MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017268	CATGCG	2	12	265967	265978	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384421789
4502	NC_017268	G	6	6	265994	265999	0 %	0 %	100 %	0 %	384421789
4503	NC_017268	T	7	7	266014	266020	0 %	100 %	0 %	0 %	384421789
4504	NC_017268	ATTG	2	8	266040	266047	25 %	50 %	25 %	0 %	384421789
4505	NC_017268	TGG	2	6	266049	266054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421789
4506	NC_017268	AGG	2	6	266077	266082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421789
4507	NC_017268	GT	3	6	266247	266252	0 %	50 %	50 %	0 %	384421790
4508	NC_017268	CG	3	6	266264	266269	0 %	0 %	50 %	50 %	384421790
4509	NC_017268	TTG	2	6	266284	266289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421790
4510	NC_017268	GGT	2	6	266315	266320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421790
4511	NC_017268	GGGAA	2	10	266428	266437	40 %	0 %	60 %	0 %	384421790
4512	NC_017268	CGT	2	6	266493	266498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421790
4513	NC_017268	CGT	2	6	266758	266763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421791
4514	NC_017268	CGG	2	6	266857	266862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421791
4515	NC_017268	GAA	2	6	266866	266871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421791
4516	NC_017268	GTG	2	6	266903	266908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421791
4517	NC_017268	AGA	2	6	266977	266982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421791
4518	NC_017268	CCG	2	6	267003	267008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421791
4519	NC_017268	TGAT	2	8	267033	267040	25 %	50 %	25 %	0 %	384421791
4520	NC_017268	ATGC	2	8	267059	267066	25 %	25 %	25 %	25 %	384421791
4521	NC_017268	TC	3	6	267096	267101	0 %	50 %	0 %	50 %	384421791
4522	NC_017268	AAG	2	6	267102	267107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421791
4523	NC_017268	ATC	2	6	267134	267139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421791
4524	NC_017268	TGG	2	6	267169	267174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421791
4525	NC_017268	T	6	6	267223	267228	0 %	100 %	0 %	0 %	384421791
4526	NC_017268	TC	3	6	267276	267281	0 %	50 %	0 %	50 %	384421791
4527	NC_017268	AGG	2	6	267348	267353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421791
4528	NC_017268	GAA	2	6	267398	267403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421791
4529	NC_017268	GCC	2	6	267559	267564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421791
4530	NC_017268	ATC	2	6	267618	267623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421791
4531	NC_017268	TGC	2	6	267642	267647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421791
4532	NC_017268	TCT	2	6	267710	267715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421791
4533	NC_017268	GC	3	6	267769	267774	0 %	0 %	50 %	50 %	384421791
4534	NC_017268	GTG	2	6	267803	267808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421791
4535	NC_017268	G	6	6	267883	267888	0 %	0 %	100 %	0 %	384421791
4536	NC_017268	CTT	2	6	267922	267927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421791
4537	NC_017268	GGA	2	6	267946	267951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421791
4538	NC_017268	AGG	2	6	267952	267957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421791
4539	NC_017268	GGAT	2	8	268002	268009	25 %	25 %	50 %	0 %	384421791
4540	NC_017268	GAG	2	6	268022	268027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421791
4541	NC_017268	TCG	2	6	268063	268068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421791
4542	NC_017268	GGA	2	6	268144	268149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421791
4543	NC_017268	AATC	2	8	268183	268190	50 %	25 %	0 %	25 %	384421791
4544	NC_017268	AAC	2	6	268247	268252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421791
4545	NC_017268	TCC	2	6	268289	268294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421791
4546	NC_017268	GAG	2	6	268443	268448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421792
4547	NC_017268	GGT	2	6	268454	268459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421792
4548	NC_017268	GT	3	6	268458	268463	0 %	50 %	50 %	0 %	384421792
4549	NC_017268	T	6	6	268539	268544	0 %	100 %	0 %	0 %	384421792
4550	NC_017268	CAG	2	6	268570	268575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421792
4551	NC_017268	CTTT	2	8	268713	268720	0 %	75 %	0 %	25 %	384421793
4552	NC_017268	GTT	2	6	268745	268750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421793
4553	NC_017268	CTG	2	6	268761	268766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421793
4554	NC_017268	GTG	2	6	268781	268786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421793
4555	NC_017268	TGC	2	6	268800	268805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421793
4556	NC_017268	TTTTC	2	10	268807	268816	0 %	80 %	0 %	20 %	384421793
4557	NC_017268	TTA	2	6	268843	268848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421793
4558	NC_017268	CG	3	6	268849	268854	0 %	0 %	50 %	50 %	384421793
4559	NC_017268	TTTTTC	2	12	268962	268973	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384421793
4560	NC_017268	ATG	2	6	269000	269005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421793
4561	NC_017268	T	6	6	269097	269102	0 %	100 %	0 %	0 %	384421793
4562	NC_017268	CTT	2	6	269105	269110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421793
4563	NC_017268	TGGC	2	8	269136	269143	0 %	25 %	50 %	25 %	384421793
4564	NC_017268	TGCG	2	8	269163	269170	0 %	25 %	50 %	25 %	384421793
4565	NC_017268	GCC	2	6	269175	269180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421793
4566	NC_017268	GTG	2	6	269189	269194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421793
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4568	NC_017268	T	8	8	269218	269225	0 %	100 %	0 %	0 %	384421793
