MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 2598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017268	TTTG	2	8	237	244	0 %	75 %	25 %	0 %	384421555
2	NC_017268	TACC	2	8	297	304	25 %	25 %	0 %	50 %	384421555
3	NC_017268	TTCC	2	8	329	336	0 %	50 %	0 %	50 %	384421555
4	NC_017268	CATT	2	8	672	679	25 %	50 %	0 %	25 %	384421555
5	NC_017268	GATA	2	8	1047	1054	50 %	25 %	25 %	0 %	384421555
6	NC_017268	CAAA	2	8	1939	1946	75 %	0 %	0 %	25 %	384421556
7	NC_017268	CTAT	2	8	2612	2619	25 %	50 %	0 %	25 %	384421556
8	NC_017268	GGTT	2	8	3587	3594	0 %	50 %	50 %	0 %	384421557
9	NC_017268	AAAG	2	8	4039	4046	75 %	0 %	25 %	0 %	384421558
10	NC_017268	GTAC	2	8	4104	4111	25 %	25 %	25 %	25 %	384421558
11	NC_017268	CGTC	2	8	4650	4657	0 %	25 %	25 %	50 %	384421559
12	NC_017268	TCAT	2	8	4707	4714	25 %	50 %	0 %	25 %	384421559
13	NC_017268	GTGC	2	8	5540	5547	0 %	25 %	50 %	25 %	384421559
14	NC_017268	TTAC	2	8	5771	5778	25 %	50 %	0 %	25 %	384421559
15	NC_017268	AAGA	2	8	5807	5814	75 %	0 %	25 %	0 %	384421559
16	NC_017268	GGGC	2	8	6092	6099	0 %	0 %	75 %	25 %	384421559
17	NC_017268	GACG	2	8	6181	6188	25 %	0 %	50 %	25 %	384421559
18	NC_017268	GAGG	2	8	6427	6434	25 %	0 %	75 %	0 %	384421559
19	NC_017268	GCGT	2	8	6765	6772	0 %	25 %	50 %	25 %	384421559
20	NC_017268	AGTT	2	8	7082	7089	25 %	50 %	25 %	0 %	384421561
21	NC_017268	TTAC	2	8	7267	7274	25 %	50 %	0 %	25 %	384421561
22	NC_017268	TTGC	2	8	7317	7324	0 %	50 %	25 %	25 %	384421561
23	NC_017268	GTCA	2	8	7488	7495	25 %	25 %	25 %	25 %	384421561
24	NC_017268	GGTT	2	8	8562	8569	0 %	50 %	50 %	0 %	384421562
25	NC_017268	CCGT	2	8	9126	9133	0 %	25 %	25 %	50 %	384421562
26	NC_017268	GGTA	2	8	9207	9214	25 %	25 %	50 %	0 %	384421562
27	NC_017268	GTGG	2	8	10238	10245	0 %	25 %	75 %	0 %	384421565
28	NC_017268	GCTT	2	8	10621	10628	0 %	50 %	25 %	25 %	384421566
29	NC_017268	TGGA	2	8	11618	11625	25 %	25 %	50 %	0 %	384421566
30	NC_017268	AAGT	2	8	11842	11849	50 %	25 %	25 %	0 %	384421566
31	NC_017268	GAGC	2	8	12343	12350	25 %	0 %	50 %	25 %	384421566
32	NC_017268	GCGT	2	8	13220	13227	0 %	25 %	50 %	25 %	384421567
33	NC_017268	GTTT	2	8	13597	13604	0 %	75 %	25 %	0 %	384421567
34	NC_017268	GAAG	2	8	13655	13662	50 %	0 %	50 %	0 %	384421567
35	NC_017268	ACAT	2	8	13690	13697	50 %	25 %	0 %	25 %	384421567
36	NC_017268	AGGG	2	8	14108	14115	25 %	0 %	75 %	0 %	384421568
37	NC_017268	TTTC	2	8	14323	14330	0 %	75 %	0 %	25 %	384421568
38	NC_017268	AGAT	2	8	14981	14988	50 %	25 %	25 %	0 %	384421568
39	NC_017268	GCTC	2	8	15783	15790	0 %	25 %	25 %	50 %	384421568
40	NC_017268	GCTG	2	8	16213	16220	0 %	25 %	50 %	25 %	384421569
41	NC_017268	GTAC	2	8	16311	16318	25 %	25 %	25 %	25 %	384421569
42	NC_017268	TGCG	2	8	16695	16702	0 %	25 %	50 %	25 %	384421569
43	NC_017268	TTGG	2	8	17147	17154	0 %	50 %	50 %	0 %	384421569
44	NC_017268	GCAG	2	8	17502	17509	25 %	0 %	50 %	25 %	384421569
45	NC_017268	AAGG	2	8	17681	17688	50 %	0 %	50 %	0 %	384421569
46	NC_017268	GTGC	2	8	18155	18162	0 %	25 %	50 %	25 %	384421569
