MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus JL-18 plasmid pTTJL1801

Total Repeats: 6043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017588	ACCT	2	8	204332	204339	25 %	25 %	0 %	50 %	386361641
4502	NC_017588	TCC	3	9	204357	204365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361642
4503	NC_017588	TCC	2	6	204378	204383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361642
4504	NC_017588	CCT	2	6	204424	204429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361642
4505	NC_017588	ACC	2	6	204455	204460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361642
4506	NC_017588	GGAGG	2	10	204505	204514	20 %	0 %	80 %	0 %	386361642
4507	NC_017588	TCC	2	6	204516	204521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361642
4508	NC_017588	GGA	2	6	204544	204549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361642
4509	NC_017588	CTT	2	6	204556	204561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361642
4510	NC_017588	CCT	2	6	204562	204567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361642
4511	NC_017588	CTC	2	6	204575	204580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361642
4512	NC_017588	TCC	2	6	204591	204596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361642
4513	NC_017588	GCC	2	6	204613	204618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361642
4514	NC_017588	CGG	2	6	204621	204626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361642
4515	NC_017588	G	6	6	204649	204654	0 %	0 %	100 %	0 %	386361642
4516	NC_017588	CTC	2	6	204665	204670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361642
4517	NC_017588	GCC	2	6	204674	204679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361642
4518	NC_017588	TCC	2	6	204690	204695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361642
4519	NC_017588	G	6	6	204704	204709	0 %	0 %	100 %	0 %	386361642
4520	NC_017588	G	7	7	204776	204782	0 %	0 %	100 %	0 %	386361642
4521	NC_017588	CCT	2	6	204784	204789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361642
4522	NC_017588	GGC	2	6	204798	204803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361642
4523	NC_017588	CTC	3	9	204809	204817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361642
4524	NC_017588	GGGC	2	8	204819	204826	0 %	0 %	75 %	25 %	386361642
4525	NC_017588	TGG	2	6	204881	204886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361642
4526	NC_017588	C	6	6	204891	204896	0 %	0 %	0 %	100 %	386361642
4527	NC_017588	GGA	2	6	204934	204939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361642
4528	NC_017588	CTT	2	6	204946	204951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361642
4529	NC_017588	CCT	3	9	204982	204990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361642
4530	NC_017588	AAAGG	2	10	205055	205064	60 %	0 %	40 %	0 %	386361643
4531	NC_017588	CCT	2	6	205085	205090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361643
4532	NC_017588	CTC	2	6	205101	205106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361643
4533	NC_017588	G	6	6	205132	205137	0 %	0 %	100 %	0 %	386361643
4534	NC_017588	G	6	6	205147	205152	0 %	0 %	100 %	0 %	386361643
4535	NC_017588	ACC	2	6	205186	205191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361643
4536	NC_017588	CTT	2	6	205196	205201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361643
4537	NC_017588	CCT	2	6	205253	205258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361643
4538	NC_017588	GAG	2	6	205340	205345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361643
4539	NC_017588	G	6	6	205354	205359	0 %	0 %	100 %	0 %	386361643
4540	NC_017588	GTGG	2	8	205361	205368	0 %	25 %	75 %	0 %	386361643
4541	NC_017588	GA	3	6	205384	205389	50 %	0 %	50 %	0 %	386361643
4542	NC_017588	CTC	2	6	205461	205466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361643
4543	NC_017588	TCC	2	6	205486	205491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361643
4544	NC_017588	C	7	7	205538	205544	0 %	0 %	0 %	100 %	386361643
4545	NC_017588	GGA	2	6	205547	205552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361643
4546	NC_017588	CTC	2	6	205593	205598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361643
4547	NC_017588	ACCC	2	8	205605	205612	25 %	0 %	0 %	75 %	386361643
4548	NC_017588	GGA	2	6	205664	205669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361643
4549	NC_017588	CTT	2	6	205692	205697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361643
4550	NC_017588	CTT	3	9	205714	205722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361644
4551	NC_017588	TCTTCC	2	12	205728	205739	0 %	50 %	0 %	50 %	386361644
4552	NC_017588	TCC	3	9	205737	205745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361644
4553	NC_017588	CTC	2	6	205760	205765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361644
4554	NC_017588	GCCCC	2	10	205795	205804	0 %	0 %	20 %	80 %	386361644
4555	NC_017588	CCTC	2	8	205824	205831	0 %	25 %	0 %	75 %	386361644
4556	NC_017588	CTC	2	6	205883	205888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361644
4557	NC_017588	GAC	2	6	205919	205924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361644
4558	NC_017588	CAC	2	6	205970	205975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361644
4559	NC_017588	CCT	2	6	205987	205992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361644
4560	NC_017588	C	6	6	206001	206006	0 %	0 %	0 %	100 %	386361644
4561	NC_017588	GAA	2	6	206026	206031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361644
4562	NC_017588	AGG	2	6	206055	206060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361644
4563	NC_017588	G	6	6	206064	206069	0 %	0 %	100 %	0 %	386361644
4564	NC_017588	GGTCTT	2	12	206071	206082	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386361644
4565	NC_017588	CCGACG	2	12	206085	206096	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386361644
4566	NC_017588	GAG	2	6	206105	206110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361644
4567	NC_017588	CGG	2	6	206119	206124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361644
