MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1801

Total Repeats: 6043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017588	CCG	2	6	62424	62429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361500
1502	NC_017588	GTA	2	6	62506	62511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361500
1503	NC_017588	GTG	2	6	62537	62542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361500
1504	NC_017588	CG	3	6	62608	62613	0 %	0 %	50 %	50 %	386361500
1505	NC_017588	CCTGGG	2	12	62634	62645	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386361500
1506	NC_017588	GCC	2	6	62651	62656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361500
1507	NC_017588	GCG	2	6	62666	62671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361500
1508	NC_017588	TTCC	2	8	63410	63417	0 %	50 %	0 %	50 %	386361501
1509	NC_017588	CCAC	2	8	63517	63524	25 %	0 %	0 %	75 %	386361501
1510	NC_017588	TCCCCG	2	12	63577	63588	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386361501
1511	NC_017588	C	6	6	63652	63657	0 %	0 %	0 %	100 %	386361501
1512	NC_017588	CCCT	2	8	63684	63691	0 %	25 %	0 %	75 %	386361501
1513	NC_017588	CAC	2	6	63782	63787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361501
1514	NC_017588	CCAC	2	8	63835	63842	25 %	0 %	0 %	75 %	386361501
1515	NC_017588	TTC	2	6	63882	63887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361501
1516	NC_017588	C	6	6	63906	63911	0 %	0 %	0 %	100 %	386361501
1517	NC_017588	GGT	2	6	63917	63922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361501
1518	NC_017588	CTC	2	6	63959	63964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361501
1519	NC_017588	C	6	6	64009	64014	0 %	0 %	0 %	100 %	386361501
1520	NC_017588	GCC	3	9	64056	64064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361501
1521	NC_017588	CTC	2	6	64094	64099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361501
1522	NC_017588	G	6	6	64104	64109	0 %	0 %	100 %	0 %	386361501
1523	NC_017588	GTA	2	6	64121	64126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361501
1524	NC_017588	CCTTT	2	10	64208	64217	0 %	60 %	0 %	40 %	386361501
1525	NC_017588	T	7	7	64237	64243	0 %	100 %	0 %	0 %	386361501
1526	NC_017588	CTCCAG	2	12	64249	64260	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386361501
1527	NC_017588	GGC	2	6	64330	64335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361501
1528	NC_017588	AGG	2	6	64373	64378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361501
1529	NC_017588	ACC	2	6	64470	64475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361501
1530	NC_017588	CCTC	2	8	65287	65294	0 %	25 %	0 %	75 %	386361502
1531	NC_017588	GAG	2	6	65342	65347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361502
1532	NC_017588	CTC	2	6	65378	65383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361502
1533	NC_017588	TC	3	6	65462	65467	0 %	50 %	0 %	50 %	386361502
1534	NC_017588	TCC	2	6	65481	65486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361502
1535	NC_017588	C	6	6	65485	65490	0 %	0 %	0 %	100 %	386361502
1536	NC_017588	ACGCC	2	10	65576	65585	20 %	0 %	20 %	60 %	386361502
1537	NC_017588	TCC	2	6	65595	65600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361502
1538	NC_017588	GAGC	2	8	65622	65629	25 %	0 %	50 %	25 %	386361502
1539	NC_017588	GGA	2	6	65635	65640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361502
1540	NC_017588	CTC	2	6	65676	65681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361502
1541	NC_017588	GAG	2	6	65699	65704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361502
1542	NC_017588	GA	3	6	65731	65736	50 %	0 %	50 %	0 %	386361502
1543	NC_017588	CAC	2	6	65762	65767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361502
1544	NC_017588	CCT	2	6	65782	65787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361502
1545	NC_017588	C	6	6	65788	65793	0 %	0 %	0 %	100 %	386361502
1546	NC_017588	GA	3	6	65848	65853	50 %	0 %	50 %	0 %	386361502
1547	NC_017588	TCCT	2	8	65910	65917	0 %	50 %	0 %	50 %	386361502
1548	NC_017588	ACC	2	6	65973	65978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361502
1549	NC_017588	GCC	2	6	66009	66014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361502
1550	NC_017588	CCG	2	6	66020	66025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361502
1551	NC_017588	CAC	2	6	66068	66073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361502
1552	NC_017588	GAT	2	6	66083	66088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361502
1553	NC_017588	GC	3	6	66134	66139	0 %	0 %	50 %	50 %	386361502
1554	NC_017588	GTAC	2	8	66360	66367	25 %	25 %	25 %	25 %	386361503
1555	NC_017588	GTAC	2	8	66395	66402	25 %	25 %	25 %	25 %	386361503
1556	NC_017588	GGC	2	6	66420	66425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361503
1557	NC_017588	TCC	2	6	66445	66450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361503
1558	NC_017588	GGT	2	6	66531	66536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361503
1559	NC_017588	CCA	2	6	66537	66542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361503
1560	NC_017588	GCA	2	6	66605	66610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361503
1561	NC_017588	GGAA	2	8	66646	66653	50 %	0 %	50 %	0 %	386361503
1562	NC_017588	G	6	6	67989	67994	0 %	0 %	100 %	0 %	386361504
1563	NC_017588	TCT	2	6	68013	68018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361504
1564	NC_017588	CCT	2	6	68025	68030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361504
1565	NC_017588	AAG	2	6	68098	68103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361504