47	NC_017268	CGAT	2	8	18416	18423	25 %	25 %	25 %	25 %	384421570
48	NC_017268	CGTT	2	8	18639	18646	0 %	50 %	25 %	25 %	384421570
49	NC_017268	TATG	2	8	18685	18692	25 %	50 %	25 %	0 %	384421570
50	NC_017268	GATT	2	8	25860	25867	25 %	50 %	25 %	0 %	384421571
51	NC_017268	AGCG	2	8	25998	26005	25 %	0 %	50 %	25 %	384421571
52	NC_017268	CCTT	2	8	26834	26841	0 %	50 %	0 %	50 %	384421571
53	NC_017268	GCAC	2	8	26940	26947	25 %	0 %	25 %	50 %	384421571
54	NC_017268	AGCG	2	8	27253	27260	25 %	0 %	50 %	25 %	384421571
55	NC_017268	CAGT	2	8	27344	27351	25 %	25 %	25 %	25 %	384421571
56	NC_017268	TGCG	2	8	27792	27799	0 %	25 %	50 %	25 %	384421572
57	NC_017268	CATC	2	8	27821	27828	25 %	25 %	0 %	50 %	384421572
58	NC_017268	AGTG	2	8	28054	28061	25 %	25 %	50 %	0 %	384421572
59	NC_017268	TTTG	2	8	28438	28445	0 %	75 %	25 %	0 %	384421572
60	NC_017268	AAAG	2	8	30938	30945	75 %	0 %	25 %	0 %	384421574
61	NC_017268	GCGG	2	8	31114	31121	0 %	0 %	75 %	25 %	384421574
62	NC_017268	TCGT	2	8	31280	31287	0 %	50 %	25 %	25 %	384421574
63	NC_017268	TGTC	2	8	31420	31427	0 %	50 %	25 %	25 %	384421574
64	NC_017268	ATCC	2	8	32110	32117	25 %	25 %	0 %	50 %	384421574
65	NC_017268	CTCG	2	8	32119	32126	0 %	25 %	25 %	50 %	384421574
66	NC_017268	GTAC	2	8	32143	32150	25 %	25 %	25 %	25 %	384421574
67	NC_017268	TTCA	2	8	32455	32462	25 %	50 %	0 %	25 %	384421574
68	NC_017268	GTTG	2	8	32484	32491	0 %	50 %	50 %	0 %	384421574
69	NC_017268	CAAA	2	8	32793	32800	75 %	0 %	0 %	25 %	384421574
70	NC_017268	TGCG	2	8	33240	33247	0 %	25 %	50 %	25 %	384421575
71	NC_017268	CCGC	2	8	33643	33650	0 %	0 %	25 %	75 %	384421575
72	NC_017268	GCCG	2	8	34518	34525	0 %	0 %	50 %	50 %	384421576
73	NC_017268	ATTG	2	8	34804	34811	25 %	50 %	25 %	0 %	384421576
74	NC_017268	GACG	2	8	34955	34962	25 %	0 %	50 %	25 %	384421576
75	NC_017268	CGTG	2	8	35749	35756	0 %	25 %	50 %	25 %	384421577
76	NC_017268	GGGT	2	8	36292	36299	0 %	25 %	75 %	0 %	384421577
77	NC_017268	GACA	2	8	36434	36441	50 %	0 %	25 %	25 %	384421577
78	NC_017268	GTGC	2	8	37193	37200	0 %	25 %	50 %	25 %	384421578
79	NC_017268	GCGA	2	8	37475	37482	25 %	0 %	50 %	25 %	384421578
80	NC_017268	ACGT	2	8	37683	37690	25 %	25 %	25 %	25 %	384421578
81	NC_017268	GAGC	2	8	37738	37745	25 %	0 %	50 %	25 %	384421578
82	NC_017268	TGCG	2	8	38052	38059	0 %	25 %	50 %	25 %	384421578
83	NC_017268	CTTG	2	8	38426	38433	0 %	50 %	25 %	25 %	384421579
84	NC_017268	ACGA	2	8	38553	38560	50 %	0 %	25 %	25 %	384421579
85	NC_017268	GACT	2	8	39610	39617	25 %	25 %	25 %	25 %	384421579
86	NC_017268	GGTT	2	8	39629	39636	0 %	50 %	50 %	0 %	384421579
87	NC_017268	GTAT	2	8	39940	39947	25 %	50 %	25 %	0 %	384421579
88	NC_017268	TTTC	2	8	40100	40107	0 %	75 %	0 %	25 %	384421580
89	NC_017268	TCGG	2	8	40173	40180	0 %	25 %	50 %	25 %	384421580
90	NC_017268	TCCA	2	8	40477	40484	25 %	25 %	0 %	50 %	384421581
91	NC_017268	GAAA	2	8	41030	41037	75 %	0 %	25 %	0 %	384421581
92	NC_017268	AGAA	2	8	41221	41228	75 %	0 %	25 %	0 %	384421582
93	NC_017268	GAAA	2	8	41629	41636	75 %	0 %	25 %	0 %	384421582
