MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 3815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017268	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	384421555
2	NC_017268	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	384421555
3	NC_017268	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	384421555
4	NC_017268	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	384421555
5	NC_017268	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	384421556
6	NC_017268	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	384421556
7	NC_017268	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	384421557
8	NC_017268	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	384421557
9	NC_017268	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	384421557
10	NC_017268	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	384421557
11	NC_017268	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	384421558
12	NC_017268	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	384421558
13	NC_017268	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	384421559
14	NC_017268	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	384421559
15	NC_017268	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	384421559
16	NC_017268	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	384421559
17	NC_017268	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	384421559
18	NC_017268	GC	3	6	7548	7553	0 %	0 %	50 %	50 %	384421561
19	NC_017268	GA	3	6	7912	7917	50 %	0 %	50 %	0 %	384421561
20	NC_017268	GC	3	6	8016	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	384421561
21	NC_017268	AT	4	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	384421562
22	NC_017268	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	384421562
23	NC_017268	AG	3	6	9425	9430	50 %	0 %	50 %	0 %	384421563
24	NC_017268	AC	3	6	9823	9828	50 %	0 %	0 %	50 %	384421563
25	NC_017268	AG	3	6	9886	9891	50 %	0 %	50 %	0 %	384421564
26	NC_017268	TC	3	6	9943	9948	0 %	50 %	0 %	50 %	384421564
27	NC_017268	TC	3	6	10700	10705	0 %	50 %	0 %	50 %	384421566
28	NC_017268	GC	3	6	11289	11294	0 %	0 %	50 %	50 %	384421566
29	NC_017268	GT	3	6	11330	11335	0 %	50 %	50 %	0 %	384421566
30	NC_017268	GT	3	6	11520	11525	0 %	50 %	50 %	0 %	384421566
31	NC_017268	TA	3	6	11907	11912	50 %	50 %	0 %	0 %	384421566
32	NC_017268	CA	3	6	12027	12032	50 %	0 %	0 %	50 %	384421566
33	NC_017268	GT	3	6	12353	12358	0 %	50 %	50 %	0 %	384421566
34	NC_017268	GC	3	6	12613	12618	0 %	0 %	50 %	50 %	384421567
35	NC_017268	GC	3	6	13060	13065	0 %	0 %	50 %	50 %	384421567
36	NC_017268	GT	3	6	13143	13148	0 %	50 %	50 %	0 %	384421567
37	NC_017268	CA	4	8	13235	13242	50 %	0 %	0 %	50 %	384421567
38	NC_017268	GA	3	6	13319	13324	50 %	0 %	50 %	0 %	384421567
39	NC_017268	GC	3	6	13530	13535	0 %	0 %	50 %	50 %	384421567
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42	NC_017268	CG	3	6	14300	14305	0 %	0 %	50 %	50 %	384421568
43	NC_017268	AT	3	6	14543	14548	50 %	50 %	0 %	0 %	384421568
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45	NC_017268	CG	3	6	16388	16393	0 %	0 %	50 %	50 %	384421569
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49	NC_017268	GT	3	6	17216	17221	0 %	50 %	50 %	0 %	384421569
50	NC_017268	CG	3	6	17335	17340	0 %	0 %	50 %	50 %	384421569
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60	NC_017268	GT	3	6	26254	26259	0 %	50 %	50 %	0 %	384421571
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68	NC_017268	AT	4	8	28141	28148	50 %	50 %	0 %	0 %	384421572
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110	NC_017268	GT	3	6	40605	40610	0 %	50 %	50 %	0 %	384421581
111	NC_017268	TG	3	6	41101	41106	0 %	50 %	50 %	0 %	384421582
112	NC_017268	AT	3	6	41284	41289	50 %	50 %	0 %	0 %	384421582
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114	NC_017268	CA	3	6	41653	41658	50 %	0 %	0 %	50 %	384421582
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123	NC_017268	GA	3	6	45145	45150	50 %	0 %	50 %	0 %	384421586
124	NC_017268	CG	3	6	45200	45205	0 %	0 %	50 %	50 %	384421586
125	NC_017268	TC	3	6	45688	45693	0 %	50 %	0 %	50 %	384421587
126	NC_017268	CG	3	6	45783	45788	0 %	0 %	50 %	50 %	384421587
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129	NC_017268	CG	3	6	47556	47561	0 %	0 %	50 %	50 %	384421589
130	NC_017268	CG	3	6	47568	47573	0 %	0 %	50 %	50 %	384421589
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132	NC_017268	GA	3	6	49856	49861	50 %	0 %	50 %	0 %	384421591
133	NC_017268	TC	4	8	50473	50480	0 %	50 %	0 %	50 %	384421592
134	NC_017268	TG	3	6	50521	50526	0 %	50 %	50 %	0 %	384421592
135	NC_017268	TG	3	6	50549	50554	0 %	50 %	50 %	0 %	384421592
136	NC_017268	CG	4	8	50555	50562	0 %	0 %	50 %	50 %	384421592
137	NC_017268	GA	3	6	50594	50599	50 %	0 %	50 %	0 %	384421593
138	NC_017268	CA	3	6	50785	50790	50 %	0 %	0 %	50 %	384421593
139	NC_017268	GA	3	6	51105	51110	50 %	0 %	50 %	0 %	384421593
140	NC_017268	TC	3	6	51167	51172	0 %	50 %	0 %	50 %	384421593
141	NC_017268	CG	4	8	51629	51636	0 %	0 %	50 %	50 %	384421593
142	NC_017268	GC	3	6	51681	51686	0 %	0 %	50 %	50 %	384421593
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