MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 338

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016844	AACAAA	2	12	3231	3242	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	378974637
2	NC_016844	TTTGAC	2	12	5642	5653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378974639
3	NC_016844	GCAGGC	2	12	5659	5670	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378974639
4	NC_016844	GTGTAT	2	12	6685	6696	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378974639
5	NC_016844	TTAAAT	2	12	7965	7976	50 %	50 %	0 %	0 %	378974641
6	NC_016844	TTGAGA	2	12	27320	27331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974650
7	NC_016844	GAACAG	2	12	31304	31315	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378974653
8	NC_016844	GTCTGG	2	12	31539	31550	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378974653
9	NC_016844	TTTCCG	2	12	34169	34180	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378974655
10	NC_016844	TTGACG	2	12	38832	38843	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378974658
11	NC_016844	TGCATG	2	12	42334	42345	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378974662
12	NC_016844	CGTGCG	2	12	49793	49804	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378974669
13	NC_016844	GTCTGG	2	12	50263	50274	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378974669
14	NC_016844	TGTAAC	2	12	62401	62412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378974681
15	NC_016844	AGGGGC	2	12	65736	65747	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378974685
16	NC_016844	GCCATT	2	12	66856	66867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378974686
17	NC_016844	TCTTGC	2	12	67085	67096	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378974686
18	NC_016844	TGAGCA	2	12	80020	80031	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378974703
19	NC_016844	CACTTT	2	12	84080	84091	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378974707
20	NC_016844	GGAGTA	2	12	85482	85493	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378974708
21	NC_016844	CGTGAA	2	12	85701	85712	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378974708
22	NC_016844	ATTTGT	2	12	86822	86833	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378974709
23	NC_016844	ACGCTT	2	12	87010	87021	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378974709
24	NC_016844	CGCTTG	2	12	92929	92940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974715
25	NC_016844	AGGGGA	2	12	97322	97333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974720
26	NC_016844	CGCACG	2	12	104086	104097	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378974727
27	NC_016844	GTCGGT	2	12	107688	107699	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378974731
28	NC_016844	ATCTGC	2	12	117194	117205	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378974737
29	NC_016844	TTTTAA	2	12	127471	127482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974743
30	NC_016844	TTGTCG	2	12	131511	131522	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378974746
31	NC_016844	TCTTGA	2	12	133366	133377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378974748
32	NC_016844	GCAGAC	2	12	134717	134728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974748
33	NC_016844	CCGGAG	2	12	136213	136224	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378974749
34	NC_016844	CAGCTG	2	12	136437	136448	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378974749
35	NC_016844	CCGTGC	2	12	147407	147418	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378974758
36	NC_016844	CGGCTG	2	12	148597	148608	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378974760
37	NC_016844	CGGCTC	2	12	151235	151246	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378974766
38	NC_016844	CCGGAG	2	12	153614	153625	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378974770
39	NC_016844	CAGCTG	2	12	153838	153849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378974770
40	NC_016844	GCAAGC	2	12	155961	155972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974772
41	NC_016844	GTGTGC	2	12	174247	174258	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378974789
42	NC_016844	ACTGTT	2	12	178403	178414	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378974794
43	NC_016844	TGCGTA	2	12	179428	179439	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378974794
44	NC_016844	TTGGGT	2	12	187983	187994	0 %	50 %	50 %	0 %	378974804
45	NC_016844	GGAAGA	2	12	193189	193200	50 %	0 %	50 %	0 %	378974810
46	NC_016844	GACACT	2	12	193350	193361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378974810
47	NC_016844	GGTGAG	2	12	193513	193524	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378974810
48	NC_016844	GAGAAA	2	12	197706	197717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974813
49	NC_016844	CGGTGA	2	12	206268	206279	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378974823
50	NC_016844	AAAAGG	2	12	206533	206544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974823
51	NC_016844	TAAGGG	2	12	213320	213331	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378974838
52	NC_016844	TTTGGT	2	12	213928	213939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974840
53	NC_016844	GTGTTT	2	12	222878	222889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974852
54	NC_016844	TGCGCT	2	12	223626	223637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974854
55	NC_016844	TCTTGT	2	12	225452	225463	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378974855
