MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017272	GTG	2	6	169744	169749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430387
4002	NC_017272	TCC	2	6	169807	169812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430387
4003	NC_017272	C	6	6	169834	169839	0 %	0 %	0 %	100 %	384430387
4004	NC_017272	GGC	2	6	169902	169907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430387
4005	NC_017272	CGT	2	6	169916	169921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430387
4006	NC_017272	CCACCC	2	12	169976	169987	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	384430387
4007	NC_017272	GGCGG	2	10	170004	170013	0 %	0 %	80 %	20 %	384430387
4008	NC_017272	CGC	2	6	170022	170027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430387
4009	NC_017272	GTG	2	6	170029	170034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430387
4010	NC_017272	GAA	2	6	170043	170048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430387
4011	NC_017272	G	6	6	170051	170056	0 %	0 %	100 %	0 %	384430387
4012	NC_017272	CGC	2	6	170064	170069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430387
4013	NC_017272	GCC	2	6	170077	170082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430387
4014	NC_017272	CTGG	2	8	170103	170110	0 %	25 %	50 %	25 %	384430387
4015	NC_017272	CTT	2	6	170175	170180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430387
4016	NC_017272	CAC	2	6	170232	170237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430387
4017	NC_017272	TCC	2	6	170269	170274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430387
4018	NC_017272	GGC	2	6	170278	170283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430387
4019	NC_017272	AGG	2	6	170296	170301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430387
4020	NC_017272	CCA	2	6	170330	170335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430387
4021	NC_017272	CCT	2	6	170348	170353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430387
4022	NC_017272	TCG	2	6	170362	170367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430387
4023	NC_017272	GGT	2	6	170369	170374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430387
4024	NC_017272	CACCCG	2	12	170400	170411	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384430387
4025	NC_017272	CCA	2	6	170435	170440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430387
4026	NC_017272	CCT	2	6	170460	170465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430387
4027	NC_017272	C	6	6	170633	170638	0 %	0 %	0 %	100 %	384430388
4028	NC_017272	TGA	2	6	170755	170760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430388
4029	NC_017272	GCC	2	6	170781	170786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430388
4030	NC_017272	CTC	2	6	170787	170792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430388
4031	NC_017272	GCCGG	2	10	170824	170833	0 %	0 %	60 %	40 %	384430388
4032	NC_017272	CCTC	2	8	170893	170900	0 %	25 %	0 %	75 %	384430388
4033	NC_017272	GGC	2	6	170915	170920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430388
4034	NC_017272	CAC	2	6	170936	170941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430388
4035	NC_017272	TGG	2	6	170970	170975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430388
4036	NC_017272	CCTT	2	8	170991	170998	0 %	50 %	0 %	50 %	384430388
4037	NC_017272	CTC	2	6	171027	171032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430388
4038	NC_017272	G	7	7	171033	171039	0 %	0 %	100 %	0 %	384430388
4039	NC_017272	G	7	7	171072	171078	0 %	0 %	100 %	0 %	384430388
4040	NC_017272	CTC	2	6	171087	171092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430388
4041	NC_017272	CTC	2	6	171108	171113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430388
4042	NC_017272	GGC	2	6	171122	171127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430388
4043	NC_017272	TCC	2	6	171139	171144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430388
4044	NC_017272	CGG	2	6	171208	171213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430388
4045	NC_017272	CTC	2	6	171216	171221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430388
4046	NC_017272	G	6	6	171249	171254	0 %	0 %	100 %	0 %	384430388
4047	NC_017272	G	6	6	171258	171263	0 %	0 %	100 %	0 %	384430388
4048	NC_017272	CCT	3	9	171287	171295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430388
4049	NC_017272	CCT	2	6	171302	171307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430388
4050	NC_017272	C	6	6	171356	171361	0 %	0 %	0 %	100 %	384430388
4051	NC_017272	CCT	2	6	171407	171412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430388
4052	NC_017272	CCT	2	6	171419	171424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430388
4053	NC_017272	TCC	2	6	171451	171456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430388
4054	NC_017272	CGT	2	6	171494	171499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430388
4055	NC_017272	G	6	6	171500	171505	0 %	0 %	100 %	0 %	384430388
4056	NC_017272	CGC	2	6	171529	171534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430389
4057	NC_017272	G	7	7	171551	171557	0 %	0 %	100 %	0 %	384430389
4058	NC_017272	GGCGG	2	10	171562	171571	0 %	0 %	80 %	20 %	384430389
4059	NC_017272	C	6	6	171586	171591	0 %	0 %	0 %	100 %	384430389
4060	NC_017272	TCC	2	6	171615	171620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430389
4061	NC_017272	TCC	3	9	171627	171635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430389
4062	NC_017272	CGCC	3	12	171652	171663	0 %	0 %	25 %	75 %	384430389
4063	NC_017272	CCG	2	6	171669	171674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430389
4064	NC_017272	GGC	3	9	171678	171686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430389
4065	NC_017272	TAC	2	6	171728	171733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430389
4066	NC_017272	CCA	2	6	171747	171752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430389
