MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1801

Total Repeats: 6043

< Previous12345678910111213Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017588	CCA	2	6	264353	264358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361709
6002	NC_017588	ACC	2	6	264370	264375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361709
6003	NC_017588	TGG	2	6	264377	264382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361709
6004	NC_017588	CCA	2	6	264446	264451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361709
6005	NC_017588	AGG	2	6	264467	264472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361709
6006	NC_017588	GGGCCC	2	12	264488	264499	0 %	0 %	50 %	50 %	386361709
6007	NC_017588	CCT	2	6	264506	264511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361709
6008	NC_017588	CTC	2	6	264535	264540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361709
6009	NC_017588	GAA	2	6	264555	264560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361709
6010	NC_017588	GAG	2	6	264579	264584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361709
6011	NC_017588	CGC	2	6	264588	264593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361709
6012	NC_017588	GTA	2	6	264654	264659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361709
6013	NC_017588	CGG	2	6	264709	264714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361709
6014	NC_017588	GCC	2	6	264748	264753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361709
6015	NC_017588	CCT	2	6	264773	264778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361709
6016	NC_017588	ACC	2	6	264802	264807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361709
6017	NC_017588	AGG	2	6	264851	264856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361709
6018	NC_017588	G	7	7	264855	264861	0 %	0 %	100 %	0 %	386361709
6019	NC_017588	GAG	2	6	264865	264870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361709
6020	NC_017588	CGG	2	6	264950	264955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361709
6021	NC_017588	CAG	2	6	265097	265102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361709
6022	NC_017588	TCC	2	6	265125	265130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361710
6023	NC_017588	CCGG	2	8	265177	265184	0 %	0 %	50 %	50 %	386361710
6024	NC_017588	C	6	6	265207	265212	0 %	0 %	0 %	100 %	386361710
6025	NC_017588	CGC	2	6	265220	265225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361710
6026	NC_017588	AGG	2	6	265269	265274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361710
6027	NC_017588	TCC	2	6	265275	265280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361710
6028	NC_017588	CGC	3	9	265298	265306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361710
6029	NC_017588	GCAGG	2	10	265419	265428	20 %	0 %	60 %	20 %	386361710
6030	NC_017588	C	6	6	265459	265464	0 %	0 %	0 %	100 %	386361710
6031	NC_017588	AGG	2	6	265470	265475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361710
6032	NC_017588	GCC	2	6	265479	265484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361710
6033	NC_017588	GGCG	2	8	265492	265499	0 %	0 %	75 %	25 %	386361710
6034	NC_017588	GTG	2	6	265509	265514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361710
6035	NC_017588	CGA	2	6	265522	265527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361710
6036	NC_017588	TCC	2	6	265566	265571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361710
6037	NC_017588	AGGG	2	8	265587	265594	25 %	0 %	75 %	0 %	386361710
6038	NC_017588	CCCG	2	8	265642	265649	0 %	0 %	25 %	75 %	386361710
6039	NC_017588	GCG	2	6	265713	265718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361710
6040	NC_017588	GAGG	2	8	265733	265740	25 %	0 %	75 %	0 %	386361710
6041	NC_017588	GTT	2	6	265742	265747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361710
6042	NC_017588	CTGGC	2	10	265864	265873	0 %	20 %	40 %	40 %	386361710
6043	NC_017588	TGC	2	6	265876	265881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361710

< Previous12345678910111213Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.