56	NC_016844	GTGTTT	2	12	225481	225492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974855
57	NC_016844	TATGCT	2	12	229483	229494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378974859
58	NC_016844	AGGAGA	2	12	236876	236887	50 %	0 %	50 %	0 %	378974861
59	NC_016844	GCAGAC	2	12	238961	238972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974865
60	NC_016844	GCGGGT	2	12	241602	241613	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378974867
61	NC_016844	GGAAAC	2	12	248153	248164	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378974877
62	NC_016844	TTTCTG	2	12	248689	248700	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378974877
63	NC_016844	GGAATG	2	12	250511	250522	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378974878
64	NC_016844	ACCTTG	2	12	250885	250896	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378974878
65	NC_016844	GTTTGT	2	12	259163	259174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974882
66	NC_016844	AACGCA	2	12	263032	263043	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378974885
67	NC_016844	CATGCG	2	12	265955	265966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378974888
68	NC_016844	TTTTTC	2	12	268950	268961	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378974892
69	NC_016844	TACAAT	2	12	270146	270157	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378974893
70	NC_016844	CCCTGC	2	12	272315	272326	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378974897
71	NC_016844	TCATTT	2	12	286721	286732	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378974906
72	NC_016844	GGGTGA	2	12	294701	294712	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378974915
73	NC_016844	CTGCCG	2	12	302946	302957	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378974921
74	NC_016844	ATGCGT	2	12	303084	303095	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378974921
75	NC_016844	GCTGCA	2	12	303794	303805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378974921
76	NC_016844	TGATGT	2	12	305016	305027	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378974922
77	NC_016844	GCAGTT	2	12	305197	305208	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378974922
78	NC_016844	TGCGCT	2	12	306851	306862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974924
79	NC_016844	GGCTGC	2	12	310966	310977	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378974928
80	NC_016844	CTCCGT	2	12	315100	315111	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378974931
81	NC_016844	GAAATC	2	12	317482	317493	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378974934
82	NC_016844	GTATGG	2	12	317724	317735	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378974934
83	NC_016844	GTGAAA	2	12	318287	318298	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378974934
84	NC_016844	ACGGTC	2	12	321206	321217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378974935
85	NC_016844	TGAGCG	2	12	323227	323238	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378974936
86	NC_016844	CGGCAC	2	12	323679	323690	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378974936
87	NC_016844	TGCAGG	2	12	325538	325549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378974938
88	NC_016844	GCACCG	2	12	331680	331691	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378974945
89	NC_016844	TGGCAT	2	12	337573	337584	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378974950
90	NC_016844	GCTGTG	2	12	341098	341109	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378974953
91	NC_016844	GTGCTC	2	12	341149	341160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974953
92	NC_016844	TGTTCG	2	12	341319	341330	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378974953
93	NC_016844	TTCATG	2	12	341435	341446	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378974953
94	NC_016844	ACCGTC	2	12	341471	341482	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378974953
95	NC_016844	TTTGGA	2	12	345132	345143	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378974953
96	NC_016844	GAGCGC	2	12	346593	346604	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378974954
97	NC_016844	CTTTGA	2	12	347036	347047	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378974954
98	NC_016844	GTGTTG	2	12	372077	372088	0 %	50 %	50 %	0 %	378974974
99	NC_016844	CAGGAG	2	12	374458	374469	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378974978
100	NC_016844	TGGGAG	2	12	374630	374641	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378974978
101	NC_016844	CTTTTG	2	12	377734	377745	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378974982
102	NC_016844	CGTGGT	2	12	380938	380949	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378974989
103	NC_016844	TCGCGT	2	12	390876	390887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975003
104	NC_016844	CTGAGC	2	12	394500	394511	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975005
105	NC_016844	GTCATC	2	12	395661	395672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975006
106	NC_016844	GTGCGC	2	12	396243	396254	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378975007
107	NC_016844	TGCGAA	2	12	397292	397303	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378975008
108	NC_016844	CCGCGT	2	12	398116	398127	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975009
109	NC_016844	TGCAGA	2	12	399495	399506	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378975010
