MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017268	CG	3	6	323428	323433	0 %	0 %	50 %	50 %	384421838
5502	NC_017268	GC	3	6	323495	323500	0 %	0 %	50 %	50 %	384421838
5503	NC_017268	GTT	2	6	323561	323566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421838
5504	NC_017268	CG	5	10	323649	323658	0 %	0 %	50 %	50 %	384421838
5505	NC_017268	G	6	6	323673	323678	0 %	0 %	100 %	0 %	384421838
5506	NC_017268	CGGCAC	2	12	323690	323701	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384421838
5507	NC_017268	GC	3	6	323729	323734	0 %	0 %	50 %	50 %	384421838
5508	NC_017268	GGT	2	6	323791	323796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421838
5509	NC_017268	TGG	2	6	323889	323894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421838
5510	NC_017268	CGG	2	6	323895	323900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421838
5511	NC_017268	CG	3	6	323930	323935	0 %	0 %	50 %	50 %	384421839
5512	NC_017268	T	6	6	323942	323947	0 %	100 %	0 %	0 %	384421839
5513	NC_017268	CTC	2	6	323953	323958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421839
5514	NC_017268	TG	3	6	323987	323992	0 %	50 %	50 %	0 %	384421839
5515	NC_017268	GC	4	8	324011	324018	0 %	0 %	50 %	50 %	384421839
5516	NC_017268	GGGA	2	8	324063	324070	25 %	0 %	75 %	0 %	384421839
5517	NC_017268	AAG	2	6	324181	324186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421839
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5519	NC_017268	AGC	2	6	324248	324253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421839
5520	NC_017268	GCG	2	6	324375	324380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421839
5521	NC_017268	GC	3	6	324503	324508	0 %	0 %	50 %	50 %	384421839
5522	NC_017268	ATG	2	6	324509	324514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421839
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5528	NC_017268	TAC	2	6	324694	324699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421839
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5534	NC_017268	TGA	2	6	324907	324912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421840
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5540	NC_017268	GCT	3	9	325161	325169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421840
5541	NC_017268	TCTG	2	8	325271	325278	0 %	50 %	25 %	25 %	384421840
5542	NC_017268	GTC	2	6	325299	325304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421840
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5544	NC_017268	GAA	2	6	325462	325467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421840
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5546	NC_017268	CG	3	6	325525	325530	0 %	0 %	50 %	50 %	384421840
5547	NC_017268	TGCAGG	2	12	325549	325560	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384421840
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5552	NC_017268	GGTG	2	8	325793	325800	0 %	25 %	75 %	0 %	384421840
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5554	NC_017268	CTG	2	6	325894	325899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421841
5555	NC_017268	CG	3	6	325970	325975	0 %	0 %	50 %	50 %	384421841
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5558	NC_017268	GC	4	8	326077	326084	0 %	0 %	50 %	50 %	384421841
5559	NC_017268	TGCGC	2	10	326148	326157	0 %	20 %	40 %	40 %	384421841
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5564	NC_017268	TGCGT	2	10	326649	326658	0 %	40 %	40 %	20 %	384421841
5565	NC_017268	TGC	2	6	326688	326693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421841
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5571	NC_017268	GTG	2	6	328294	328299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421842
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5574	NC_017268	GC	3	6	328465	328470	0 %	0 %	50 %	50 %	384421842
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5582	NC_017268	CGG	2	6	328622	328627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421842
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5585	NC_017268	CG	3	6	328646	328651	0 %	0 %	50 %	50 %	384421842
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5589	NC_017268	G	6	6	328791	328796	0 %	0 %	100 %	0 %	384421842
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5591	NC_017268	TG	3	6	328867	328872	0 %	50 %	50 %	0 %	384421842
5592	NC_017268	GCG	2	6	328897	328902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421842
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5596	NC_017268	GT	3	6	329055	329060	0 %	50 %	50 %	0 %	384421842
5597	NC_017268	GC	3	6	329098	329103	0 %	0 %	50 %	50 %	384421842
5598	NC_017268	GCGG	2	8	329107	329114	0 %	0 %	75 %	25 %	384421842
5599	NC_017268	TG	4	8	329237	329244	0 %	50 %	50 %	0 %	384421843
5600	NC_017268	GTG	3	9	329242	329250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421843
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5605	NC_017268	ACACT	2	10	329587	329596	40 %	20 %	0 %	40 %	384421843
5606	NC_017268	GAA	2	6	329622	329627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421843
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5609	NC_017268	TC	3	6	329793	329798	0 %	50 %	0 %	50 %	384421843
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5995	NC_017268	AAT	2	6	354116	354121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421855
5996	NC_017268	TTC	2	6	354129	354134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421855
5997	NC_017268	ATCG	2	8	354209	354216	25 %	25 %	25 %	25 %	384421855
5998	NC_017268	TGG	2	6	354240	354245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421855
5999	NC_017268	TCC	2	6	354321	354326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421855
6000	NC_017268	TTC	2	6	354362	354367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421855

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