MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017268	CGT	2	6	300825	300830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421821
5003	NC_017268	GC	3	6	300925	300930	0 %	0 %	50 %	50 %	384421821
5004	NC_017268	GC	3	6	300937	300942	0 %	0 %	50 %	50 %	384421821
5005	NC_017268	GT	3	6	301013	301018	0 %	50 %	50 %	0 %	384421821
5006	NC_017268	T	6	6	301036	301041	0 %	100 %	0 %	0 %	384421821
5007	NC_017268	AAG	2	6	301046	301051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421821
5008	NC_017268	ATGA	2	8	301117	301124	50 %	25 %	25 %	0 %	384421821
5009	NC_017268	TG	3	6	301203	301208	0 %	50 %	50 %	0 %	384421821
5010	NC_017268	CGG	2	6	301225	301230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421821
5011	NC_017268	ATCT	2	8	301238	301245	25 %	50 %	0 %	25 %	384421821
5012	NC_017268	ATT	2	6	301288	301293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421821
5013	NC_017268	AGA	2	6	301323	301328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421821
5014	NC_017268	CAG	2	6	301363	301368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421821
5015	NC_017268	GGC	2	6	301385	301390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421821
5016	NC_017268	TGA	2	6	301452	301457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421821
5017	NC_017268	CA	3	6	301494	301499	50 %	0 %	0 %	50 %	384421822
5018	NC_017268	GGT	2	6	301501	301506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421822
5019	NC_017268	GGT	2	6	301508	301513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421822
5020	NC_017268	T	6	6	301537	301542	0 %	100 %	0 %	0 %	384421822
5021	NC_017268	AGT	2	6	301549	301554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421822
5022	NC_017268	T	6	6	301589	301594	0 %	100 %	0 %	0 %	384421822
5023	NC_017268	GCA	2	6	301646	301651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421822
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5025	NC_017268	TTC	2	6	301879	301884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421822
5026	NC_017268	GTACT	2	10	301890	301899	20 %	40 %	20 %	20 %	384421822
5027	NC_017268	CTT	2	6	301936	301941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421822
5028	NC_017268	TTG	2	6	301998	302003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421822
5029	NC_017268	G	6	6	302106	302111	0 %	0 %	100 %	0 %	384421822
5030	NC_017268	T	7	7	302264	302270	0 %	100 %	0 %	0 %	384421822
5031	NC_017268	T	6	6	302273	302278	0 %	100 %	0 %	0 %	384421822
5032	NC_017268	A	7	7	302363	302369	100 %	0 %	0 %	0 %	384421822
5033	NC_017268	CG	3	6	302374	302379	0 %	0 %	50 %	50 %	384421822
5034	NC_017268	AGTG	2	8	302387	302394	25 %	25 %	50 %	0 %	384421822
5035	NC_017268	TGA	2	6	302568	302573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421823
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5037	NC_017268	GC	5	10	302602	302611	0 %	0 %	50 %	50 %	384421823
5038	NC_017268	AGA	2	6	302640	302645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421823
5039	NC_017268	CGT	2	6	302706	302711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421823
5040	NC_017268	T	6	6	302733	302738	0 %	100 %	0 %	0 %	384421823
5041	NC_017268	AGC	2	6	302748	302753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421823
5042	NC_017268	TGC	2	6	302754	302759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421823
5043	NC_017268	ATT	2	6	302795	302800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421823
5044	NC_017268	GC	3	6	302848	302853	0 %	0 %	50 %	50 %	384421823
5045	NC_017268	CGC	2	6	302923	302928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421823
5046	NC_017268	GT	4	8	302941	302948	0 %	50 %	50 %	0 %	384421823
5047	NC_017268	CTGCCG	2	12	302957	302968	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384421823
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5049	NC_017268	ATG	2	6	303034	303039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421823
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5051	NC_017268	ATGCGT	2	12	303095	303106	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384421823
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5053	NC_017268	GGT	3	9	303117	303125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421823
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5055	NC_017268	TGCT	2	8	303377	303384	0 %	50 %	25 %	25 %	384421823
5056	NC_017268	G	6	6	303393	303398	0 %	0 %	100 %	0 %	384421823
5057	NC_017268	T	6	6	303559	303564	0 %	100 %	0 %	0 %	384421823
5058	NC_017268	CAC	2	6	303579	303584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421823
5059	NC_017268	TGG	2	6	303590	303595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421823