110	NC_016844	GCAGGA	2	12	399699	399710	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378975010
111	NC_016844	CAGGGG	2	12	403658	403669	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378975015
112	NC_016844	GTACTG	2	12	406976	406987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975016
113	NC_016844	GGGGCG	2	12	410001	410012	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	378975019
114	NC_016844	TGTAGG	2	12	414765	414776	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378975024
115	NC_016844	AAGGGG	2	12	414964	414975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975024
116	NC_016844	ATTAAA	2	12	415444	415455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975024
117	NC_016844	GGGAGA	2	12	416667	416678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975025
118	NC_016844	TATTGA	2	12	419989	420000	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378975029
119	NC_016844	GAAGAT	2	12	426897	426908	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378975035
120	NC_016844	ACGCGC	2	12	429925	429936	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975038
121	NC_016844	TGCTCG	2	12	431793	431804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975041
122	NC_016844	TTTTTG	2	12	436389	436400	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	378975044
123	NC_016844	TGACCG	2	12	437325	437336	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975046
124	NC_016844	ACGCTT	2	12	438055	438066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975046
125	NC_016844	TCCGAC	2	12	441651	441662	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378975050
126	NC_016844	GCGATT	2	12	442347	442358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975051
127	NC_016844	GGCCCT	2	12	445744	445755	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975054
128	NC_016844	GTTGCC	2	12	448872	448883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975056
129	NC_016844	GCGTGT	2	12	451427	451438	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378975058
130	NC_016844	TGTGCA	2	12	458004	458015	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975065
131	NC_016844	CGTGCG	2	12	470412	470423	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378975078
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133	NC_016844	ACGTGT	2	12	472798	472809	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975080
134	NC_016844	CGCGTA	2	12	477567	477578	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975085
135	NC_016844	ACAGGA	2	12	478138	478149	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378975086
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137	NC_016844	GTGCGC	2	12	488193	488204	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378975094
138	NC_016844	ACGTGC	2	12	488862	488873	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975094
139	NC_016844	GGCAGC	2	12	489352	489363	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378975094
140	NC_016844	GGTGCG	2	12	489835	489846	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378975094
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142	NC_016844	GTGTGC	2	12	494918	494929	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378975102
143	NC_016844	TTTGAG	2	12	517295	517306	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378975118
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145	NC_016844	GCACCG	2	12	522089	522100	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975121
146	NC_016844	TGGAGA	2	12	525979	525990	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378975123
147	NC_016844	CGATGG	2	12	530055	530066	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378975127
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153	NC_016844	CGTGTA	2	12	542302	542313	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975138
154	NC_016844	AGCAGG	2	12	544146	544157	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378975140
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185	NC_016844	TCAGAT	2	12	652671	652682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975231
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214	NC_016844	GTGTGG	2	12	727869	727880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975295
215	NC_016844	CCGGGC	2	12	728961	728972	0 %	0 %	50 %	50 %	378975297
216	NC_016844	CAGCAA	2	12	732234	732245	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378975300
217	NC_016844	CAGCAT	2	12	732246	732257	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975300
218	NC_016844	AAGCGC	2	12	735935	735946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975301
219	NC_016844	TGCATA	2	12	736902	736913	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975302
220	NC_016844	GCCAAT	2	12	737429	737440	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975303
221	NC_016844	ACCGTA	2	12	738562	738573	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975304
222	NC_016844	AACCGC	2	12	740367	740378	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378975305
223	NC_016844	ATACAT	2	12	755277	755288	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378975320
224	NC_016844	TCTTGC	2	12	756581	756592	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378975320
225	NC_016844	ATCTAG	2	12	760372	760383	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975324
226	NC_016844	CCACAC	2	12	763440	763451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975326
