MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017278	GGA	2	6	127921	127926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438516
3002	NC_017278	GCT	2	6	127978	127983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438516
3003	NC_017278	GGA	2	6	127999	128004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438516
3004	NC_017278	GAA	2	6	128081	128086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438516
3005	NC_017278	CTT	2	6	128095	128100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438516
3006	NC_017278	AC	3	6	128110	128115	50 %	0 %	0 %	50 %	384438516
3007	NC_017278	AGG	2	6	128159	128164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438517
3008	NC_017278	CTG	2	6	128199	128204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438517
3009	NC_017278	GCC	2	6	128233	128238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438517
3010	NC_017278	CCG	2	6	128248	128253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438517
3011	NC_017278	C	6	6	128316	128321	0 %	0 %	0 %	100 %	384438517
3012	NC_017278	G	6	6	128352	128357	0 %	0 %	100 %	0 %	384438517
3013	NC_017278	CGC	2	6	128375	128380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438517
3014	NC_017278	GAG	2	6	128421	128426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438517
3015	NC_017278	GGC	2	6	128428	128433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438517
3016	NC_017278	C	6	6	128485	128490	0 %	0 %	0 %	100 %	384438517
3017	NC_017278	CCA	2	6	128536	128541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438517
3018	NC_017278	CTG	2	6	128598	128603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438517
3019	NC_017278	CCT	2	6	128657	128662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438517
3020	NC_017278	GGA	2	6	128768	128773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438517
3021	NC_017278	GGT	3	9	128834	128842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438517
3022	NC_017278	G	6	6	128847	128852	0 %	0 %	100 %	0 %	384438517
3023	NC_017278	CCCTC	2	10	128868	128877	0 %	20 %	0 %	80 %	384438518
3024	NC_017278	GAG	3	9	128909	128917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438518
3025	NC_017278	GAG	2	6	129044	129049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438518
3026	NC_017278	G	6	6	129053	129058	0 %	0 %	100 %	0 %	384438518
3027	NC_017278	GCA	2	6	129079	129084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438518
3028	NC_017278	GAG	3	9	129113	129121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438518
3029	NC_017278	AGG	2	6	129183	129188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438518
3030	NC_017278	TCC	2	6	129312	129317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438519
3031	NC_017278	CCCG	2	8	129364	129371	0 %	0 %	25 %	75 %	384438519
3032	NC_017278	CTT	2	6	129399	129404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438519
3033	NC_017278	GCA	2	6	129428	129433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438519
3034	NC_017278	C	6	6	129500	129505	0 %	0 %	0 %	100 %	384438519
3035	NC_017278	CGTG	2	8	129512	129519	0 %	25 %	50 %	25 %	384438519
3036	NC_017278	CAC	2	6	129660	129665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438519
3037	NC_017278	GCC	2	6	129674	129679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438519
3038	NC_017278	CCG	2	6	129693	129698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438519
3039	NC_017278	CT	3	6	129712	129717	0 %	50 %	0 %	50 %	384438519
3040	NC_017278	TCC	2	6	129820	129825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438519
3041	NC_017278	GGA	2	6	129951	129956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438519
3042	NC_017278	CGT	2	6	129962	129967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438519
3043	NC_017278	GAAG	2	8	129971	129978	50 %	0 %	50 %	0 %	384438519
3044	NC_017278	AGG	2	6	130027	130032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438519
3045	NC_017278	CGGTC	2	10	130061	130070	0 %	20 %	40 %	40 %	384438519
3046	NC_017278	AGG	2	6	130078	130083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438519
3047	NC_017278	GGA	2	6	130097	130102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438519
3048	NC_017278	GGCCA	2	10	130144	130153	20 %	0 %	40 %	40 %	384438519
3049	NC_017278	GGCT	2	8	130193	130200	0 %	25 %	50 %	25 %	384438519
3050	NC_017278	GCGG	2	8	130242	130249	0 %	0 %	75 %	25 %	384438519
3051	NC_017278	GGC	2	6	130269	130274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438519
3052	NC_017278	TGA	2	6	130325	130330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438519
3053	NC_017278	GCC	2	6	130755	130760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438520
3054	NC_017278	C	7	7	130796	130802	0 %	0 %	0 %	100 %	384438520
3055	NC_017278	CGC	2	6	130807	130812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438520
3056	NC_017278	GGT	2	6	130820	130825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438520
3057	NC_017278	GAA	2	6	130884	130889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438520
3058	NC_017278	CAC	2	6	130938	130943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438520
3059	NC_017278	C	7	7	130956	130962	0 %	0 %	0 %	100 %	384438520
3060	NC_017278	GGC	2	6	131016	131021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438520
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3062	NC_017278	CTC	2	6	131052	131057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438520
3063	NC_017278	AGG	2	6	131066	131071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438520
3064	NC_017278	G	7	7	131079	131085	0 %	0 %	100 %	0 %	384438520
3065	NC_017278	AGG	2	6	131095	131100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438520
3066	NC_017278	GCG	2	6	131118	131123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438520
3067	NC_017278	CCGC	2	8	131141	131148	0 %	0 %	25 %	75 %	384438520
3068	NC_017278	CGC	2	6	131191	131196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438520
3069	NC_017278	CCCAGG	2	12	131197	131208	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384438520
3070	NC_017278	CCT	2	6	131210	131215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438520