4568	NC_017588	AGG	2	6	206175	206180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361644
4569	NC_017588	AGGG	2	8	206189	206196	25 %	0 %	75 %	0 %	386361644
4570	NC_017588	TGG	2	6	206202	206207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361644
4571	NC_017588	TGA	2	6	206214	206219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361644
4572	NC_017588	TC	3	6	206227	206232	0 %	50 %	0 %	50 %	386361644
4573	NC_017588	TCC	2	6	206235	206240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361644
4574	NC_017588	GGC	2	6	206299	206304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361644
4575	NC_017588	G	6	6	206318	206323	0 %	0 %	100 %	0 %	386361644
4576	NC_017588	GGC	2	6	206329	206334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361644
4577	NC_017588	GGA	2	6	206350	206355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361644
4578	NC_017588	TGGCCC	2	12	206358	206369	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386361644
4579	NC_017588	G	6	6	206402	206407	0 %	0 %	100 %	0 %	386361644
4580	NC_017588	GAA	2	6	206461	206466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361644
4581	NC_017588	GAA	2	6	206485	206490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361644
4582	NC_017588	TCC	2	6	206499	206504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361644
4583	NC_017588	ACC	2	6	206520	206525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361644
4584	NC_017588	CCCTG	2	10	206538	206547	0 %	20 %	20 %	60 %	386361644
4585	NC_017588	TTC	2	6	206549	206554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361644
4586	NC_017588	G	6	6	206615	206620	0 %	0 %	100 %	0 %	386361644
4587	NC_017588	GCCC	2	8	206629	206636	0 %	0 %	25 %	75 %	386361644
4588	NC_017588	C	6	6	206652	206657	0 %	0 %	0 %	100 %	386361644
4589	NC_017588	TCC	3	9	206661	206669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361644
4590	NC_017588	CCT	2	6	206677	206682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361644
4591	NC_017588	CTC	2	6	206687	206692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361644
4592	NC_017588	AGAC	2	8	206745	206752	50 %	0 %	25 %	25 %	386361645
4593	NC_017588	GGT	2	6	206826	206831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361645
4594	NC_017588	TCC	2	6	206864	206869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361645
4595	NC_017588	AAG	2	6	206878	206883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361645
4596	NC_017588	GGT	3	9	206886	206894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361645
4597	NC_017588	C	6	6	206959	206964	0 %	0 %	0 %	100 %	386361645
4598	NC_017588	GAG	2	6	206980	206985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361645
4599	NC_017588	GCG	2	6	207080	207085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361646
4600	NC_017588	GGT	2	6	207098	207103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361646
4601	NC_017588	GAGG	2	8	207314	207321	25 %	0 %	75 %	0 %	386361646
4602	NC_017588	CT	3	6	207330	207335	0 %	50 %	0 %	50 %	386361646
4603	NC_017588	GGC	2	6	207353	207358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361646
4604	NC_017588	AGG	2	6	207579	207584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361647
4605	NC_017588	CT	3	6	207586	207591	0 %	50 %	0 %	50 %	386361647
4606	NC_017588	CGC	2	6	207606	207611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361647
4607	NC_017588	GGTCCT	2	12	207624	207635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361647
4608	NC_017588	C	7	7	207723	207729	0 %	0 %	0 %	100 %	386361647
4609	NC_017588	GGA	2	6	207735	207740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361647
4610	NC_017588	AGG	2	6	207791	207796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361647
4611	NC_017588	GAC	2	6	207892	207897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361647
4612	NC_017588	CGCC	2	8	207921	207928	0 %	0 %	25 %	75 %	386361647
4613	NC_017588	GGA	2	6	207936	207941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361647
4614	NC_017588	CCG	2	6	207954	207959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361647
4615	NC_017588	CCT	2	6	208029	208034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361647
4616	NC_017588	CCT	2	6	208038	208043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361647
4617	NC_017588	CCT	2	6	208059	208064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361647
4618	NC_017588	TCT	2	6	208136	208141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386361647
4619	NC_017588	CTC	2	6	208153	208158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361647
4620	NC_017588	GCCC	2	8	208182	208189	0 %	0 %	25 %	75 %	386361647
4621	NC_017588	GCG	2	6	208215	208220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361647
4622	NC_017588	G	6	6	208223	208228	0 %	0 %	100 %	0 %	386361647
4623	NC_017588	G	7	7	208242	208248	0 %	0 %	100 %	0 %	386361647
4624	NC_017588	GGA	2	6	208284	208289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361647
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4742	NC_017588	AAGGG	2	10	212915	212924	40 %	0 %	60 %	0 %	386361653
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4993	NC_017588	TCC	2	6	224914	224919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361662
4994	NC_017588	GGA	2	6	224945	224950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386361662
4995	NC_017588	CGG	2	6	224974	224979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361662
4996	NC_017588	GGC	2	6	225015	225020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386361662
4997	NC_017588	CTC	2	6	225021	225026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361662
4998	NC_017588	GCCTCC	2	12	225040	225051	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386361662
4999	NC_017588	GCC	2	6	225058	225063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386361662
5000	NC_017588	CCA	2	6	225131	225136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386361662

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