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5062	NC_017268	CG	4	8	303622	303629	0 %	0 %	50 %	50 %	384421823
5063	NC_017268	ACGG	3	12	303699	303710	25 %	0 %	50 %	25 %	384421823
5064	NC_017268	CTT	2	6	303728	303733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421823
5065	NC_017268	GCTGCA	2	12	303805	303816	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384421823
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5067	NC_017268	T	6	6	303855	303860	0 %	100 %	0 %	0 %	384421823
5068	NC_017268	CTG	2	6	303896	303901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421823
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5074	NC_017268	CTG	2	6	304029	304034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421823
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5081	NC_017268	GGA	2	6	304254	304259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421823
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5083	NC_017268	AC	3	6	304436	304441	50 %	0 %	0 %	50 %	384421823
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5088	NC_017268	A	6	6	304770	304775	100 %	0 %	0 %	0 %	384421823
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5091	NC_017268	TGG	2	6	304866	304871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421823
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5093	NC_017268	AGGTT	2	10	305048	305057	20 %	40 %	40 %	0 %	384421824
5094	NC_017268	GGT	2	6	305058	305063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421824
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5096	NC_017268	GAA	2	6	305145	305150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421824
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5099	NC_017268	GTT	2	6	305230	305235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421824
5100	NC_017268	TGC	2	6	305298	305303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421824
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5103	NC_017268	GC	3	6	305450	305455	0 %	0 %	50 %	50 %	384421824
5104	NC_017268	CAG	2	6	305552	305557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421824
5105	NC_017268	TGAT	2	8	305612	305619	25 %	50 %	25 %	0 %	384421824
5106	NC_017268	AT	3	6	305657	305662	50 %	50 %	0 %	0 %	384421824
5107	NC_017268	TAC	2	6	305671	305676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421824
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5109	NC_017268	A	7	7	305784	305790	100 %	0 %	0 %	0 %	384421824
5110	NC_017268	ATG	3	9	305816	305824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421824
5111	NC_017268	GGT	2	6	305856	305861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421824
5112	NC_017268	TG	3	6	305942	305947	0 %	50 %	50 %	0 %	384421825
5113	NC_017268	G	6	6	305991	305996	0 %	0 %	100 %	0 %	384421825
5114	NC_017268	A	6	6	306040	306045	100 %	0 %	0 %	0 %	384421825
5115	NC_017268	TAT	2	6	306139	306144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421825
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5118	NC_017268	A	7	7	306286	306292	100 %	0 %	0 %	0 %	384421825
5119	NC_017268	GA	3	6	306372	306377	50 %	0 %	50 %	0 %	384421825
5120	NC_017268	GTG	2	6	306448	306453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421825
5121	NC_017268	CG	3	6	306470	306475	0 %	0 %	50 %	50 %	384421825
5122	NC_017268	AG	3	6	306490	306495	50 %	0 %	50 %	0 %	384421825
5123	NC_017268	GC	3	6	306547	306552	0 %	0 %	50 %	50 %	384421825
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5485	NC_017268	T	6	6	322878	322883	0 %	100 %	0 %	0 %	384421838
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5488	NC_017268	TG	3	6	322980	322985	0 %	50 %	50 %	0 %	384421838
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5492	NC_017268	G	7	7	323074	323080	0 %	0 %	100 %	0 %	384421838
5493	NC_017268	GGT	2	6	323096	323101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421838
5494	NC_017268	GCA	2	6	323111	323116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421838
5495	NC_017268	GC	3	6	323149	323154	0 %	0 %	50 %	50 %	384421838
5496	NC_017268	CGG	2	6	323180	323185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421838
5497	NC_017268	TGG	2	6	323202	323207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421838
5498	NC_017268	TGAGCG	2	12	323238	323249	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384421838
5499	NC_017268	CGG	3	9	323259	323267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421838
5500	NC_017268	GAT	2	6	323407	323412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421838

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