MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_017272	C	7	7	1355152	1355158	0 %	0 %	0 %	100 %	384431572
34003	NC_017272	G	6	6	1355191	1355196	0 %	0 %	100 %	0 %	384431572
34004	NC_017272	GGACGC	2	12	1355253	1355264	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384431572
34005	NC_017272	GGCG	2	8	1355298	1355305	0 %	0 %	75 %	25 %	384431572
34006	NC_017272	CCG	2	6	1355309	1355314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431572
34007	NC_017272	C	6	6	1355321	1355326	0 %	0 %	0 %	100 %	384431572
34008	NC_017272	GAG	2	6	1355365	1355370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431572
34009	NC_017272	GGC	2	6	1355391	1355396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431572
34010	NC_017272	GCGGA	2	10	1355407	1355416	20 %	0 %	60 %	20 %	384431572
34011	NC_017272	GGT	2	6	1355451	1355456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431572
34012	NC_017272	G	7	7	1355511	1355517	0 %	0 %	100 %	0 %	384431572
34013	NC_017272	CGC	2	6	1355544	1355549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431572
34014	NC_017272	CCT	2	6	1355622	1355627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431572
34015	NC_017272	CTC	2	6	1355650	1355655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431572
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34017	NC_017272	CTC	2	6	1355695	1355700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431572
34018	NC_017272	AGG	2	6	1355702	1355707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431572
34019	NC_017272	TCC	2	6	1355729	1355734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431572
34020	NC_017272	CCCCG	2	10	1355878	1355887	0 %	0 %	20 %	80 %	384431573
34021	NC_017272	CCGGG	2	10	1355956	1355965	0 %	0 %	60 %	40 %	384431573
34022	NC_017272	CCCCT	2	10	1355987	1355996	0 %	20 %	0 %	80 %	384431573
34023	NC_017272	CTC	2	6	1356046	1356051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431573
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34028	NC_017272	GCC	2	6	1356191	1356196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431573
34029	NC_017272	C	6	6	1356206	1356211	0 %	0 %	0 %	100 %	384431573
34030	NC_017272	C	7	7	1356262	1356268	0 %	0 %	0 %	100 %	384431573
34031	NC_017272	GGA	2	6	1356322	1356327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431573
34032	NC_017272	AAG	2	6	1356346	1356351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431573
34033	NC_017272	GAGG	2	8	1356397	1356404	25 %	0 %	75 %	0 %	384431573
34034	NC_017272	CCA	2	6	1356421	1356426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431573
34035	NC_017272	GCCT	2	8	1356437	1356444	0 %	25 %	25 %	50 %	384431573
34036	NC_017272	GC	3	6	1356474	1356479	0 %	0 %	50 %	50 %	384431573
34037	NC_017272	GGC	2	6	1356496	1356501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431573
34038	NC_017272	GGGCG	2	10	1356508	1356517	0 %	0 %	80 %	20 %	384431573
34039	NC_017272	GCC	2	6	1356530	1356535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431573
34040	NC_017272	GC	4	8	1356539	1356546	0 %	0 %	50 %	50 %	384431573
34041	NC_017272	GGA	2	6	1356550	1356555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431573
34042	NC_017272	GGGA	2	8	1356624	1356631	25 %	0 %	75 %	0 %	384431573
34043	NC_017272	GGT	2	6	1356765	1356770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431574
34044	NC_017272	GGA	2	6	1356831	1356836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431574
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34047	NC_017272	CCTT	2	8	1357013	1357020	0 %	50 %	0 %	50 %	384431574
34048	NC_017272	G	6	6	1357021	1357026	0 %	0 %	100 %	0 %	384431574
34049	NC_017272	G	6	6	1357055	1357060	0 %	0 %	100 %	0 %	384431574
34050	NC_017272	TCA	2	6	1357067	1357072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431574
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34052	NC_017272	AAGACC	2	12	1357171	1357182	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384431574
34053	NC_017272	GGA	2	6	1357185	1357190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431574
34054	NC_017272	CGC	2	6	1357203	1357208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431574
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34056	NC_017272	GA	3	6	1357235	1357240	50 %	0 %	50 %	0 %	384431574
34057	NC_017272	C	7	7	1357313	1357319	0 %	0 %	0 %	100 %	384431574
34058	NC_017272	CTC	2	6	1357333	1357338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431574
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34063	NC_017272	GCC	3	9	1357484	1357492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431576
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34065	NC_017272	GCGG	2	8	1357556	1357563	0 %	0 %	75 %	25 %	384431576
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34102	NC_017272	AAG	2	6	1359006	1359011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431578
34103	NC_017272	CTC	2	6	1359033	1359038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431578
34104	NC_017272	ACT	2	6	1359043	1359048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431578
34105	NC_017272	CCT	2	6	1359053	1359058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431578
34106	NC_017272	GGA	2	6	1359068	1359073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431578
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34110	NC_017272	CCCG	2	8	1359168	1359175	0 %	0 %	25 %	75 %	384431578
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34116	NC_017272	GAAG	2	8	1359344	1359351	50 %	0 %	50 %	0 %	384431578
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34471	NC_017272	G	6	6	1372895	1372900	0 %	0 %	100 %	0 %	384431596
34472	NC_017272	GGGCCT	2	12	1372927	1372938	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384431596
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