MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017268	GC	3	6	175431	175436	0 %	0 %	50 %	50 %	384421701
3003	NC_017268	G	6	6	175440	175445	0 %	0 %	100 %	0 %	384421701
3004	NC_017268	CG	4	8	175454	175461	0 %	0 %	50 %	50 %	384421701
3005	NC_017268	CTGA	2	8	175522	175529	25 %	25 %	25 %	25 %	384421701
3006	NC_017268	AGTG	2	8	175558	175565	25 %	25 %	50 %	0 %	384421701
3007	NC_017268	GTC	2	6	175623	175628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421701
3008	NC_017268	CGT	2	6	175635	175640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421701
3009	NC_017268	GC	3	6	175664	175669	0 %	0 %	50 %	50 %	384421701
3010	NC_017268	AAT	2	6	175744	175749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421701
3011	NC_017268	GAAC	2	8	175792	175799	50 %	0 %	25 %	25 %	384421701
3012	NC_017268	CGT	3	9	175815	175823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421701
3013	NC_017268	CGC	2	6	175906	175911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421701
3014	NC_017268	GC	3	6	175910	175915	0 %	0 %	50 %	50 %	384421701
3015	NC_017268	CTTCT	2	10	175943	175952	0 %	60 %	0 %	40 %	384421701
3016	NC_017268	CGTG	2	8	175989	175996	0 %	25 %	50 %	25 %	384421701
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3019	NC_017268	GTGCT	2	10	176087	176096	0 %	40 %	40 %	20 %	384421701
3020	NC_017268	TTGG	2	8	176109	176116	0 %	50 %	50 %	0 %	384421701
3021	NC_017268	GC	3	6	176162	176167	0 %	0 %	50 %	50 %	384421701
3022	NC_017268	GAC	2	6	176209	176214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421701
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3026	NC_017268	GAACG	2	10	176341	176350	40 %	0 %	40 %	20 %	384421701
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3030	NC_017268	TGG	2	6	176402	176407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421701
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3033	NC_017268	ATG	2	6	176795	176800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421702
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3037	NC_017268	ACCG	2	8	176942	176949	25 %	0 %	25 %	50 %	384421702
3038	NC_017268	AG	3	6	177016	177021	50 %	0 %	50 %	0 %	384421702
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3043	NC_017268	GAG	2	6	177202	177207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421703
3044	NC_017268	TCG	2	6	177254	177259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421703
3045	NC_017268	GTC	2	6	177309	177314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421703
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3047	NC_017268	TGG	2	6	177341	177346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421703
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3049	NC_017268	CCTG	2	8	177423	177430	0 %	25 %	25 %	50 %	384421703
3050	NC_017268	GTC	2	6	177484	177489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421703
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3056	NC_017268	TG	4	8	177670	177677	0 %	50 %	50 %	0 %	384421703
3057	NC_017268	GCA	3	9	177845	177853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421703
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3059	NC_017268	GC	3	6	177894	177899	0 %	0 %	50 %	50 %	384421703
3060	NC_017268	GCT	2	6	177903	177908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421703
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3062	NC_017268	GC	3	6	177976	177981	0 %	0 %	50 %	50 %	384421703
3063	NC_017268	T	8	8	178119	178126	0 %	100 %	0 %	0 %	384421703
3064	NC_017268	GCTT	2	8	178127	178134	0 %	50 %	25 %	25 %	384421703
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3076	NC_017268	TCAG	2	8	178656	178663	25 %	25 %	25 %	25 %	384421704
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3102	NC_017268	A	6	6	179797	179802	100 %	0 %	0 %	0 %	384421705
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3109	NC_017268	GTC	2	6	180053	180058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421706
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3113	NC_017268	TC	3	6	180340	180345	0 %	50 %	0 %	50 %	384421706
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3242	NC_017268	AC	3	6	186714	186719	50 %	0 %	0 %	50 %	384421712
3243	NC_017268	TGC	2	6	186737	186742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421712
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3496	NC_017268	ATC	2	6	206082	206087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421729
3497	NC_017268	TGA	2	6	206104	206109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421729
3498	NC_017268	TGGT	2	8	206213	206220	0 %	50 %	50 %	0 %	384421730
3499	NC_017268	CGGTGA	2	12	206279	206290	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384421730
3500	NC_017268	GTG	2	6	206308	206313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421730

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