MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_016844	GC	3	6	134710	134715	0 %	0 %	50 %	50 %	378974748
2503	NC_016844	GCAGAC	2	12	134717	134728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974748
2504	NC_016844	CA	3	6	134734	134739	50 %	0 %	0 %	50 %	378974748
2505	NC_016844	TGC	2	6	134740	134745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974748
2506	NC_016844	A	7	7	134750	134756	100 %	0 %	0 %	0 %	378974748
2507	NC_016844	AGCA	2	8	134997	135004	50 %	0 %	25 %	25 %	378974749
2508	NC_016844	TTCA	2	8	135084	135091	25 %	50 %	0 %	25 %	378974749
2509	NC_016844	TAA	2	6	135110	135115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974749
2510	NC_016844	TG	4	8	135147	135154	0 %	50 %	50 %	0 %	378974749
2511	NC_016844	CAC	2	6	135196	135201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974749
2512	NC_016844	GGTG	2	8	135341	135348	0 %	25 %	75 %	0 %	378974749
2513	NC_016844	AGT	2	6	135398	135403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974749
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2519	NC_016844	CAT	2	6	135759	135764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974749
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2521	NC_016844	CCT	2	6	135934	135939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974749
2522	NC_016844	TGTTT	2	10	135957	135966	0 %	80 %	20 %	0 %	378974749
2523	NC_016844	AGC	2	6	136039	136044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974749
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2528	NC_016844	GGAA	2	8	136361	136368	50 %	0 %	50 %	0 %	378974749
2529	NC_016844	AGA	2	6	136407	136412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974749
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2536	NC_016844	CACT	2	8	136704	136711	25 %	25 %	0 %	50 %	378974749
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2538	NC_016844	GACA	2	8	136810	136817	50 %	0 %	25 %	25 %	378974750
2539	NC_016844	AG	3	6	136828	136833	50 %	0 %	50 %	0 %	378974750
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2555	NC_016844	GC	3	6	137323	137328	0 %	0 %	50 %	50 %	378974750
2556	NC_016844	CTT	2	6	137337	137342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974750
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2566	NC_016844	CTG	2	6	137995	138000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974750
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2587	NC_016844	GCC	2	6	138927	138932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974753
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2613	NC_016844	CGC	2	6	140095	140100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974754
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2996	NC_016844	ACC	2	6	162519	162524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974778
2997	NC_016844	CTT	2	6	162578	162583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974778
2998	NC_016844	GTG	2	6	162645	162650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974778
2999	NC_016844	GCAC	2	8	162687	162694	25 %	0 %	25 %	50 %	378974778
3000	NC_016844	TGA	2	6	162709	162714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974778

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