MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017268	TCT	2	6	354549	354554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421855
6002	NC_017268	GA	3	6	354563	354568	50 %	0 %	50 %	0 %	384421855
6003	NC_017268	GAT	2	6	354581	354586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421855
6004	NC_017268	ATA	2	6	354618	354623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421855
6005	NC_017268	GAAA	2	8	354666	354673	75 %	0 %	25 %	0 %	384421855
6006	NC_017268	GCAT	2	8	354702	354709	25 %	25 %	25 %	25 %	384421855
6007	NC_017268	TAAG	2	8	354716	354723	50 %	25 %	25 %	0 %	384421855
6008	NC_017268	AGA	2	6	354772	354777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421855
6009	NC_017268	GAT	2	6	354779	354784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421855
6010	NC_017268	CGAA	2	8	354828	354835	50 %	0 %	25 %	25 %	384421855
6011	NC_017268	GGA	2	6	354865	354870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421855
6012	NC_017268	CTT	2	6	354923	354928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421855
6013	NC_017268	G	6	6	354947	354952	0 %	0 %	100 %	0 %	384421855
6014	NC_017268	ATA	3	9	354963	354971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421855
6015	NC_017268	TGC	2	6	354990	354995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421855
6016	NC_017268	CCG	2	6	355267	355272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421856
6017	NC_017268	TG	3	6	355287	355292	0 %	50 %	50 %	0 %	384421856
6018	NC_017268	A	6	6	355293	355298	100 %	0 %	0 %	0 %	384421856
6019	NC_017268	CTCTC	2	10	355299	355308	0 %	40 %	0 %	60 %	384421856
6020	NC_017268	AAT	2	6	355343	355348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421856
6021	NC_017268	AGG	2	6	355363	355368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421856
6022	NC_017268	AGC	2	6	355380	355385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421856
6023	NC_017268	GCA	2	6	355414	355419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421856
6024	NC_017268	ACGC	2	8	355484	355491	25 %	0 %	25 %	50 %	384421856
6025	NC_017268	TGC	2	6	355540	355545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421856
6026	NC_017268	CGC	2	6	355554	355559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421856
6027	NC_017268	AAT	2	6	355587	355592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421856
6028	NC_017268	CGCCA	2	10	355598	355607	20 %	0 %	20 %	60 %	384421856
6029	NC_017268	TTC	2	6	355737	355742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421856
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6032	NC_017268	CTT	2	6	355883	355888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421856
6033	NC_017268	AC	3	6	355900	355905	50 %	0 %	0 %	50 %	384421856
6034	NC_017268	GTG	2	6	355958	355963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421856
6035	NC_017268	GCA	2	6	356193	356198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421856
6036	NC_017268	TCG	2	6	356209	356214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421856
6037	NC_017268	GGC	2	6	356220	356225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421856
6038	NC_017268	C	6	6	356314	356319	0 %	0 %	0 %	100 %	384421856
6039	NC_017268	AATGA	2	10	356334	356343	60 %	20 %	20 %	0 %	384421856
6040	NC_017268	GCAT	2	8	356362	356369	25 %	25 %	25 %	25 %	384421856
6041	NC_017268	CTGC	2	8	356470	356477	0 %	25 %	25 %	50 %	384421856
6042	NC_017268	GC	3	6	356566	356571	0 %	0 %	50 %	50 %	384421856
6043	NC_017268	ACC	2	6	356590	356595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421856
6044	NC_017268	GTG	3	9	356596	356604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421856
6045	NC_017268	TC	3	6	356657	356662	0 %	50 %	0 %	50 %	384421856
6046	NC_017268	CTT	2	6	356929	356934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421857
6047	NC_017268	GCT	2	6	357016	357021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421857
6048	NC_017268	CG	3	6	357052	357057	0 %	0 %	50 %	50 %	384421857
6049	NC_017268	GC	3	6	357066	357071	0 %	0 %	50 %	50 %	384421857
6050	NC_017268	CTG	2	6	357122	357127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421857
6051	NC_017268	TGC	2	6	357225	357230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421857
6052	NC_017268	ACGAG	2	10	357287	357296	40 %	0 %	40 %	20 %	384421857
6053	NC_017268	TTC	2	6	357297	357302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421857
6054	NC_017268	GCA	2	6	357367	357372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421857
6055	NC_017268	A	6	6	357455	357460	100 %	0 %	0 %	0 %	384421857
6056	NC_017268	AC	3	6	357506	357511	50 %	0 %	0 %	50 %	384421857
6057	NC_017268	GCT	2	6	357615	357620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421858
6058	NC_017268	GAC	2	6	357624	357629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421858
6059	NC_017268	ACGAG	2	10	357668	357677	40 %	0 %	40 %	20 %	384421858
6060	NC_017268	ATG	2	6	357719	357724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421858
6061	NC_017268	TCGC	2	8	357803	357810	0 %	25 %	25 %	50 %	384421858
6062	NC_017268	CCT	2	6	357855	357860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421858
6063	NC_017268	TG	3	6	357907	357912	0 %	50 %	50 %	0 %	384421858
6064	NC_017268	TGGG	2	8	357920	357927	0 %	25 %	75 %	0 %	384421858
6065	NC_017268	GT	3	6	357935	357940	0 %	50 %	50 %	0 %	384421858
6066	NC_017268	CG	3	6	357945	357950	0 %	0 %	50 %	50 %	384421858
6067	NC_017268	CG	3	6	357955	357960	0 %	0 %	50 %	50 %	384421858
6068	NC_017268	C	6	6	358024	358029	0 %	0 %	0 %	100 %	384421858
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6072	NC_017268	AC	3	6	358146	358151	50 %	0 %	0 %	50 %	384421858
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6096	NC_017268	GGGAA	2	10	359146	359155	40 %	0 %	60 %	0 %	384421859
6097	NC_017268	GAAG	2	8	359178	359185	50 %	0 %	50 %	0 %	384421859
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6108	NC_017268	CCTC	2	8	359606	359613	0 %	25 %	0 %	75 %	384421860
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