4569	NC_017268	T	6	6	269239	269244	0 %	100 %	0 %	0 %	384421793
4570	NC_017268	GT	3	6	269261	269266	0 %	50 %	50 %	0 %	384421793
4571	NC_017268	TG	3	6	269426	269431	0 %	50 %	50 %	0 %	384421794
4572	NC_017268	G	9	9	269439	269447	0 %	0 %	100 %	0 %	384421794
4573	NC_017268	GCA	2	6	269578	269583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421794
4574	NC_017268	ATA	2	6	269640	269645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421794
4575	NC_017268	TGAC	2	8	269646	269653	25 %	25 %	25 %	25 %	384421794
4576	NC_017268	AGA	2	6	269719	269724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421794
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4578	NC_017268	CG	3	6	269760	269765	0 %	0 %	50 %	50 %	384421794
4579	NC_017268	TCA	3	9	269923	269931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421794
4580	NC_017268	GGAA	2	8	269932	269939	50 %	0 %	50 %	0 %	384421794
4581	NC_017268	A	6	6	269972	269977	100 %	0 %	0 %	0 %	384421794
4582	NC_017268	TACAAT	2	12	270158	270169	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384421794
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4584	NC_017268	GGA	2	6	270234	270239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421794
4585	NC_017268	GAAT	2	8	270250	270257	50 %	25 %	25 %	0 %	384421794
4586	NC_017268	GAAA	2	8	270343	270350	75 %	0 %	25 %	0 %	384421794
4587	NC_017268	CG	3	6	270364	270369	0 %	0 %	50 %	50 %	384421794
4588	NC_017268	GTG	2	6	270419	270424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421794
4589	NC_017268	CCCG	2	8	270467	270474	0 %	0 %	25 %	75 %	384421794
4590	NC_017268	GCAC	2	8	270578	270585	25 %	0 %	25 %	50 %	384421795
4591	NC_017268	CG	3	6	270606	270611	0 %	0 %	50 %	50 %	384421795
4592	NC_017268	CG	4	8	270639	270646	0 %	0 %	50 %	50 %	384421795
4593	NC_017268	GC	3	6	270716	270721	0 %	0 %	50 %	50 %	384421795
4594	NC_017268	CGC	2	6	270733	270738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421795
4595	NC_017268	CGG	2	6	270777	270782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421795
4596	NC_017268	TTCTC	2	10	270800	270809	0 %	60 %	0 %	40 %	384421795
4597	NC_017268	CAT	2	6	270898	270903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421795
4598	NC_017268	T	7	7	270930	270936	0 %	100 %	0 %	0 %	384421795
4599	NC_017268	GC	3	6	270989	270994	0 %	0 %	50 %	50 %	384421795
4600	NC_017268	GT	3	6	271042	271047	0 %	50 %	50 %	0 %	384421795
4601	NC_017268	CGC	2	6	271104	271109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421795
4602	NC_017268	GTG	2	6	271124	271129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421795
4603	NC_017268	AGA	2	6	271130	271135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421795
4604	NC_017268	CGG	2	6	271143	271148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421795
4605	NC_017268	GT	3	6	271286	271291	0 %	50 %	50 %	0 %	384421796
4606	NC_017268	TG	3	6	271361	271366	0 %	50 %	50 %	0 %	384421796
4607	NC_017268	GGA	3	9	271407	271415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421796
4608	NC_017268	GAT	2	6	271419	271424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421796
4609	NC_017268	CGG	2	6	271499	271504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421797
4610	NC_017268	GCC	2	6	271524	271529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421797
4611	NC_017268	GGA	2	6	271533	271538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421797
4612	NC_017268	GAA	2	6	271543	271548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421797
4613	NC_017268	GAG	2	6	271570	271575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421797
4614	NC_017268	ATT	2	6	271705	271710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421797
4615	NC_017268	TATC	2	8	271851	271858	25 %	50 %	0 %	25 %	384421797
4616	NC_017268	AGCT	2	8	271877	271884	25 %	25 %	25 %	25 %	384421797
4617	NC_017268	A	6	6	271907	271912	100 %	0 %	0 %	0 %	384421797
4618	NC_017268	CTT	2	6	272074	272079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421798
4619	NC_017268	GGTG	2	8	272164	272171	0 %	25 %	75 %	0 %	384421798
4620	NC_017268	C	6	6	272195	272200	0 %	0 %	0 %	100 %	384421798
4621	NC_017268	GC	3	6	272236	272241	0 %	0 %	50 %	50 %	384421798
4622	NC_017268	CCCTGC	2	12	272327	272338	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384421798
4623	NC_017268	GC	5	10	272359	272368	0 %	0 %	50 %	50 %	384421798
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4978	NC_017268	TTGAT	2	10	299364	299373	20 %	60 %	20 %	0 %	384421819
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4980	NC_017268	TACG	2	8	299434	299441	25 %	25 %	25 %	25 %	384421819
4981	NC_017268	T	7	7	299556	299562	0 %	100 %	0 %	0 %	384421819
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4988	NC_017268	CGTGC	2	10	299925	299934	0 %	20 %	40 %	40 %	384421821
4989	NC_017268	GCG	2	6	299973	299978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421821
4990	NC_017268	GCT	2	6	300004	300009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421821
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4992	NC_017268	GCG	2	6	300052	300057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421821
4993	NC_017268	CTT	2	6	300150	300155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421821
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4996	NC_017268	GCA	2	6	300276	300281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421821
4997	NC_017268	TGC	2	6	300336	300341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421821
4998	NC_017268	GTT	2	6	300343	300348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421821
4999	NC_017268	TGC	2	6	300540	300545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421821
5000	NC_017268	TTC	2	6	300657	300662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421821

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