NC_017588	CCTCC	2	10	150104	150113	0 %	20 %	0 %	80 %	386361583
3103	NC_017588	GCG	2	6	150129	150134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361583
3104	NC_017588	C	7	7	150160	150166	0 %	0 %	0 %	100 %	386361583
3105	NC_017588	AGG	2	6	150177	150182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3106	NC_017588	AGG	2	6	150231	150236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3107	NC_017588	GTA	2	6	150248	150253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361583
3108	NC_017588	TCC	2	6	150291	150296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
3109	NC_017588	AGG	2	6	150315	150320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3110	NC_017588	GCC	2	6	150383	150388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361583
3111	NC_017588	CCG	2	6	150389	150394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361583
3112	NC_017588	AGG	2	6	150396	150401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3113	NC_017588	GGA	2	6	150463	150468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3114	NC_017588	TTC	2	6	150470	150475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361583
3115	NC_017588	GCCC	2	8	150482	150489	0 %	0 %	25 %	75 %	386361583
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3119	NC_017588	GCAG	2	8	150678	150685	25 %	0 %	50 %	25 %	386361583
3120	NC_017588	AGG	3	9	150702	150710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361583
3121	NC_017588	CTC	3	9	150722	150730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361583
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3123	NC_017588	C	6	6	150819	150824	0 %	0 %	0 %	100 %	386361583
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3235	NC_017588	C	6	6	155653	155658	0 %	0 %	0 %	100 %	386361589
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3242	NC_017588	G	6	6	155918	155923	0 %	0 %	100 %	0 %	386361589
3243	NC_017588	GGCCT	2	10	155930	155939	0 %	20 %	40 %	40 %	386361589
3244	NC_017588	GGGGC	2	10	155946	155955	0 %	0 %	80 %	20 %	386361589
3245	NC_017588	GGC	2	6	155959	155964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361589
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3372	NC_017588	CCCA	2	8	160079	160086	25 %	0 %	0 %	75 %	386361593
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3493	NC_017588	GAT	2	6	164035	164040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361598
3494	NC_017588	CCG	2	6	164049	164054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361598
3495	NC_017588	AGG	2	6	164121	164126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361598
3496	NC_017588	TGG	2	6	164139	164144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361598
3497	NC_017588	GAT	2	6	164152	164157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361598
3498	NC_017588	AGGCTC	2	12	164180	164191	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386361598
3499	NC_017588	GGT	2	6	164203	164208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361598
3500	NC_017588	CTC	2	6	164213	164218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361598

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