MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_017268	CAG	2	6	117722	117727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421657
2003	NC_017268	T	6	6	117741	117746	0 %	100 %	0 %	0 %	384421657
2004	NC_017268	GAA	2	6	117871	117876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421657
2005	NC_017268	A	6	6	117903	117908	100 %	0 %	0 %	0 %	384421657
2006	NC_017268	GAAG	2	8	118079	118086	50 %	0 %	50 %	0 %	384421657
2007	NC_017268	AGGC	2	8	118094	118101	25 %	0 %	50 %	25 %	384421657
2008	NC_017268	ATCT	2	8	118173	118180	25 %	50 %	0 %	25 %	384421657
2009	NC_017268	TCT	2	6	118192	118197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421657
2010	NC_017268	CTG	2	6	118236	118241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421657
2011	NC_017268	AT	3	6	118243	118248	50 %	50 %	0 %	0 %	384421657
2012	NC_017268	GAA	2	6	118287	118292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421657
2013	NC_017268	GAAG	2	8	118369	118376	50 %	0 %	50 %	0 %	384421657
2014	NC_017268	GCAGA	2	10	118442	118451	40 %	0 %	40 %	20 %	384421657
2015	NC_017268	GAC	2	6	118488	118493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421657
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2017	NC_017268	GCG	2	6	118580	118585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421657
2018	NC_017268	GCGT	2	8	118618	118625	0 %	25 %	50 %	25 %	384421657
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2021	NC_017268	GCT	2	6	118694	118699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421657
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2023	NC_017268	A	6	6	118875	118880	100 %	0 %	0 %	0 %	384421658
2024	NC_017268	ATG	2	6	118927	118932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421658
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2033	NC_017268	GGT	2	6	119234	119239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421658
2034	NC_017268	CGTA	2	8	119285	119292	25 %	25 %	25 %	25 %	384421658
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2039	NC_017268	AAGA	2	8	119493	119500	75 %	0 %	25 %	0 %	384421658
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2041	NC_017268	AGA	2	6	119570	119575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421658
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2049	NC_017268	TACG	2	8	119835	119842	25 %	25 %	25 %	25 %	384421658
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2055	NC_017268	ATG	2	6	119950	119955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421658
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2057	NC_017268	GGGAG	2	10	120003	120012	20 %	0 %	80 %	0 %	384421658
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2063	NC_017268	CGT	2	6	120192	120197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421658
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2091	NC_017268	GA	3	6	121990	121995	50 %	0 %	50 %	0 %	384421659
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2104	NC_017268	CGA	2	6	123176	123181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421660
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2106	NC_017268	CG	3	6	123206	123211	0 %	0 %	50 %	50 %	384421660
2107	NC_017268	AGC	2	6	123220	123225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421660
2108	NC_017268	ACC	2	6	123228	123233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421660
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2110	NC_017268	TCT	2	6	123455	123460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421660
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2119	NC_017268	GTTC	2	8	124296	124303	0 %	50 %	25 %	25 %	384421661
2120	NC_017268	T	7	7	124328	124334	0 %	100 %	0 %	0 %	384421661
2121	NC_017268	GCG	2	6	124351	124356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421661
2122	NC_017268	CGCAG	2	10	124401	124410	20 %	0 %	40 %	40 %	384421661
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2124	NC_017268	TG	3	6	124451	124456	0 %	50 %	50 %	0 %	384421661
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2250	NC_017268	AGGA	2	8	131012	131019	50 %	0 %	50 %	0 %	384421667
2251	NC_017268	TCA	2	6	131030	131035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421667
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2359	NC_017268	AAC	2	6	137201	137206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421671
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2373	NC_017268	GCA	2	6	137944	137949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421671
2374	NC_017268	CCG	2	6	137950	137955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421671
2375	NC_017268	CAA	2	6	137980	137985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421671
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2481	NC_017268	GCG	2	6	143878	143883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421676
2482	NC_017268	CCG	2	6	143884	143889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421676
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2487	NC_017268	ATTT	2	8	144128	144135	25 %	75 %	0 %	0 %	384421676
2488	NC_017268	CTTC	2	8	144260	144267	0 %	50 %	0 %	50 %	384421676
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2491	NC_017268	TG	3	6	144358	144363	0 %	50 %	50 %	0 %	384421676
2492	NC_017268	AGA	2	6	144417	144422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421676
2493	NC_017268	AC	3	6	144465	144470	50 %	0 %	0 %	50 %	384421676
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2495	NC_017268	ACA	2	6	144532	144537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421676
2496	NC_017268	GCG	2	6	144546	144551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421676
2497	NC_017268	GAT	2	6	144652	144657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421676
2498	NC_017268	GCA	2	6	144726	144731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421676
2499	NC_017268	AGC	2	6	144794	144799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421676
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