MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1801

Total Repeats: 6043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017588	GCGCC	2	10	225225	225234	0 %	0 %	40 %	60 %	386361662
5002	NC_017588	GAG	2	6	225273	225278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361662
5003	NC_017588	CCCG	2	8	225303	225310	0 %	0 %	25 %	75 %	386361662
5004	NC_017588	CCT	2	6	225311	225316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361662
5005	NC_017588	TTC	2	6	225343	225348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361662
5006	NC_017588	CGGAG	2	10	225368	225377	20 %	0 %	60 %	20 %	386361662
5007	NC_017588	GCG	2	6	225381	225386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361662
5008	NC_017588	GGGC	2	8	225404	225411	0 %	0 %	75 %	25 %	386361662
5009	NC_017588	GGC	3	9	225459	225467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361662
5010	NC_017588	CTC	2	6	225504	225509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361662
5011	NC_017588	AGG	2	6	225538	225543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361662
5012	NC_017588	CCTT	2	8	225682	225689	0 %	50 %	0 %	50 %	386361662
5013	NC_017588	CGTC	2	8	225742	225749	0 %	25 %	25 %	50 %	386361662
5014	NC_017588	GGT	2	6	225783	225788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361662
5015	NC_017588	GGA	2	6	225794	225799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361662
5016	NC_017588	CT	3	6	225802	225807	0 %	50 %	0 %	50 %	386361662
5017	NC_017588	GTA	3	9	225819	225827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361662
5018	NC_017588	GTG	3	9	225871	225879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361662
5019	NC_017588	G	7	7	225891	225897	0 %	0 %	100 %	0 %	386361662
5020	NC_017588	C	6	6	225964	225969	0 %	0 %	0 %	100 %	386361662
5021	NC_017588	TCC	2	6	226027	226032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361662
5022	NC_017588	AGG	2	6	226034	226039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361662
5023	NC_017588	TGGA	2	8	226063	226070	25 %	25 %	50 %	0 %	386361662
5024	NC_017588	GCTTGC	2	12	226160	226171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361662
5025	NC_017588	TGG	2	6	226617	226622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361663
5026	NC_017588	GCG	2	6	226692	226697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361663
5027	NC_017588	CCT	2	6	226714	226719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361663
5028	NC_017588	GAG	2	6	226784	226789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361663
5029	NC_017588	CCG	2	6	226795	226800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361663
5030	NC_017588	AGG	4	12	226823	226834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5031	NC_017588	GAG	3	9	226837	226845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5032	NC_017588	GAG	2	6	226915	226920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5033	NC_017588	GGA	2	6	226929	226934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5034	NC_017588	AGG	2	6	226958	226963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5035	NC_017588	AGG	2	6	226967	226972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5036	NC_017588	GAG	2	6	226993	226998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5037	NC_017588	GAG	2	6	227032	227037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5038	NC_017588	CGG	2	6	227094	227099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361664
5039	NC_017588	GAG	2	6	227107	227112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5040	NC_017588	GCG	2	6	227147	227152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361664
5041	NC_017588	GAG	2	6	227164	227169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5042	NC_017588	CAC	2	6	227194	227199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361664
5043	NC_017588	CGGG	2	8	227201	227208	0 %	0 %	75 %	25 %	386361664
5044	NC_017588	G	6	6	227213	227218	0 %	0 %	100 %	0 %	386361664
5045	NC_017588	GAG	4	12	227248	227259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5046	NC_017588	GAG	2	6	227281	227286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5047	NC_017588	GAG	2	6	227299	227304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5048	NC_017588	AGG	2	6	227312	227317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5049	NC_017588	GTA	2	6	227395	227400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361664
5050	NC_017588	GGC	2	6	227404	227409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361664
5051	NC_017588	CAGGGC	2	12	227419	227430	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386361664
5052	NC_017588	CCT	2	6	227451	227456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361664
5053	NC_017588	CGG	2	6	227481	227486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361664
5054	NC_017588	GGC	2	6	227494	227499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361664
5055	NC_017588	GGC	2	6	227509	227514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361664
5056	NC_017588	AGGGC	2	10	227580	227589	20 %	0 %	60 %	20 %	386361664
5057	NC_017588	AGG	2	6	227594	227599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5058	NC_017588	AGG	2	6	227603	227608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5059	NC_017588	GGC	2	6	227629	227634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361664
5060	NC_017588	GAG	2	6	227635	227640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5061	NC_017588	AGG	2	6	227648	227653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5062	NC_017588	GTCC	2	8	227692	227699	0 %	25 %	25 %	50 %	386361664
5063	NC_017588	GAG	3	9	227812	227820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5064	NC_017588	AGG	2	6	227828	227833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361664
5065	NC_017588	CG	3	6	227902	227907	0 %	0 %	50 %	50 %	386361664
5066	NC_017588	AGGA	2	8	228003	228010	50 %	0 %	50 %	0 %	386361665
