MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017278	CCCGGG	2	12	38140	38151	0 %	0 %	50 %	50 %	384438442
1002	NC_017278	TCC	2	6	38152	38157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438442
1003	NC_017278	GGCA	2	8	38159	38166	25 %	0 %	50 %	25 %	384438442
1004	NC_017278	TGG	2	6	38167	38172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438442
1005	NC_017278	AGG	2	6	38173	38178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438442
1006	NC_017278	CCA	2	6	38191	38196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438442
1007	NC_017278	G	6	6	38202	38207	0 %	0 %	100 %	0 %	384438442
1008	NC_017278	ATG	2	6	38208	38213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438442
1009	NC_017278	CGA	2	6	38231	38236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438442
1010	NC_017278	AGG	2	6	38299	38304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438442
1011	NC_017278	C	6	6	38308	38313	0 %	0 %	0 %	100 %	384438442
1012	NC_017278	G	7	7	38346	38352	0 %	0 %	100 %	0 %	384438442
1013	NC_017278	GAG	2	6	38385	38390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438442
1014	NC_017278	TGGAGG	2	12	38413	38424	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384438442
1015	NC_017278	CCT	2	6	38471	38476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438442
1016	NC_017278	AGG	2	6	38551	38556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438442
1017	NC_017278	TCC	2	6	38635	38640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438442
1018	NC_017278	GCA	2	6	38659	38664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438442
1019	NC_017278	AGG	3	9	38665	38673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438442
1020	NC_017278	GCT	2	6	38752	38757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438443
1021	NC_017278	CTT	2	6	38779	38784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438443
1022	NC_017278	CCA	2	6	38799	38804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438443
1023	NC_017278	GGT	2	6	38812	38817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438443
1024	NC_017278	GGC	2	6	38839	38844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438443
1025	NC_017278	CCA	2	6	38895	38900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438443
1026	NC_017278	GGC	2	6	38920	38925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438443
1027	NC_017278	CAC	3	9	38971	38979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438443
1028	NC_017278	GGCG	2	8	39012	39019	0 %	0 %	75 %	25 %	384438443
1029	NC_017278	CTC	2	6	39022	39027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438443
1030	NC_017278	CTT	2	6	39076	39081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438443
1031	NC_017278	AGG	2	6	39113	39118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438443
1032	NC_017278	CGC	3	9	39123	39131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438443
1033	NC_017278	CTC	2	6	39145	39150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438443
1034	NC_017278	CTT	2	6	39193	39198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438443
1035	NC_017278	CTCGGT	2	12	39208	39219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438443
1036	NC_017278	CACC	2	8	39225	39232	25 %	0 %	0 %	75 %	384438443
1037	NC_017278	C	6	6	39248	39253	0 %	0 %	0 %	100 %	384438443
1038	NC_017278	GGT	2	6	39304	39309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438443
1039	NC_017278	CTT	2	6	39319	39324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438443
1040	NC_017278	TCC	2	6	39350	39355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438443
1041	NC_017278	CTTGCC	2	12	39358	39369	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384438443
1042	NC_017278	TGG	2	6	39378	39383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438443
1043	NC_017278	CGGCC	2	10	39411	39420	0 %	0 %	40 %	60 %	384438443
1044	NC_017278	CTC	2	6	39460	39465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438443
1045	NC_017278	GCC	2	6	39478	39483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438443
1046	NC_017278	GCG	2	6	39517	39522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438443
1047	NC_017278	CAC	2	6	39580	39585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438443
1048	NC_017278	AGG	3	9	39626	39634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438443
1049	NC_017278	GAG	2	6	39670	39675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438443
1050	NC_017278	CTT	2	6	39694	39699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438443
1051	NC_017278	TCC	2	6	39722	39727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438443
1052	NC_017278	TGA	2	6	39756	39761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438443
1053	NC_017278	CTC	2	6	39835	39840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438443
1054	NC_017278	TGA	2	6	39846	39851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438443
1055	NC_017278	CCT	2	6	39855	39860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438443
1056	NC_017278	TGG	2	6	39921	39926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438443
1057	NC_017278	CCT	2	6	39930	39935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438443
1058	NC_017278	TCC	2	6	39950	39955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438443
1059	NC_017278	TCT	2	6	39978	39983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438443
1060	NC_017278	CGG	2	6	40041	40046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438443
1061	NC_017278	TTC	2	6	40052	40057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438443
1062	NC_017278	CGGTGG	2	12	40089	40100	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384438443
1063	NC_017278	CGT	2	6	40119	40124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438443
1064	NC_017278	CCT	2	6	40140	40145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438443