227	NC_016844	GCCCCT	2	12	763778	763789	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378975327
228	NC_016844	TTTCCG	2	12	764632	764643	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378975328
229	NC_016844	GACACC	2	12	768596	768607	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378975332
230	NC_016844	GGCACA	2	12	772871	772882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975336
231	NC_016844	TTAAAG	2	12	778567	778578	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378975342
232	NC_016844	ATTCCC	2	12	781219	781230	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378975345
233	NC_016844	AGTCCA	2	12	785339	785350	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975347
234	NC_016844	CCTGCG	2	12	789730	789741	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975353
235	NC_016844	ACGTGC	2	12	791188	791199	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975354
236	NC_016844	CTGCGC	2	12	796483	796494	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975361
237	NC_016844	GGGCAG	2	12	796869	796880	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378975361
238	NC_016844	TGTGAC	2	12	799653	799664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975364
239	NC_016844	AACGGC	2	12	800577	800588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975365
240	NC_016844	CGGGGG	2	12	800597	800608	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	378975365
241	NC_016844	TTTCCA	2	12	801184	801195	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378975366
242	NC_016844	GCATAC	2	12	803170	803181	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975367
243	NC_016844	TTGGAA	2	12	804624	804635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975370
244	NC_016844	TAACGT	2	12	807525	807536	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975373
245	NC_016844	GCACTT	2	12	808553	808564	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975374
246	NC_016844	GAGCAA	2	12	810026	810037	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378975376
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248	NC_016844	CATCTT	2	12	816059	816070	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378975382
249	NC_016844	AGAGCG	2	12	819534	819545	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378975386
250	NC_016844	AACTCA	2	12	826107	826118	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378975393
251	NC_016844	GCACAC	2	12	828104	828115	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378975395
252	NC_016844	CCAGTC	2	12	833974	833985	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378975401
253	NC_016844	GCAAGC	2	12	850252	850263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975416
254	NC_016844	ACCCCT	2	12	851585	851596	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	378975418
255	NC_016844	GCATCT	2	12	864187	864198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975433
256	NC_016844	GGTATC	2	12	874076	874087	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975441
257	NC_016844	CACGCG	2	12	877573	877584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975443
258	NC_016844	TGCTCC	2	12	883948	883959	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975449
259	NC_016844	AAAACT	2	12	885544	885555	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378975450
260	NC_016844	CAAACA	2	12	886028	886039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975453
261	NC_016844	CACCTT	2	12	892903	892914	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378975461
262	NC_016844	CAGGTG	2	12	897107	897118	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378975466
263	NC_016844	AAAGAC	2	12	899815	899826	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378975470
264	NC_016844	TATCAG	2	12	902250	902261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975472
265	NC_016844	CTGCGC	2	12	905893	905904	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975474
266	NC_016844	GCGATA	2	12	911429	911440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378975477
267	NC_016844	TTTTCA	2	12	924577	924588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378975492
268	NC_016844	CTTCTG	3	18	925905	925922	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378975493
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270	NC_016844	ACAGGC	2	12	930779	930790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975494
271	NC_016844	GAGTGG	2	12	937418	937429	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378975497
272	NC_016844	CTTGCG	2	12	938617	938628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975499
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275	NC_016844	GCTCCT	2	12	941977	941988	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975502
276	NC_016844	GCGCTC	2	12	943099	943110	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975503
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279	NC_016844	AAGCTC	2	12	948401	948412	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975506
280	NC_016844	CTGCGC	2	12	951971	951982	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975513
281	NC_016844	CAACAT	2	12	956962	956973	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378975519
282	NC_016844	CAAAAA	2	12	962297	962308	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	378975524
283	NC_016844	TTCTCC	2	12	967411	967422	0 %	50 %	0 %	50 %	378975528
284	NC_016844	ACTCGA	2	12	967429	967440	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975529