3071	NC_017278	CCA	2	6	131216	131221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438520
3072	NC_017278	CCA	3	9	131246	131254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438520
3073	NC_017278	GGGA	2	8	131263	131270	25 %	0 %	75 %	0 %	384438520
3074	NC_017278	CCA	2	6	131279	131284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438520
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3077	NC_017278	TCC	2	6	131371	131376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438520
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3080	NC_017278	GAG	2	6	131445	131450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438520
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3082	NC_017278	AGG	2	6	131533	131538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438520
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3085	NC_017278	GC	3	6	131665	131670	0 %	0 %	50 %	50 %	384438520
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3088	NC_017278	AGG	2	6	131854	131859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438521
3089	NC_017278	TGA	2	6	131882	131887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438521
3090	NC_017278	TCCA	2	8	131916	131923	25 %	25 %	0 %	50 %	384438521
3091	NC_017278	CTC	2	6	131945	131950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438521
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3093	NC_017278	G	6	6	132017	132022	0 %	0 %	100 %	0 %	384438521
3094	NC_017278	CTA	3	9	132158	132166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438521
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3096	NC_017278	GGCG	2	8	132229	132236	0 %	0 %	75 %	25 %	384438521
3097	NC_017278	CCT	2	6	132289	132294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438521
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3101	NC_017278	GCG	2	6	132560	132565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438521
3102	NC_017278	GCCC	2	8	132575	132582	0 %	0 %	25 %	75 %	384438521
3103	NC_017278	GAG	2	6	132585	132590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438521
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3105	NC_017278	GAG	2	6	132669	132674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438521
3106	NC_017278	GCGG	2	8	132675	132682	0 %	0 %	75 %	25 %	384438521
3107	NC_017278	TGG	2	6	132850	132855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438521
3108	NC_017278	CGA	2	6	132866	132871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438521
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3110	NC_017278	CGG	2	6	132912	132917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438521
3111	NC_017278	GAG	4	12	132933	132944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438521
3112	NC_017278	GAA	2	6	132960	132965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438521
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3115	NC_017278	GGT	2	6	133115	133120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438521
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3119	NC_017278	GTGG	2	8	133782	133789	0 %	25 %	75 %	0 %	384438522
3120	NC_017278	CGTCC	2	10	133811	133820	0 %	20 %	20 %	60 %	384438522
3121	NC_017278	GGA	2	6	133821	133826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438522
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3123	NC_017278	CCG	2	6	133875	133880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438522
3124	NC_017278	CAA	2	6	133962	133967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384438522
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3231	NC_017278	AGA	2	6	138402	138407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438522
3232	NC_017278	CTT	2	6	138409	138414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438522
3233	NC_017278	TTC	2	6	138448	138453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438522
3234	NC_017278	GGA	2	6	138462	138467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438522
3235	NC_017278	GGACC	2	10	138528	138537	20 %	0 %	40 %	40 %	384438522
3236	NC_017278	CTT	2	6	138547	138552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438522
3237	NC_017278	TCCT	2	8	138592	138599	0 %	50 %	0 %	50 %	384438522
3238	NC_017278	AGC	2	6	138608	138613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438522
3239	NC_017278	GA	4	8	138745	138752	50 %	0 %	50 %	0 %	384438523
3240	NC_017278	CGC	2	6	138754	138759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438523
3241	NC_017278	CCT	2	6	138775	138780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438523
3242	NC_017278	GTC	2	6	138811	138816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438523
3243	NC_017278	GGA	2	6	138818	138823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438523
3244	NC_017278	TTG	2	6	138870	138875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384438523
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3485	NC_017278	GCAC	2	8	149923	149930	25 %	0 %	25 %	50 %	384438532
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3489	NC_017278	CAC	2	6	150233	150238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438532
3490	NC_017278	CG	3	6	150296	150301	0 %	0 %	50 %	50 %	384438532
3491	NC_017278	CCT	2	6	150392	150397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438532
3492	NC_017278	CCT	2	6	150400	150405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438532
3493	NC_017278	CAGGC	2	10	150438	150447	20 %	0 %	40 %	40 %	384438532
3494	NC_017278	CCA	2	6	150538	150543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438532
3495	NC_017278	TTG	2	6	150549	150554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384438532
3496	NC_017278	GCC	3	9	150629	150637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438532
3497	NC_017278	GAG	2	6	150658	150663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438532
3498	NC_017278	TCC	2	6	150666	150671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438532
3499	NC_017278	TCGT	2	8	150696	150703	0 %	50 %	25 %	25 %	384438532
3500	NC_017278	CCA	2	6	150769	150774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438532

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