1566	NC_017588	CGC	2	6	68156	68161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361504
1567	NC_017588	CAC	2	6	68272	68277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361504
1568	NC_017588	GGC	2	6	68299	68304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361504
1569	NC_017588	CCT	2	6	68310	68315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361504
1570	NC_017588	CTT	2	6	68331	68336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361504
1571	NC_017588	TCC	2	6	68369	68374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361504
1572	NC_017588	CAG	2	6	68377	68382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361504
1573	NC_017588	CAC	2	6	68431	68436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361504
1574	NC_017588	TGA	2	6	68505	68510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361504
1575	NC_017588	CGC	2	6	68522	68527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361504
1576	NC_017588	TCCCA	2	10	68561	68570	20 %	20 %	0 %	60 %	386361504
1577	NC_017588	GCC	2	6	68756	68761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361504
1578	NC_017588	GGTC	2	8	68772	68779	0 %	25 %	50 %	25 %	386361504
1579	NC_017588	GCC	2	6	68837	68842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361504
1580	NC_017588	CTGA	2	8	68848	68855	25 %	25 %	25 %	25 %	386361504
1581	NC_017588	CGG	2	6	68859	68864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361504
1582	NC_017588	CCA	2	6	68895	68900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361504
1583	NC_017588	GGC	2	6	68901	68906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361504
1584	NC_017588	GGT	2	6	68983	68988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361504
1585	NC_017588	GTA	2	6	69004	69009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361504
1586	NC_017588	C	6	6	69022	69027	0 %	0 %	0 %	100 %	386361504
1587	NC_017588	AAG	2	6	69038	69043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361504
1588	NC_017588	CCCT	2	8	70548	70555	0 %	25 %	0 %	75 %	386361505
1589	NC_017588	AAGG	2	8	70560	70567	50 %	0 %	50 %	0 %	386361505
1590	NC_017588	CCG	2	6	70618	70623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361505
1591	NC_017588	TCC	2	6	70636	70641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361505
1592	NC_017588	GAG	2	6	70665	70670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361505
1593	NC_017588	CGC	2	6	70732	70737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361505
1594	NC_017588	GAG	2	6	71232	71237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361506
1595	NC_017588	CGT	2	6	71327	71332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361506
1596	NC_017588	GAG	2	6	71352	71357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361506
1597	NC_017588	AGG	2	6	71392	71397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361506
1598	NC_017588	AGG	2	6	71425	71430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361506
1599	NC_017588	GGT	2	6	71465	71470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361506
1600	NC_017588	GGAG	2	8	71516	71523	25 %	0 %	75 %	0 %	386361507
1601	NC_017588	C	6	6	71545	71550	0 %	0 %	0 %	100 %	386361507
1602	NC_017588	CCG	2	6	71555	71560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361507
1603	NC_017588	GC	3	6	71586	71591	0 %	0 %	50 %	50 %	386361507
1604	NC_017588	GGC	2	6	71601	71606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361507
1605	NC_017588	CCT	3	9	71607	71615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361507
1606	NC_017588	AGGG	2	8	71669	71676	25 %	0 %	75 %	0 %	386361507
1607	NC_017588	AGG	2	6	72004	72009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361508
1608	NC_017588	GA	3	6	72010	72015	50 %	0 %	50 %	0 %	386361508
1609	NC_017588	C	6	6	72117	72122	0 %	0 %	0 %	100 %	386361509
1610	NC_017588	C	7	7	72126	72132	0 %	0 %	0 %	100 %	386361509
1611	NC_017588	TCC	2	6	72171	72176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361509
1612	NC_017588	TGG	2	6	72288	72293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361509
1613	NC_017588	CTC	2	6	72305	72310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361509
1614	NC_017588	G	6	6	72702	72707	0 %	0 %	100 %	0 %	386361510
1615	NC_017588	TCT	2	6	72726	72731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361510
1616	NC_017588	CCT	2	6	72738	72743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361510
1617	NC_017588	AAG	2	6	72811	72816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361510
1618	NC_017588	CGC	2	6	72869	72874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361510
1619	NC_017588	CAC	2	6	72985	72990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361510
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1621	NC_017588	CCT	2	6	73023	73028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361510
1622	NC_017588	CTT	2	6	73044	73049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361510
1623	NC_017588	TCC	2	6	73082	73087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361510
1624	NC_017588	CAG	2	6	73090	73095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361510
1625	NC_017588	CAC	2	6	73144	73149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361510
1626	NC_017588	TGA	2	6	73218	73223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361510
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1628	NC_017588	TCCCA	2	10	73274	73283	20 %	20 %	0 %	60 %	386361510
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