285	NC_016844	AGATCA	2	12	968817	968828	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378975530
286	NC_016844	CTGATA	2	12	971579	971590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975532
287	NC_016844	CCGGAG	2	12	978323	978334	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378975539
288	NC_016844	GCAGGA	2	12	978670	978681	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378975539
289	NC_016844	CAGCTC	2	12	979005	979016	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378975539
290	NC_016844	CCGGCT	2	12	981218	981229	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975539
291	NC_016844	ACCTGC	2	12	981396	981407	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378975539
292	NC_016844	TCTTCA	2	12	982791	982802	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378975540
293	NC_016844	TCTGCG	2	12	989200	989211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975546
294	NC_016844	GGACGT	2	12	989783	989794	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378975547
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296	NC_016844	CCACGG	2	12	993297	993308	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975553
297	NC_016844	CTTGCA	2	12	999832	999843	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975562
298	NC_016844	CAGCGC	2	12	1000537	1000548	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975562
299	NC_016844	GCTAAC	2	12	1004106	1004117	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975565
300	NC_016844	TACCGT	2	12	1004223	1004234	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975565
301	NC_016844	TGGCGG	2	12	1010616	1010627	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378975572
302	NC_016844	ACGCTG	2	12	1010940	1010951	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975572
303	NC_016844	ACTGAC	2	12	1017848	1017859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975577
304	NC_016844	GCGCGT	2	12	1020495	1020506	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378975579
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306	NC_016844	TGCCTC	2	12	1037920	1037931	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975598
307	NC_016844	CGGTTA	2	12	1045537	1045548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975606
308	NC_016844	CTCGCC	2	12	1046297	1046308	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378975606
309	NC_016844	CATGTT	2	12	1051161	1051172	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378975611
310	NC_016844	TTCGCC	2	12	1051233	1051244	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975611
311	NC_016844	CCCGCT	2	12	1051927	1051938	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378975611
312	NC_016844	TCTTGC	2	12	1053023	1053034	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378975612
313	NC_016844	GCCACC	2	12	1060490	1060501	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	378975619
314	NC_016844	GGAGCC	2	12	1065331	1065342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378975624
315	NC_016844	GGTGCG	2	12	1067547	1067558	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378975627
316	NC_016844	AGAGGA	2	12	1068334	1068345	50 %	0 %	50 %	0 %	378975628
317	NC_016844	GAGGTG	2	12	1070981	1070992	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378975631
318	NC_016844	TCTTTT	2	12	1073062	1073073	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378975632
319	NC_016844	ACGCAG	2	12	1076322	1076333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975637
320	NC_016844	TATGAG	2	12	1081456	1081467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975643
321	NC_016844	TGACGA	2	12	1090175	1090186	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378975646
322	NC_016844	ATCTGC	2	12	1096321	1096332	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975652
323	NC_016844	AACTCC	2	12	1098523	1098534	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378975653
324	NC_016844	AAAGCG	2	12	1099284	1099295	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378975654
325	NC_016844	ACTGCA	2	12	1101329	1101340	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975655
326	NC_016844	TAATTC	2	12	1104666	1104677	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378975658
327	NC_016844	CATGCA	2	12	1105781	1105792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975659
328	NC_016844	TTGCCA	2	12	1112907	1112918	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975666
329	NC_016844	GCCCTC	2	12	1114586	1114597	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378975668
330	NC_016844	CTGTGC	2	12	1115510	1115521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975669
331	NC_016844	CGCCTT	2	12	1117004	1117015	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975670
332	NC_016844	TCTGCA	2	12	1118593	1118604	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975671
333	NC_016844	ATGCGT	2	12	1120409	1120420	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975675
334	NC_016844	GCTGAC	2	12	1126840	1126851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975679
335	NC_016844	TGCACG	2	12	1127238	1127249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975679
336	NC_016844	AATTTC	2	12	1128093	1128104	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378975680
337	NC_016844	AGCCCC	2	12	1128966	1128977	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	378975681
338	NC_016844	TCCTCG	2	12	1129981	1129992	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975682

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.