1065	NC_017278	GAG	2	6	40147	40152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438443
1066	NC_017278	GGT	2	6	40173	40178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438443
1067	NC_017278	TGG	2	6	40224	40229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438443
1068	NC_017278	CTT	2	6	40240	40245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438443
1069	NC_017278	CGC	2	6	40311	40316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438443
1070	NC_017278	CGG	2	6	40328	40333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438443
1071	NC_017278	CAG	2	6	40404	40409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438444
1072	NC_017278	CTC	2	6	40434	40439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438444
1073	NC_017278	GCC	2	6	40461	40466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438444
1074	NC_017278	CCT	2	6	40493	40498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438444
1075	NC_017278	GCC	2	6	40605	40610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438444
1076	NC_017278	TCC	2	6	40624	40629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438444
1077	NC_017278	CAC	3	9	40641	40649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438444
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1079	NC_017278	CAC	2	6	40818	40823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438445
1080	NC_017278	GCC	2	6	40843	40848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438445
1081	NC_017278	GGGCCC	2	12	40853	40864	0 %	0 %	50 %	50 %	384438445
1082	NC_017278	GGC	2	6	40904	40909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438445
1083	NC_017278	AGG	2	6	40945	40950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438445
1084	NC_017278	CCGGGC	2	12	40965	40976	0 %	0 %	50 %	50 %	384438445
1085	NC_017278	CCT	2	6	41006	41011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438445
1086	NC_017278	AGG	2	6	41029	41034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438445
1087	NC_017278	GAG	2	6	41097	41102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438445
1088	NC_017278	C	6	6	41177	41182	0 %	0 %	0 %	100 %	384438445
1089	NC_017278	CAG	2	6	41196	41201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438445
1090	NC_017278	GGC	2	6	41208	41213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438445
1091	NC_017278	GGC	2	6	41220	41225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438445
1092	NC_017278	GGA	2	6	41267	41272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438445
1093	NC_017278	C	6	6	41278	41283	0 %	0 %	0 %	100 %	384438445
1094	NC_017278	AGG	2	6	41347	41352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438445
1095	NC_017278	C	6	6	41427	41432	0 %	0 %	0 %	100 %	384438445
1096	NC_017278	GAA	2	6	41439	41444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438445
1097	NC_017278	GGC	2	6	41464	41469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438445
1098	NC_017278	AGG	2	6	41480	41485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438445
1099	NC_017278	CGC	2	6	41584	41589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438445
1100	NC_017278	CGGTAG	2	12	41590	41601	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384438445
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1102	NC_017278	AGGC	2	8	41679	41686	25 %	0 %	50 %	25 %	384438445
1103	NC_017278	C	6	6	41745	41750	0 %	0 %	0 %	100 %	384438445
1104	NC_017278	G	6	6	41767	41772	0 %	0 %	100 %	0 %	384438445
1105	NC_017278	AGGC	2	8	41782	41789	25 %	0 %	50 %	25 %	384438445
1106	NC_017278	G	6	6	41807	41812	0 %	0 %	100 %	0 %	384438445
1107	NC_017278	GAG	4	12	41826	41837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438445
1108	NC_017278	CCT	2	6	41899	41904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438446
1109	NC_017278	GGGC	2	8	41919	41926	0 %	0 %	75 %	25 %	384438446
1110	NC_017278	GAG	3	9	41951	41959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438446
1111	NC_017278	TCC	2	6	42021	42026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438446
1112	NC_017278	AGA	2	6	42027	42032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438446
1113	NC_017278	GGAGAG	2	12	42119	42130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438446
1114	NC_017278	TAG	2	6	42140	42145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438446
1115	NC_017278	TCC	2	6	42150	42155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438446
1116	NC_017278	TTG	2	6	42173	42178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384438446
1117	NC_017278	CCT	2	6	42193	42198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438446
1118	NC_017278	TCG	2	6	42267	42272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438446
1119	NC_017278	GCG	2	6	42294	42299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438446
1120	NC_017278	CTC	3	9	42338	42346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438446
1121	NC_017278	A	7	7	42371	42377	100 %	0 %	0 %	0 %	384438446
1122	NC_017278	GGGT	2	8	42390	42397	0 %	25 %	75 %	0 %	384438446
1123	NC_017278	GAG	2	6	42437	42442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438446
1124	NC_017278	G	6	6	42457	42462	0 %	0 %	100 %	0 %	384438446
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1126	NC_017278	GGA	2	6	42487	42492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438446
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1377	NC_017278	GGT	2	6	52470	52475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438454
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1497	NC_017278	GAG	2	6	60265	60270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438459
1498	NC_017278	AGA	2	6	60317	60322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438459
1499	NC_017278	CGTC	2	8	60357	60364	0 %	25 %	25 %	50 %	384438459
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