MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017272	AGGACG	2	12	189336	189347	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384430405
4502	NC_017272	GGT	2	6	189353	189358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430405
4503	NC_017272	TCC	2	6	189400	189405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430405
4504	NC_017272	CCT	2	6	189412	189417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430405
4505	NC_017272	AGG	2	6	189429	189434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430405
4506	NC_017272	C	6	6	189522	189527	0 %	0 %	0 %	100 %	384430405
4507	NC_017272	CCA	2	6	189538	189543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430405
4508	NC_017272	GGGT	2	8	189612	189619	0 %	25 %	75 %	0 %	384430405
4509	NC_017272	GGC	2	6	189626	189631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430405
4510	NC_017272	GGC	2	6	190639	190644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430406
4511	NC_017272	GAG	2	6	190664	190669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430406
4512	NC_017272	AAGGAG	2	12	190847	190858	50 %	0 %	50 %	0 %	384430406
4513	NC_017272	CTGGAG	2	12	190877	190888	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384430406
4514	NC_017272	CGC	2	6	190889	190894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430406
4515	NC_017272	TCC	2	6	190905	190910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430406
4516	NC_017272	ATG	2	6	190925	190930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430406
4517	NC_017272	CAA	2	6	190942	190947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430406
4518	NC_017272	G	6	6	190964	190969	0 %	0 %	100 %	0 %	384430406
4519	NC_017272	CTT	2	6	191023	191028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430406
4520	NC_017272	TCT	2	6	191064	191069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430406
4521	NC_017272	AGG	3	9	191127	191135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430406
4522	NC_017272	CCG	2	6	191149	191154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430406
4523	NC_017272	CCCG	2	8	191164	191171	0 %	0 %	25 %	75 %	384430406
4524	NC_017272	ACG	2	6	191367	191372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430406
4525	NC_017272	GGC	2	6	191401	191406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430406
4526	NC_017272	TCG	2	6	191433	191438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430406
4527	NC_017272	GGT	2	6	191542	191547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430406
4528	NC_017272	CTC	2	6	191570	191575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430406
4529	NC_017272	AGG	2	6	191586	191591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430406
4530	NC_017272	CCT	2	6	191596	191601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430406
4531	NC_017272	CCG	2	6	191602	191607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430406
4532	NC_017272	TGG	2	6	191619	191624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430406
4533	NC_017272	CGC	2	6	191644	191649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430406
4534	NC_017272	G	6	6	191654	191659	0 %	0 %	100 %	0 %	384430406
4535	NC_017272	CTT	2	6	191677	191682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430406
4536	NC_017272	AAG	2	6	191699	191704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430406
4537	NC_017272	GACG	2	8	191719	191726	25 %	0 %	50 %	25 %	384430406
4538	NC_017272	GGC	2	6	191756	191761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430406
4539	NC_017272	CGC	2	6	191782	191787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430406
4540	NC_017272	CCA	2	6	191890	191895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430406
4541	NC_017272	GAA	2	6	191899	191904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430406
4542	NC_017272	GAG	2	6	191912	191917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430406
4543	NC_017272	AGG	2	6	191925	191930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430406
4544	NC_017272	GAG	2	6	191960	191965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430406
4545	NC_017272	GGA	2	6	191971	191976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430406
4546	NC_017272	ACC	2	6	191988	191993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430406
4547	NC_017272	CCT	2	6	192022	192027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430406
4548	NC_017272	AGG	2	6	192032	192037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430406
4549	NC_017272	AGG	2	6	192065	192070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430406
4550	NC_017272	G	6	6	192082	192087	0 %	0 %	100 %	0 %	384430406
4551	NC_017272	TTC	2	6	192110	192115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430406
4552	NC_017272	G	7	7	192136	192142	0 %	0 %	100 %	0 %	384430406
4553	NC_017272	CCA	3	9	192153	192161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430406
4554	NC_017272	CTC	2	6	192188	192193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430406
4555	NC_017272	CCG	2	6	192201	192206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430406
4556	NC_017272	CGA	2	6	192235	192240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430406
4557	NC_017272	GGA	2	6	192370	192375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430406
4558	NC_017272	CCA	2	6	192447	192452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430406
4559	NC_017272	TCA	2	6	192462	192467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430406
4560	NC_017272	CTT	2	6	192538	192543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430406
4561	NC_017272	CGG	2	6	192555	192560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430406
4562	NC_017272	CAC	2	6	192565	192570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430406
4563	NC_017272	GCC	2	6	192626	192631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430406
4564	NC_017272	CCT	2	6	192637	192642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430406
4565	NC_017272	GGA	2	6	192685	192690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430406
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4567	NC_017272	TCT	2	6	192726	192731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430406
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4569	NC_017272	C	7	7	192766	192772	0 %	0 %	0 %	100 %	384430406
4570	NC_017272	AGG	2	6	192798	192803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430406
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4572	NC_017272	GTG	2	6	192929	192934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430406
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4574	NC_017272	CTA	2	6	192970	192975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430406
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4582	NC_017272	CTGGAG	2	12	193448	193459	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384430407
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4585	NC_017272	GTG	2	6	193502	193507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430407
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4592	NC_017272	CCG	2	6	193710	193715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430407
4593	NC_017272	GCC	2	6	193719	193724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430407
4594	NC_017272	CGG	2	6	193731	193736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430407
4595	NC_017272	CTCC	2	8	193737	193744	0 %	25 %	0 %	75 %	384430407
4596	NC_017272	GGC	2	6	193749	193754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430407
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4599	NC_017272	GCCCCC	2	12	193877	193888	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	384430407
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4601	NC_017272	GCGG	2	8	194059	194066	0 %	0 %	75 %	25 %	384430407
4602	NC_017272	GA	3	6	194069	194074	50 %	0 %	50 %	0 %	384430407
4603	NC_017272	CCTCAC	2	12	194083	194094	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384430407
4604	NC_017272	TCC	2	6	194100	194105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430407
4605	NC_017272	GGCCCT	2	12	194110	194121	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384430407
4606	NC_017272	GGA	2	6	194284	194289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430407
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4608	NC_017272	G	7	7	194374	194380	0 %	0 %	100 %	0 %	384430407
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4618	NC_017272	C	7	7	194771	194777	0 %	0 %	0 %	100 %	384430408
4619	NC_017272	CGG	2	6	194816	194821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430408
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4622	NC_017272	GAG	2	6	194936	194941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430408
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4861	NC_017272	GAA	2	6	204564	204569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430415
4862	NC_017272	CCA	2	6	204587	204592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430415
4863	NC_017272	CCTC	3	12	204627	204638	0 %	25 %	0 %	75 %	384430415
4864	NC_017272	GCC	2	6	204639	204644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430415
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4868	NC_017272	TCC	2	6	204739	204744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430415
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4989	NC_017272	CTT	2	6	208817	208822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430420
4990	NC_017272	CAC	2	6	208851	208856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430420
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4992	NC_017272	GGA	2	6	208958	208963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430420
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