94	NC_017268	CATC	2	8	43826	43833	25 %	25 %	0 %	50 %	384421585
95	NC_017268	GCTC	2	8	44242	44249	0 %	25 %	25 %	50 %	384421585
96	NC_017268	GGGT	2	8	44284	44291	0 %	25 %	75 %	0 %	384421585
97	NC_017268	GCAC	2	8	45363	45370	25 %	0 %	25 %	50 %	384421586
98	NC_017268	AGGA	2	8	45745	45752	50 %	0 %	50 %	0 %	384421587
99	NC_017268	TTAC	2	8	47162	47169	25 %	50 %	0 %	25 %	384421589
100	NC_017268	TCCC	2	8	47206	47213	0 %	25 %	0 %	75 %	384421589
101	NC_017268	TGGG	2	8	47830	47837	0 %	25 %	75 %	0 %	384421589
102	NC_017268	GTCG	2	8	48723	48730	0 %	25 %	50 %	25 %	384421589
103	NC_017268	GGAC	2	8	48773	48780	25 %	0 %	50 %	25 %	384421589
104	NC_017268	CGCC	2	8	49297	49304	0 %	0 %	25 %	75 %	384421589
105	NC_017268	AGCG	2	8	49429	49436	25 %	0 %	50 %	25 %	384421590
106	NC_017268	CGGG	2	8	49497	49504	0 %	0 %	75 %	25 %	384421590
107	NC_017268	GAGG	2	8	49934	49941	25 %	0 %	75 %	0 %	384421591
108	NC_017268	GCAG	2	8	50850	50857	25 %	0 %	50 %	25 %	384421593
109	NC_017268	TTCT	2	8	51464	51471	0 %	75 %	0 %	25 %	384421593
110	NC_017268	GGGC	2	8	52168	52175	0 %	0 %	75 %	25 %	384421593
111	NC_017268	ATGC	2	8	52825	52832	25 %	25 %	25 %	25 %	384421594
112	NC_017268	AATC	2	8	53327	53334	50 %	25 %	0 %	25 %	384421594
113	NC_017268	ATTA	2	8	53355	53362	50 %	50 %	0 %	0 %	384421594
114	NC_017268	CAAA	2	8	53697	53704	75 %	0 %	0 %	25 %	384421594
115	NC_017268	GGAA	2	8	54320	54327	50 %	0 %	50 %	0 %	384421594
116	NC_017268	CATC	2	8	54681	54688	25 %	25 %	0 %	50 %	384421595
117	NC_017268	TTTC	2	8	54770	54777	0 %	75 %	0 %	25 %	384421595
118	NC_017268	CTTT	2	8	54900	54907	0 %	75 %	0 %	25 %	384421595
119	NC_017268	TCGT	2	8	55366	55373	0 %	50 %	25 %	25 %	384421595
120	NC_017268	CTAA	2	8	56046	56053	50 %	25 %	0 %	25 %	384421596
121	NC_017268	TATG	2	8	56203	56210	25 %	50 %	25 %	0 %	384421596
122	NC_017268	TCCT	2	8	56420	56427	0 %	50 %	0 %	50 %	384421596
123	NC_017268	CGTG	2	8	60244	60251	0 %	25 %	50 %	25 %	384421600
124	NC_017268	CTAC	2	8	60326	60333	25 %	25 %	0 %	50 %	384421600
125	NC_017268	TGTC	2	8	60346	60353	0 %	50 %	25 %	25 %	384421600
126	NC_017268	GCGT	2	8	60543	60550	0 %	25 %	50 %	25 %	384421600
127	NC_017268	TTGC	2	8	60763	60770	0 %	50 %	25 %	25 %	384421601
128	NC_017268	CGTG	2	8	60778	60785	0 %	25 %	50 %	25 %	384421601
129	NC_017268	TGCG	2	8	61112	61119	0 %	25 %	50 %	25 %	384421601
130	NC_017268	AAGG	2	8	61480	61487	50 %	0 %	50 %	0 %	384421601
131	NC_017268	AAAT	2	8	62220	62227	75 %	25 %	0 %	0 %	384421602
132	NC_017268	AAGG	2	8	62534	62541	50 %	0 %	50 %	0 %	384421602
133	NC_017268	TGCC	2	8	62645	62652	0 %	25 %	25 %	50 %	384421602
134	NC_017268	TGCG	2	8	63131	63138	0 %	25 %	50 %	25 %	384421603
135	NC_017268	CACT	2	8	63403	63410	25 %	25 %	0 %	50 %	384421603
136	NC_017268	GCAG	2	8	63700	63707	25 %	0 %	50 %	25 %	384421603
137	NC_017268	TCAG	2	8	64749	64756	25 %	25 %	25 %	25 %	384421606
138	NC_017268	CAGT	2	8	65414	65421	25 %	25 %	25 %	25 %	384421606
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