5067	NC_017588	GAA	2	6	228020	228025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361665
5068	NC_017588	CCAGG	2	10	228056	228065	20 %	0 %	40 %	40 %	386361665
5069	NC_017588	TGGGCG	2	12	228210	228221	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386361665
5070	NC_017588	AGA	2	6	228255	228260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361665
5071	NC_017588	CCA	2	6	228265	228270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361665
5072	NC_017588	CGC	2	6	228275	228280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361665
5073	NC_017588	AGG	2	6	228291	228296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361665
5074	NC_017588	GGC	2	6	228313	228318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361665
5075	NC_017588	TGA	2	6	228342	228347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361666
5076	NC_017588	GAG	2	6	228412	228417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361666
5077	NC_017588	GGC	2	6	228430	228435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361666
5078	NC_017588	CCT	2	6	228438	228443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361666
5079	NC_017588	AGG	2	6	228458	228463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361666
5080	NC_017588	CCT	2	6	228516	228521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361666
5081	NC_017588	CTT	2	6	228525	228530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361666
5082	NC_017588	GGT	2	6	228561	228566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361666
5083	NC_017588	GAG	2	6	228571	228576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361666
5084	NC_017588	C	6	6	228582	228587	0 %	0 %	0 %	100 %	386361666
5085	NC_017588	CCTGC	2	10	228674	228683	0 %	20 %	20 %	60 %	386361667
5086	NC_017588	GCC	2	6	228691	228696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361667
5087	NC_017588	TCC	2	6	228697	228702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361667
5088	NC_017588	CGC	2	6	228716	228721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361667
5089	NC_017588	GAG	2	6	228747	228752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361667
5090	NC_017588	G	7	7	228872	228878	0 %	0 %	100 %	0 %	386361668
5091	NC_017588	CT	3	6	228978	228983	0 %	50 %	0 %	50 %	386361668
5092	NC_017588	GAG	2	6	229055	229060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361668
5093	NC_017588	TC	3	6	229066	229071	0 %	50 %	0 %	50 %	386361668
5094	NC_017588	CCT	2	6	229095	229100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361668
5095	NC_017588	GGCG	2	8	229166	229173	0 %	0 %	75 %	25 %	386361668
5096	NC_017588	CTC	2	6	229217	229222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361668
5097	NC_017588	CTC	2	6	229256	229261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361668
5098	NC_017588	ACC	2	6	229439	229444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361669
5099	NC_017588	GCTG	2	8	229500	229507	0 %	25 %	50 %	25 %	386361669
5100	NC_017588	CGC	2	6	229528	229533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361669
5101	NC_017588	GGT	2	6	229534	229539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361669
5102	NC_017588	TCA	2	6	229548	229553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361669
5103	NC_017588	TGCC	2	8	229620	229627	0 %	25 %	25 %	50 %	386361669
5104	NC_017588	TCA	2	6	229635	229640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361669
5105	NC_017588	GAG	2	6	229700	229705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361669
5106	NC_017588	CTT	2	6	229711	229716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361669
5107	NC_017588	CAA	2	6	229756	229761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361669
5108	NC_017588	CTC	2	6	229808	229813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361669
5109	NC_017588	GAG	2	6	229910	229915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361669
5110	NC_017588	GCA	2	6	229933	229938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361669
5111	NC_017588	GGA	3	9	229990	229998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361669
5112	NC_017588	TGG	2	6	230010	230015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361669
5113	NC_017588	GCG	3	9	230069	230077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361669
5114	NC_017588	AGG	2	6	230082	230087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361669
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5117	NC_017588	TGGG	2	8	230314	230321	0 %	25 %	75 %	0 %	386361670
5118	NC_017588	GGT	2	6	230357	230362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361670
5119	NC_017588	GCC	2	6	230382	230387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361670
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5121	NC_017588	TGG	2	6	230398	230403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361670
5122	NC_017588	GGT	3	9	230414	230422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361670
5123	NC_017588	CCT	2	6	230432	230437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361670
5124	NC_017588	TCA	2	6	230476	230481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361670
5125	NC_017588	AGGGA	2	10	230485	230494	40 %	0 %	60 %	0 %	386361670
5126	NC_017588	GTG	2	6	230562	230567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361670
5127	NC_017588	GTG	2	6	230601	230606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361670
5128	NC_017588	CGG	2	6	230650	230655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361670
5129	NC_017588	TGG	3	9	230697	230705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361670
5130	NC_017588	GTG	2	6	230706	230711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361670
5131	NC_017588	CAT	2	6	230753	230758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361670
5132	NC_017588	CCA	2	6	230864	230869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361670