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4068	NC_017272	CTCC	2	8	171790	171797	0 %	25 %	0 %	75 %	384430389
4069	NC_017272	CTC	2	6	171812	171817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430389
4070	NC_017272	TGGGG	2	10	171850	171859	0 %	20 %	80 %	0 %	384430389
4071	NC_017272	CCT	2	6	171865	171870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430389
4072	NC_017272	CCT	2	6	171880	171885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430389
4073	NC_017272	GGT	2	6	171886	171891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430389
4074	NC_017272	CCT	2	6	171937	171942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430389
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4078	NC_017272	CTC	2	6	172037	172042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430389
4079	NC_017272	CGGCC	2	10	172087	172096	0 %	0 %	40 %	60 %	384430389
4080	NC_017272	G	6	6	172101	172106	0 %	0 %	100 %	0 %	384430389
4081	NC_017272	GGT	2	6	172135	172140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430389
4082	NC_017272	TCC	2	6	172155	172160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430389
4083	NC_017272	CCCG	2	8	172178	172185	0 %	0 %	25 %	75 %	384430389
4084	NC_017272	TGG	2	6	172197	172202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430389
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4088	NC_017272	G	7	7	173527	173533	0 %	0 %	100 %	0 %	384430390
4089	NC_017272	AGG	2	6	173534	173539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430390
4090	NC_017272	GAG	2	6	173581	173586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430390
4091	NC_017272	TGC	2	6	173630	173635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430390
4092	NC_017272	AGG	2	6	173711	173716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430390
4093	NC_017272	CCA	2	6	173805	173810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430390
4094	NC_017272	GTA	2	6	173875	173880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430390
4095	NC_017272	CAC	2	6	173911	173916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430390
4096	NC_017272	GAG	2	6	173953	173958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430390
4097	NC_017272	AGG	3	9	174056	174064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430390
4098	NC_017272	CTCCA	2	10	174142	174151	20 %	20 %	0 %	60 %	384430390
4099	NC_017272	CGG	2	6	174153	174158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430390
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4102	NC_017272	AGT	2	6	174297	174302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430390
4103	NC_017272	CCG	2	6	174312	174317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430390
4104	NC_017272	GTG	2	6	174359	174364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430390
4105	NC_017272	TCC	2	6	174398	174403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430390
4106	NC_017272	CTC	2	6	174421	174426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430390
4107	NC_017272	GGC	2	6	174465	174470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430390
4108	NC_017272	GGA	2	6	174471	174476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430390
4109	NC_017272	CTC	2	6	174487	174492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430390
4110	NC_017272	GCG	2	6	174499	174504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430390
4111	NC_017272	CG	3	6	174531	174536	0 %	0 %	50 %	50 %	384430390
4112	NC_017272	TGG	2	6	174724	174729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430391
4113	NC_017272	GGA	2	6	174749	174754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430391
4114	NC_017272	GGC	2	6	174773	174778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430391
4115	NC_017272	GTG	3	9	174816	174824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430391
4116	NC_017272	CGG	2	6	174835	174840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430391
4117	NC_017272	AGG	2	6	174850	174855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430391
4118	NC_017272	CCT	2	6	174887	174892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430391
4119	NC_017272	GTG	2	6	174906	174911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430391
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4121	NC_017272	CTC	2	6	175029	175034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430391
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4123	NC_017272	TGG	2	6	175066	175071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430391
4124	NC_017272	GAG	2	6	175131	175136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430391
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4370	NC_017272	GCCC	2	8	184571	184578	0 %	0 %	25 %	75 %	384430399
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4491	NC_017272	CCT	2	6	189037	189042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430405
4492	NC_017272	TCC	2	6	189054	189059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430405
4493	NC_017272	AGG	2	6	189087	189092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430405
4494	NC_017272	GAG	2	6	189122	189127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430405
4495	NC_017272	CCT	2	6	189196	189201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430405
4496	NC_017272	GAG	2	6	189209	189214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430405
4497	NC_017272	TCC	2	6	189249	189254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430405
4498	NC_017272	GGA	2	6	189262	189267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430405
4499	NC_017272	CCCT	2	8	189273	189280	0 %	25 %	0 %	75 %	384430405
4500	NC_017272	CCA	2	6	189313	189318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430405

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