5133	NC_017588	CTCGGC	2	12	230901	230912	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386361670
5134	NC_017588	TTC	2	6	230916	230921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361670
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5136	NC_017588	ACG	2	6	230971	230976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361670
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5138	NC_017588	TCT	2	6	231016	231021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361670
5139	NC_017588	CGGGG	2	10	231053	231062	0 %	0 %	80 %	20 %	386361670
5140	NC_017588	CTT	2	6	231146	231151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361670
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5142	NC_017588	TGG	2	6	231325	231330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361670
5143	NC_017588	G	6	6	231342	231347	0 %	0 %	100 %	0 %	386361670
5144	NC_017588	TCT	3	9	231427	231435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361670
5145	NC_017588	TCC	2	6	231451	231456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361670
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5147	NC_017588	GGGC	2	8	231483	231490	0 %	0 %	75 %	25 %	386361670
5148	NC_017588	CCG	3	9	231569	231577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361671
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5155	NC_017588	CTT	2	6	231995	232000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361672
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5157	NC_017588	GGA	2	6	232014	232019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361672
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5159	NC_017588	AAG	2	6	232111	232116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361672
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5161	NC_017588	CGG	2	6	232158	232163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361672
5162	NC_017588	GGC	2	6	232190	232195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361672
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5187	NC_017588	GGT	2	6	233112	233117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361672
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5194	NC_017588	ACA	2	6	233519	233524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361672
5195	NC_017588	TCG	2	6	233660	233665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361673
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5202	NC_017588	GGA	2	6	233841	233846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361673
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5210	NC_017588	ACC	2	6	234097	234102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361673
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5220	NC_017588	AGG	3	9	234344	234352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361673
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5224	NC_017588	CCGGGC	2	12	234642	234653	0 %	0 %	50 %	50 %	386361673
5225	NC_017588	ACT	2	6	234671	234676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361673
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5227	NC_017588	AAG	2	6	234733	234738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361673
5228	NC_017588	TGG	2	6	234778	234783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361674
5229	NC_017588	CCA	2	6	234866	234871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361674
5230	NC_017588	GACG	2	8	234935	234942	25 %	0 %	50 %	25 %	386361674
5231	NC_017588	GTG	2	6	234966	234971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361674
5232	NC_017588	TCGG	2	8	235036	235043	0 %	25 %	50 %	25 %	386361674
5233	NC_017588	GCC	2	6	235065	235070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361674
5234	NC_017588	TCCTC	2	10	235084	235093	0 %	40 %	0 %	60 %	386361674
5235	NC_017588	CAA	2	6	235100	235105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361674
5236	NC_017588	GAG	2	6	235128	235133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361674
5237	NC_017588	AAG	2	6	235137	235142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361674
5238	NC_017588	GCC	2	6	235183	235188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361674
5239	NC_017588	AGGCG	2	10	235213	235222	20 %	0 %	60 %	20 %	386361675
5240	NC_017588	GGA	2	6	235249	235254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361675
5241	NC_017588	GGC	2	6	235288	235293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361675
5242	NC_017588	AGG	2	6	235339	235344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361675
5243	NC_017588	GAG	2	6	235346	235351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361675
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5369	NC_017588	CGG	2	6	240494	240499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361686
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5490	NC_017588	C	6	6	244708	244713	0 %	0 %	0 %	100 %	386361690
5491	NC_017588	TCC	2	6	244749	244754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361690
5492	NC_017588	CGGG	2	8	244774	244781	0 %	0 %	75 %	25 %	386361690
5493	NC_017588	CGC	2	6	244835	244840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361690
5494	NC_017588	CCT	2	6	244870	244875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361690
5495	NC_017588	GCG	2	6	244881	244886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361690
5496	NC_017588	GGCCTC	2	12	244907	244918	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386361690
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5498	NC_017588	GCC	2	6	244938	244943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361690
5499	NC_017588	GCTCC	2	10	244985	244994	0 %	20 %	20 %	60 %	386361690
5500	NC_017588	GAG	2	6	245015	245020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361690

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